Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000138 G 0.13 0.28 0.21 A 0.87 0.72 0.79 0.23 0.41 0.33 000248 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000305 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000987 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001175 * 001533 A 0.06 0.07 0.06 C 0.94 0.93 0.94 0.10 0.13 0.12 001612 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 001614 C 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001851 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 001930 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001953 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002114 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003698 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003760 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003889 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003968 C 0.44 0.41 0.43 T 0.56 0.59 0.57 0.49 0.48 0.49 004195 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004417 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004534 G 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 005093 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005122 + 0.10 0.28 0.19 - 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 005137 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005173 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005223 T 0.06 0.28 0.17 C 0.94 0.72 0.83 0.12 0.41 0.28 005263 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005359 T 0.06 0.28 0.17 C 0.94 0.72 0.83 0.12 0.41 0.28 005505 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005537 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005900 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 006147 G 0.10 0.28 0.19 A 0.90 0.72 0.81 0.17 0.41 0.31 006525 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006577 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.05 007118 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 007141 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007428 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 007508 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 007880 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 008116 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008129 C 0.10 0.26 0.18 T 0.90 0.74 0.82 0.19 0.39 0.29 008213 A 0.10 0.26 0.18 C 0.90 0.74 0.82 0.19 0.39 0.29 008331 G 0.10 0.26 0.18 C 0.90 0.74 0.82 0.19 0.39 0.29 008454 T 0.06 0.26 0.16 C 0.94 0.74 0.84 0.12 0.39 0.26 008773 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008895 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009039 A 0.18 0.07 0.13 G 0.82 0.93 0.87 0.30 0.13 0.22 009569 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009733 A 0.07 0.26 0.16 T 0.93 0.74 0.84 0.12 0.39 0.27 009769 C 0.11 0.28 0.20 T 0.89 0.72 0.80 0.19 0.41 0.31 010761 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010880 A 0.06 0.30 0.17 G 0.94 0.70 0.83 0.12 0.42 0.29 011147 G 0.11 0.30 0.20 A 0.89 0.70 0.80 0.20 0.42 0.32 011198 C 0.07 0.30 0.18 G 0.93 0.70 0.82 0.13 0.42 0.29 011324 A 0.07 0.30 0.18 G 0.93 0.70 0.82 0.13 0.42 0.29 011534 C 0.10 0.27 0.18 T 0.90 0.73 0.82 0.19 0.40 0.30 011537 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011639 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011650 T 0.10 0.27 0.18 A 0.90 0.73 0.82 0.19 0.40 0.30 012305 + 0.10 0.27 0.18 - 0.90 0.73 0.82 0.19 0.40 0.30 012435 - 0.09 0.28 0.19 + 0.91 0.72 0.81 0.17 0.41 0.31 012571 C 0.12 0.28 0.20 A 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 012576 G 0.12 0.28 0.20 A 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 012715 + 0.09 0.00 0.05 - 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 013106 T 0.07 0.26 0.16 C 0.93 0.74 0.84 0.12 0.39 0.27 013607 T 0.10 0.28 0.19 C 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 013611 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013647 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013659 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014147 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014255 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014409 A 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 014514 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014526 C 0.10 0.28 0.19 A 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 014545 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014634 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 015012 C 0.10 0.28 0.19 T 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 015316 G 0.10 0.28 0.19 A 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 015319 T 0.10 0.28 0.19 A 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 015525 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015534 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015694 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016030 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016185 A 0.11 0.28 0.20 G 0.89 0.72 0.80 0.20 0.41 0.32 016252 + 0.41 0.13 0.27 - 0.59 0.87 0.73 0.48 0.23 0.39 016816 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016968 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017116 T 0.23 0.28 0.26 C 0.77 0.72 0.74 0.35 0.41 0.38 017191 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017327 A 0.06 0.07 0.06 G 