Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000061 AA 18 23 41 AC 5 0 5 CC 1 0 1 0.644 0.000 2.448 000201 AA 24 20 44 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.112 0.051 000361 CC 0 1 1 CT 1 12 13 TT 21 9 30 0.012 1.455 0.088 000704 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 000729 AA 18 23 41 AT 6 0 6 TT 0 0 0 0.490 0.000 0.218 000744 GG 0 0 0 GT 5 0 5 TT 19 23 42 0.324 0.000 0.148 001041 AA 20 22 42 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.095 001113 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 24 19 43 0.000 0.118 0.052 001190 GG 0 0 0 GT 0 2 2 TT 23 20 43 0.000 0.050 0.023 001487 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 001610 CC 0 0 0 CT 9 0 9 TT 15 23 38 1.278 0.000 0.527 002137 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 17 14 31 0.015 0.000 0.008 008994 AA 0 0 0 AT 6 0 6 TT 18 22 40 0.490 0.000 0.224 009089 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 009281 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 009292 CC 1 4 5 CT 7 15 22 TT 16 4 20 0.044 2.130 0.084 009352 GG 0 0 0 GT 6 0 6 TT 18 23 41 0.490 0.000 0.218 009369 AA 0 0 0 AG 9 0 9 GG 15 23 38 1.278 0.000 0.527 011760 CC 22 17 39 CT 2 5 7 TT 0 0 0 0.045 0.362 0.312 011973 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 011993 -- 0 3 3 +- 1 11 12 ++ 22 8 30 0.011 0.065 1.250 012084 GG 14 22 36 GT 10 0 10 TT 0 0 0 1.662 0.000 0.684 012120 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 012329 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 012501 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 012576 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 012586 AA 22 16 38 AT 2 6 8 TT 0 0 0 0.045 0.548 0.417 012590 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 012591 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 012631 AA 18 16 34 AG 6 6 12 GG 0 0 0 0.490 0.548 1.035 012791 AA 0 0 0 AC 6 0 6 CC 18 22 40 0.490 0.000 0.224 012945 AA 23 19 42 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 013403 AA 0 2 2 AG 8 11 19 GG 16 9 25 0.960 0.279 0.473 014018 AA 0 0 0 AT 1 12 13 TT 23 10 33 0.011 3.094 1.246 014062 CC 23 10 33 CT 1 12 13 TT 0 0 0 0.011 3.094 1.246 014947 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 015341 AA 10 3 13 AG 11 11 22 GG 1 9 10 0.889 0.016 0.014 015589 AA 15 23 38 AG 9 0 9 GG 0 0 0 1.278 0.000 0.527 015665 AA 18 23 41 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.218 016291 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 016493 AA 0 0 0 AG 11 0 11 GG 13 23 36 2.121 0.000 0.826 016545 AA 15 23 38 AG 9 0 9 GG 0 0 0 1.278 0.000 0.527 016555 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 017189 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 20 20 40 0.012 0.012 0.025 017264 AA 20 21 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 017379 AA 20 9 29 AC 1 11 12 CC 0 1 1 0.012 1.068 0.034 019952 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 020027 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 020089 CC 0 3 3 CT 10 11 21 TT 14 9 23 1.662 0.016 0.391 020379 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 020428 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 024630 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 024776 AA 0 0 0 AG 2 6 8 GG 21 17 38 0.048 0.517 0.417 025241 