Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000154 CC 4 1 5 CG 9 7 16 GG 5 11 16 0.000 0.007 0.097 000423 CC 20 11 31 CT 2 7 9 TT 0 1 1 0.050 0.007 0.124 000508 CC 21 19 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 000700 CC 20 19 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 001576 CC 20 12 32 CT 4 10 14 TT 0 1 1 0.198 0.374 0.140 001745 CC 0 1 1 CT 3 9 12 TT 21 13 34 0.107 0.130 0.002 001750 CC 20 12 32 CG 4 10 14 GG 0 1 1 0.198 0.374 0.140 001751 CC 23 21 44 CG 1 1 2 GG 0 1 1 0.011 9.521 10.729 001925 GG 0 1 1 GT 3 9 12 TT 21 13 34 0.107 0.130 0.002 002018 AA 0 0 0 AC 3 5 8 CC 21 18 39 0.107 0.342 0.407 002021 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 002028 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 002040 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 23 45 0.045 0.000 0.022 002048 AA 0 1 1 AG 1 1 2 GG 23 21 44 0.011 9.521 10.729 002275 -- 4 8 12 +- 11 8 19 ++ 6 0 6 0.069 1.778 0.111 003682 CC 2 10 12 CT 11 10 21 TT 4 1 5 1.658 0.583 0.789 003846 AA 0 1 1 AG 1 3 4 GG 23 19 42 0.011 2.457 3.895 003903 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 003906 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 004346 AA 18 11 29 AG 5 4 9 GG 0 1 1 0.342 0.515 0.088 004378 AA 17 15 32 AG 5 3 8 GG 1 0 1 0.571 0.149 0.324 004888 -- 0 0 0 +- 3 4 7 ++ 15 7 22 0.149 0.543 0.546 005035 CC 10 6 16 CT 5 0 5 TT 0 1 1 0.600 7.000 0.499 005080 CC 12 6 18 CT 0 0 0 TT 0 1 1 0.000 7.000 19.000 005843 AA 20 18 38 AG 3 5 8 GG 0 0 0 0.112 0.342 0.417 005883 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 006227 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 006420 CC 15 19 34 CT 4 3 7 TT 1 0 1 0.930 0.118 0.698 007001 AA 23 20 43 AT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 007370 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 007482 CC 20 12 32 CT 4 8 12 TT 0 3 3 0.198 0.733 1.447 007865 CC 20 22 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 007880 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 21 21 42 0.048 0.000 0.024 008397 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 008413 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 008764 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 20 23 43 0.198 0.000 0.093 009537 CC 4 3 7 CT 10 11 21 TT 2 9 11 1.165 0.016 0.305 010363 GG 19 11 30 GT 2 9 11 TT 0 1 1 0.053 0.247 0.000 010374 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 21 41 0.012 0.000 0.006 010378 CC 20 21 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 010509 AA 18 20 38 AC 3 3 6 CC 1 0 1 2.296 0.112 1.407 010969 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 011190 AA 17 18 35 AG 4 4 8 GG 1 0 1 1.144 0.220 0.418 011317 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 011329 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 011530 -- 21 18 39 +- 3 5 8 ++ 0 0 0 0.107 0.342 0.407 011877 CC 19 19 38 CT 4 4 8 TT 1 0 1 1.361 0.209 0.516 011967 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 011983 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011993 CC 5 13 18 CT 13 9 22 TT 6 1 7 0.174 0.130 0.004 012724 AA 13 6 19 AC 7 6 13 CC 0 0 0 0.900 1.333 2.079 013093 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 22 44 0.000 0.011 0.006 013110 AA 0 0 0 AG 3 5 8 GG 19 18 37 0.118 0.342 0.428 013346 CC 19 18 37 CT 3 5 8 TT 0 0 0 0.118 0.342 0.428 013365 CC 18 13 31 CT 4 9 13 TT 0 1 1 0.220 0.130 0.072 013567 AA 19 19 38 AG 3 4 7 GG 0 0 0 0.118 0.209 0.320 013627 CC 4 1 5 CT 15 9 24 TT 5 13 18 1.526 0.130 0.527 014115 GG 0 1 1 GT 3 9 12 TT 21 13 34 0.107 0.130 0.002 014193 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 014194 AA 4 1 5 AG 15 9 24 GG 5 13 18 1.526 0.130 0.527 014852 CC 17 13 30 CT 7 9 16 TT 0 1 1 0.700 0.130 0.465 015309 CC 0 1 1 CT 4 1 5 TT 19 21 40 0.209 9.521 2.368 015792 AA 22 21 43 AG 1 1 2 GG 0 1 1 0.011 9.521 10.478 015935 CC 17 21 38 CT 6 1 7 TT 0 1 1 0.517 9.521 0.875 015996 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 016003 CC 0 1 1 CT 4 1 5 TT 19 21 40 0.209 9.521 2.368 016069 AA 0 1 1 AG 2 9 11 GG 21 13 34 0.048 0.130 0.010 016228 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 016260 CC 0 1 1 CT 6 10 16 TT 18 12 30 0.490 0.374 0.465 016385 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 24 20 44 0.000 0.112 0.051 016971 AA 1 0 1 AC 3 4 7 CC 19 19 38 2.457 0.209 0.875 017080 AA 3 1 4 AG 15 9 24 GG 4 13 17 2.954 0.130 1.207 017277 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 23 43 0.050 0.000 0.023 017460 CC 21 23 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 017644 -- 4 13 17 +- 15 9 24 ++ 3 1 4 2.954 0.130 1.207 017687 AA 0 1 1 AG 4 1 5 GG 19 21 40 0.209 9.521 2.368 017937 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 017977 CC 19 19 38 CT 4 4 8 TT 1 0 1 1.361 0.209 0.516 018199 CC 18 13 31 CT 6 9 15 TT 0 1 1 0.490 0.130 0.280 018223 CC 22 13 35 CT 2 9 11 TT 0 1 1 0.045 0.130 0.015 018690 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 18 21 39 0.055 0.000 0.026 018865 CC 5 12 17 CT 12 8 20 TT 3 1 4 0.900 0.053 0.294 019085 CC 16 17 33 CT 3 4 7 TT 1 0 1 1.976 0.233 0.654 019495 AA 22 13 35 AG 1 9 10 GG 0 1 1 0.011 0.130 0.080 019512 AA 3 1 4 AG 13 9 22 GG 7 13 20 0.631 0.130 0.358 019527 AA 21 18 39 AT 3 5 8 TT 0 0 0 0.107 0.342 0.407 019724 CC 19 18 37 CT 3 5 8 TT 0 0 0 0.118 0.342 0.428 020338 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 020353 CC 22 13 35 CT 2 9 11 TT 0 1 1 0.045 0.130 0.015 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002040: C 002275: GGTAGAGTCA 004888: A 007880: agctaa 011530: ggga 017644: cttta