0.94 0.93 0.94 0.12 0.12 0.12 017336 G 0.23 0.28 0.26 A 0.77 0.72 0.74 0.35 0.41 0.38 017360 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017793 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017889 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018027 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018141 - 0.08 0.28 0.18 + 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 018262 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018374 C 0.10 0.04 0.07 T 0.90 0.96 0.93 0.19 0.08 0.14 018459 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018460 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018605 T 0.12 0.28 0.20 C 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 018701 A 0.12 0.28 0.20 T 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 018723 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018841 G 0.08 0.28 0.18 T 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 019085 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019123 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019260 C 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019361 C 0.08 0.28 0.18 T 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 019385 C 0.12 0.28 0.20 T 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 019516 C 0.12 0.28 0.20 T 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 019651 C 0.12 0.28 0.20 T 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 019778 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 019838 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019850 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019942 - 0.08 0.28 0.18 + 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 020037 G 0.24 0.28 0.26 A 0.76 0.72 0.74 0.36 0.41 0.39 020445 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020488 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020754 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020877 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021132 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021156 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021195 C 0.25 0.28 0.27 T 0.75 0.72 0.73 0.38 0.41 0.39 021234 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 021235 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021551 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021833 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021972 C 0.12 0.28 0.20 T 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 021984 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022069 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022142 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022279 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 022306 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022384 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 022452 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 022654 T 0.11 0.28 0.20 C 0.89 0.72 0.80 0.19 0.41 0.31 022850 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 022881 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022919 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 023671 T 0.03 0.05 0.04 C 0.97 0.95 0.96 0.05 0.09 0.07 023866 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023992 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024038 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024198 G 0.09 0.29 0.18 C 0.91 0.71 0.82 0.16 0.41 0.30 024355 T 0.08 0.28 0.18 C 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 024410 - 0.09 0.28 0.19 + 0.91 0.72 0.81 0.17 0.41 0.31 024594 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024710 G 0.23 0.28 0.26 A 0.77 0.72 0.74 0.35 0.41 0.38 025026 G 0.23 0.28 0.26 A 0.77 0.72 0.74 0.35 0.41 0.38 025039 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 025073 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 025098 C 0.23 0.28 0.26 T 0.77 0.72 0.74 0.35 0.41 0.38 025165 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 025263 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 025373 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025431 T 0.08 0.28 0.18 C 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 025468 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 025581 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 025920 T 0.07 0.30 0.18 C 0.93 0.70 0.82 0.13 0.42 0.29 026041 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 027763 A 0.08 0.28 0.18 G 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 027858 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 027956 + 0.12 0.28 0.20 - 0.88 0.72 0.80 0.22 0.41 0.32 029049 T 0.09 0.00 0.05 C 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 029290 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 029391 T 0.09 0.28 0.17 C 0.91 0.72 0.83 0.16 0.40 0.29 029544 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 029935 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030009 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030147 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 030324 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 030461 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030701 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 030896 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 031185 A 0.12 0.26 0.19 G 0.88 