Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000100 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000104 C 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 000108 G 0.10 0.04 0.07 T 0.90 0.96 0.93 0.19 0.08 0.14 000147 C 0.00 0.20 0.10 T 1.00 0.80 0.90 0.00 0.33 0.18 000279 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000385 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001065 T 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 001161 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001371 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001438 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001509 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001511 C 0.14 0.22 0.18 T 0.86 0.78 0.82 0.24 0.34 0.30 001724 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 001792 + 0.19 0.23 0.21 - 0.81 0.77 0.79 0.31 0.35 0.33 001852 - 0.03 0.23 0.15 + 0.97 0.77 0.85 0.06 0.35 0.25 002099 A 0.46 0.43 0.45 G 0.54 0.57 0.55 0.50 0.49 0.49 002284 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002385 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.14 0.07 002400 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 002417 G 0.00 0.23 0.10 T 1.00 0.78 0.90 0.00 0.35 0.19 002566 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 002960 C 0.14 0.22 0.18 G 0.86 0.78 0.82 0.24 0.34 0.29 003158 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003381 A 0.58 0.41 0.50 G 0.42 0.59 0.50 0.49 0.48 0.50 003449 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003517 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 003566 A 0.02 0.14 0.08 G 0.98 0.86 0.92 0.05 0.24 0.15 003785 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008710 A 0.15 0.22 0.18 G 0.85 0.78 0.82 0.25 0.34 0.30 032139 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032314 T 0.18 0.11 0.14 C 0.82 0.89 0.86 0.30 0.19 0.25 032445 C 0.52 0.11 0.31 T 0.48 0.89 0.69 0.50 0.19 0.43 032549 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033490 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 033707 G 0.50 0.13 0.32 A 0.50 0.87 0.68 0.50 0.23 0.43 034234 C 0.20 0.09 0.14 T 0.80 0.91 0.86 0.31 0.17 0.25 034255 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 034334 + 0.08 0.00 0.04 - 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 034340 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034357 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034607 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 035174 T 0.19 0.11 0.15 C 0.81 0.89 0.85 0.30 0.19 0.25 035260 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035555 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035594 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035862 G 0.42 0.11 0.27 A 0.58 0.89 0.73 0.49 0.19 0.39 036423 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036929 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036941 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 037470 G 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 037908 A 0.20 0.11 0.16 G 0.80 0.89 0.84 0.33 0.19 0.26 037960 T 0.18 0.00 0.09 C 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.16 038235 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 042540 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042606 A 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 042642 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 042669 C 0.19 0.00 0.10 T 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 043046 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 043347 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043402 A 0.07 0.00 0.04 G 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.08 043431 + 0.50 0.28 0.39 - 0.50 0.72 0.61 0.50 0.41 0.48 043884 G 0.20 0.11 0.15 A 0.80 0.89 0.85 0.31 0.19 0.26 043922 G 0.28 0.11 0.20 A 0.72 0.89 0.80 0.41 0.19 0.31 044010 C 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 044080 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044326 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 048102 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 048103 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 048364 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 048532 T 0.50 0.11 0.31 C 0.50 0.89 0.69 0.50 0.19 0.43 048550 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 048637 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 049207 T 0.33 0.00 0.16 G 0.67 1.00 0.84 0.44 0.00 0.27 049971 G 0.65 0.30 0.48 C 0.35 0.70 0.52 0.45 0.42 0.50 050097 A 0.43 0.30 0.37 G 0.57 0.70 0.63 0.49 0.42 0.47 060100 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060125 - 0.07 0.09 0.08 + 0.93 0.91 0.92 0.12 0.17 0.14 060312 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060410 A 0.25 0.00 0.13 G 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 060418 G 0.06 0.09 0.07 A 0.94 0.91 0.93 0.12 0.16 0.14 060494 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060505 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 060537 T 0.07 0.09 0.08 C 0.93 0.91 0.92 0.12 0.16 0.14 060564 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060646 T 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 060975 T 0.24 0.00 0.12 G 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 061015 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 061053 C 0.24 0.61 0.42 T 0.76 0.39 0.58 0.36 0.47 0.49 061276 T 0.02 0.17 0.10 G 0.98 0.83 0.90 0.04 0.29 0.17 061681 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 061801 A 0.31 0.11 0.21 C 0.69 0.89 0.79 0.43 0.19 0.33 061834 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 061843 G 0.06 0.09 0.07 T 0.94 0.91 0.93 0.12 0.16 0.14 061922 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 062109 A 0.31 0.11 0.21 G 0.69 0.89 0.79 0.43 0.19 0.33 062252 G 0.06 0.09 0.07 C 0.94 0.91 0.93 0.12 0.16 0.14 062265 A 0.06 0.07 0.06 G 0.94 0.93 0.94 0.12 0.12 0.12 062360 A 0.62 0.11 0.37 G 0.38 0.89 0.63 0.47 0.19 0.47 062427 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 062546 C 0.06 0.09 0.07 T 0.94 0.91 0.93 0.12 0.16 0.14 062738 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 062812 T 0.25 0.00 0.13 C 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 062836 