AA 23 10 33 AG 1 12 13 GG 0 1 1 0.011 1.239 0.046 025320 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 025517 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 025785 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.048 0.000 0.023 025831 -- 0 0 0 +- 11 0 11 ++ 12 23 35 2.272 0.000 0.848 025836 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 20 23 43 0.112 0.000 0.052 025843 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 026008 AA 23 10 33 AC 1 12 13 CC 0 1 1 0.011 1.239 0.046 026133 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 026415 AA 22 9 31 AG 1 11 12 GG 0 1 1 0.011 1.068 0.016 026668 AA 23 21 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 029838 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 030112 GG 0 0 0 GT 0 3 3 TT 24 19 43 0.000 0.118 0.052 030200 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 030255 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 030302 AA 5 4 9 AG 9 16 25 GG 10 3 13 1.119 3.569 0.241 030449 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 030570 AA 0 0 0 AG 11 0 11 GG 13 23 36 2.121 0.000 0.826 030716 AA 10 17 27 AG 12 6 18 GG 2 0 2 0.375 0.517 0.218 031177 CC 22 9 31 CT 1 12 13 TT 0 1 1 0.011 1.455 0.072 031234 -- 23 22 45 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 031566 AA 22 23 45 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 031722 AA 11 15 26 AC 10 5 15 CC 1 0 1 0.468 0.408 0.474 031786 CC 0 0 0 CG 5 0 5 GG 18 21 39 0.342 0.000 0.160 031968 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 031989 AA 22 12 34 AG 1 9 10 GG 0 1 1 0.011 0.182 0.067 033745 CC 0 0 0 CT 1 3 4 TT 23 20 43 0.011 0.112 0.093 033852 AA 10 8 18 AG 11 13 24 GG 3 2 5 0.000 1.043 0.527 034006 AA 10 8 18 AG 11 13 24 GG 3 2 5 0.000 1.043 0.527 034036 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 034200 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 034544 AA 0 0 0 AG 4 4 8 GG 20 18 38 0.198 0.220 0.417 034669 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 034713 AA 14 18 32 AG 8 2 10 GG 1 0 1 0.011 0.055 0.043 034831 AA 22 12 34 AG 1 9 10 GG 0 1 1 0.011 0.182 0.067 035006 AA 22 22 44 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.023 035145 CC 20 19 39 CG 4 4 8 GG 0 0 0 0.198 0.209 0.407 035392 CC 1 0 1 CT 11 0 11 TT 12 22 34 0.618 0.000 0.010 035405 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 035461 CC 0 1 1 CT 1 9 10 TT 23 12 35 0.011 0.182 0.080 035584 CC 4 8 12 CT 10 10 20 TT 10 4 14 0.296 0.079 0.763 035594 CC 0 0 0 CG 1 1 2 GG 23 21 44 0.011 0.012 0.023 035603 AA 2 2 4 AG 8 9 17 GG 14 12 26 0.296 0.028 0.255 035715 AA 10 4 14 AG 10 10 20 GG 4 9 13 0.296 0.175 1.037 035718 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 037652 CC 24 21 45 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 037790 GG 22 22 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 037885 GG 17 18 35 GT 1 1 2 TT 0 0 0 0.015 0.014 0.029 038199 CC 23 22 45 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.011 0.022 038294 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 038479 AA 14 21 35 AG 9 2 11 GG 1 0 1 0.091 0.048 0.015 038509 AA 20 23 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 038690 AA 1 2 3 AC 6 6 12 CC 17 15 32 0.240 1.252 1.447 038692 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 038908 