Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz hz 000276 A 0.00 0.07 0.03 C 0.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 001000 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 001783 G 0.00 0.13 0.15 C 0.00 0.87 0.85 0.00 0.23 0.25 001819 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 002292 T 0.00 0.63 0.39 C 0.00 0.37 0.61 0.00 0.47 0.48 002295 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002754 C 0.00 0.15 0.12 T 0.00 0.85 0.88 0.00 0.26 0.21 002806 G 0.00 0.09 0.05 T 0.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.09 003302 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 003369 A 0.00 0.14 0.11 G 0.00 0.86 0.89 0.00 0.24 0.19 003390 T 0.00 0.00 0.03 C 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 003569 C 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 003868 T 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 003908 + 0.00 0.63 0.39 - 0.00 0.37 0.61 0.00 0.47 0.48 004065 T 0.00 0.13 0.14 G 0.00 0.87 0.86 0.00 0.23 0.24 004121 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 004396 G 0.00 0.63 0.39 A 0.00 0.37 0.61 0.00 0.47 0.48 004668 C 0.00 0.00 0.04 T 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 005363 G 0.00 0.24 0.30 A 0.00 0.76 0.70 0.00 0.36 0.42 005436 A 0.00 0.00 0.03 G 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 005810 A 0.00 0.14 0.13 G 0.00 0.86 0.87 0.00 0.24 0.23 005886 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 005898 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006295 T 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006315 A 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 007527 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 007661 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 007722 A 0.00 0.13 0.14 C 0.00 0.87 0.86 0.00 0.23 0.24 007737 T 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008061 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008065 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008261 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.05 008496 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008509 C 0.00 0.04 0.04 T 0.00 0.96 0.96 0.00 0.08 0.08 008595 C 0.00 0.07 0.03 A 0.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 008680 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 008760 A 0.00 0.11 0.11 T 0.00 0.89 0.89 0.00 0.20 0.19 008810 G 0.00 0.00 0.02 T 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 009022 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009093 T 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009191 C 0.00 0.13 0.12 T 0.00 0.87 0.88 0.00 0.23 0.21 009667 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 009685 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 009862 G 0.00 0.00 0.02 C 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 010128 C 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.03 010242 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.03 010782 T 0.00 0.00 0.09 G 0.00 1.00 0.91 0.00 0.00 0.16 010985 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 011061 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 011186 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011255 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 011385 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 011686 C 0.00 0.09 0.05 T 0.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.10 011692 G 0.00 0.65 0.41 A 0.00 0.35 0.59 0.00 0.45 0.49 011888 A 0.00 0.07 0.15 T 0.00 0.93 0.85 0.00 0.12 0.26 011928 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 011942 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 012652 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 012737 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 012801 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 012845 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 012862 A 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 013122 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 013354 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014095 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014341 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 014711 A 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 015057 T 0.00 0.07 0.14 G 0.00 0.93 0.86 0.00 0.12 0.24 015237 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 015255 T 0.00 0.50 0.35 C 0.00 0.50 0.65 0.00 0.50 0.45 015340 A 0.00 0.27 0.18 G 0.00 0.73 0.82 0.00 0.40 0.30 015573 A 0.00 0.26 0.20 G 0.00 0.74 0.80 0.00 0.39 0.32 015718 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 015854 G 0.00 0.02 0.01 A 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016022 A 0.00 0.00 0.02 G 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 016373 T 0.00 0.32 0.42 C 0.00 0.68 0.58 0.00 0.43 0.49 016486 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 017052 G 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 017079 T 0.00 0.00 0.10 C 0.00 1.00 0.90 0.00 0.00 0.17 017171 G 0.00 0.33 0.40 A 0.00 0.67 0.60 0.00 0.44 0.48 017311 A 0.00 0.07 0.07 T 0.00 0.93 0.93 0.00 0.12 0.14 017397 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 017474 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 017683 A 0.00 0.13 0.07 G 0.00 0.87 0.93 0.00 0.23 0.14 018532 T 0.00 0.07 0.19 C 0.00 0.93 0.81 0.00 0.12 0.31 018810 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 019445 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 019506 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 019779 C 0.00 0.07 0.03 A 0.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 019816 A 0.00 0.33 0.41 G 0.00 0.67 0.59 0.00 0.44 0.49 020293 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 020467 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 020880 A 0.00 0.20 0.23 G 0.00 0.80 0.77 0.00 0.31 0.36 021124 + 0.00 0.48 0.37 - 0.00 0.52 0.63 0.00 0.50 0.47 021349 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 021539 A 0.00 0.00 0.04 T 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 021626 T 0.00 0.07 0.03 C 0.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 021721 C 0.00 0.18 0.09 T 0.00 0.82 0.91 0.00 0.30 0.16 021728 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 021900 G 0.00 0.00 0.04 A 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.08 022537 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 023016 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 023024 T 0.00 0.25 0.17 G 0.00 0.75 0.83 0.00 0.38 0.29 023094 G 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 023131 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 023141 T 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 023203 C 0.00 0.20 0.23 A 0.00 0.80 0.77 0.00 0.31 0.35 023478 C 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 023577 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 023681 G 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023700 T 0.00 0.26 0.17 C 0.00 0.74 0.83 0.00 0.39 0.28 023864 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 024262 G 0.00 0.00 0.10 A 0.00 1.00 0.90 0.00 0.00 0.17 024346 T 0.00 0.02 0.01 G 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 025340 C 0.00 0.00 0.04 T 0.00 1.00 0.96 0.00 0.00 0.07 025780 C 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 025800 C 0.00 0.07 0.20 T 0.00 0.93 0.80 0.00 0.13 0.32 026293 - 0.00 0.00 0.03 + 0.00 1.00 0.97 0.00 0.00 0.06 026617 C 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 026946 A 0.00 0.07 0.19 G 0.00 0.93 0.81 0.00 0.12 0.31 026985 T 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 027167 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 027461 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 027868 C 0.00 0.04 0.02 G 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 028320 T 0.00 0.43 0.33 A 0.00 0.57 0.67 0.00 0.49 0.44 028914 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 028929 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 029084 C 0.00 0.30 0.39 G 0.00 0.70 0.61 0.00 0.42 0.48 029789 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 029956 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 030078 G 0.00 0.26 0.30 T 0.00 0.74 0.70 0.00 0.39 0.42 030293 A 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 030368 - 0.00 0.00 0.01 + 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 030610 T 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 030986 A 0.00 0.00 0.01 G 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 031021 G 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 031164 G 0.00 0.02 0.01 C 0.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 031277 C 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 031331 A 0.00 0.00 0.01 C 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 031854 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 032160 T 0.00 0.26 0.29 C 0.00 0.74 0.71 0.00 0.39 0.41 032287 C 0.00 0.00 0.01 A 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 032647 - 0.00 0.37 0.18 + 0.00 0.63 0.82 0.00 0.47 0.30 033634 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 033711 A 0.00 0.04 0.02 T 0.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 033831 C 0.00 0.00 0.12 A 0.00 1.00 0.88 0.00 0.00 0.21 034281 G 0.00 0.26 0.34 A 0.00 0.74 0.66 0.00 0.39 0.45 034367 - 0.00 0.00 0.02 + 0.00 1.00 0.98 0.00 0.00 0.04 034756 C 0.00 0.00 0.01 T 0.00 1.00 0.99 0.00 0.00 0.02 Note: ED : European Descent AD : African Descent pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003908: ACT 007661: ccaag 008061: CTCT 013122: ataa 021124: T 026293: t 030368: AAGAG 032647: gatt 034367: CACACTGAG