Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000110 AA 2 0 2 AG 10 0 10 GG 9 23 32 0.107 0.000 0.998 000190 CC 0 1 1 CG 0 3 3 GG 21 19 40 0.000 2.457 5.825 000201 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 23 43 0.112 0.000 0.052 000431 GG 20 19 39 GT 3 4 7 TT 0 0 0 0.112 0.209 0.312 000512 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 000514 AA 23 21 44 AG 0 1 1 GG 0 1 1 0.000 9.521 19.761 000544 -- 0 0 0 +- 4 0 4 ++ 19 23 42 0.209 0.000 0.095 000584 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 21 23 44 0.048 0.000 0.023 000673 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 000765 AA 18 23 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.006 000884 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 17 23 40 0.059 0.000 0.025 000973 CC 17 19 36 CT 2 4 6 TT 0 0 0 0.059 0.209 0.249 001047 GG 18 23 41 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 001105 CC 16 4 20 CT 3 9 12 TT 0 10 10 0.140 0.591 6.528 001131 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 18 23 41 0.014 0.000 0.006 001832 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 22 44 0.011 0.000 0.006 001893 AA 1 1 2 AG 7 5 12 GG 14 16 30 0.011 0.499 0.306 001926 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 21 44 0.000 0.012 0.006 002288 AA 9 21 30 AG 9 0 9 GG 2 0 2 0.013 0.000 1.288 002336 CC 19 20 39 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.013 0.000 0.006 002370 AA 19 18 37 AC 1 2 3 CC 0 1 1 0.013 4.203 5.344 002405 AA 19 19 38 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.013 0.000 0.007 002638 AA 15 14 29 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.017 0.000 0.009 003309 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 003761 AA 23 20 43 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 004115 CC 19 14 33 CG 2 4 6 GG 0 1 1 0.053 0.825 1.111 004214 CC 3 15 18 CG 5 4 9 GG 14 0 14 3.414 0.263 12.709 004478 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 006837 AA 22 23 45 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.022 007203 CC 1 0 1 CT 2 0 2 TT 20 23 43 4.707 0.000 10.478 007341 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 007565 CC 17 22 39 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.131 0.000 0.058 007872 AA 22 21 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 007881 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 22 21 43 0.000 0.012 0.006 008015 CC 2 0 2 CT 10 5 15 TT 9 17 26 0.107 0.362 0.008 008319 GG 23 22 45 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 008335 GG 10 22 32 GT 12 1 13 TT 1 0 1 1.239 0.011 0.058 008772 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 21 41 0.198 0.000 0.097 008811 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 18 39 0.012 0.000 0.006 008941 -- 23 17 40 +- 1 5 6 ++ 0 0 0 0.011 0.362 0.224 009128 -- 1 0 1 +- 2 0 2 ++ 21 22 43 4.959 0.000 10.478 009306 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 23 43 0.198 0.000 0.093 009362 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 009369 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 009371 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 009481 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 009572 AA 2 0 2 AG 10 5 15 GG 12 18 30 0.002 0.342 0.005 009577 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 009737 CC 23 20 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 009743 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 009886 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 21 40 0.209 0.000 0.100 009909 AA 19 21 40 AT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.100 009957 AA 2 0 2 AC 10 4 14 CC 11 17 28 0.017 0.233 0.022 010109 CC 8 16 24 CT 8 5 13 TT 7 0 7 2.112 0.383 4.104 010211 CC 20 21 41 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.055 010241 GG 20 23 43 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 010244 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 010315 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 010397 AA 20 21 41 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.012 0.048 0.055 010640 AA 21 22 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 010919 AA 18 22 40 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.124 0.000 0.056 011079 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011252 AA 2 0 2 AG 6 4 10 GG 16 18 34 1.407 0.220 1.141 012604 AA 8 0 8 AG 11 6 17 GG 5 17 22 0.114 0.517 1.998 012635 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 012982 AA 0 0 0 AT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 013058 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 013125 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 013230 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 19 23 42 0.013 0.000 0.006 013449 CC 15 23 38 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.408 0.000 0.164 013695 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 014407 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 20 23 43 0.012 0.000 0.006 015131 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 015240 AA 0 8 8 AG 3 11 14 GG 21 4 25 0.107 0.004 4.651 015663 -- 17 22 39 +- 5 0 5 ++ 0 0 0 0.362 0.000 0.160 016041 -- 6 0 6 +- 8 6 14 ++ 7 17 24 1.173 0.517 2.445 016423 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 21 22 43 0.000 0.011 0.006 016487 CC 23 21 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016543 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 016657 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 21 43 0.000 0.012 0.006 016940 CC 16 18 34 CT 6 5 11 TT 2 0 2 1.407 0.342 0.763 017551 AA 0 8 8 AC 5 11 16 CC 19 4 23 0.324 0.004 2.751 017625 CC 18 23 41 CG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.218 017710 AA 18 23 41 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.218 017755 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 018171 -- 0 0 0 +- 4 0 4 ++ 20 21 41 0.198 0.000 0.097 018453 AA 19 21 40 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.053 0.000 0.025 018494 -- 0 0 0 +- 5 0 5 ++ 18 21 39 0.342 0.000 0.160 018582 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 018686 -- 14 18 32 +- 5 5 10 ++ 2 0 2 1.802 0.342 0.998 018721 -- 19 23 42 +- 3 0 3 ++ 0 0 0 0.118 0.000 0.054 019032 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 019424 CC 0 0 0 CT 2 5 7 TT 22 18 40 0.045 0.342 0.304 019540 CC 23 21 44 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 019578 CC 23 22 45 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 019685 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 23 22 45 0.000 0.011 0.006 020036 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 020580 AA 7 0 7 AG 10 6 16 GG 4 17 21 0.016 0.517 1.602 020784 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 22 21 43 0.000 0.012 0.006 021084 AA 0 0 0 AG 2 4 6 GG 22 19 41 0.045 0.209 0.218 021225 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 022168 -- 0 6 6 +- 4 10 14 ++ 20 7 27 0.198 0.381 3.072 022641 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 023576 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 023581 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 23 22 45 0.011 0.011 0.022 023691 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 024224 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 024253 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 024324 CC 16 18 34 CT 6 5 11 TT 2 0 2 1.407 0.342 0.763 024595 AA 20 23 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.052 024775 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 024800 AA 23 19 42 AG 0 4 4 GG 0 0 0 0.000 0.209 0.095 024845 AA 20 17 37 AG 3 5 8 GG 0 0 0 0.112 0.362 0.428 025095 AA 1 0 1 AT 5 0 5 TT 18 23 41 0.644 0.000 2.448 025172 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 025305 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 025514 AA 23 21 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 025682 AA 0 0 0 AC 2 5 7 CC 20 18 38 0.050 0.342 0.320 025725 AA 11 18 29 AG 10 5 15 GG 1 0 1 0.468 0.342 0.347 025731 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 20 23 43 0.050 0.000 0.023 026137 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 22 22 44 0.000 0.011 0.006 026251 CC 16 4 20 CT 6 10 16 TT 0 8 8 0.548 0.079 2.020 026458 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 9 13 22 0.000 0.019 0.011 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000544: G 001832: attt 008941: CTGT 009128: atttt 009371: tatg 015663: T 016041: T 016423: C 018171: ATTT 018494: TAAT 018686: at 018721: AG 019685: TG 020784: T 022168: A 026137: cat