Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000061 C 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 000201 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 000361 C 0.02 0.32 0.17 T 0.98 0.68 0.83 0.04 0.43 0.28 000704 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000729 T 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 000744 G 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 001041 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 001113 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 001190 G 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 001487 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001610 C 0.19 0.00 0.10 T 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 002137 G 0.03 0.00 0.02 T 0.97 1.00 0.98 0.05 0.00 0.03 008994 A 0.12 0.00 0.07 T 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 009089 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009281 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009292 C 0.19 0.50 0.34 T 0.81 0.50 0.66 0.30 0.50 0.45 009352 G 0.12 0.00 0.06 T 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 009369 A 0.19 0.00 0.10 G 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 011760 T 0.04 0.11 0.08 C 0.96 0.89 0.92 0.08 0.20 0.14 011973 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011993 - 0.02 0.39 0.20 + 0.98 0.61 0.80 0.04 0.47 0.32 012084 T 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 012120 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012329 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012501 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012576 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012586 T 0.04 0.14 0.09 A 0.96 0.86 0.91 0.08 0.24 0.16 012590 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012591 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012631 G 0.12 0.14 0.13 A 0.88 0.86 0.87 0.22 0.24 0.23 012791 A 0.12 0.00 0.07 C 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 012945 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013403 A 0.17 0.34 0.25 G 0.83 0.66 0.75 0.28 0.45 0.38 014018 A 0.02 0.27 0.14 T 0.98 0.73 0.86 0.04 0.40 0.24 014062 T 0.02 0.27 0.14 C 0.98 0.73 0.86 0.04 0.40 0.24 014947 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015341 G 0.30 0.63 0.47 A 0.70 0.37 0.53 0.42 0.47 0.50 015589 G 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 015665 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 016291 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 016493 A 0.23 0.00 0.12 G 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 016545 G 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 016555 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017189 C 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.05 0.05 0.05 017264 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 017379 C 0.02 0.31 0.17 A 0.98 0.69 0.83 0.05 0.43 0.28 019952 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020027 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 020089 C 0.21 0.37 0.29 T 0.79 0.63 0.71 0.33 0.47 0.41 020379 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020428 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024630 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 024776 A 0.04 0.13 0.09 G 0.96 0.87 0.91 0.08 0.23 0.16 025241 G 0.02 0.30 0.16 A 0.98 0.70 0.84 0.04 0.42 0.27 025320 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025517 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 025785 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 025831 - 0.24 0.00 0.12 + 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 025836 G 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 025843 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026008 C 0.02 0.30 0.16 A 0.98 0.70 0.84 0.04 0.42 0.27 026133 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026415 G 0.02 0.31 0.16 A 0.98 0.69 0.84 0.04 0.43 0.27 026668 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 029838 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 030112 G 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 030200 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030255 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030302 A 0.40 0.52 0.46 G 0.60 0.48 0.54 0.48 0.50 0.50 030449 