Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000072 A 0.04 0.15 0.10 G 0.96 0.85 0.90 0.08 0.26 0.17 000194 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000261 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 000321 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000627 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001204 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 001328 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 001502 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 001545 C 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001950 + 0.07 0.00 0.03 - 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001964 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003217 A 0.17 0.35 0.26 G 0.83 0.65 0.74 0.28 0.45 0.38 004011 A 0.44 0.35 0.39 G 0.56 0.65 0.61 0.49 0.45 0.48 004194 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004235 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004239 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004683 + 0.08 0.00 0.04 - 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 004820 A 0.17 0.32 0.24 G 0.83 0.68 0.76 0.28 0.43 0.36 004872 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 005336 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 006890 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007145 T 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 007760 T 0.21 0.00 0.11 C 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 007848 G 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 008399 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008522 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 008967 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 009210 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009805 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009827 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009831 G 0.23 0.00 0.12 A 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 009854 G 0.22 0.00 0.11 C 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.19 009940 G 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.26 0.00 0.14 009997 G 0.20 0.38 0.29 A 0.80 0.62 0.71 0.32 0.47 0.41 010604 A 0.09 0.00 0.05 G 0.91 1.00 0.95 0.16 0.00 0.09 010684 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011047 A 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 012011 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012908 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013099 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013275 C 0.06 0.13 0.10 A 0.94 0.87 0.90 0.12 0.23 0.17 013461 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013984 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 014006 T 0.38 0.55 0.46 C 0.62 0.45 0.54 0.47 0.50 0.50 014257 T 0.06 0.02 0.04 C 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 014903 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015139 T 0.06 0.02 0.04 C 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 015160 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015415 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015752 G 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 016624 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016902 A 0.17 0.35 0.26 G 0.83 0.65 0.74 0.28 0.45 0.38 017174 A 0.24 0.45 0.34 G 0.76 0.55 0.66 0.36 0.50 0.45 017293 G 0.04 0.13 0.09 A 0.96 0.87 0.91 0.08 0.23 0.16 017354 G 0.40 0.37 0.38 A 0.60 0.63 0.62 0.48 0.47 0.47 017584 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 017845 A 0.00 0.08 0.04 G 1.00 0.92 0.96 0.00 0.15 0.08 018210 C 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 018295 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018662 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018709 A 0.04 0.14 0.09 T 0.96 0.86 0.91 0.08 0.24 0.16 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001950: TGG 004683: TTGCCTCCCC 008399: C 018662: GGT