************************************************************* **** **** **** Output from PHASE v2.0 **** **** Code by M Stephens, with contributions from N Li **** **** **** ************************************************************* BEGIN COMMAND_LINE /home/qyi/lib/phase/PHASE2 -d1 traf6.phase.inp traf6.phase.out END COMMAND_LINE BEGIN OUTFILE_LIST traf6.phase.out_freqs : haplotype frequency estimates traf6.phase.out_pairs : most likely haplotype pairs for each individual traf6.phase.out_recom : estimates of recombination parameters traf6.phase.out_monitor : file for monitoring convergence END OUTFILE_LIST BEGIN INPUT_SUMMARY Number of Individuals: 47 Number of Loci: 62 Positions of loci: 110 190 201 431 514 544 884 973 1105 1893 2288 2370 4115 4214 7203 7565 8015 8335 8772 8941 9128 9306 9481 9572 9886 9909 9957 10109 10211 10241 10919 11252 12604 12635 12982 13449 15240 15663 16041 16940 17551 17625 17710 17755 18171 18494 18686 18721 19032 19424 20580 21084 22168 23576 24324 24595 24800 24845 25095 25682 25725 26251 END INPUT_SUMMARY List of haplotypes found in best reconstruction, with counts. (See file traf6.phase.out_freqs for haplotype population frequency estimates) BEGIN LIST_SUMMARY 1 GGGGAITCCGGACGTCCGTDITAAGAATCTAGAATCGDDCCCAGDIDDGTAGIACAAATCAC 1.000000 2 GGGGAITCCGGACGTCTGTDITAGGACTCGAGAATCGDDCCCAGIIDDGTAGIACAAAACAC 2.000000 3 GGGGAITCCGGACGTCTTTDITAGGACTCGAGAATCGDDCCCAGIIDDGTAGIACAAATCAC 1.000000 4 GGGGAITCCGGACGTCTTTDITAGGACCCGAGGATTGDICCGGGIDDDGTGGIACGAATCGC 1.000000 5 GGGGAITCCGGACGTTTTCDICAGATCCCGAGAATCGDICCCACIIDDATAGIACAAATCAC 4.000000 6 GGGGAITCCGAACGTCTGTDITGGGACTCGCGAGTCGIDCCCAGIIDIGTAGDACAAATCAC 1.000000 7 GGGGAITCCGAACGTCTTTDITAGGACTCGAGAATCGDDCCCAGIIDDGTAGIACAAATCAC 1.000000 8 GGGGAITCCGAACGTCTTTDITAGGACCCGAGGATTGDICCGGGIIDDGTGGIACAAATCAC 1.000000 9 GGGGAITCCGAACGTCTTTDITAGGACCCGAGGATTGDICCGGGIDDDGTGGIACGAATCGC 2.000000 10 GGGGAITCCGAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICACAGIIDDGTGGIACAAATCAC 2.000000 11 GGGGAITCCAAACGTCTGTDITGGGACTCGCGAGTCGIDCCCAGIIDDGTAGIACAAAACAT 1.000000 12 GGGGAITCCAAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 4.000000 13 GGGGAITCCAAAGCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 1.000000 14 GGGGAITCCAACCCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 1.000000 15 GGGGAITCCAACGCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 6.000000 16 GGGGAITCCAACGCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCGC 1.000000 17 GGGGAITCTGAACGTCCGTIITAAGAATCGAAAATCGDDTCCAGIIIDGCAAIATAAGTAGC 1.000000 18 GGGGAITCTGAACGTCTGTDITGGGACTCGCGAGTCGIDCCCAGIIDDGTAGIACAAAACAT 1.000000 19 GGGGAITCTGAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCADICACAGIIDDGTGGIACAAATCAT 5.000000 20 GGGGAITCTGAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCADICACAGIIDDGTGGDACAAATCAT 21.000000 21 GGGGAITCTGAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCADICACAGIIDDGTGGDACAGATCAT 4.000000 22 GGGGAITCTGAAGCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 1.000000 23 GGGGAICCCAAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 2.000000 24 GGGGADTCCGGACGTCTTTDITAGGACTCGAGAATCGIDCCCAGIIDIGTAGIACAAATCAC 1.000000 25 GGGGADTCCGGACGTCTTTDITAGGACTCGAGAATCGIDCCCAGIIDIGTAGIACAAAACAC 1.000000 26 GGGGADTCCGGACGTCTTTDITAGGACCCGAGGATTGDICCGGGIDDDGTGGIACAAATCGC 2.000000 27 GGGTAITTCGAACGTCCGTDITAAGAATCGAAAATCGDDTCCAGIIIDGCAAIATAAGTAGC 1.000000 28 GGGTAITTCGAACGTCCGTIITAAGAATCGAAAATCGDDTCCAGIIIDGCAGIATAAGTAGC 1.000000 29 GGGTAITTCGAACGTCCGTIITAAGAATCGAAAATCGDDTCCAGIIIDGCAAIATAAGTAGC 4.000000 30 GCGGAITCCGAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 2.000000 31 GCGGGITCCGAACCTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAC 3.000000 32 AGGGAITCCGAACGTCCGTDITAAGAATCGAAAATCGDDTCCAGIIIDGTAGIATAAGTCGC 1.000000 33 AGGGAITCCGAACGTCCGTDITAAGAATCGAAAATCGDDTCCAGIIIDGTAGIGTAAATCAC 3.000000 34 AGGGAITCCGAACGTCTGTDITAGGACCCGAGGATCGDICCCAGIIDDGTGGIACAAATCAT 2.000000 35 AGGGAITCCGAACGCCCGTDDTAAGAATCGAAAATCGDDTCCAGIIIDGTAGIATAAATCGC 4.000000 36 AGGTAITCCGAACGTCTTTDITAGGACTCGAGAATCGDDCCCAGIIDDGTAGIACAAATCAC 1.000000 37 AGAGAITCCGAACGTCCGTDITAAGAATGTAGAAACGDDCCCAGDIDDGTAGIACAAATCAC 1.000000 38 AGAGAITCCGAACGTCCGTDITAAGAATGTAGAAACGDDCCCAGDIDDGTAGIACAAAACAC 2.000000 END LIST_SUMMARY Summary of best reconstruction (numbers refer to the list of haplotypes given above) BEGIN BESTPAIRS_SUMMARY D001: (1,3) D002: (2,26) D003: (11,15) D004: (35,35) D005: (25,38) D006: (20,23) D007: (32,34) D008: (18,26) D009: (5,14) D010: (10,12) D011: (20,23) D012: (10,13) D013: (27,33) D014: (16,33) D015: (20,38) D016: (4,33) D033: (9,37) D034: (24,35) D035: (5,8) D036: (5,29) D037: (9,12) D038: (6,35) D039: (5,34) D040: (2,36) E001: (15,20) E002: (20,20) E003: (20,29) E004: (20,21) E005: (21,30) E006: (15,19) E007: (20,20) E008: (17,19) E009: (12,20) E010: (19,20) E011: (31,31) E012: (7,19) E013: (21,28) E014: (20,20) E015: (20,20) E016: (15,15) E017: (12,29) E018: (20,22) E019: (15,29) E020: (20,31) E021: (20,30) E022: (20,21) E023: (19,20) END BESTPAIRS_SUMMARY Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in []: BEGIN BESTPAIRS1 0 D001 G G G G A I T C C G G A C G T C C G T D I T A A G A A T C T A G A A T C G D D C C C A G D I D D G T A G I A C A A A T C A C G G G G A I T C C G G A C G T C T T T D I T A G G A C T C G A G A A T C G D D C C C A G I I D D G T A G I A C A A A T C A C 0 D002 G G G G A I T C C G G A C G T C T G T D I T A G G A C T C G A G A A T C G D D C C C A G I I D D G T A G I A C A A A A C A C G G G G A D T C C G G A C G T C T T T D I T A G G A C C C G A G G A T T G D I C C G G G I D D D G T G G I A C A A A T C G C 0 D003 G G G G A I T C C A A [A] C G T C T G T D I T G G G A C T C G C G A G T C G I D C C C A G I I D D G T A G I A C A A A A C A T G G G G A I T C C A A [C] G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D004 A G G G A I T C C G A A C G C C C G T D D T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G I A T A A A T C G C A G G G A I T C C G A A C G C C C G T D D T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G I A T A A A T C G C 0 D005 G G G G A D T C C G G A C G T C T T T D I T A G G A C T C G A G A A T C G I D C C C A G I I D I G T A G I A C A A A A C A C A G A G A I T C C G A A C G T C C G T D I T A A G A A T G T A G A A A C G D D C C C A G D I D D G T A G I A C A A A A C A C 0 D006 G G G G A I (T) C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I (C) C C A A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D007 A G G G A I T C C G A A C G T C C G T D I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G I A T A A G T C G C A G G G A I T C C G A A C G T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A T 0 D008 G G G G A I T C [T] G A A C G T C T G T D I T G G G A C T C G C G A G T C G I D C C C A G I I D D G T A G I A C A A A A C A T G G G G A D T C C G G A C G T C T T T D I T A G G A C C C G A G G A T T G D I C C G G G I D D D G T G G I A C A A A T C G C 0 D009 G G G G A I T C C G G (A) C G T T T T C D I C A G A T C C C G A G A A T C G D I C C C A C I I D D A T A G I A C A A A T C A C G G G G A I T C C A A (C) C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D010 G G G G A I T C C G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C A C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G G A I T C C A A [A] C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D011 G G G G A I (T) C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I (C) C C A A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D012 G G G G A I T C C G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C A C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G G A I T C C A A A G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D013 G G G T A I T T C G A A C G T C C G T D I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G C A A I A T A A G T A G C A G G G A I T C C G A A C G T C C G T D I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G I G T A A A T C A C 0 D014 G G G G A I T C C A A [C] [G] C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C (G) C A G G G A I T C C G [A] A C G T C C G T D I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G I G T A A A T C (A) C 0 D015 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T A G A G A I T C C G A A C G T C C G T D I T A A G A A T G T A G A A A C G D D C C C A G D I D D G T A G I A C A A A A C A C 0 D016 G G G G A I T C C G (G) A C G T C T T T D I T A G G A C C C G A G G A T T G D I C C G G G I D D D G T G G I A C G A A T C G C A G G G A I T C C G (A) A C G T C C G T D I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G I G T A A A T C A C 0 D033 G G G G A I T C C G A A C G T C T T T D I T A G G A C C C G A G G A T T G D I C C G G G I D D D G T G G I A C G A A T C G C A G A G A I T C C G A A C G T C C G T D I T A A G A A T G T A G A A A C G D D C C C A G D I D D G T A G I A C A A A T C A C 0 D034 G G G G A D T C C G G A C G T C T T T D I T A G G A C T C G A G A A T C G I D C C C A G I I D I G T A G I A C A A A T C A C A G G G A I T C C G A A C G C C C G T D D