Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000099 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000104 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000300 C 0.15 0.00 0.08 T 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 000457 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000891 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001155 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001815 C 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 001910 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 004776 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004777 C 0.52 0.00 0.30 T 0.48 1.00 0.70 0.50 0.00 0.42 004950 G 0.52 0.00 0.30 A 0.48 1.00 0.70 0.50 0.00 0.42 004955 C 0.17 0.00 0.10 T 0.83 1.00 0.90 0.28 0.00 0.18 004977 A 0.52 0.00 0.30 G 0.48 1.00 0.70 0.50 0.00 0.42 005344 G 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.02 006207 C 0.17 0.00 0.08 G 0.82 1.00 0.92 0.29 0.00 0.15 006299 C 0.08 0.09 0.09 A 0.92 0.91 0.91 0.15 0.16 0.16 006363 G 0.27 0.52 0.40 C 0.73 0.48 0.60 0.40 0.50 0.48 006621 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006974 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006983 C 0.18 0.00 0.09 A 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.16 006999 C 0.00 0.43 0.22 G 1.00 0.57 0.78 0.00 0.49 0.35 007051 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007079 T 0.09 0.09 0.09 C 0.91 0.91 0.91 0.17 0.16 0.16 007098 G 0.13 0.00 0.07 C 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 007315 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007826 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008105 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008193 C 0.16 0.00 0.09 T 0.84 1.00 0.91 0.27 0.00 0.16 008271 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.15 008314 C 0.20 0.00 0.11 T 0.80 1.00 0.89 0.31 0.00 0.19 008708 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008738 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 008900 A 0.52 0.00 0.27 G 0.48 1.00 0.73 0.50 0.00 0.39 008972 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009020 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009042 C 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 009241 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009260 A 0.35 0.00 0.18 G 0.65 1.00 0.82 0.46 0.00 0.30 009388 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 009570 C 0.50 0.41 0.46 T 0.50 0.59 0.54 0.50 0.48 0.50 009802 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009903 A 0.04 0.09 0.07 G 0.96 0.91 0.93 0.08 0.17 0.12 010315 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010367 G 0.50 0.00 0.25 A 0.50 1.00 0.75 0.50 0.00 0.38 010399 T 0.50 0.00 0.25 G 0.50 1.00 0.75 0.50 0.00 0.38 010436 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010481 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011508 T 0.04 0.09 0.06 C 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 011521 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011579 A 0.08 0.52 0.30 C 0.92 0.48 0.70 0.15 0.50 0.42 011660 C 0.08 0.52 0.30 T 0.92 0.48 0.70 0.15 0.50 0.42 012667 T 0.00 0.06 0.03 C 1.00 0.94 0.97 0.00 0.10 0.05 012770 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 012776 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.10 013058 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 013064 G 0.00 0.42 0.19 A 1.00 0.58 0.81 0.00 0.49 0.31 014361 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014379 C 0.52 0.00 0.27 G 0.48 1.00 0.73 0.50 0.00 0.39 014552 A 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 014781 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014916 T 0.60 0.11 0.36 C 0.40 0.89 0.64 0.48 0.19 0.46 014969 G 0.64 0.13 0.40 A 0.36 0.87 0.60 0.46 0.23 0.48 014990 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 015322 T 0.52 0.00 0.28 C 0.48 1.00 0.72 0.50 0.00 0.40 015332 T 0.04 0.12 0.08 G 0.96 0.88 0.92 0.08 0.21 0.14 016091 T 0.09 0.11 0.10 C 0.91 0.89 0.90 0.16 0.19 0.18 016185 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 016314 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016461 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016479 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 016500 C 0.09 0.57 0.31 G 0.91 0.42 0.69 0.16 0.49 0.43 016638 T 0.52 0.00 0.27 G 0.48 1.00 0.73 0.50 0.00 0.39 016859 T 0.52 0.00 0.27 C 0.48 1.00 0.73 0.50 0.00 0.39 016872 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017147 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017324 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017417 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017631 A 0.07 0.00 0.04 T 0.93 1.00 0.96 0.12 0.00 0.07 017676 G 0.00 0.08 0.04 A 1.00 0.92 0.96 0.00 0.15 0.07 017784 G 0.07 0.08 0.07 C 0.93 0.92 0.93 0.12 0.15 0.13 017804 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017964 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.10 018144 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 018294 T 0.35 0.07 0.22 C 0.65 0.93 0.78 0.46 0.13 0.35 018632 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018703 C 0.52 0.10 0.32 A 0.48 0.90 0.68 0.50 0.17 0.44 018864 G 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 019198 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019393 T 0.14 0.00 0.07 C 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 019808 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 020276 A 0.35 0.07 0.21 G 0.65 0.93 0.79 0.46 0.12 0.33 020800 G 0.33 0.15 0.24 T 0.68 0.85 0.76 0.44 0.26 0.36 021326 T 0.35 0.07 0.21 C 0.65 0.93 0.79 0.46 0.12 0.33 021704 A 0.35 0.07 0.21 G 0.65 0.93 0.79 0.46 0.12 0.33 022409 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.10 022509 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 022587 T 0.57 0.25 0.41 C 0.43 0.75 0.59 0.49 0.38 0.49 023611 T 0.35 0.07 0.21 C 0.65 0.93 0.79 0.46 0.12 0.33 023681 T 0.15 0.11 0.13 C 0.85 0.89 0.87 0.25 0.19 0.22 024340 G 0.67 0.24 0.46 A 0.33 0.76 0.54 0.44 0.36 0.50 024836 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025247 T 0.35 0.07 0.21 C 0.65 0.93 0.79 0.46 0.12 0.33 025375 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 025491 T 0.35 0.07 0.21 C 0.65 0.93 0.79 0.46 0.12 0.33 025608 G 0.12 0.07 0.10 A 0.88 0.93 0.90 0.22 0.12 0.17 026258 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 026496 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 026857 A 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.10 027069 T 0.31 0.14 0.23 C 0.69 0.86 0.77 0.43 0.24 0.36 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000457: gctggcttcagggcc 006621: g