Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000475 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 15 22 37 0.000 0.011 0.007 001100 AA 22 21 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 002065 AA 0 3 3 AT 2 11 13 TT 19 6 25 0.053 0.314 0.491 002167 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 21 19 40 0.000 0.013 0.006 014604 AA 18 6 24 AG 3 9 12 GG 1 4 5 2.296 0.034 2.657 014650 CC 22 20 42 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.024 014805 CC 17 23 40 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.059 0.000 0.025 015189 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 015437 -- 11 5 16 +- 7 11 18 ++ 4 7 11 1.875 0.030 1.624 019980 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 028199 -- 0 0 0 +- 0 2 2 ++ 24 20 44 0.000 0.050 0.023 028224 -- 20 19 39 +- 4 2 6 ++ 0 0 0 0.198 0.053 0.230 028339 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 033563 AA 18 7 25 AG 4 9 13 GG 1 3 4 1.252 0.001 1.280 033946 GG 1 5 6 GT 5 11 16 TT 14 7 21 0.360 0.030 1.003 037552 AA 22 22 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 038504 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 038667 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 039523 GG 1 0 1 GT 5 2 7 TT 17 21 38 0.571 0.048 0.875 040374 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 040945 AA 20 21 41 AT 4 2 6 TT 0 0 0 0.198 0.048 0.218 041316 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 22 44 0.045 0.000 0.023 041326 GG 0 0 0 GT 6 0 6 TT 17 22 39 0.517 0.000 0.230 041373 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 16 21 37 0.062 0.000 0.027 041428 -- 17 20 37 +- 5 2 7 ++ 0 0 0 0.362 0.050 0.329 041521 AA 0 0 0 AG 8 0 8 GG 15 22 37 1.019 0.000 0.428 041593 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 041713 CC 22 22 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 041757 AA 0 0 0 AG 1 4 5 GG 22 18 40 0.011 0.220 0.156 041948 AA 1 5 6 AT 3 11 14 TT 19 7 26 2.457 0.030 2.862 041998 -- 19 21 40 +- 4 2 6 ++ 0 0 0 0.209 0.048 0.224 042115 CC 18 21 39 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.006 042173 AA 1 5 6 AG 2 10 12 GG 16 6 22 3.698 0.043 3.265 042490 AA 20 21 41 AG 4 2 6 GG 0 0 0 0.198 0.048 0.218 042756 CC 23 19 42 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.053 0.054 043114 CC 21 7 28 CT 2 10 12 TT 0 4 4 0.048 0.016 2.198 043575 AA 23 21 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 043736 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 044205 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 049086 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 22 20 42 0.000 0.012 0.006 049229 -- 16 21 37 +- 6 2 8 ++ 0 0 0 0.548 0.048 0.428 049231 AA 16 21 37 AT 6 2 8 TT 0 0 0 0.548 0.048 0.428 049300 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 049396 AA 23 22 45 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.006 049502 CC 21 22 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 049858 AA 17 21 38 AG 6 2 8 GG 1 0 1 0.240 0.048 0.516 050119 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 050140 CC 20 21 41 CT 3 2 5 TT 1 0 1 2.617 0.048 2.448 050469 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 050929 -- 0 0 0 +- 1 2 3 ++ 23 21 44 0.011 0.048 0.051 055490 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 056389 CC 0 0 0 CT 7 2 9 TT 17 21 38 0.700 0.048 0.527 056459 AA 0 0 0 AT 4 2 6 TT 20 21 41 0.198 0.048 0.218 056753 CC 0 0 0 CT 7 2 9 TT 17 21 38 0.700 0.048 0.527 056901 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 24 20 44 0.000 0.012 0.006 056998 AA 0 0 0 AG 4 2 6 GG 20 18 38 0.198 0.055 0.236 057018 AA 17 18 35 AG 7 2 9 GG 0 0 0 0.700 0.055 0.571 057144 GG 0 0 0 GT 1 2 3 TT 23 21 44 0.011 0.048 0.051 057217 GG 0 0 0 GT 4 1 5 TT 20 21 41 0.198 0.012 0.152 057509 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 057584 AA 0 0 0 AG 7 2 9 GG 17 21 38 0.700 0.048 0.527 062800 AA 20 7 27 AG 4 11 15 GG 0 5 5 0.198 0.030 1.567 063071 CC 20 19 39 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.012 0.053 0.058 063226 AA 20 21 41 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.024 063296 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 21 42 0.012 0.000 0.006 063383 AA 0 0 0 AG 4 1 5 GG 18 20 38 0.220 0.012 0.164 063485 AA 21 19 40 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.012 0.053 0.056 063819 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 23 43 0.050 0.000 0.023 064307 AA 23 17 40 AG 1 6 7 GG 0 0 0 0.011 0.517 0.304 065129 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 065162 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 071867 CC 17 18 35 CT 5 1 6 TT 0 0 0 0.362 0.014 0.256 071994 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 20 44 0.000 0.012 0.006 080690 CC 23 20 43 CG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.050 0.052 080867 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 080873 CC 22 20 42 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.024 081080 AA 2 0 2 AG 6 0 6 GG 15 22 37 1.252 0.000 4.753 081160 -- 20 20 40 +- 4 2 6 ++ 0 0 0 0.198 0.050 0.224 081420 AA 23 20 43 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.050 0.052 082044 CC 2 0 2 CT 6 0 6 TT 16 23 39 1.407 0.000 5.074 082087 CC 20 7 27 CG 4 11 15 GG 0 5 5 0.198 0.030 1.567 084010 CC 17 21 38 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.015 0.000 0.007 085222 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 22 42 0.050 0.000 0.024 085538 CC 17 19 36 CT 6 2 8 TT 0 0 0 0.517 0.053 0.440 085634 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 085955 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 086042 -- 11 16 27 +- 10 0 10 ++ 0 0 0 2.051 0.000 0.903 086748 CC 1 0 1 CT 7 0 7 TT 15 22 37 0.025 0.000 0.830 086853 CC 1 4 5 CT 4 9 13 TT 19 7 26 1.361 0.126 2.425 087005 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 23 20 43 0.011 0.050 0.052 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 015437: CTT 028199: CTTC 028224: CTCC 041428: CTGCAA 041998: Ctg 049229: A 050929: TTCA 056901: CACT 081160: tAA 086042: ATT