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 030570 A 0.23 0.00 0.12 G 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 030716 G 0.33 0.13 0.23 A 0.67 0.87 0.77 0.44 0.23 0.36 031177 T 0.02 0.32 0.17 C 0.98 0.68 0.83 0.04 0.43 0.28 031234 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031566 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 031722 C 0.27 0.12 0.20 A 0.73 0.88 0.80 0.40 0.22 0.32 031786 C 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 031968 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031989 G 0.02 0.25 0.13 A 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 033745 C 0.02 0.07 0.04 T 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 033852 G 0.35 0.37 0.36 A 0.65 0.63 0.64 0.46 0.47 0.46 034006 G 0.35 0.37 0.36 A 0.65 0.63 0.64 0.46 0.47 0.46 034036 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034200 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034544 A 0.08 0.09 0.09 G 0.92 0.91 0.91 0.15 0.17 0.16 034669 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 034713 G 0.22 0.05 0.14 A 0.78 0.95 0.86 0.34 0.10 0.24 034831 G 0.02 0.25 0.13 A 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 035006 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 035145 G 0.08 0.09 0.09 C 0.92 0.91 0.91 0.15 0.16 0.16 035392 C 0.27 0.00 0.14 T 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 035405 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035461 C 0.02 0.25 0.13 T 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 035584 C 0.38 0.59 0.48 T 0.62 0.41 0.52 0.47 0.48 0.50 035594 C 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 035603 A 0.25 0.28 0.27 G 0.75 0.72 0.73 0.38 0.41 0.39 035715 G 0.38 0.61 0.49 A 0.62 0.39 0.51 0.47 0.48 0.50 035718 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037652 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 037790 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037885 T 0.03 0.03 0.03 G 0.97 0.97 0.97 0.05 0.05 0.05 038199 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 038294 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 038479 G 0.23 0.04 0.14 A 0.77 0.96 0.86 0.35 0.08 0.24 038509 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 038690 A 0.17 0.22 0.19 C 0.83 0.78 0.81 0.28 0.34 0.31 038692 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 038908 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038926 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 038940 - 0.10 0.33 0.21 + 0.90 0.67 0.79 0.19 0.44 0.33 039063 C 0.29 0.71 0.48 T 0.71 0.29 0.52 0.41 0.41 0.50 039163 C 0.25 0.05 0.16 T 0.75 0.95 0.84 0.38 0.09 0.26 039222 T 0.17 0.26 0.21 C 0.83 0.74 0.79 0.28 0.39 0.33 039275 T 0.10 0.50 0.29 C 0.90 0.50 0.71 0.19 0.50 0.41 039300 T 0.25 0.00 0.13 G 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.23 039477 G 0.48 0.22 0.35 T 0.52 0.78 0.65 0.50 0.34 0.45 039709 + 0.27 0.02 0.15 - 0.73 0.98 0.85 0.39 0.04 0.25 041410 T 0.17 0.03 0.11 C 0.82 0.97 0.89 0.29 0.06 0.19 042441 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042547 G 0.44 0.38 0.41 A 0.56 0.62 0.59 0.49 0.47 0.49 042746 T 0.09 0.00 0.05 A 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 042825 A 0.33 0.00 0.17 G 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 042843 C 0.09 0.00 0.04 A 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 042982 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043146 G 0.17 0.23 0.20 A 0.83 0.77 0.80 0.28 0.35 0.31 043607 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 043613 G 0.46 0.07 0.27 T 0.54 0.93 0.73 0.50 0.13 0.40 043748 G 0.25 0.02 0.14 A 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 043801 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043893 C 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 044025 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044555 T 0.41 0.24 0.32 G 0.59 0.76 0.68 0.48 0.36 0.43 044609 T 0.21 0.23 0.22 G 0.79 0.77 0.78 0.34 0.35 0.34 045128 + 0.25 0.02 0.14 - 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 045540 A 0.45 0.12 0.29 C 0.55 0.88 0.71 0.50 0.21 0.41 045642 G 0.09 0.00 0.04 A 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 045706 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 046011 G 0.25 0.02 0.14 A 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 046042 G 0.46 0.16 0.32 A 0.54 0.84 