Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000335 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000376 T 0.35 0.52 0.43 C 0.65 0.48 0.57 0.45 0.50 0.49 000434 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 000452 - 0.09 0.00 0.05 + 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 000798 G 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 000805 C 0.24 0.23 0.23 T 0.76 0.77 0.77 0.36 0.35 0.36 001564 C 0.15 0.02 0.09 T 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 001804 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001857 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002211 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002288 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 002343 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 002383 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002823 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 003358 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003359 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003418 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003850 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004103 A 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 004199 G 0.57 0.39 0.48 A 0.43 0.61 0.52 0.49 0.48 0.50 004301 T 0.00 0.15 0.08 C 1.00 0.85 0.92 0.00 0.26 0.14 004593 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 004952 G 0.25 0.02 0.14 C 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 005172 A 0.08 0.23 0.15 G 0.92 0.77 0.85 0.15 0.35 0.26 005420 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006390 T 0.04 0.10 0.07 C 0.96 0.90 0.93 0.08 0.17 0.13 006925 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 007153 T 0.08 0.22 0.15 C 0.92 0.78 0.85 0.15 0.34 0.25 007584 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007752 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 007846 C 0.00 0.15 0.07 A 1.00 0.85 0.93 0.00 0.26 0.14 009122 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009152 C 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 009342 T 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 009672 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009925 A 0.15 0.00 0.08 C 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 009983 G 0.08 0.22 0.15 A 0.92 0.78 0.85 0.15 0.34 0.25 010032 C 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 010313 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 010330 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010530 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010539 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010574 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010651 - 0.12 0.00 0.06 + 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 010698 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011162 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 011199 T 0.05 0.27 0.16 C 0.95 0.73 0.84 0.09 0.40 0.27 011513 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011691 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011888 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012434 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012439 T 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 012518 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012648 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012664 T 0.19 0.68 0.42 G 0.81 0.32 0.58 0.30 0.43 0.49 012740 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012815 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012907 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013180 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 013292 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013438 T 0.02 0.20 0.11 A 0.98 0.80 0.89 0.04 0.31 0.19 013642 C 0.29 0.00 0.15 T 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.26 013792 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 014294 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.33 0.00 0.19 014361 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014389 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 014875 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015633 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015713 T 0.02 0.15 0.09 C 0.98 0.85 0.91 0.04 0.26 0.16 015818 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015894 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 016019 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016045 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016047 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016152 G 0.15 0.15 0.15 A 0.85 0.85 0.85 0.25 0.26 0.25 016307 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016891 G 0.03 0.14 0.09 A 0.97 0.86 0.91 0.05 0.24 0.16 016984 A 0.08 0.04 0.06 G 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 017472 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017613 G 0.52 0.33 0.43 A 0.48 0.67 0.57 0.50 0.44 0.49 017804 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017920 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018044 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 018152 A 0.02 0.13 0.07 T 0.98 0.87 0.93 0.04 0.23 0.14 018345 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 018831 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 018848 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019061 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019227 G 0.30 0.65 0.48 A 0.70 0.35 0.52 0.42 0.45 0.50 019261 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 019359 A 0.41 0.34 0.38 G 0.59 0.66 0.62 0.48 0.45 0.47 019957 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020118 T 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020400 T 0.31 0.65 0.49 A 0.69 0.35 0.51 0.43 0.45 0.50 020669 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 020703 T 0.12 0.16 0.14 C 0.88 0.84 0.86 0.21 0.27 0.24 020770 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020832 G 0.33 0.04 0.19 A 0.67 0.96 0.81 0.44 0.08 0.31 020886 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021131 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021172 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 021500 A 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 021649 G 0.29 0.65 0.47 A 0.71 0.35 0.53 0.41 0.45 0.50 021733 T 0.09 0.04 0.07 C 0.91 0.96 0.93 0.17 0.08 0.12 021771 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021803 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021888 C 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 022121 A 0.16 0.10 0.13 C 0.84 0.90 0.87 0.27 0.18 0.23 022237 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022304 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022548 T 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 022668 G 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 022701 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000452: ct 010530: tgTA 010574: g 010651: t 012648: T 018848: a