Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000110 A 0.33 0.00 0.16 G 0.67 1.00 0.84 0.44 0.00 0.27 000190 C 0.00 0.11 0.06 G 1.00 0.89 0.94 0.00 0.19 0.11 000201 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 000431 T 0.07 0.09 0.08 G 0.93 0.91 0.92 0.12 0.16 0.14 000512 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000514 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 000544 - 0.09 0.00 0.04 + 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 000584 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000673 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000765 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000884 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 000973 T 0.05 0.09 0.07 C 0.95 0.91 0.93 0.10 0.16 0.13 001047 T 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001105 T 0.08 0.63 0.38 C 0.92 0.37 0.62 0.15 0.47 0.47 001131 A 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001832 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001893 A 0.20 0.16 0.18 G 0.80 0.84 0.82 0.33 0.27 0.30 001926 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002288 G 0.33 0.00 0.16 A 0.68 1.00 0.84 0.44 0.00 0.27 002336 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002370 C 0.03 0.10 0.06 A 0.97 0.90 0.94 0.05 0.17 0.11 002405 C 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 002638 G 0.03 0.00 0.02 A 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 003309 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003761 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 004115 G 0.05 0.16 0.10 C 0.95 0.84 0.90 0.09 0.27 0.18 004214 G 0.75 0.11 0.45 C 0.25 0.89 0.55 0.38 0.19 0.50 004478 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006837 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007203 C 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 007341 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007565 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.14 0.00 0.07 007872 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007881 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008015 C 0.33 0.11 0.22 T 0.67 0.89 0.78 0.44 0.20 0.34 008319 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008335 T 0.30 0.02 0.16 G 0.70 0.98 0.84 0.42 0.04 0.27 008772 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008811 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008941 + 0.02 0.11 0.07 - 0.98 0.89 0.93 0.04 0.20 0.12 009128 - 0.08 0.00 0.04 + 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 009306 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 009362 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009369 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009371 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009481 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009572 A 0.29 0.11 0.20 G 0.71 0.89 0.80 0.41 0.19 0.32 009577 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009737 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 009743 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009886 A 0.09 0.00 0.05 G 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 009909 T 0.09 0.00 0.05 A 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 009957 A 0.30 0.10 0.20 C 0.70 0.90 0.80 0.42 0.17 0.33 010109 T 0.48 0.12 0.31 C 0.52 0.88 0.69 0.50 0.21 0.43 010211 G 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 010241 T 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 010244 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010315 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010397 G 0.02 0.04 0.03 A 0.98 0.96 0.97 0.05 0.08 0.07 010640 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010919 C 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 011079 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011252 A 0.21 0.09 0.15 G 0.79 0.91 0.85 0.33 0.17 0.26 012604 A 0.56 0.13 0.35 G 0.44 0.87 0.65 0.49 0.23 0.46 012635 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012982 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013058 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 013125 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013230 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 013449 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 013695 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014407 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 015131 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015240 A 0.06 0.59 0.32 G 0.94 0.41 0.68 0.12 0.48 0.43 015663 + 0.11 0.00 0.06 - 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 016041 - 0.48 0.13 0.30 + 0.52 0.87 0.70 0.50 0.23 0.42 016423 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016487 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016543 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016657 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016940 T 0.21 0.11 0.16 C 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 017551 A 0.10 0.59 0.34 C 0.90 0.41 0.66 0.19 0.48 0.45 017625 G 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 017710 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 017755 C 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 018171 - 0.08 0.00 0.04 + 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 018453 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 018494 - 0.11 0.00 0.06 + 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 018582 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018686 + 0.21 0.11 0.16 - 0.79 0.89 0.84 0.34 0.19 0.27 018721 + 0.07 0.00 0.03 - 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 019032 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 019424 C 0.04 0.11 0.07 T 0.96 0.89 0.93 0.08 0.19 0.14 019540 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019578 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019685 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020036 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020580 A 0.57 0.13 0.34 G 0.43 0.87 0.66 0.49 0.23 0.45 020784 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021084 A 0.04 0.09 0.06 G 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 021225 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022168 - 0.08 0.48 0.28 + 0.92 0.52 0.72 0.15 0.50 0.40 022641 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023576 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 023581 C 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 023691 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024224 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 024253 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 024324 T 0.21 0.11 0.16 C 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 024595 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 024775 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024800 G 0.00 0.09 0.04 A 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 024845 G 0.07 0.11 0.09 A 0.93 0.89 0.91 0.12 0.20 0.16 025095 A 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 025172 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 025305 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 025514 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 025682 A 0.05 0.11 0.08 C 0.95 0.89 0.92 0.09 0.19 0.14 025725 G 0.27 0.11 0.19 A 0.73 0.89 0.81 0.40 0.19 0.31 025731 A 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 026137 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 026251 T 0.14 0.59 0.36 C 0.86 0.41 0.64 0.24 0.48 0.46 026458 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.07 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000544: G 001832: attt 008941: CTGT 009128: atttt 009371: tatg 015663: T 016041: T 016423: C 018171: ATTT 018494: TAAT 018686: at 018721: AG 019685: TG 020784: T 022168: A 026137: cat