0.68 0.50 0.27 0.43 046187 - 0.25 0.02 0.14 + 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 046196 A 0.57 0.17 0.33 T 0.43 0.83 0.67 0.49 0.28 0.44 046224 G 0.33 0.60 0.49 C 0.67 0.40 0.51 0.44 0.48 0.50 046262 T 0.03 0.09 0.06 G 0.97 0.91 0.94 0.05 0.17 0.12 046365 C 0.02 0.23 0.12 T 0.98 0.77 0.88 0.04 0.35 0.22 046639 T 0.24 0.02 0.13 G 0.76 0.98 0.87 0.36 0.04 0.23 046672 C 0.48 0.15 0.32 T 0.52 0.85 0.68 0.50 0.26 0.43 046987 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 047190 C 0.17 0.23 0.20 T 0.83 0.77 0.80 0.28 0.35 0.31 047224 T 0.17 0.23 0.20 C 0.83 0.77 0.80 0.28 0.35 0.31 047538 A 0.27 0.59 0.43 G 0.73 0.41 0.57 0.39 0.48 0.49 047561 A 0.02 0.24 0.13 G 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 047613 A 0.02 0.24 0.13 C 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 047624 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 047632 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 047791 T 0.02 0.24 0.13 C 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.23 047796 T 0.46 0.17 0.32 A 0.54 0.83 0.68 0.50 0.29 0.43 047820 A 0.46 0.14 0.30 G 0.54 0.86 0.70 0.50 0.24 0.42 047822 A 0.11 0.36 0.23 G 0.89 0.64 0.77 0.19 0.46 0.36 048011 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 048151 G 0.48 0.15 0.32 A 0.52 0.85 0.68 0.50 0.26 0.43 048487 G 0.23 0.02 0.13 A 0.77 0.98 0.87 0.35 0.04 0.23 048788 C 0.48 0.18 0.35 T 0.52 0.82 0.65 0.50 0.29 0.46 048857 G 0.45 0.16 0.32 A 0.55 0.84 0.68 0.50 0.27 0.43 048859 G 0.48 0.16 0.33 A 0.52 0.84 0.68 0.50 0.27 0.44 048935 T 0.40 0.15 0.28 G 0.60 0.85 0.72 0.48 0.26 0.40 048979 A 0.44 0.14 0.30 G 0.56 0.86 0.70 0.49 0.24 0.42 049038 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 049198 - 0.50 0.39 0.45 + 0.50 0.61 0.55 0.50 0.48 0.49 049349 C 0.03 0.07 0.05 T 0.97 0.93 0.95 0.06 0.13 0.10 049399 C 0.18 0.61 0.41 T 0.82 0.39 0.59 0.30 0.47 0.49 049425 T 0.45 0.39 0.42 C 0.55 0.61 0.58 0.50 0.48 0.49 049787 T 0.10 0.37 0.23 C 0.90 0.63 0.77 0.19 0.47 0.36 049907 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 050021 T 0.31 0.59 0.45 A 0.69 0.41 0.55 0.43 0.48 0.49 050223 A 0.02 0.24 0.13 G 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 050452 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 051451 A 0.15 0.36 0.26 C 0.85 0.64 0.74 0.26 0.46 0.38 051545 A 0.02 0.25 0.13 G 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 051609 C 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 051712 T 0.03 0.25 0.14 G 0.97 0.75 0.86 0.05 0.38 0.24 051810 C 0.03 0.23 0.14 T 0.97 0.77 0.86 0.05 0.35 0.24 052014 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 052027 T 0.33 0.15 0.24 C 0.67 0.85 0.76 0.44 0.26 0.36 052169 C 0.02 0.23 0.12 G 0.98 0.77 0.88 0.04 0.35 0.21 052187 C 0.02 0.24 0.13 T 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 052261 A 0.02 0.24 0.13 T 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 052328 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 052370 C 0.15 0.15 0.15 T 0.85 0.85 0.85 0.25 0.26 0.25 052399 C 0.02 0.24 0.13 T 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 052400 A 0.25 0.22 0.23 G 0.75 0.78 0.77 0.38 0.34 0.36 052770 T 0.02 0.24 0.13 C 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 052990 G 0.14 0.40 0.26 C 0.86 0.60 0.74 0.24 0.48 0.39 053090 G 0.02 0.24 0.13 T 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 053140 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 053181 C 0.16 0.40 0.27 G 0.84 0.60 0.73 0.27 0.48 0.40 053192 C 0.02 0.25 0.13 A 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 053254 C 0.02 0.28 0.14 T 0.98 0.72 0.86 0.04 0.40 0.24 053278 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 053370 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 053532 + 0.02 0.26 0.14 - 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 053553 G 0.35 0.12 0.24 C 0.65 0.88 0.76 0.45 0.21 0.36 053585 T 0.30 0.60 0.44 C 0.70 0.40 0.56 0.42 0.48 0.49 053609 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 057062 A 0.02 0.30 0.15 G 0.98 0.70 0.85 0.04 0.42 0.26 057177 + 0.03 0.28 0.14 - 0.97 0.72 0.86 0.05 0.40 0.24 057188 C 0.00 0.08 0.03 G 1.00 0.92 0.97 0.00 0.14 0.05 057421 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 057423 G 0.02 0.29 0.15 A 0.98 0.71 0.85 0.04 0.41 0.25 057499 T 0.22 0.02 0.12 C 0.78 0.98 0.88 0.34 0.05 0.22 057527 