Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000060 AA 0 0 0 AG 2 2 4 GG 22 21 43 0.045 0.048 0.093 000255 AA 1 1 2 AG 6 10 16 GG 17 12 29 0.240 0.374 0.012 000303 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 000586 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 001002 -- 24 22 46 +- 0 1 1 ++ 0 0 0 0.000 0.011 0.005 001466 CC 2 1 3 CT 19 11 30 TT 2 11 13 9.783 0.741 6.265 001833 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 001906 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 22 43 0.048 0.000 0.023 002274 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 002642 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 002735 CC 20 21 41 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.055 002792 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 002835 GG 22 21 43 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 002855 CC 21 21 42 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.024 002893 GG 20 22 42 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.024 003430 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 003744 GG 24 22 46 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 004515 CC 17 16 33 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.015 0.000 0.008 004546 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 13 16 29 0.668 0.000 0.308 004645 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 17 16 33 0.059 0.000 0.030 004646 CC 17 16 33 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.059 0.000 0.030 004801 AA 18 23 41 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.124 0.000 0.055 004932 GG 17 23 40 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.233 0.000 0.100 005168 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 005394 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 21 22 43 0.107 0.000 0.052 005405 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 008021 AA 0 5 5 AG 0 5 5 GG 13 6 19 0.000 2.221 8.785 008142 AA 2 8 10 AC 4 6 10 CC 7 2 9 1.003 0.259 2.778 008324 -- 12 19 31 +- 11 4 15 ++ 1 0 1 0.618 0.209 0.280 008448 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 008501 AA 18 22 40 AG 5 1 6 GG 1 0 1 0.644 0.011 1.527 008832 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 008952 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 008964 CC 18 20 38 CT 6 3 9 TT 0 0 0 0.490 0.112 0.527 008993 CC 18 22 40 CT 6 1 7 TT 0 0 0 0.490 0.011 0.304 009094 AA 18 20 38 AG 6 3 9 GG 0 0 0 0.490 0.112 0.527 009470 CC 11 13 24 CT 8 8 16 TT 5 2 7 2.003 0.221 2.206 010342 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 010355 AA 4 1 5 AG 9 5 14 GG 11 17 28 0.780 0.571 2.206 010391 -- 18 22 40 +- 5 1 6 ++ 1 0 1 0.644 0.011 1.527 010400 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 010466 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 011023 CC 23 22 45 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.011 0.022 011298 AA 16 7 23 AG 7 9 16 GG 1 7 8 0.044 1.087 2.751 011503 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 011762 CC 10 16 26 CT 9 5 14 TT 5 2 7 1.119 2.200 3.895 012050 CC 23 22 45 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.011 0.022 012060 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 012312 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 24 20 44 0.000 0.112 0.051 012497 AA 13 14 27 AG 8 7 15 GG 3 2 5 0.897 0.616 1.567 012625 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 012795 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 24 21 45 0.000 0.048 0.022 013105 CC 23 10 33 CT 1 9 10 TT 0 4 4 0.011 0.591 4.601 013121 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 013435 AA 5 11 16 AG 7 9 16 GG 12 3 15 3.153 0.277 4.778 013698 -- 0 0 0 +- 0 2 2 ++ 24 21 45 0.000 0.048 0.022 014376 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 014639 AA 24 21 45 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.022 014644 AA 0 0 0 AG 0 6 6 GG 24 17 41 0.000 0.517 0.218 014860 CC 1 0 1 CT 2 0 2 TT 21 23 44 4.959 0.000 10.729 014906 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 1 0 1 4.959 0.000 10.729 015479 CC 22 22 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 016750 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 018576 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 018849 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 17 23 40 0.517 0.000 0.224 019573 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 19 22 41 0.324 0.000 0.152 019891 AA 1 0 1 AG 0 2 2 GG 16 19 35 17.000 0.053 8.474 019954 AA 5 2 7 AC 15 7 22 CC 4 12 16 1.526 0.399 0.015 019970 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 21 40 0.324 0.000 0.156 020415 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 17 21 38 0.015 0.000 0.007 020595 -- 16 21 37 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.016 0.000 0.007 020725 -- 1 0 1 +- 6 0 6 ++ 9 21 30 0.000 0.000 0.936 021240 AA 19 22 41 AT 2 1 3 TT 1 0 1 4.455 0.011 5.985 022092 AA 6 23 29 AG 12 0 12 GG 4 0 4 0.220 0.000 2.351 022187 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001002: a 002274: c 008324: g 010391: g 013698: ccagcct 020415: t 020595: t 020725: a