Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000154 C 0.47 0.24 0.35 G 0.53 0.76 0.65 0.50 0.36 0.46 000423 T 0.05 0.24 0.13 C 0.95 0.76 0.87 0.09 0.36 0.23 000508 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000700 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001576 T 0.08 0.26 0.17 C 0.92 0.74 0.83 0.15 0.39 0.28 001745 C 0.06 0.24 0.15 T 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 001750 G 0.08 0.26 0.17 C 0.92 0.74 0.83 0.15 0.39 0.28 001751 G 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 001925 G 0.06 0.24 0.15 T 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 002018 A 0.06 0.11 0.09 C 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 002021 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002028 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002040 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002048 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 002275 + 0.55 0.25 0.42 - 0.45 0.75 0.58 0.50 0.38 0.49 003682 T 0.56 0.29 0.41 C 0.44 0.71 0.59 0.49 0.41 0.48 003846 A 0.02 0.11 0.06 G 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 003903 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003906 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004346 G 0.11 0.19 0.14 A 0.89 0.81 0.86 0.19 0.30 0.24 004378 G 0.15 0.08 0.12 A 0.85 0.92 0.88 0.26 0.15 0.21 004888 - 0.08 0.18 0.12 + 0.92 0.82 0.88 0.15 0.30 0.21 005035 T 0.17 0.14 0.16 C 0.83 0.86 0.84 0.28 0.24 0.27 005080 T 0.00 0.14 0.05 C 1.00 0.86 0.95 0.00 0.24 0.10 005843 G 0.07 0.11 0.09 A 0.93 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 005883 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006227 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006420 T 0.15 0.07 0.11 C 0.85 0.93 0.89 0.26 0.13 0.19 007001 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 007370 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007482 T 0.08 0.30 0.19 C 0.92 0.70 0.81 0.15 0.42 0.31 007865 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007880 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008397 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008413 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008764 A 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 009537 C 0.56 0.37 0.45 T 0.44 0.63 0.55 0.49 0.47 0.49 010363 T 0.05 0.26 0.15 G 0.95 0.74 0.85 0.09 0.39 0.26 010374 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 010378 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 010509 C 0.11 0.07 0.09 A 0.89 0.93 0.91 0.20 0.12 0.16 010969 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011190 G 0.14 0.09 0.11 A 0.86 0.91 0.89 0.24 0.17 0.20 011317 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011329 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011530 + 0.06 0.11 0.09 - 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 011877 T 0.12 0.09 0.11 C 0.88 0.91 0.89 0.22 0.16 0.19 011967 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011983 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011993 T 0.52 0.24 0.38 C 0.48 0.76 0.62 0.50 0.36 0.47 012724 C 0.17 0.25 0.20 A 0.82 0.75 0.80 0.29 0.38 0.32 013093 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013110 A 0.07 0.11 0.09 G 0.93 0.89 0.91 0.13 0.19 0.16 013346 T 0.07 0.11 0.09 C 0.93 0.89 0.91 0.13 0.19 0.16 013365 T 0.09 0.24 0.17 C 0.91 0.76 0.83 0.17 0.36 0.28 013567 G 0.07 0.09 0.08 A 0.93 0.91 0.92 0.13 0.16 0.14 013627 C 0.48 0.24 0.36 T 0.52 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 014115 G 0.06 0.24 0.15 T 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 014193 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014194 A 0.48 0.24 0.36 G 0.52 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 014852 T 0.15 0.24 0.19 C 0.85 0.76 0.81 0.25 0.36 0.31 015309 C 0.09 0.07 0.08 T 0.91 0.93 0.92 0.16 0.12 0.14 015792 G 0.02 0.07 0.04 A 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 015935 T 0.13 0.07 0.10 C 0.87 0.93 0.90 0.23 0.12 0.18 015996 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016003 C 0.09 0.07 0.08 T 0.91 0.93 0.92 0.16 0.12 0.14 016069 A 0.04 0.24 0.14 G 0.96 0.76 0.86 0.08 0.36 0.24 016228 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016260 C 0.12 0.26 0.19 T 0.88 0.74 0.81 0.22 0.39 0.31 016385 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 016971 A 0.11 0.09 0.10 C 0.89 0.91 0.90 0.19 0.16 0.18 017080 A 0.48 0.24 0.36 G 0.52 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 017277 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 017460 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017644 + 0.48 0.24 0.36 - 0.52 0.76 0.64 0.50 0.36 0.46 017687 A 0.09 0.07 0.08 G 0.91 0.93 0.92 0.16 0.12 0.14 017937 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017977 T 0.12 0.09 0.11 C 0.88 0.91 0.89 0.22 0.16 0.19 018199 T 0.12 0.24 0.18 C 0.88 0.76 0.82 0.22 0.36 0.30 018223 T 0.04 0.24 0.14 C 0.96 0.76 0.86 0.08 0.36 0.24 018690 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 018865 T 0.45 0.24 0.34 C 0.55 0.76 0.66 0.50 0.36 0.45 019085 T 0.12 0.10 0.11 C 0.88 0.90 0.89 0.22 0.17 0.20 019495 G 0.02 0.24 0.13 A 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.23 019512 A 0.41 0.24 0.33 G 0.59 0.76 0.67 0.48 0.36 0.44 019527 T 0.06 0.11 0.09 A 0.94 0.89 0.91 0.12 0.19 0.16 019724 T 0.07 0.11 0.09 C 0.93 0.89 0.91 0.13 0.19 0.16 020338 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020353 T 0.04 0.24 0.14 C 0.96 0.76 0.86 0.08 0.36 0.24 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002040: C 002275: GGTAGAGTCA 004888: A 007880: agctaa 011530: ggga 017644: cttta