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 057632 A 0.02 0.27 0.14 G 0.98 0.73 0.86 0.04 0.40 0.24 057634 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 058665 A 0.03 0.26 0.15 G 0.97 0.74 0.85 0.05 0.39 0.25 058672 C 0.03 0.26 0.15 T 0.97 0.74 0.85 0.05 0.39 0.25 058815 G 0.02 0.25 0.14 A 0.98 0.75 0.86 0.05 0.38 0.24 058905 T 0.41 0.39 0.40 C 0.59 0.61 0.60 0.48 0.48 0.48 058949 C 0.02 0.20 0.11 T 0.98 0.80 0.89 0.04 0.31 0.19 058959 G 0.02 0.20 0.11 T 0.98 0.80 0.89 0.04 0.31 0.19 059105 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 061642 C 0.13 0.09 0.11 A 0.87 0.91 0.89 0.23 0.17 0.20 061695 G 0.22 0.07 0.14 A 0.78 0.93 0.86 0.34 0.13 0.25 061956 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 062006 - 0.27 0.04 0.19 + 0.73 0.96 0.81 0.40 0.08 0.31 062353 A 0.04 0.53 0.26 T 0.96 0.47 0.74 0.08 0.50 0.38 062529 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 063745 T 0.02 0.07 0.04 A 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 066681 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 068206 C 0.02 0.26 0.14 T 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 068478 T 0.29 0.56 0.40 C 0.71 0.44 0.60 0.41 0.49 0.48 068497 A 0.26 0.62 0.43 C 0.74 0.38 0.57 0.39 0.47 0.49 068499 G 0.03 0.38 0.20 T 0.97 0.62 0.80 0.06 0.47 0.32 068600 T 0.29 0.02 0.16 G 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 068671 G 0.31 0.02 0.17 A 0.69 0.98 0.83 0.43 0.04 0.28 069200 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 069206 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 069383 - 0.07 0.00 0.03 + 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 069569 T 0.02 0.04 0.03 C 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 069788 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 069819 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 069861 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 070126 G 0.25 0.09 0.17 A 0.75 0.91 0.83 0.38 0.16 0.28 070352 G 0.25 0.09 0.17 A 0.75 0.91 0.83 0.38 0.16 0.28 070482 G 0.02 0.27 0.14 A 0.98 0.73 0.86 0.04 0.40 0.24 070559 - 0.06 0.00 0.03 + 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 070842 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 070849 G 0.08 0.00 0.05 A 0.92 1.00 0.95 0.15 0.00 0.09 071179 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 071368 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 071459 C 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 071483 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 071637 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 071683 G 0.29 0.02 0.16 A 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 071722 G 0.62 0.11 0.37 C 0.38 0.89 0.63 0.47 0.19 0.47 071789 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 071842 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 071983 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 072151 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 072179 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 072230 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 072281 G 0.11 0.16 0.13 A 0.89 0.84 0.87 0.20 0.26 0.23 072305 C 0.09 0.42 0.24 T 0.91 0.58 0.76 0.16 0.49 0.36 072608 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 072749 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 072896 C 0.26 0.02 0.14 T 0.74 0.98 0.86 0.39 0.04 0.24 072926 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 073283 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 073300 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 073348 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 073540 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 073749 G 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 073757 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 074069 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 074342 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 074437 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 074538 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 074547 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 074872 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 075026 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 075170 G 0.04 0.13 0.09 A 0.96 0.87 0.91 0.08 0.23 0.16 075421 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 