Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000104 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000548 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 000868 T 0.31 0.02 0.16 C 0.69 0.98 0.84 0.43 0.04 0.27 001099 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001610 A 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.03 002523 + 0.07 0.03 0.05 - 0.93 0.97 0.95 0.13 0.06 0.10 002886 G 0.39 0.03 0.21 A 0.61 0.97 0.79 0.48 0.05 0.33 003101 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003233 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003255 C 0.37 0.40 0.39 T 0.63 0.60 0.61 0.47 0.48 0.47 003313 T 0.43 0.11 0.28 C 0.57 0.89 0.72 0.49 0.20 0.40 003492 - 0.17 0.46 0.33 + 0.82 0.54 0.67 0.29 0.50 0.44 003525 G 0.48 0.11 0.28 A 0.52 0.89 0.72 0.50 0.19 0.41 004008 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004055 C 0.36 0.11 0.22 A 0.64 0.89 0.78 0.46 0.20 0.34 004187 G 0.07 0.07 0.07 C 0.93 0.93 0.93 0.13 0.13 0.13 005014 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005433 G 0.09 0.09 0.09 A 0.91 0.91 0.91 0.16 0.16 0.16 006116 A 0.48 0.11 0.29 G 0.52 0.89 0.71 0.50 0.19 0.41 006132 G 0.48 0.11 0.29 A 0.52 0.89 0.71 0.50 0.19 0.41 006880 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008114 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008143 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008308 A 0.10 0.09 0.09 G 0.90 0.91 0.91 0.17 0.16 0.17 008412 G 0.21 0.46 0.34 A 0.79 0.54 0.66 0.34 0.50 0.45 008522 T 0.36 0.02 0.18 G 0.64 0.98 0.82 0.46 0.04 0.30 008773 T 0.31 0.47 0.39 C 0.69 0.53 0.61 0.43 0.50 0.48 009004 T 0.10 0.07 0.08 C 0.90 0.93 0.92 0.17 0.13 0.15 009064 T 0.33 0.43 0.38 C 0.67 0.57 0.62 0.44 0.49 0.47 009094 G 0.35 0.02 0.18 C 0.65 0.98 0.82 0.45 0.04 0.29 009335 - 0.21 0.42 0.32 + 0.79 0.57 0.68 0.34 0.49 0.43 009431 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009437 G 0.37 0.02 0.20 T 0.63 0.98 0.80 0.47 0.04 0.31 009959 + 0.09 0.10 0.09 - 0.91 0.90 0.91 0.17 0.17 0.17 009972 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009980 A 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 010034 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010189 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010701 T 0.13 0.09 0.11 C 0.87 0.91 0.89 0.23 0.16 0.19 010703 C 0.17 0.46 0.32 A 0.83 0.54 0.68 0.29 0.50 0.43 010713 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010878 G 0.22 0.02 0.12 A 0.78 0.98 0.88 0.34 0.04 0.21 011152 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011196 C 0.29 0.43 0.36 T 0.71 0.57 0.64 0.41 0.49 0.46 012354 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012428 - 0.20 0.02 0.11 + 0.80 0.98 0.89 0.31 0.04 0.19 012480 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012789 T 0.39 0.48 0.43 G 0.61 0.52 0.57 0.48 0.50 0.49 014132 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 014224 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 014939 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015208 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015746 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015747 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016657 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016904 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017031 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017677 C 0.05 0.00 0.03 T 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 018009 - 0.05 0.00 0.03 + 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 019256 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019384 A 0.03 0.15 0.09 G 0.97 0.85 0.91 0.05 0.26 0.17 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002523: G 003492: AA 009335: cct 009959: A 012428: g 018009: c