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 038926 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 038940 -- 1 2 3 +- 3 11 14 ++ 20 10 30 2.617 0.179 0.577 039063 CC 3 11 14 CT 8 5 13 TT 13 3 16 0.897 2.466 6.676 039163 CC 2 1 3 CT 8 0 8 TT 14 20 34 0.296 21.000 4.704 039222 CC 17 13 30 CT 6 5 11 TT 1 3 4 0.240 3.099 3.187 039275 CC 20 8 28 CT 3 5 8 TT 1 8 9 2.617 5.762 14.483 039300 GG 14 21 35 GT 8 0 8 TT 2 0 2 0.296 0.000 2.396 039477 GG 6 2 8 GT 10 6 16 TT 7 15 22 0.381 1.252 2.504 039709 -- 13 22 35 +- 9 1 10 ++ 2 0 2 0.061 0.011 1.214 041410 CC 13 16 29 CT 7 1 8 TT 0 0 0 0.900 0.016 0.544 042441 AA 22 20 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 042547 AA 5 7 12 AG 10 7 17 GG 3 3 6 0.281 0.279 0.000 042746 AA 18 22 40 AT 4 0 4 TT 0 0 0 0.220 0.000 0.100 042825 AA 3 0 3 AG 9 0 9 GG 11 22 33 0.277 0.000 3.528 042843 AA 19 23 42 AC 4 0 4 CC 0 0 0 0.209 0.000 0.095 042982 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 043146 AA 17 14 31 AG 6 6 12 GG 1 2 3 0.240 1.099 1.348 043607 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 22 44 0.045 0.000 0.023 043613 GG 6 0 6 GT 10 3 13 TT 8 19 27 0.621 0.118 3.762 043748 AA 13 22 35 AG 10 1 11 GG 1 0 1 0.296 0.011 0.015 043801 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 043893 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 23 22 45 0.011 0.011 0.022 044025 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 044555 GG 5 14 19 GT 10 4 14 TT 2 3 5 0.781 4.738 0.826 044609 GG 14 14 28 GT 5 6 11 TT 2 2 4 1.802 1.099 2.837 045128 -- 13 22 35 +- 10 1 11 ++ 1 0 1 0.296 0.011 0.015 045540 AA 6 0 6 AC 8 5 13 CC 8 16 24 1.564 0.383 3.063 045642 AA 19 23 42 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.209 0.000 0.095 045706 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 23 22 45 0.011 0.011 0.022 046011 AA 13 21 34 AG 10 1 11 GG 1 0 1 0.296 0.012 0.010 046042 AA 8 15 23 AG 10 7 17 GG 6 0 6 0.621 0.787 0.953 046187 -- 1 0 1 +- 10 1 11 ++ 13 21 34 0.296 0.012 0.010 046196 AA 6 0 6 AT 4 7 11 TT 4 14 18 2.431 0.840 2.897 046224 CC 8 3 11 CG 4 11 15 GG 3 7 10 2.400 0.159 0.992 046262 GG 17 18 35 GT 1 4 5 TT 0 0 0 0.015 0.220 0.178 046365 CC 0 1 1 CT 1 8 9 TT 21 13 34 0.012 0.027 0.186 046639 GG 13 21 34 GT 9 1 10 TT 1 0 1 0.130 0.012 0.067 046672 CC 7 0 7 CT 9 7 16 TT 8 16 24 1.484 0.741 2.206 046987 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 047190 CC 1 2 3 CT 6 6 12 TT 17 14 31 0.240 1.099 1.348 047224 CC 17 14 31 CT 6 6 12 TT 1 2 3 0.240 1.099 1.348 047538 AA 3 7 10 AG 7 13 20 GG 14 3 17 1.642 0.631 0.790 047561 AA 0 1 1 AG 1 9 10 GG 23 13 36 0.011 0.130 0.094 047613 AA 0 1 1 AC 1 9 10 CC 23 13 36 0.011 0.130 0.094 047624 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 047632 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 047791 CC 22 13 35 CT 1 9 10 TT 0 1 1 0.011 0.130 0.080 047796 AA 8 16 24 AT 9 6 15 TT 6 1 7 1.028 0.195 2.754 047820 AA 6 0 6 AG 9 6 15 GG 8 16 24 1.028 0.548 1.916 047822 AA 1 2 3 AG 3 12 15 GG 19 8 27 2.457 0.702 0.210 048011 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 048151 AA 8 16 24 AG 9 7 16 GG 7 0 7 1.484 0.741 2.206 048487 AA 14 21 35 AG 9 1 10 GG 1 0 1 0.091 0.012 0.080 048788 CC 7 1 8 CT 9 4 13 TT 8 12 20 1.484 0.617 3.850 048857 AA 8 13 21 AG 8 6 14 GG 6 0 6 1.564 0.668 1.835 048859 