Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000632 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 000990 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 001001 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 001041 C 0.39 0.00 0.23 T 0.61 1.00 0.77 0.47 0.00 0.35 001169 C 0.16 0.17 0.16 A 0.84 0.83 0.84 0.27 0.28 0.27 001401 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 001640 T 0.04 0.03 0.04 G 0.96 0.97 0.96 0.08 0.06 0.07 001643 A 0.25 0.00 0.14 G 0.75 1.00 0.86 0.38 0.00 0.24 001645 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002425 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002524 A 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 002923 G 0.15 0.26 0.21 A 0.85 0.74 0.79 0.26 0.39 0.33 003005 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003043 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003221 A 0.20 0.27 0.23 G 0.80 0.73 0.77 0.31 0.40 0.36 003437 C 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 003942 C 0.07 0.05 0.06 T 0.93 0.95 0.94 0.12 0.09 0.10 004111 C 0.50 0.29 0.40 T 0.50 0.71 0.60 0.50 0.41 0.48 004141 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 004850 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 005328 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 005586 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 005979 - 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: deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 005979: AATTTT 015578: g