Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000574 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 000685 T 0.46 0.00 0.23 C 0.54 1.00 0.77 0.50 0.00 0.36 000718 C 0.15 0.59 0.36 G 0.85 0.41 0.64 0.25 0.48 0.46 000945 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000947 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001596 T 0.10 0.32 0.21 G 0.90 0.68 0.79 0.19 0.43 0.33 001625 G 0.46 0.00 0.23 A 0.54 1.00 0.77 0.50 0.00 0.36 001823 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 002241 G 0.40 0.55 0.47 A 0.60 0.45 0.53 0.48 0.49 0.50 002547 G 0.43 0.00 0.21 A 0.57 1.00 0.79 0.49 0.00 0.33 002608 C 0.45 0.00 0.22 T 0.55 1.00 0.78 0.50 0.00 0.35 002890 T 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002991 * 003047 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003443 T 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 003802 C 0.06 0.07 0.06 G 0.94 0.93 0.94 0.12 0.12 0.12 003975 A 0.06 0.07 0.06 G 0.94 0.93 0.94 0.12 0.12 0.12 003976 A 0.06 0.07 0.06 C 0.94 0.93 0.94 0.12 0.12 0.12 004071 A 0.15 0.59 0.36 G 0.85 0.41 0.64 0.25 0.48 0.46 004506 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005587 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005664 C 0.12 0.36 0.24 T 0.88 0.64 0.76 0.22 0.46 0.36 005749 A 0.21 0.07 0.14 G 0.79 0.93 0.86 0.33 0.13 0.24 005829 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006196 T 0.11 0.57 0.34 C 0.89 0.43 0.66 0.20 0.49 0.45 006201 G 0.11 0.57 0.34 A 0.89 0.43 0.66 0.20 0.49 0.45 006247 + 0.38 0.00 0.19 - 0.62 1.00 0.81 0.47 0.00 0.31 006410 T 0.13 0.52 0.32 C 0.87 0.48 0.68 0.23 0.50 0.43 006923 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006947 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007205 T 0.21 0.35 0.28 G 0.79 0.65 0.72 0.33 0.45 0.40 007299 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007429 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007518 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007776 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 008727 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 009145 G 0.02 0.02 0.02 A 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 009375 G 0.44 0.00 0.22 T 0.56 1.00 0.78 0.49 0.00 0.35 009410 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010126 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010186 T 0.14 0.00 0.07 C 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 010544 A 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 010718 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010736 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010841 T 0.08 0.35 0.21 C 0.92 0.65 0.79 0.15 0.45 0.33 011186 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 011327 T 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 011678 T 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 011839 G 0.42 0.43 0.43 C 0.58 0.57 0.57 0.49 0.49 0.49 012502 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012679 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013178 G 0.36 0.55 0.45 A 0.64 0.45 0.55 0.46 0.50 0.50 013281 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 013899 T 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 013900 T 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 015042 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 015475 T 0.20 0.00 0.10 C 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 015518 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015536 + 0.11 0.30 0.21 - 0.89 0.70 0.79 0.19 0.42 0.33 015549 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015660 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015799 G 0.27 0.00 0.14 A 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 015806 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016017 - 0.50 0.39 0.45 + 0.50 0.61 0.55 0.50 0.47 0.49 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 006247: t 015536: T 016017: CC Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 002991 A 0.00 0.02 0.01 G 0.07 0.00 0.03 C 0.93 0.98 0.96