AA 7 13 20 AG 8 6 14 GG 6 0 6 1.173 0.668 1.637 048935 GG 8 14 22 GT 8 6 14 TT 4 0 4 0.556 0.623 0.598 048979 AA 6 0 6 AG 9 6 15 GG 9 15 24 1.361 0.583 1.916 049038 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 049198 -- 7 3 10 +- 10 12 22 ++ 7 8 15 0.667 0.209 0.133 049349 CC 0 0 0 CT 1 3 4 TT 15 18 33 0.017 0.124 0.121 049399 CC 1 9 10 CT 5 9 14 TT 13 4 17 0.294 0.414 3.606 049425 CC 7 8 15 CT 9 12 21 TT 5 3 8 0.383 0.209 0.019 049787 CC 20 8 28 CT 3 13 16 TT 1 2 3 2.617 1.043 0.120 049907 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 050021 AA 12 3 15 AT 9 13 22 TT 3 7 10 0.389 0.631 0.133 050223 AA 0 1 1 AG 1 9 10 GG 23 13 36 0.011 0.130 0.094 050452 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 051451 AA 1 2 3 AC 5 12 17 CC 17 8 25 0.571 0.702 0.002 051545 AA 0 1 1 AG 1 9 10 GG 22 12 34 0.011 0.182 0.067 051609 CC 0 0 0 CG 9 0 9 GG 14 22 36 1.361 0.000 0.556 051712 GG 19 12 31 GT 1 9 10 TT 0 1 1 0.013 0.182 0.032 051810 CC 0 1 1 CT 1 8 9 TT 17 13 30 0.015 0.027 0.106 052014 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 21 44 0.000 0.048 0.023 052027 CC 10 16 26 CT 11 7 18 TT 2 0 2 0.179 0.741 0.261 052169 CC 0 1 1 CG 1 8 9 GG 23 13 36 0.011 0.027 0.230 052187 CC 0 1 1 CT 1 9 10 TT 23 13 36 0.011 0.130 0.094 052261 AA 0 1 1 AT 1 9 10 TT 23 13 36 0.011 0.130 0.094 052328 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 052370 CC 1 0 1 CT 5 7 12 TT 18 16 34 0.644 0.741 0.002 052399 CC 0 1 1 CT 1 9 10 TT 23 13 36 0.011 0.130 0.094 052400 AA 2 2 4 AG 8 6 14 GG 14 15 29 0.296 1.252 1.345 052770 CC 23 13 36 CT 1 9 10 TT 0 1 1 0.011 0.130 0.094 052990 CC 17 6 23 CG 4 12 16 GG 1 2 3 1.144 1.250 0.009 053090 GG 0 1 1 GT 1 8 9 TT 21 12 33 0.012 0.053 0.164 053140 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 20 41 0.012 0.000 0.006 053181 CC 1 3 4 CG 5 10 15 GG 16 7 23 0.499 0.035 0.436 053192 AA 21 11 32 AC 1 8 9 CC 0 1 1 0.012 0.089 0.144 053254 CC 0 2 2 CT 1 7 8 TT 22 11 33 0.011 0.299 2.181 053278 CC 21 20 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.024 053370 AA 22 17 39 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 053532 -- 22 11 33 +- 1 9 10 ++ 0 1 1 0.011 0.247 0.054 053553 CC 10 16 26 CG 10 5 15 GG 3 0 3 0.040 0.383 0.168 053585 CC 12 2 14 CT 8 13 21 TT 3 6 9 0.733 1.702 0.048 053609 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 21 43 0.011 0.000 0.006 057062 AA 0 1 1 AG 1 10 11 GG 22 9 31 0.011 0.726 0.000 057177 -- 19 8 27 +- 1 7 8 ++ 0 1 1 0.013 0.108 0.181 057188 CC 0 1 1 CG 0 0 0 GG 23 12 35 0.000 13.000 36.000 057421 -- 21 21 42 +- 2 0 2 ++ 0 0 0 0.048 0.000 0.024 057423 AA 22 10 32 AG 1 10 11 GG 0 1 1 0.011 0.583 0.002 057499 CC 14 20 34 CT 8 1 9 TT 1 0 1 0.011 0.012 0.186 057527 GG 22 21 43 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 057632 AA 0 1 1 AG 1 10 11 GG 23 11 34 0.011 0.468 0.010 057634 GG 24 21 45 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 058665 AA 0 1 1 AG 1 8 9 GG 17 10 27 0.015 0.140 0.056 058672 CC 0 1 1 CT 1 8 9 TT 17 10 27 0.015 0.140 0.056 058815 AA 20 12 32 AG 1 9 10 GG 0 1 1 0.012 0.182 0.043 058905 CC 9 7 16 CT 9 14 23 TT 5 2 7 0.857 1.775 0.073 058949 CC 0 0 0 CT 1 9 10 TT 22 14 36 0.011 1.361 0.684 058959 GG 0 0 0 GT 1 9 10 TT 22 14 36 0.011 1.361 0.684 059105 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 061642 AA 