Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000107 C 0.23 0.39 0.31 T 0.77 0.61 0.69 0.35 0.48 0.43 000251 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000267 C 0.17 0.20 0.18 T 0.83 0.80 0.82 0.28 0.31 0.30 000295 C 0.25 0.39 0.32 G 0.75 0.61 0.68 0.38 0.48 0.43 000304 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000320 G 0.23 0.39 0.31 T 0.77 0.61 0.69 0.35 0.48 0.43 000346 A 0.23 0.39 0.31 C 0.77 0.61 0.69 0.35 0.48 0.43 000414 T 0.29 0.37 0.33 C 0.71 0.63 0.67 0.41 0.47 0.44 000415 A 0.19 0.17 0.18 G 0.81 0.83 0.82 0.30 0.29 0.30 000512 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000750 C 0.15 0.17 0.16 T 0.85 0.83 0.84 0.25 0.29 0.27 000792 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000904 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000994 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001073 A 0.11 0.20 0.15 G 0.89 0.80 0.85 0.19 0.32 0.26 001284 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 001297 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001328 T 0.29 0.59 0.44 C 0.71 0.41 0.56 0.41 0.48 0.49 001338 G 0.29 0.59 0.44 C 0.71 0.41 0.56 0.41 0.48 0.49 001359 A 0.33 0.59 0.47 G 0.67 0.41 0.53 0.44 0.48 0.50 001616 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001636 C 0.58 0.09 0.34 T 0.42 0.91 0.66 0.49 0.16 0.45 001650 T 0.57 0.09 0.33 C 0.43 0.91 0.67 0.49 0.16 0.44 001677 G 0.11 0.37 0.24 A 0.89 0.63 0.76 0.19 0.47 0.36 001678 T 0.57 0.09 0.33 C 0.43 0.91 0.67 0.49 0.16 0.44 001767 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001799 G 0.53 0.09 0.29 A 0.47 0.91 0.71 0.50 0.17 0.41 001830 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001963 T 0.11 0.37 0.24 C 0.89 0.63 0.76 0.20 0.47 0.37 002359 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 002589 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003141 C 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 003341 A 0.00 0.11 0.05 T 1.00 0.89 0.95 0.00 0.20 0.10 003345 G 0.00 0.11 0.05 C 1.00 0.89 0.95 0.00 0.20 0.10 003347 A 0.00 0.11 0.05 G 1.00 0.89 0.95 0.00 0.20 0.10 003390 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 003409 T 0.15 0.07 0.11 A 0.85 0.93 0.89 0.26 0.13 0.20 003598 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003670 A 0.00 0.11 0.05 T 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 003772 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003894 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003900 A 0.30 0.41 0.36 G 0.70 0.59 0.64 0.42 0.48 0.46 004051 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004194 C 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 004316 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.11 0.00 0.05 004677 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005057 G 0.05 0.39 0.23 A 0.95 0.61 0.77 0.10 0.47 0.35 005081 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 005919 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005931 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006177 A 0.06 0.38 0.21 G 0.94 0.62 0.79 0.12 0.47 0.33 006279 C 0.33 0.45 0.39 A 0.67 0.55 0.61 0.44 0.50 0.47 006294 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 006431 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006448 A 0.50 0.46 0.48 T 0.50 0.54 0.52 0.50 0.50 0.50 006459 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006510 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006554 A 0.19 0.09 0.14 G 0.81 0.91 0.86 0.30 0.16 0.24 006620 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006630 G 0.33 0.43 0.38 A 0.67 0.57 0.62 0.44 0.49 0.47 006742 G 0.33 0.43 0.38 A 0.67 0.57 0.62 0.44 0.49 0.47 006824 C 0.17 0.09 0.12 G 0.83 0.91 0.88 0.28 0.16 0.21 006893 T 0.47 0.46 0.46 C 0.53 0.54 0.54 0.50 0.50 0.50 007004 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 007027 A 0.00 0.11 0.06 G 1.00 0.89 0.94 0.00 0.19 0.11 007198 G 0.33 0.39 0.37 A 0.67 0.61 0.63 0.44 0.48 0.46 007559 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 007599 G 0.33 0.42 0.37 A 0.67 0.58 0.63 0.44 0.49 0.47 007681 A 0.33 0.42 0.38 G 0.67 0.57 0.62 0.44 0.49 0.47 007904 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 003598: A