Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000060 A 0.04 0.04 0.04 G 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 000255 A 0.17 0.26 0.21 G 0.83 0.74 0.79 0.28 0.39 0.33 000303 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000586 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001002 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001466 C 0.50 0.28 0.39 T 0.50 0.72 0.61 0.50 0.41 0.48 001833 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001906 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002274 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002642 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002735 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 002792 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002835 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002855 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002893 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 003430 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003744 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004515 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 004546 C 0.16 0.00 0.09 T 0.84 1.00 0.91 0.27 0.00 0.16 004645 A 0.05 0.00 0.03 G 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.06 004646 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.06 004801 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 004932 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 005168 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005394 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005405 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008021 A 0.00 0.47 0.26 G 1.00 0.53 0.74 0.00 0.50 0.38 008142 C 0.69 0.31 0.48 A 0.31 0.69 0.52 0.43 0.43 0.50 008324 + 0.27 0.09 0.18 - 0.73 0.91 0.82 0.39 0.16 0.30 008448 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008501 G 0.15 0.02 0.09 A 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 008832 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008952 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008964 T 0.12 0.07 0.10 C 0.88 0.93 0.90 0.22 0.12 0.17 008993 T 0.12 0.02 0.07 C 0.88 0.98 0.93 0.22 0.04 0.14 009094 G 0.12 0.07 0.10 A 0.88 0.93 0.90 0.22 0.12 0.17 009470 T 0.38 0.26 0.32 C 0.62 0.74 0.68 0.47 0.39 0.43 010342 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010355 A 0.35 0.15 0.26 G 0.65 0.85 0.74 0.46 0.26 0.38 010391 + 0.15 0.02 0.09 - 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 010400 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 010466 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 011023 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 011298 G 0.19 0.50 0.34 A 0.81 0.50 0.66 0.30 0.50 0.45 011503 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011762 T 0.40 0.20 0.30 C 0.60 0.80 0.70 0.48 0.31 0.42 012050 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 012060 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 012312 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 012497 G 0.29 0.24 0.27 A 0.71 0.76 0.73 0.41 0.36 0.39 012625 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012795 C 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 013105 T 0.02 0.37 0.19 C 0.98 0.63 0.81 0.04 0.47 0.31 013121 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 013435 G 0.65 0.33 0.49 A 0.35 0.67 0.51 0.46 0.44 0.50 013698 - 0.00 0.04 0.02 + 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 014376 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 014639 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 014644 A 0.00 0.13 0.06 G 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 014860 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 014906 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 015479 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016750 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018576 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018849 A 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 019573 C 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019891 A 0.06 0.05 0.05 G 0.94 0.95 0.95 0.11 0.09 0.10 019954 A 0.52 0.26 0.40 C 0.48 0.74 0.60 0.50 0.39 0.48 019970 A 0.10 0.00 0.06 G 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 020415 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 020595 + 0.03 0.00 0.01 - 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 020725 - 0.25 0.00 0.11 + 0.75 1.00 0.89 0.38 0.00 0.19 021240 T 0.09 0.02 0.06 A 0.91 0.98 0.94 0.17 0.04 0.10 022092 G 0.45 0.00 0.22 A 0.55 1.00 0.78 0.50 0.00 0.35 022187 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001002: a 002274: c 008324: g 010391: g 013698: ccagcct 020415: t 020595: t 020725: a