T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G I A T A A A T C G C 0 D035 G G G G A I T C C G G A C G T T T T C D I C A G A T C C C G A G A A T C G D I C C C A C I I D D A T A G I A C A A A T C A C G G G G A I T C C G A A C G T C T T T D I T A G G A C C C G A G G A T T G D I C C G G G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D036 G G G G A I T C C G G A C G T T T T C D I C A G A T C C C G A G A A T C G D I C C C A C I I D D A T A G I A C A A A T C A C G G G T A I T T C G A A C G T C C G T I I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G C A A I A T A A G T A G C 0 D037 G G G G A I T C C G A A C G T C T T T D I T A G G A C C C G A G G A T T G D I C C G G G I D D D G T G G I A C G A A T C G C G G G G A I T C C A A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 D038 G G G G A I T C C G A A C G T C T G T D I T G G G A C T C G C G A G T C G I D C C C A G I I D I G T A G (D) A C A A A T C A C A G G G A I T C C G A A C G C C C G T D D T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G T A G (I) A T A A A T C G C 0 D039 G G G G A I T C C G G A C G T T T T C D I C A G A T C C C G A G A A T C G D I C C C A C I I D D A T A G I A C A A A T C A C A G G G A I T C C G A A C G T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A T 0 D040 (G) G G (G) A I T C C G (G) A C G T C T (G) T D I T A G G A C T C G A G A A T C G D D C C C A G I I D D G T A G I A C A A A (A) C A C (A) G G (T) A I T C C G (A) A C G T C T (T) T D I T A G G A C T C G A G A A T C G D D C C C A G I I D D G T A G I A C A A A (T) C A C 0 E001 G G G G A I T C C A A C G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T 0 E002 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T 0 E003 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G T A I T T C G A A C G T C C G T I I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G C A A I A T A A G T A G C 0 E004 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A G A T C A T 0 E005 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A G A T C A T G C G G A I T C C G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 E006 G G G G A I T C C A A [C] G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A T 0 E007 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T 0 E008 G G G G A I T C T G A A C G T C C G T I I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G C A A I A T A A G T A G C G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A T 0 E009 G G G G A I T C C A A A [C] C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T 0 E010 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T 0 E011 G C G G G I T C C G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G C G G G I T C C G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 E012 G G G G A I T C C G A A C G T C T T T D I T A G G A C T C G A G A A T C G D D C C C A G I I D D G T A G I A C A A A T C A C G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A T 0 E013 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A G A T C A T G G G T A I T T C G A A C G T C C G T I I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G C A G I A T A A G T A G C 0 E014 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T 0 E015 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T 0 E016 G G G G A I T C C A A C G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G G A I T C C A A C G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 E017 G G G G A I T C C A A A [C] C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G T A I T T C G A A C G T C C G T I I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G C A A I A T A A G T A G C 0 E018 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 E019 G G G G A I T C C A A C G C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C G G G T A I T T C G A A C G T C C G T I I T A A G A A T C G A A A A T C G D D T C C A G I I I D G C A A I A T A A G T A G C 0 E020 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G C G G G I T C C G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 E021 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G C G G A I T C C G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C G D I C C C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A C 0 E022 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A G A T C A T 0 E023 G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G I A C A A A T C A T G G G G A I T C T G A A C C T C T G T D I T A G G A C C C G A G G A T C A D I C A C A G I I D D G T G G D A C A A A T C A T END BESTPAIRS1 