Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 001746 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 002182 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 010057 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010087 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011089 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011752 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 012417 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012500 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012539 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012629 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016370 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016392 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 016887 C 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 017294 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017543 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017645 - 0.19 0.00 0.10 + 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.18 017927 - 0.42 0.00 0.21 + 0.58 1.00 0.79 0.49 0.00 0.33 017979 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018075 T 0.23 0.20 0.21 C 0.77 0.80 0.79 0.35 0.31 0.33 018404 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019058 G 0.05 0.00 0.03 A 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 020649 A 0.21 0.20 0.20 G 0.79 0.80 0.80 0.33 0.31 0.32 020840 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020874 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 025526 T 0.77 0.16 0.48 G 0.23 0.84 0.52 0.35 0.27 0.50 026268 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 026684 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 028381 G 0.56 0.22 0.42 C 0.44 0.78 0.57 0.49 0.34 0.49 034235 A 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 034941 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034965 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035249 G 0.15 0.20 0.17 A 0.85 0.80 0.83 0.25 0.31 0.28 035340 T 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 035787 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 036064 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036260 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 037670 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038546 A 0.08 0.00 0.05 G 0.92 1.00 0.95 0.15 0.00 0.09 039558 G 0.79 0.20 0.48 A 0.21 0.80 0.52 0.34 0.31 0.50 044642 T 0.15 0.20 0.17 A 0.85 0.80 0.83 0.25 0.31 0.28 045419 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 045490 A 0.43 0.00 0.20 G 0.57 1.00 0.80 0.49 0.00 0.33 046021 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.07 0.00 0.03 046388 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046438 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046517 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 047076 C 0.25 0.20 0.22 T 0.75 0.80 0.78 0.38 0.31 0.35 047446 A 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 047903 T 0.12 0.20 0.16 A 0.88 0.80 0.84 0.21 0.31 0.27 048135 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 017645: cac 017927: ggagagac