17 18 35 AC 6 4 10 CC 0 0 0 0.517 0.220 0.703 061695 AA 16 19 35 AG 4 3 7 GG 3 0 3 5.497 0.118 6.181 061956 AA 23 21 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 062006 -- 2 0 2 +- 8 1 9 ++ 12 11 23 0.153 0.023 0.706 062353 AA 0 7 7 AT 2 5 7 TT 21 6 27 0.048 3.528 12.489 062529 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 063745 AA 23 19 42 AT 1 3 4 TT 0 0 0 0.011 0.118 0.095 066681 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 21 21 42 0.012 0.000 0.006 068206 CC 0 1 1 CT 1 10 11 TT 23 12 35 0.011 0.374 0.015 068478 CC 13 3 16 CT 8 10 18 TT 3 5 8 0.897 0.281 0.514 068497 AA 2 6 8 AC 6 8 14 CC 11 2 13 0.655 0.071 1.176 068499 GG 0 3 3 GT 1 6 7 TT 16 7 23 0.016 0.640 3.582 068600 GG 11 22 33 GT 12 1 13 TT 1 0 1 1.059 0.011 0.046 068671 AA 10 22 32 AG 13 1 14 GG 1 0 1 1.630 0.011 0.140 069200 -- 22 22 44 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 069206 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 069383 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 20 23 43 0.112 0.000 0.052 069569 CC 22 21 43 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.048 0.052 069788 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 20 43 0.011 0.000 0.006 069819 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 20 42 0.045 0.000 0.024 069861 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 20 41 0.107 0.000 0.055 070126 AA 12 19 31 AG 9 4 13 GG 1 0 1 0.182 0.209 0.072 070352 AA 13 19 32 AG 10 4 14 GG 1 0 1 0.296 0.209 0.140 070482 AA 23 11 34 AG 1 10 11 GG 0 1 1 0.011 0.468 0.010 070559 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 21 21 42 0.107 0.000 0.054 070842 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 18 39 0.048 0.000 0.026 070849 AA 20 19 39 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.102 071179 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 071368 CC 18 22 40 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.124 0.000 0.056 071459 AA 17 22 39 AC 4 0 4 CC 0 0 0 0.233 0.000 0.102 071483 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 17 22 39 0.233 0.000 0.102 071637 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 071683 AA 12 22 34 AG 10 1 11 GG 2 0 2 0.002 0.011 0.763 071722 CC 4 18 22 CG 10 5 15 GG 10 0 10 0.296 0.342 4.729 071789 CC 21 23 44 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 071842 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 071983 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 22 43 0.107 0.000 0.052 072151 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 072179 CC 19 22 41 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.152 072230 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 072281 AA 14 12 26 AG 4 3 7 GG 0 1 1 0.281 1.335 0.365 072305 CC 1 3 4 CT 2 10 12 TT 20 6 26 4.707 0.120 1.897 072608 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 072749 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 072896 CC 1 0 1 CT 10 1 11 TT 12 22 34 0.374 0.011 0.010 072926 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 23 43 0.112 0.000 0.052 073283 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 19 22 41 0.013 0.000 0.006 073300 CC 18 22 40 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.055 0.000 0.025 073348 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 16 22 38 