Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000674 T 0.25 0.36 0.31 C 0.75 0.64 0.69 0.38 0.46 0.43 000836 T 0.02 0.07 0.05 C 0.98 0.93 0.95 0.04 0.14 0.09 001411 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001447 T 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.05 001659 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 001955 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 002415 * 002523 A 0.54 0.41 0.48 G 0.46 0.59 0.52 0.50 0.48 0.50 002575 T 0.31 0.59 0.45 C 0.69 0.41 0.55 0.43 0.48 0.49 002622 T 0.28 0.39 0.33 C 0.72 0.61 0.67 0.41 0.47 0.44 002752 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003031 G 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 003057 - 0.33 0.59 0.46 + 0.67 0.41 0.54 0.44 0.48 0.50 003238 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003300 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003504 T 0.02 0.10 0.06 C 0.98 0.90 0.94 0.05 0.17 0.11 004113 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 004244 C 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 004618 T 0.07 0.39 0.23 C 0.93 0.61 0.77 0.13 0.47 0.35 005092 A 0.23 0.26 0.24 C 0.77 0.74 0.76 0.35 0.39 0.37 005104 A 0.42 0.41 0.41 G 0.58 0.59 0.59 0.49 0.48 0.49 005132 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005449 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005574 T 0.46 0.41 0.43 C 0.54 0.59 0.57 0.50 0.48 0.49 005872 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 006166 T 0.11 0.44 0.26 C 0.89 0.56 0.74 0.20 0.49 0.39 006326 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 006361 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006407 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 006420 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006468 G 0.13 0.00 0.06 T 0.87 1.00 0.94 0.23 0.00 0.11 006486 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 007125 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007245 C 0.42 0.43 0.42 T 0.58 0.57 0.58 0.49 0.49 0.49 007368 T 0.25 0.30 0.28 C 0.75 0.70 0.72 0.38 0.42 0.40 007375 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007446 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007447 A 0.42 0.43 0.42 G 0.58 0.57 0.58 0.49 0.49 0.49 007574 C 0.40 0.26 0.33 T 0.60 0.74 0.67 0.48 0.39 0.44 007620 T 0.02 0.12 0.07 A 0.98 0.88 0.93 0.05 0.22 0.14 007959 G 0.15 0.11 0.13 A 0.85 0.89 0.87 0.25 0.19 0.22 007969 + 0.35 0.50 0.42 - 0.65 0.50 0.58 0.45 0.50 0.49 008347 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008349 A 0.02 0.09 0.05 G 0.98 0.91 0.95 0.04 0.16 0.10 008355 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008356 A 0.04 0.02 0.03 G 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 008433 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008438 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008642 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 008794 * 008985 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009109 T 0.08 0.33 0.20 C 0.92 0.67 0.80 0.15 0.44 0.32 009162 T 0.19 0.35 0.27 C 0.81 0.65 0.73 0.30 0.45 0.39 009229 C 0.19 0.35 0.27 T 0.81 0.65 0.73 0.30 0.45 0.39 009489 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009512 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 009552 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010489 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010490 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010549 C 0.26 0.45 0.36 G 0.74 0.55 0.64 0.39 0.50 0.46 010554 A 0.12 0.09 0.11 G 0.88 0.91 0.89 0.22 0.17 0.19 010585 C 0.12 0.09 0.11 G 0.88 0.91 0.89 0.22 0.17 0.19 010694 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011035 T 0.22 0.36 0.29 C 0.78 0.64 0.71 0.34 0.46 0.41 011073 G 0.24 0.11 0.17 A 0.76 0.89 0.83 0.36 0.19 0.28 011189 T 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 011357 T 0.33 0.11 0.22 C 0.67 0.89 0.78 0.44 0.19 0.34 011667 G 0.21 0.35 0.28 C 0.79 0.65 0.72 0.33 0.45 0.40 011926 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 012081 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012222 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012534 T 0.08 0.11 0.10 C 0.92 0.89 0.90 0.15 0.20 0.18 013049 T 0.20 0.11 0.16 C 0.80 0.89 0.84 0.31 0.20 0.26 013210 A 0.33 0.44 0.38 G 0.67 0.56 0.62 0.44 0.49 0.47 013323 A 0.00 0.10 0.05 G 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 013893 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015186 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003057: T 007969: TG Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 002415 T 0.10 0.00 0.05 G 0.35 0.59 0.47 C 0.54 0.41 0.48 008794 T 0.08 0.04 0.06 G 0.02 0.13 0.07 C 0.90 0.83 0.86