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 063044 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 063119 - 0.06 0.09 0.07 + 0.94 0.91 0.93 0.12 0.16 0.14 063188 T 0.35 0.13 0.24 G 0.65 0.87 0.76 0.46 0.23 0.37 066443 T 0.71 0.22 0.47 C 0.29 0.78 0.53 0.41 0.34 0.50 066462 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 066507 G 0.69 0.22 0.46 A 0.31 0.78 0.54 0.43 0.34 0.50 066545 - 0.25 0.00 0.13 + 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 073623 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 074181 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 074216 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 074244 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 075462 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 075740 C 0.52 0.35 0.45 G 0.48 0.65 0.55 0.50 0.46 0.50 076279 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 076588 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 076679 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 076690 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 076879 G 0.09 0.26 0.17 T 0.91 0.74 0.83 0.17 0.39 0.28 077071 T 0.05 0.07 0.06 G 0.95 0.93 0.94 0.09 0.12 0.10 077283 G 0.33 0.00 0.16 A 0.67 1.00 0.84 0.44 0.00 0.27 077379 - 0.20 0.00 0.11 + 0.80 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 077659 T 0.28 0.00 0.14 A 0.72 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 104484 C 0.33 0.00 0.17 A 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 104576 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 104631 T 0.21 0.39 0.30 C 0.79 0.61 0.70 0.33 0.48 0.42 104747 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 104752 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 104867 G 0.58 0.13 0.36 C 0.42 0.87 0.64 0.49 0.23 0.46 104900 + 0.58 0.17 0.38 - 0.42 0.83 0.62 0.49 0.29 0.47 104978 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 104983 G 0.25 0.17 0.21 A 0.75 0.83 0.79 0.38 0.29 0.33 105046 T 0.25 0.17 0.21 C 0.75 0.83 0.79 0.38 0.29 0.33 105054 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 105073 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 105345 A 0.33 0.00 0.17 G 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 105503 C 0.33 0.00 0.17 T 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 105823 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 106190 G 0.58 0.17 0.38 A 0.42 0.83 0.62 0.49 0.29 0.47 106721 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 106969 C 0.58 0.17 0.38 T 0.42 0.83 0.62 0.49 0.29 0.47 107370 T 0.25 0.48 0.36 G 0.75 0.52 0.64 0.38 0.50 0.46 107602 C 0.25 0.17 0.21 T 0.75 0.83 0.79 0.38 0.29 0.33 107623 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 108102 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 108218 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 108245 T 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 112335 G 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 112528 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 112726 G 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 112859 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 112900 A 0.37 0.55 0.46 G 0.63 0.45 0.54 0.47 0.50 0.50 113058 C 0.31 0.48 0.39 A 0.69 0.52 0.61 0.43 0.50 0.48 113168 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 113457 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 113644 G 0.37 0.18 0.28 T 0.63 0.82 0.72 0.47 0.30 0.40 113747 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 113933 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 113945 C 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 114378 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 114391 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 114691 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 114949 G 0.02 0.07 0.04 A 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 114995 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 115400 G 0.42 0.15 0.29 A 0.58 0.85 0.71 0.49 0.26 0.41 115533 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 115539 T 0.06 0.26 0.16 C 0.94 0.74 0.84 0.12 0.39 0.27 116165 - 0.25 0.48 0.36 + 0.75 0.52 0.64 0.38 0.50 0.46 116249 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 116402 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 116459 G 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 116992 T 0.00 0.10 0.05 C 1.00 0.90 0.95 0.00 0.18 0.09 117185 - 0.07 0.35 0.20 + 0.93 0.65 0.80 0.13 0.45 0.32 117238 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 117418 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 117517 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 128078 C 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 128402 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 128439 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 128511 C 0.23 0.00 0.12 T 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 128772 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 128801 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 128977 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 129209 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 129371 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 129440 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 129464 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 134269 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 134283 A 0.39 0.09 0.23 G 0.61 0.91 0.77 0.47 0.16 0.36 134439 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 134667 T 0.21 0.00 0.10 G 0.79 1.00 0.90 0.33 0.00 0.17 135040 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 135374 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 144562 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 144589 T 0.08 0.05 0.07 G 0.92 0.95 0.93 0.15 0.09 0.12 144717 C 0.10 0.00 0.06 T 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 144748 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 144753 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 144755 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 145164 C 0.02 0.07 0.04 T 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 145316 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 145591 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 