0.247 0.000 0.105 073540 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 21 21 42 0.048 0.000 0.024 073749 CC 18 21 39 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.124 0.000 0.058 073757 AA 20 21 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 074069 AA 23 19 42 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 074342 CC 23 22 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 074437 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 074538 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 22 44 0.045 0.000 0.023 074547 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 22 21 43 0.000 0.012 0.006 074872 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 075026 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 075170 AA 22 18 40 AG 2 4 6 GG 0 1 1 0.045 1.252 1.527 075421 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 19 21 40 0.053 0.000 0.025 075442 CC 19 21 40 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.025 075522 CC 12 18 30 CT 9 3 12 TT 0 0 0 1.562 0.124 1.167 075542 CC 4 17 21 CT 11 4 15 TT 6 0 6 0.069 0.233 1.380 075564 CC 0 0 0 CG 9 3 12 GG 12 18 30 1.562 0.124 1.167 075580 CC 19 21 40 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.025 075759 CC 0 0 0 CT 3 1 4 TT 21 21 42 0.107 0.012 0.095 075895 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 075917 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 21 16 37 0.107 0.000 0.061 076039 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 076318 AA 21 22 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.052 076485 -- 0 0 0 +- 0 3 3 ++ 24 19 43 0.000 0.118 0.052 076509 -- 3 6 9 +- 7 12 19 ++ 12 2 14 1.223 1.250 0.284 076597 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 13 8 21 0.077 0.000 0.048 076747 CC 0 0 0 CG 5 0 5 GG 17 15 32 0.362 0.000 0.194 087373 CC 23 11 34 CT 1 10 11 TT 0 1 1 0.011 0.468 0.010 087696 CC 10 17 27 CG 7 4 11 GG 5 0 5 2.381 0.233 4.052 087777 CC 4 0 4 CT 6 4 10 TT 9 13 22 1.963 0.302 2.420 087791 -- 1 0 1 +- 6 5 11 ++ 17 17 34 0.240 0.362 0.010 087798 AA 1 0 1 AG 10 1 11 GG 13 21 34 0.296 0.012 0.010 088328 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 088492 CC 21 6 27 CT 3 14 17 TT 0 3 3 0.107 1.308 0.022 088495 CC 15 9 24 CT 7 11 18 TT 2 3 5 0.730 0.016 0.335 088497 AA 2 3 5 AC 7 11 18 CC 15 9 24 0.730 0.016 0.335 088664 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 088713 AA 0 0 0 AG 1 3 4 GG 23 20 43 0.011 0.112 0.093 088717 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 088760 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 088836 AA 21 23 44 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 088871 AA 22 21 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 088888 AA 0 1 1 AG 3 10 13 GG 18 12 30 0.124 0.374 0.088 088957 CC 2 3 5 CT 6 11 17 TT 13 9 22 0.948 0.016 0.370 089351 AA 15 14 29 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.017 0.071 0.077 089358 -- 1 0 1 +- 3 3 6 ++ 14 16 30 1.655 0.140 0.936 089486 AA 18 18 36 AT 1 2 3 TT 0 0 0 0.014 0.055 0.062 092047 AA 13 6 19 AT 5 9 14 TT 1 2 3 0.294 0.248 0.034 092098 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 21 44 0.011 0.000 0.006 092126 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 21 44 0.011 0.000 0.006 092277 CC 23 11 34 CT 1 9 10 TT 0 1 1 0.011 0.247 0.067 