Haplotype estimates for each individual, with uncertain phases enclosed in () and uncertain genotypes enclosed in [] with phase known positions indicated by = BEGIN BESTPAIRS2 0 D001 ? ? = = = = = = = = = = = = = = C G = = = = = A = = A = = T = = = = = ? = = ? = = = = = D = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = T T = = = = = G = = C = = G = = = = = ? = = ? = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D002 = = = = = I ? ? ? ? = = ? ? = = = G = = = = = = = = = T = = = = A = = C = = ? = = C A = = I = = = = ? = = = = = = = A = A = = = = = = D ? ? ? ? = = ? ? = = = T = = = = = = = = = C = = = = G = = T = = ? = = G G = = D = = = = ? = = = = = = = T = G = 0 D003 = = = = = = = = = = ? ? C G = = = = = = = = G = ? ? ? ? ? = C = A G = = = I D = = = = = = = = = = = A = = = = = = = A = = T = = = = = = = = = = ? ? G C = = = = = = = = A = ? ? ? ? ? = A = G A = = = D I = = = = = = = = = = = G = = = = = = = T = = C 0 D004 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 D005 G = G = = D = = = = G = = = ? = T T = = = = = G = = C = C G ? = = = T ? = I = = = = = = I ? ? I = = ? = = = = = = = = = = = A = A = = I = = = = A = = = ? = C G = = = = = A = = A = G T ? = = = A ? = D = = = = = = D ? ? D = = ? = = = = = = = = = = = 0 D006 ? ? = = = = (T) = T G ? ? ? ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = T ? ? = = = = (C) = C A ? ? ? ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = C 0 D007 = = = = = = ? ? ? = = = = = = ? C = = = = = = A = = A T = = = A A = = = = = D T = = = = = = I = = = A = = = T = = G = = G C = = = = = = ? ? ? = = = = = = ? T = = = = = = G = = C C = = = G G = = = = = I C = = = = = = D = = = G = = = C = = A = = A T 0 D008 = = = = = I ? ? ? = A = = = = ? ? G = = = = G = = = = T = = C = A G = C = I D = = C A = = I = = = = A = = = = = = = A ? ? ? = = = = = D ? ? ? = G = = = = ? ? T = = = = A = = = = C = = A = G A = T = D I = = G G = = D = = = = G = = = = = = = T ? ? ? 0 D009 = = = = = = ? ? ? G G (A) = G = ? ? T C = = C = = A T = = = = = = A = = = = = = = = = = C = = = = A = A = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? ? A A (C) = C = ? ? G T = = T = = G A = = = = = = G = = = = = = = = = = G = = = = G = G = = = = = = = = = = = 0 D010 = = = = = = = = = G ? ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = A = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A ? ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = C = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = 0 D011 = = = = = = (T) = T G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = D = = ? ? ? = = = T = = = = = = (C) = C A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = I = = ? ? ? = = = C 0 D012 = = = = = = = = = G = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = 0 D013 G = = T = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = A = A = = = G = A G = A = = G = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T = G = G = = = A = C A = 0 D014 G = = = = = = = = A ? ? ? C = = T = = = = = = G = = C C = = = G G = = = = = I C = = = = = = D = = = G = = A C = = = = = (G) = A = = = = = = = = G ? ? ? G = = C = = = = = = A = = A T = = = A A = = = = = D T = = = = = = I = = = A = = G T = = = = = (A) = 0 D015 G = G = = = = = T ? = = = C = = T = = = = = = G = = C C C G ? = G = T ? A = I = A = = = I = = = = = G = D = = = = = T = = T A = A = = = = = C ? = = = G = = C = = = = = = A = = A T G T ? = A = A ? G = D = C = = = D = = = = = A = I = = = = = A = = C 0 D016 G = = = = = = = = = (G) = = = = = T T = = = = = G = = C C = = = G G = = T = = I C = G G = = D ? ? = = G = = A C G = = = = G = A = = = = = = = = = (A) = = = = = C G = = = = = A = = A T = = = A A = = C = = D T = C A = = I ? ? = = A = = G T A = = = = A = 0 D033 G = G = = = = = = = = = = = = = T T = = = = = G = = C C C G ? = G = T ? = = I = = G G = I D = = = = G = = = = G = = = = G = A = A = = = = = = = = = = = = = C G = = = = = A = = A T G T ? = A = A ? = = D = = C A = D I = = = = A = = = = A = = = = A = 0 D034 G = = = = D = = = = G = = = T = T T = = I = = G = = C = = = = G = = = = = I = C = = = = = = D I = = = = = = C = = = = = A = A = = = = I = = = = A = = = C = C G = = D = = A = = A = = = = A = = = = = D = T = = = = = = I D = = = = = = T = = = = = G = 0 D035 = = = = = = = = = = G = = = = T = = C = = C = = A T = = = = = = A = = C = = = = = C A C = = = = A = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = C = = T = = T = = G A = = = = = = G = = T = = = = = G G G = = = = G = G = = = = = = = = = = = 0 D036 = = = G = = = C = = G = = = = T