146198 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 146236 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 146395 G 0.40 0.07 0.23 C 0.60 0.93 0.77 0.48 0.12 0.36 146407 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 146460 A 0.40 0.07 0.23 G 0.60 0.93 0.77 0.48 0.12 0.36 146486 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 146492 T 0.40 0.07 0.23 C 0.60 0.93 0.77 0.48 0.12 0.36 146588 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 146619 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 146726 C 0.39 0.09 0.24 A 0.61 0.91 0.76 0.48 0.17 0.37 146733 - 0.00 0.05 0.02 + 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 146897 G 0.28 0.07 0.17 A 0.72 0.93 0.83 0.41 0.12 0.29 147062 T 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 147094 T 0.28 0.07 0.17 G 0.72 0.93 0.83 0.41 0.12 0.29 147151 A 0.09 0.07 0.08 G 0.91 0.93 0.92 0.16 0.12 0.14 147160 C 0.41 0.11 0.26 T 0.59 0.89 0.74 0.48 0.19 0.39 147198 T 0.00 0.11 0.05 C 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 147624 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 147770 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 147797 A 0.32 0.05 0.19 G 0.68 0.95 0.81 0.43 0.10 0.31 148117 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 148199 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 148343 G 0.07 0.35 0.21 C 0.93 0.65 0.79 0.13 0.45 0.33 148367 C 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 148465 + 0.08 0.00 0.04 - 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 148476 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 148598 C 0.08 0.07 0.07 A 0.92 0.93 0.93 0.15 0.12 0.14 148609 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 149110 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 149617 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 149951 A 0.38 0.07 0.22 C 0.62 0.93 0.78 0.47 0.12 0.35 149952 C 0.06 0.35 0.20 G 0.94 0.65 0.80 0.12 0.45 0.32 162909 G 0.45 0.30 0.38 A 0.55 0.70 0.62 0.50 0.42 0.47 162943 * 162974 C 0.45 0.30 0.38 T 0.55 0.70 0.62 0.50 0.42 0.47 162975 T 0.45 0.30 0.38 G 0.55 0.70 0.62 0.50 0.42 0.47 163064 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 163114 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 163375 C 0.10 0.30 0.20 T 0.90 0.70 0.80 0.17 0.42 0.33 163654 C 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 164094 C 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 164176 C 0.25 0.00 0.13 T 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 171676 C 0.17 0.09 0.13 A 0.83 0.91 0.87 0.29 0.17 0.23 171728 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 172005 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 172157 A 0.03 0.11 0.07 G 0.97 0.89 0.93 0.05 0.20 0.14 172161 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 172465 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 172533 G 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.18 172555 T 0.10 0.17 0.14 C 0.90 0.83 0.86 0.19 0.29 0.24 172668 C 0.17 0.09 0.13 T 0.83 0.91 0.87 0.28 0.17 0.23 172677 T 0.19 0.00 0.10 C 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 172730 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 173020 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 173238 C 0.17 0.00 0.09 T 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.17 173239 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.17 173246 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 173274 C 0.13 0.00 0.07 A 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.13 173294 C 0.17 0.00 0.09 T 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.17 173502 T 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.17 173609 - 0.17 0.00 0.09 + 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.17 173610 C 0.17 0.00 0.09 A 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.17 173687 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 173758 C 0.14 0.10 0.12 T 0.86 0.90 0.88 0.24 0.17 0.21 190232 G 0.17 0.16 0.16 A 0.83 0.84 0.84 0.28 0.27 0.27 190248 G 0.31 0.23 0.27 A 0.69 0.77 0.73 0.43 0.35 0.39 190276 C 0.13 0.16 0.15 G 0.87 0.84 0.85 0.23 0.27 0.25 190280 T 0.12 0.16 0.14 C 0.88 0.84 0.86 0.21 0.27 0.24 190309 C 0.17 0.00 0.08 G 0.83 1.00 0.92 0.28 0.00 0.15 190441 G 0.11 0.16 0.14 A 0.89 0.84 0.86 0.20 0.27 0.24 190592 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 190596 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 191115 A 0.68 0.23 0.42 G 0.32 0.77 0.58 0.44 0.35 0.49 191146 T 0.08 0.25 0.17 C 0.92 0.75 0.83 0.15 0.38 0.28 191340 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 201974 G 0.20 0.76 0.48 A 0.80 0.24 0.52 0.31 0.36 0.50 202061 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 202103 G 0.13 0.09 0.11 A 0.87 0.91 0.89 0.23 0.16 0.19 202789 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 202840 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 203218 A 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 203247 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 203475 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 203987 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 203996 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 204091 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 204502 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 204654 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 204828 T 0.40 0.00 0.20 C 0.60 1.00 0.80 0.48 0.00 0.32 205094 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 205452 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 205912 A 0.05 0.07 0.06 G 0.95 0.93 0.94 0.09 0.12 0.11 205914 A 0.79 0.24 0.50 G 0.21 0.76 0.50 0.34 0.36 0.50 206240 A 0.20 0.76 0.49 G 0.80 0.24 0.51 0.33 0.36 0.50 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000100: c 001792: C 001852: GGAG 002566: ATAG 034334: T 043431: CTTTTTATCATT 048103: TTAGCAA 048550: C 060125: aaagtatgac 061681: cacagttctggcagccagaa 062427: A 063119: AT 066545: AA 074216: at 074244: t 076279: A 077379: TAAAT 104576: act 104900: T 105823: A 116165: A 117185: t 146733: t 147624: ta 148465: G 173609: a 173687: aa 204502: A Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 162943 A 0.12 0.00 0.06 C 0.33 0.30 0.32 T 0.55 0.70 0.62