092351 CC 8 5 13 CT 8 12 20 TT 8 4 12 2.667 0.444 0.551 092416 CC 21 12 33 CG 3 9 12 GG 0 1 1 0.107 0.182 0.006 092479 CC 13 9 22 CT 7 10 17 TT 3 3 6 1.431 0.007 0.821 092651 AA 7 5 12 AG 7 13 20 GG 10 4 14 3.984 0.747 0.763 092767 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 092874 AA 0 2 2 AT 3 9 12 TT 21 12 33 0.107 0.028 0.435 092876 CC 0 1 1 CG 6 10 16 GG 18 12 30 0.490 0.374 0.465 093339 AA 22 23 45 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 093583 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 093981 AA 3 3 6 AG 8 11 19 GG 13 9 22 0.897 0.016 0.344 094116 AA 22 23 45 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.022 094322 CC 8 7 15 CT 9 13 22 TT 7 3 10 1.484 0.631 0.133 094351 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 094499 -- 15 9 24 +- 9 14 23 ++ 0 0 0 1.278 4.402 4.932 095047 CC 3 3 6 CT 8 11 19 TT 13 9 22 0.897 0.016 0.344 095106 AA 22 23 45 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 095272 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 23 41 0.490 0.000 0.218 095311 AA 0 1 1 AC 3 9 12 CC 21 13 34 0.107 0.130 0.002 095373 CC 1 0 1 CG 6 5 11 GG 17 18 35 0.240 0.342 0.015 095736 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 095835 AA 1 0 1 AG 6 5 11 GG 17 18 35 0.240 0.342 0.015 096277 CC 22 21 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 096479 AA 3 3 6 AC 6 9 15 CC 13 9 22 2.148 0.093 1.556 096929 AA 13 9 22 AG 4 6 10 GG 0 0 0 0.302 0.937 1.097 096951 CC 15 15 30 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.066 0.000 0.033 096981 AA 13 9 22 AG 4 6 10 GG 0 0 0 0.302 0.937 1.097 096989 CC 13 9 22 CT 4 6 10 TT 0 0 0 0.302 0.937 1.097 097094 AA 0 0 0 AG 4 7 11 GG 13 9 22 0.302 1.254 1.320 097103 AA 17 9 26 AG 0 7 7 GG 0 0 0 0.000 1.254 0.465 097131 CC 13 9 22 CT 4 7 11 TT 0 0 0 0.302 1.254 1.320 097176 AA 21 22 43 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.107 0.000 0.052 097213 AA 3 3 6 AG 8 10 18 GG 13 9 22 0.897 0.007 0.553 097380 AA 1 0 1 AC 7 2 9 CC 16 20 36 0.044 0.050 0.230 097447 AA 13 9 22 AG 8 10 18 GG 3 3 6 0.897 0.007 0.553 097517 -- 13 9 22 +- 8 10 18 ++ 3 3 6 0.897 0.007 0.553 097676 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 097695 CC 2 3 5 CT 7 10 17 TT 15 9 24 0.730 0.007 0.545 097726 AA 23 12 35 AG 1 9 10 GG 0 1 1 0.011 0.182 0.080 097746 AA 0 1 1 AC 1 9 10 CC 23 12 35 0.011 0.182 0.080 097787 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 21 22 43 0.107 0.000 0.052 097796 AA 1 0 1 AG 6 5 11 GG 17 17 34 0.240 0.362 0.010 098052 CC 13 9 22 CG 6 10 16 GG 2 3 5 0.948 0.007 0.598 098173 CC 22 22 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 098379 GG 0 0 0 GT 3 0 3 TT 20 15 35 0.112 0.000 0.064 098446 AA 22 10 32 AT 1 2 3 TT 0 0 0 0.011 0.099 0.070 098560 -- 0 1 1 +- 1 10 11 ++ 23 11 34 0.011 0.468 0.010 098605 AA 0 0 0 AT 3 0 3 TT 21 22 43 0.107 0.000 0.052 098773 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 098843 AA 13 4 17 AT 4 14 18 TT 7 5 12 9.967 1.110 2.385 098929 GG 2 3 5 GT 7 11 18 TT 15 9 24 0.730 0.016 0.335 099007 GG 2 0 2 GT 8 5 13 TT 14 18 32 0.296 0.342 0.208 099086 AA 22 12 34 AG 1 10 11 GG 0 1 1 0.011 0.374 0.010 099194 CC 20 17 37 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.007 099418 CC 4 3 7 CT 8 11 19 TT 12 9 21 1.500 0.016 0.598 099476 GG 19 22 41 