075442 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 075522 T 0.21 0.07 0.14 C 0.79 0.93 0.86 0.34 0.13 0.24 075542 T 0.55 0.10 0.32 C 0.45 0.90 0.68 0.50 0.17 0.44 075564 C 0.21 0.07 0.14 G 0.79 0.93 0.86 0.34 0.13 0.24 075580 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 075759 C 0.06 0.02 0.04 T 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 075895 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 075917 - 0.06 0.00 0.04 + 0.94 1.00 0.96 0.12 0.00 0.07 076039 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 076318 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 076485 - 0.00 0.07 0.03 + 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 076509 - 0.30 0.60 0.44 + 0.70 0.40 0.56 0.42 0.48 0.49 076597 C 0.07 0.00 0.04 G 0.93 1.00 0.96 0.12 0.00 0.08 076747 C 0.11 0.00 0.07 G 0.89 1.00 0.93 0.20 0.00 0.13 087373 T 0.02 0.27 0.14 C 0.98 0.73 0.86 0.04 0.40 0.24 087696 G 0.39 0.10 0.24 C 0.61 0.90 0.76 0.47 0.17 0.37 087777 C 0.37 0.12 0.25 T 0.63 0.88 0.75 0.47 0.21 0.38 087791 - 0.17 0.11 0.14 + 0.83 0.89 0.86 0.28 0.20 0.24 087798 A 0.25 0.02 0.14 G 0.75 0.98 0.86 0.38 0.04 0.24 088328 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 088492 T 0.06 0.43 0.24 C 0.94 0.57 0.76 0.12 0.49 0.37 088495 T 0.23 0.37 0.30 C 0.77 0.63 0.70 0.35 0.47 0.42 088497 A 0.23 0.37 0.30 C 0.77 0.63 0.70 0.35 0.47 0.42 088664 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 088713 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 088717 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 088760 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 088836 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 088871 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 088888 A 0.07 0.26 0.17 G 0.93 0.74 0.83 0.13 0.39 0.28 088957 C 0.24 0.37 0.31 T 0.76 0.63 0.69 0.36 0.47 0.43 089351 G 0.03 0.06 0.05 A 0.97 0.94 0.95 0.06 0.12 0.09 089358 - 0.14 0.08 0.11 + 0.86 0.92 0.89 0.24 0.15 0.19 089486 T 0.03 0.05 0.04 A 0.97 0.95 0.96 0.05 0.10 0.07 092047 T 0.18 0.38 0.28 A 0.82 0.62 0.72 0.30 0.47 0.40 092098 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 092126 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 092277 T 0.02 0.26 0.13 C 0.98 0.74 0.87 0.04 0.39 0.23 092351 T 0.50 0.48 0.49 C 0.50 0.52 0.51 0.50 0.50 0.50 092416 G 0.06 0.25 0.15 C 0.94 0.75 0.85 0.12 0.38 0.26 092479 T 0.28 0.36 0.32 C 0.72 0.64 0.68 0.41 0.46 0.44 092651 A 0.44 0.52 0.48 G 0.56 0.48 0.52 0.49 0.50 0.50 092767 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 092874 A 0.06 0.28 0.17 T 0.94 0.72 0.83 0.12 0.41 0.28 092876 C 0.12 0.26 0.19 G 0.88 0.74 0.81 0.22 0.39 0.31 093339 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 093583 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 093981 A 0.29 0.37 0.33 G 0.71 0.63 0.67 0.41 0.47 0.44 094116 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 094322 T 0.48 0.41 0.45 C 0.52 0.59 0.55 0.50 0.48 0.49 094351 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 094499 + 0.19 0.30 0.24 - 0.81 0.70 0.76 0.30 0.42 0.37 095047 C 0.29 0.37 0.33 T 0.71 0.63 0.67 0.41 0.47 0.44 095106 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 095272 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 095311 A 0.06 0.24 0.15 C 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 095373 C 0.17 0.11 0.14 G 0.83 0.89 0.86 0.28 0.19 0.24 095736 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 095835 A 0.17 0.11 0.14 G 0.83 0.89 0.86 0.28 0.19 0.24 096277 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 096479 A 0.27 0.36 0.31 C 0.73 0.64 0.69 0.40 0.46 0.43 096929 G 0.12 0.20 0.16 A 0.88 0.80 0.84 0.21 0.32 0.26 096951 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.11 0.00 0.06 096981 G 0.12 0.20 0.16 A 0.88 0.80 0.84 0.21 0.32 0.26 096989 T 0.12 0.20 0.16 C 0.88 0.80 0.84 0.21 0.32 0.26 097094 A 0.12 0.22 0.17 G 0.88 0.78 0.83 0.21 0.34 0.28 097103 G 0.00 0.22 0.11 A 1.00 0.78 0.89 0.00 0.34 0.19 097131 T 0.12 0.22 0.17 C 0.88 0.78 0.83 0.21 0.34 0.28 097176 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 097213 A 0.29 0.36 0.33 G 0.71 0.64 0.67 0.41 0.46 0.44 097380 A 0.19 0.05 0.12 C 0.81 0.95 0.88 0.30 0.09 0.21 097447 G 0.29 0.36 0.33 A 0.71 0.64 0.67 0.41 0.46 0.44 097517 + 0.29 0.36 0.33 - 0.71 0.64 0.67 0.41 0.46 0.44 097676 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 