0.74 0.81 0.21 0.39 0.31 031189 C 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 031347 C 0.12 0.26 0.19 T 0.88 0.74 0.81 0.21 0.39 0.31 031404 G 0.12 0.29 0.20 A 0.88 0.71 0.80 0.21 0.41 0.32 031878 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 032026 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 032155 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 032226 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032234 G 0.23 0.28 0.25 A 0.77 0.72 0.75 0.35 0.40 0.38 032337 A 0.08 0.28 0.17 G 0.92 0.72 0.83 0.15 0.40 0.28 032697 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 032743 T 0.08 0.28 0.17 C 0.92 0.72 0.83 0.15 0.40 0.28 032874 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 033106 T 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.20 0.00 0.10 033209 T 0.08 0.13 0.11 C 0.92 0.87 0.89 0.15 0.23 0.19 034895 - 0.08 0.30 0.18 + 0.92 0.70 0.82 0.15 0.42 0.30 035264 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 035424 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035699 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035821 G 0.45 0.43 0.44 A 0.55 0.57 0.56 0.50 0.49 0.49 035927 A 0.02 0.07 0.05 G 0.98 0.93 0.95 0.04 0.13 0.09 035960 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036185 A 0.02 0.07 0.05 G 0.98 0.93 0.95 0.04 0.13 0.09 036380 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 036728 * 036731 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 036928 A 0.02 0.07 0.04 T 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 036963 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 037002 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 037046 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037087 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 037419 T 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 037642 + 0.02 0.02 0.02 - 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 037649 C 0.25 0.33 0.29 T 0.75 0.67 0.71 0.38 0.44 0.41 037779 G 0.46 0.50 0.48 A 0.54 0.50 0.52 0.50 0.50 0.50 037863 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 037882 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 037911 A 0.46 0.50 0.48 G 0.54 0.50 0.52 0.50 0.50 0.50 038314 A 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 038342 G 0.13 0.21 0.17 C 0.87 0.79 0.83 0.23 0.33 0.28 038480 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 038660 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.14 0.00 0.07 038941 + 0.16 0.29 0.22 - 0.84 0.71 0.78 0.27 0.41 0.34 038987 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039539 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 039626 + 0.45 0.35 0.40 - 0.55 0.65 0.60 0.50 0.45 0.48 039741 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 039866 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 040001 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 040092 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 040117 T 0.31 0.14 0.22 C 0.69 0.86 0.78 0.43 0.24 0.34 040122 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 040124 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 040149 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 040168 C 0.10 0.32 0.21 T 0.90 0.68 0.79 0.17 0.43 0.33 040395 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 040420 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 040527 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 040601 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 040754 T 0.31 0.25 0.28 C 0.69 0.75 0.72 0.43 0.38 0.40 040756 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 040818 A 0.12 0.22 0.17 G 0.88 0.78 0.83 0.22 0.34 0.29 041133 G 0.04 0.07 0.05 A 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 041191 G 0.46 0.43 0.45 A 0.54 0.57 0.55 0.50 0.49 0.49 041627 - 0.46 0.39 0.42 + 0.54 0.61 0.58 0.50 0.47 0.49 041705 + 0.09 0.28 0.18 - 0.91 0.72 0.82 0.16 0.41 0.30 041824 + 0.20 0.13 0.16 - 0.80 0.87 0.84 0.31 0.23 0.27 041841 G 0.14 0.28 0.21 A 0.86 0.72 0.79 0.24 0.41 0.33 042004 A 0.06 0.22 0.14 C 0.94 0.78 0.86 0.12 0.34 0.24 042068 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042294 C 0.33 0.41 0.37 T 0.67 0.59 0.63 0.44 0.48 0.47 042349 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 042451 T 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 042539 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042579 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042809 G 0.35 0.41 0.38 C 0.65 0.59 0.62 0.46 0.48 0.47 042959 + 0.08 0.00 0.04 - 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 043086 C 0.35 0.41 0.38 T 0.65 0.59 0.62 0.46 0.48 0.47 043158 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043324 C 0.36 0.42 0.39 T 0.64 0.57 0.61 0.46 0.49 0.48 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 005122: AG 012305: gagg 012435: AGAG 012715: C 014545: AG 016252: TGCTGGGCGAGCCGTG 018141: AG 019942: TCATAAAAGCCATAATAGTTGCT 021833: CAAAA 024410: GCATTTCTGCGGTGCACAGAGCTAGTCGCT 027956: G 031878: c 032026: C 032874: ag 034895: GTCCCGTCTTCCCTTC 037642: C 037882: GAGGATGGG 038941: TT 039626: A 040527: C 040601: ATAATT 041627: GG 041705: AG 041824: A 042959: CCCATCCCT 043158: TTG Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 001175 C 0.04 0.00 0.02 G 0.17 0.28 0.22 A 0.79 0.72 0.76 036728 C 0.04 0.00 0.02 A 0.04 0.09 0.06 G 0.92 0.91 0.91