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.152 099554 AA 19 22 41 AC 5 0 5 CC 0 0 0 0.324 0.000 0.152 100015 -- 11 8 19 +- 8 11 19 ++ 4 2 6 1.252 0.416 0.127 100055 -- 11 8 19 +- 8 11 19 ++ 4 2 6 1.252 0.416 0.127 100075 AA 21 21 42 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.024 100083 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 21 44 0.011 0.000 0.006 100152 AA 23 21 44 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 100166 CC 2 2 4 CT 7 11 18 TT 15 8 23 0.730 0.416 0.031 103989 -- 4 2 6 +- 6 3 9 ++ 13 17 30 3.390 5.290 8.751 104667 CC 2 2 4 CT 5 3 8 TT 17 17 34 2.400 5.290 7.168 104844 CC 23 20 43 CG 1 3 4 GG 0 0 0 0.011 0.112 0.093 104892 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 104939 AA 20 23 43 AC 3 0 3 CC 1 0 1 2.617 0.000 6.306 104994 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 105170 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 105262 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 105302 CC 23 12 35 CG 1 10 11 GG 0 1 1 0.011 0.374 0.015 105759 -- 21 12 33 +- 3 11 14 ++ 0 0 0 0.107 2.272 1.439 109161 CC 1 1 2 CT 9 6 15 TT 14 14 28 0.091 0.114 0.000 109177 AA 1 0 1 AG 6 4 10 GG 17 17 34 0.240 0.233 0.067 109325 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 24 20 44 0.000 0.012 0.006 109433 AA 17 17 34 AG 6 4 10 GG 1 0 1 0.240 0.233 0.067 109507 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 21 44 0.011 0.000 0.006 109643 CC 0 0 0 CT 3 11 14 TT 21 10 31 0.107 2.644 1.527 110030 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 110115 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 110387 GG 2 4 6 GT 10 12 22 TT 11 7 18 0.017 0.087 0.032 110397 AA 22 12 34 AC 0 11 11 CC 0 0 0 0.000 2.272 0.872 110411 AA 10 7 17 AG 10 12 22 GG 2 4 6 0.050 0.087 0.072 110619 AA 21 11 32 AG 3 11 14 GG 0 0 0 0.107 2.444 1.482 110644 CC 0 0 0 CT 3 11 14 TT 21 11 32 0.107 2.444 1.482 110843 GG 2 3 5 GT 10 12 22 TT 12 7 19 0.002 0.362 0.135 111172 -- 0 0 0 +- 3 11 14 ++ 20 11 31 0.112 2.444 1.527 111235 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 111244 GG 24 21 45 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 111294 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 22 42 0.198 0.000 0.095 111305 CC 21 19 40 CT 3 3 6 TT 0 0 0 0.107 0.118 0.224 111411 AA 0 0 0 AG 2 11 13 GG 21 12 33 0.048 2.272 1.246 111476 AA 13 15 28 AC 9 7 16 CC 1 1 2 0.130 0.025 0.023 111551 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 111554 AA 22 23 45 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 111578 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 111654 AA 0 0 0 AT 3 11 14 TT 21 12 33 0.107 2.272 1.439 111655 AA 21 12 33 AT 3 11 14 TT 0 0 0 0.107 2.272 1.439 112042 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 112369 AA 0 0 0 AG 1 11 12 GG 23 12 35 0.011 2.272 1.007 112383 CC 0 0 0 CT 0 4 4 TT 24 19 43 0.000 0.209 0.093 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 011993: ACTT 025831: T 031234: A 038940: ATATT 039709: ATTTTT 045128: T 046187: t 049198: CTTGTA 053532: CTCA 057177: TTGT 057421: A 062006: A 069200: A 069383: AATA 070559: tttg 073540: ttaag 074538: ccttt 075917: t 076485: a 076509: CTT 087791: a 089358: gtt 094499: A 097517: C 098560: at 100015: CCACAGT 100055: C 100083: AT 103989: t 104892: a 105759: A 111172: aaggttattat 111235: a