Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000100 C 0.57 0.16 0.37 T 0.43 0.84 0.63 0.49 0.27 0.46 000397 A 0.46 0.20 0.33 G 0.54 0.80 0.67 0.50 0.33 0.44 000729 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000790 T 0.10 0.13 0.12 C 0.90 0.87 0.88 0.19 0.23 0.21 000940 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001080 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001224 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001249 A 0.00 0.13 0.06 G 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 001454 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001469 + 0.15 0.00 0.07 - 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 001720 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001917 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 002174 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002271 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002282 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 002294 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002296 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002878 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 002947 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002974 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003137 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003192 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 003204 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003865 T 0.00 0.13 0.06 C 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 003939 A 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 004138 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004164 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004359 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004421 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004541 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004570 A 0.12 0.67 0.39 G 0.88 0.33 0.61 0.22 0.44 0.48 004614 G 0.56 0.20 0.38 A 0.44 0.80 0.62 0.49 0.31 0.47 004848 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.05 004914 T 0.30 0.21 0.25 A 0.70 0.79 0.75 0.42 0.34 0.38 005243 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005245 A 0.70 0.20 0.44 G 0.30 0.80 0.56 0.42 0.31 0.49 005552 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 005923 A 0.46 0.20 0.33 G 0.54 0.80 0.67 0.50 0.31 0.44 006057 C 0.54 0.20 0.37 G 0.46 0.80 0.63 0.50 0.31 0.47 006058 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006180 G 0.50 0.20 0.35 A 0.50 0.80 0.65 0.50 0.31 0.46 006232 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006381 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006560 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 007048 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 007105 C 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 007107 T 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 007138 T 0.17 0.00 0.09 A 0.82 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 008696 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009226 G 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 009393 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 009449 - 0.08 0.13 0.11 + 0.92 0.87 0.89 0.15 0.23 0.19 009451 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 009515 G 0.45 0.20 0.32 A 0.55 0.80 0.68 0.50 0.31 0.44 009516 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009528 T 0.16 0.13 0.14 C 0.84 0.87 0.86 0.27 0.23 0.25 009544 C 0.16 0.13 0.14 G 0.84 0.87 0.86 0.27 0.23 0.25 009583 - 0.46 0.20 0.33 + 0.54 0.80 0.67 0.50 0.31 0.44 009600 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010013 C 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 010356 T 0.46 0.20 0.33 G 0.54 0.80 0.67 0.50 0.31 0.44 010616 C 0.54 0.20 0.37 T 0.46 0.80 0.63 0.50 0.31 0.47 010878 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011050 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011072 T 0.46 0.20 0.33 C 0.54 0.80 0.67 0.50 0.31 0.44 011271 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011392 T 0.15 0.68 0.40 C 0.85 0.32 0.60 0.25 0.43 0.48 011528 G 0.54 0.20 0.37 A 0.46 0.80 0.63 0.50 0.31 0.47 011963 C 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 011978 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012059 + 0.18 0.00 0.09 - 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.16 012223 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012294 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012457 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012578 T 0.12 0.67 0.39 C 0.88 0.33 0.61 0.22 0.44 0.48 012579 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 012596 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012672 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013019 T 0.18 0.77 0.45 A 0.82 0.23 0.55 0.29 0.36 0.50 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001080: t 001469: t 005552: TG 009449: gtgta 009583: ag 012059: C