T T C D = C = G A T C C = = = G = = = = = = I C = = = C = = D = A T = G = = C = = A = C A = = = = T = = = T = = A = = = = C C G T I = T = A G A A T = = = A = = = = = = D T = = = G = = I = G C = A = = T = = G = A G = 0 D037 ? ? ? ? ? ? = = = G = = = G = = ? T = = = = = = = = = = = = = = = = = T = ? ? = = G G = = D = = = = = = = = = G = = = = G = ? ? ? ? ? ? = = = A = = = C = = ? G = = = = = = = = = = = = = = = = = C = ? ? = = C A = = I = = = = = = = = = A = = = = A = 0 D038 G = = = = = = = = = = = = = T = T = = = I = G G = = C = = = C G = G = = = I = C = = = = = = D I = = = = (D) = C = = = = = A = A = = = = = = = = = = = = = C = C = = = D = A A = = A = = = A A = A = = = D = T = = = = = = I D = = = = (I) = T = = = = = G = 0 D039 G = = = = = ? ? ? = G = = = = T = T C = = C = = A T = = = = = = A = = = = = = = = = = C = = = = A = A = = = = = = = = = = C A = = = = = ? ? ? = A = = = = C = G T = = T = = G A = = = = = = G = = = = = = = = = = G = = = = G = G = = = = = = = = = = T 0 D040 (G) = = (G) = = = = = = (G) = = = = = = (G) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (A) ? ? ? (A) = = (T) = = = = = = (A) = = = = = = (T) = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = (T) ? ? ? 0 E001 = = = = = = = = C A = C G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = C = = = = = = = = T G = A C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = T 0 E002 = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = 0 E003 = = = G = = = C T = = = ? ? = = T = ? D = = = G = = C C = = = G G = = = A = I C A = = = ? ? D = = T G G D = C = = A = C A T = = = T = = = T C = = = ? ? = = C = ? I = = = A = = A T = = = A A = = = G = D T C = = = ? ? I = = C A A I = T = = G = A G C 0 E004 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = 0 E005 = G = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A ? = = A = = = = = = = = = = = D = = = G = = = = T = C = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G ? = = C = = = = = = = = = = = I = = = A = = = = C 0 E006 = = = = = = = = C A ? ? G = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = T G ? ? C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = T 0 E007 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E008 = = = = = = = = = = = = = G = = C = = I = = = A = = A T = = = A A = = = G = D T C = = = = = I = = C A A = = T = = G = A G ? = = = = = = = = = = = = = C = = T = = D = = = G = = C C = = = G G = = = A = I C A = = = = = D = = T G G = = C = = A = C A ? 0 E009 = = = = = = = = C A = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = C = = = = = = = = T G = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = T 0 E010 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = 0 E011 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E012 = = = = = = = = C = = = = G = = = T = = = = = = = = = T = = = = A = = = G = D = C = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = C = = = = = = = = T = = = = C = = = G = = = = = = = = = C = = = = G = = = A = I = A = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = T 0 E013 = = = G = = = C T = = = = C = = T = = D = = = G = = C C = = = G G = = = A = I C A = = = = = D = = T G = D = C = G A = C A T = = = T = = = T C = = = = G = = C = = I = = = A = = A T = = = A A = = = G = D T C = = = = = I = = C A = I = T = A G = A G C 0 E014 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E015 = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E016 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0 E017 = = = G = = = C = A = = ? ? = = T = ? D = = = G = = C C = = = ? G = = = = = I C = = = = = = D = = T G G = = C = = A = C A = = = = T = = = T = G = = ? ? = = C = ? I = = = A = = A T = = = ? A = = = = = D T = = = = = = I = = C A A = = T = = G = A G = 0 E018 = = = = = = = = = = = = C = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = T = = = = = = = = = = = = G = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = C 0 E019 = = = G = = = C = A = C G C = = T = = D = = = G ? ? ? ? ? = = G G = = = = = I C = = = = ? ? D = = T G G = = C = = A = C A = = = = T = = = T = G = A C G = = C = = I = = = A ? ? ? ? ? = = A A = = = = = D T = = = = ? ? I = = C A A = = T = = G = A G = 0 E020 = G = = A = = = T ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = T = C = = G = = = C ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = C 0 E021 = G = = = = = = T = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = A = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = T = C = = = = = = C = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = C = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = C 0 E022 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = A = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = G = = = = = 0 E023 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = I = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = D = = = = = = = = = END BESTPAIRS2 Phase probabilities at each site with phase known positions indicated by = and missing data positions indicated by ? BEGIN PHASEPROBS ? ? = = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = = ? = = ? = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.97 ? ? ? ? = = ? ? = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = ? = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = ? = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = ? ? 1.00 1.00 = = = = = = = = 1.00 = ? ? ? ? ? = 1.00 = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = ? = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 ? = = = 1.00 ? = 1.00 = = = = = = 1.00 ? ? 1.00 = = ? = = = = = = = = = = = ? ? = = = = 0.73 = 1.00 1.00 ? ? ? ? = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = ? ? ? = = = = = = ? 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = = 0.91 = = 1.00 1.00 = = = = = 0.98 ? ? ? = 1.00 = = = = ? ? 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = = = 1.00 ? ? ? = = = = = = ? ? ? 1.00 1.00 0.87 = 1.00 = ? ? 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 ? ? = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = 1.00 = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.75 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = ? ? ? = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = 0.95 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = 0.97 = = 0.97 = = = 0.97 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = = = = = = = 1.00 ? ? ? 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = 0.51 = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 ? = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 = 1.00 ? 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 0.98 = = = = = = = = = 0.59 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 ? ? = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 0.99 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 ? = 1.00 = 1.00 ? = = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = = = = 1.00 1.00 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = = = = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 = = = 1.00 = = = = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = ? ? ? ? ? ? = = = 1.00 = = = 1.00 = = ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = ? ? = = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 0.99 = = = = = = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 0.91 = = = = 0.62 = 1.00 = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = ? ? ? = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 0.64 = = 0.62 = = = = = = 0.79 = = = = = = 0.86 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 0.86 ? ? ? = = = = = = = = 1.00 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = ? ? = = 1.00 = ? 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 1.00 = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 ? = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 0.99 = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 1.00 ? ? 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 ? = = = = = = = = 1.00 1.00 = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = = 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = 1.00 1.00 = = = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = 1.00 = 1.00 = 0.97 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = = ? ? = = 1.00 = ? 1.00 = = = 1.00 = = 1.00 1.00 = = = ? 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = = = 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = = = = = = = = = = = = 0.99 = = = = = = = = = = = ? ? ? ? ? = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = 1.00 = 1.00 = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 ? ? ? ? ? = = 1.00 1.00 = = = = = 1.00 1.00 = = = = ? ? 1.00 = = 1.00 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = 1.00 1.00 = = 1.00 = = 1.00 = = = 1.00 ? ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = 1.00 = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = 1.00 = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = ? ? = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = 1.00 = = = = = = = = = END PHASEPROBS