Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000475 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.03 001100 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002065 A 0.05 0.42 0.23 T 0.95 0.57 0.77 0.09 0.49 0.36 002167 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 014604 G 0.11 0.45 0.27 A 0.89 0.55 0.73 0.20 0.49 0.39 014650 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 014805 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 015189 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015437 + 0.34 0.54 0.44 - 0.66 0.46 0.56 0.45 0.50 0.49 019980 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 028199 - 0.00 0.05 0.02 + 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 028224 + 0.08 0.05 0.07 - 0.92 0.95 0.93 0.15 0.09 0.12 028339 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033563 G 0.13 0.39 0.25 A 0.87 0.61 0.75 0.23 0.48 0.38 033946 G 0.17 0.46 0.33 T 0.82 0.54 0.67 0.29 0.50 0.44 037552 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038504 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038667 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039523 G 0.15 0.04 0.10 T 0.85 0.96 0.90 0.26 0.08 0.18 040374 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040945 T 0.08 0.04 0.06 A 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 041316 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 041326 G 0.13 0.00 0.07 T 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 041373 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 041428 + 0.11 0.05 0.08 - 0.89 0.95 0.92 0.20 0.09 0.15 041521 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 041593 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 041713 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 041757 A 0.02 0.09 0.06 G 0.98 0.91 0.94 0.04 0.17 0.10 041948 A 0.11 0.46 0.28 T 0.89 0.54 0.72 0.19 0.50 0.41 041998 + 0.09 0.04 0.07 - 0.91 0.96 0.93 0.16 0.08 0.12 042115 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 042173 A 0.11 0.48 0.30 G 0.89 0.52 0.70 0.19 0.50 0.42 042490 G 0.08 0.04 0.06 A 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 042756 T 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 043114 T 0.04 0.43 0.23 C 0.96 0.57 0.77 0.08 0.49 0.35 043575 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 043736 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 044205 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049086 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 049229 + 0.14 0.04 0.09 - 0.86 0.96 0.91 0.24 0.08 0.16 049231 T 0.14 0.04 0.09 A 0.86 0.96 0.91 0.24 0.08 0.16 049300 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049396 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 049502 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049858 G 0.17 0.04 0.11 A 0.83 0.96 0.89 0.28 0.08 0.19 050119 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 050140 T 0.10 0.04 0.07 C 0.90 0.96 0.93 0.19 0.08 0.14 050469 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 050929 - 0.02 0.04 0.03 + 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 055490 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056389 C 0.15 0.04 0.10 T 0.85 0.96 0.90 0.25 0.08 0.17 056459 A 0.08 0.04 0.06 T 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 056753 C 0.15 0.04 0.10 T 0.85 0.96 0.90 0.25 0.08 0.17 056901 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 056998 A 0.08 0.05 0.07 G 0.92 0.95 0.93 0.15 0.10 0.13 057018 G 0.15 0.05 0.10 A 0.85 0.95 0.90 0.25 0.10 0.18 057144 G 0.02 0.04 0.03 T 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 057217 G 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 057509 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 057584 A 0.15 0.04 0.10 G 0.85 0.96 0.90 0.25 0.08 0.17 062800 G 0.08 0.46 0.27 A 0.92 0.54 0.73 0.15 0.50 0.39 063071 T 0.02 0.05 0.04 C 0.98 0.95 0.96 0.05 0.09 0.07 063226 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 063296 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 063383 A 0.09 0.02 0.06 G 0.91 0.98 0.94 0.17 0.05 0.11 063485 G 0.02 0.05 0.03 A 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.07 063819 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 064307 G 0.02 0.13 0.07 A 0.98 0.87 0.93 0.04 0.23 0.14 065129 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 065162 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 071867 T 0.11 0.03 0.07 C 0.89 0.97 0.93 0.20 0.05 0.14 071994 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 080690 G 0.02 0.05 0.03 C 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 080867 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 080873 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 081080 A 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.20 081160 + 0.08 0.05 0.07 - 0.92 0.95 0.93 0.15 0.09 0.12 081420 G 0.02 0.05 0.03 A 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 082044 C 0.21 0.00 0.11 T 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 082087 G 0.08 0.46 0.27 C 0.92 0.54 0.73 0.15 0.50 0.39 084010 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 085222 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 085538 T 0.13 0.05 0.09 C 0.87 0.95 0.91 0.23 0.09 0.17 085634 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 085955 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 086042 + 0.24 0.00 0.14 - 0.76 1.00 0.86 0.36 0.00 0.23 086748 C 0.20 0.00 0.10 T 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 086853 C 0.12 0.42 0.26 T 0.88 0.57 0.74 0.22 0.49 0.39 087005 C 0.02 0.05 0.03 T 0.98 0.95 0.97 0.04 0.09 0.06 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 015437: CTT 028199: CTTC 028224: CTCC 041428: CTGCAA 041998: Ctg 049229: A 050929: TTCA 056901: CACT 081160: tAA 086042: ATT