097695 C 0.23 0.36 0.29 T 0.77 0.64 0.71 0.35 0.46 0.41 097726 G 0.02 0.25 0.13 A 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 097746 A 0.02 0.25 0.13 C 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 097787 G 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 097796 A 0.17 0.11 0.14 G 0.83 0.89 0.86 0.28 0.20 0.24 098052 G 0.24 0.36 0.30 C 0.76 0.64 0.70 0.36 0.46 0.42 098173 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 098379 G 0.07 0.00 0.04 T 0.93 1.00 0.96 0.12 0.00 0.08 098446 T 0.02 0.08 0.04 A 0.98 0.92 0.96 0.04 0.15 0.08 098560 - 0.02 0.27 0.14 + 0.98 0.73 0.86 0.04 0.40 0.24 098605 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 098773 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 098843 T 0.38 0.52 0.45 A 0.62 0.48 0.55 0.47 0.50 0.49 098929 G 0.23 0.37 0.30 T 0.77 0.63 0.70 0.35 0.47 0.42 099007 G 0.25 0.11 0.18 T 0.75 0.89 0.82 0.38 0.19 0.30 099086 G 0.02 0.26 0.14 A 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 099194 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 099418 C 0.33 0.37 0.35 T 0.67 0.63 0.65 0.44 0.47 0.46 099476 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 099554 C 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 100015 + 0.35 0.36 0.35 - 0.65 0.64 0.65 0.45 0.46 0.46 100055 + 0.35 0.36 0.35 - 0.65 0.64 0.65 0.45 0.46 0.46 100075 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 100083 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 100152 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 100166 C 0.23 0.36 0.29 T 0.77 0.64 0.71 0.35 0.46 0.41 103989 - 0.30 0.16 0.23 + 0.70 0.84 0.77 0.42 0.27 0.36 104667 C 0.19 0.16 0.17 T 0.81 0.84 0.83 0.30 0.27 0.29 104844 G 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 104892 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 104939 C 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 104994 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 105170 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 105262 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 105302 G 0.02 0.26 0.14 C 0.98 0.74 0.86 0.04 0.39 0.24 105759 + 0.06 0.24 0.15 - 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 109161 C 0.23 0.19 0.21 T 0.77 0.81 0.79 0.35 0.31 0.33 109177 A 0.17 0.10 0.13 G 0.83 0.90 0.87 0.28 0.17 0.23 109325 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 109433 G 0.17 0.10 0.13 A 0.83 0.90 0.87 0.28 0.17 0.23 109507 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 109643 C 0.06 0.26 0.16 T 0.94 0.74 0.84 0.12 0.39 0.26 110030 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 110115 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 110387 G 0.30 0.43 0.37 T 0.70 0.57 0.63 0.42 0.49 0.47 110397 C 0.00 0.24 0.12 A 1.00 0.76 0.88 0.00 0.36 0.21 110411 G 0.32 0.43 0.38 A 0.68 0.57 0.62 0.43 0.49 0.47 110619 G 0.06 0.25 0.15 A 0.94 0.75 0.85 0.12 0.38 0.26 110644 C 0.06 0.25 0.15 T 0.94 0.75 0.85 0.12 0.38 0.26 110843 G 0.29 0.41 0.35 T 0.71 0.59 0.65 0.41 0.48 0.45 111172 - 0.07 0.25 0.16 + 0.93 0.75 0.84 0.12 0.38 0.26 111235 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 111244 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 111294 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 111305 T 0.06 0.07 0.07 C 0.94 0.93 0.93 0.12 0.13 0.12 111411 A 0.04 0.24 0.14 G 0.96 0.76 0.86 0.08 0.36 0.24 111476 C 0.24 0.20 0.22 A 0.76 0.80 0.78 0.36 0.31 0.34 111551 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 111554 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 111578 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 111654 A 0.06 0.24 0.15 T 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 111655 T 0.06 0.24 0.15 A 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 112042 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 112369 A 0.02 0.24 0.13 G 0.98 0.76 0.87 0.04 0.36 0.22 112383 C 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 011993: ACTT 025831: T 031234: A 038940: ATATT 039709: ATTTTT 045128: T 046187: t 049198: CTTGTA 053532: CTCA 057177: TTGT 057421: A 062006: A 069200: A 069383: AATA 070559: tttg 073540: ttaag 074538: ccttt 075917: t 076485: a 076509: CTT 087791: a 089358: gtt 094499: A 097517: C 098560: at 100015: CCACAGT 100055: C 100083: AT 103989: t 104892: a 105759: A 111172: aaggttattat 111235: a