Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000118 G 0.58 0.36 0.46 A 0.42 0.64 0.54 0.49 0.46 0.50 000130 A 0.00 0.05 0.03 G 1.00 0.95 0.97 0.00 0.09 0.05 000356 T 0.07 0.02 0.05 C 0.93 0.98 0.95 0.14 0.04 0.09 000511 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000653 A 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 000685 A 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 001020 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001148 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 001684 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002066 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 002766 + 0.07 0.00 0.04 - 0.93 1.00 0.96 0.14 0.00 0.07 003299 C 0.50 0.48 0.49 G 0.50 0.52 0.51 0.50 0.50 0.50 004311 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 004584 G 0.08 0.00 0.05 A 0.92 1.00 0.95 0.15 0.00 0.09 004591 T 0.08 0.00 0.05 C 0.92 1.00 0.95 0.15 0.00 0.09 004914 T 0.48 0.11 0.30 C 0.52 0.89 0.70 0.50 0.19 0.42 005346 C 0.39 0.45 0.42 G 0.61 0.55 0.58 0.48 0.50 0.49 005814 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 005837 A 0.42 0.59 0.50 G 0.58 0.41 0.50 0.49 0.48 0.50 005901 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005931 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005958 A 0.40 0.50 0.45 T 0.60 0.50 0.55 0.48 0.50 0.49 006388 T 0.06 0.03 0.05 C 0.94 0.97 0.95 0.12 0.05 0.09 006553 G 0.08 0.05 0.07 C 0.92 0.95 0.93 0.15 0.10 0.13 006671 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 006874 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 006914 G 0.14 0.35 0.25 A 0.86 0.65 0.75 0.24 0.45 0.38 007777 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007798 A 0.29 0.38 0.33 G 0.71 0.62 0.67 0.41 0.47 0.44 008021 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 008085 C 0.50 0.37 0.44 G 0.50 0.63 0.56 0.50 0.47 0.49 008212 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008289 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008355 - 0.33 0.07 0.20 + 0.67 0.93 0.80 0.44 0.13 0.32 008660 G 0.15 0.30 0.22 A 0.85 0.70 0.78 0.25 0.42 0.34 008682 T 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 008820 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008948 A 0.07 0.02 0.04 G 0.93 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 009198 T 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 009289 C 0.07 0.30 0.19 T 0.93 0.70 0.81 0.13 0.42 0.31 009372 T 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 009381 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009407 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 009618 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010489 T 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 010589 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010817 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011003 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011103 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 011629 A 0.57 0.43 0.50 G 0.43 0.57 0.50 0.49 0.49 0.50 011991 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.21 0.00 0.11 012008 T 0.07 0.02 0.05 C 0.93 0.98 0.95 0.13 0.04 0.09 012846 G 0.56 0.39 0.49 A 0.44 0.61 0.51 0.49 0.48 0.50 012847 A 0.56 0.38 0.49 T 0.44 0.62 0.51 0.49 0.47 0.50 012920 C 0.35 0.35 0.35 T 0.65 0.65 0.65 0.45 0.46 0.45 012921 T 0.20 0.00 0.11 G 0.80 1.00 0.89 0.31 0.00 0.20 013004 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.12 013045 A 0.07 0.03 0.05 T 0.93 0.97 0.95 0.13 0.05 0.10 013222 A 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 013351 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013463 G 0.17 0.04 0.11 A 0.83 0.96 0.89 0.29 0.08 0.19 013469 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013573 A 0.04 0.28 0.16 G 0.96 0.72 0.84 0.08 0.41 0.27 013699 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013919 T 0.15 0.00 0.08 C 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 014045 A 0.21 0.00 0.10 G 0.79 1.00 0.90 0.33 0.00 0.18 014235 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 014331 A 0.03 0.03 0.03 G 0.97 0.97 0.97 0.05 0.05 0.05 014443 A 0.13 0.05 0.09 G 0.87 0.95 0.91 0.23 0.10 0.17 014459 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 014465 C 0.03 0.05 0.04 G 0.97 0.95 0.96 0.05 0.10 0.08 014466 A 0.05 0.26 0.16 G 0.95 0.74 0.84 0.10 0.39 0.27 014526 A 0.05 0.03 0.04 G 0.95 0.97 0.96 0.10 0.05 0.08 014976 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 015058 C 0.18 0.02 0.10 T 0.82 0.98 0.90 0.30 0.05 0.19 015121 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015127 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015158 C 0.50 0.33 0.41 T 0.50 0.67 0.59 0.50 0.44 0.49 015586 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015627 C 0.40 0.33 0.36 T 0.60 0.67 0.64 0.48 0.44 0.46 015688 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002066: G 002766: CGG 008355: GTGTCTGC