Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000086 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 22 16 38 0.011 0.062 0.059 000135 AA 14 9 23 AG 10 10 20 GG 0 0 0 1.662 2.423 3.949 000194 CC 0 2 2 CG 4 11 15 GG 20 6 26 0.198 0.851 0.008 000261 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 21 19 40 0.048 0.000 0.025 000413 AA 22 12 34 AG 1 3 4 GG 0 0 0 0.011 0.185 0.117 000670 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 21 10 31 0.048 0.025 0.072 000758 GG 22 13 35 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.007 001131 GG 24 20 44 GT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.023 001169 CC 22 21 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 001279 GG 0 0 0 GT 1 3 4 TT 23 19 42 0.011 0.118 0.095 001564 AA 18 22 40 AG 2 0 2 GG 1 0 1 4.203 0.000 9.727 001586 AA 20 20 40 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.012 0.050 0.056 001730 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 20 21 41 0.012 0.000 0.006 001774 AA 5 15 20 AG 12 5 17 GG 4 1 5 0.444 0.429 0.218 001849 CC 20 17 37 CT 1 5 6 TT 0 0 0 0.012 0.362 0.242 001976 GG 20 17 37 GT 1 4 5 TT 0 0 0 0.012 0.233 0.168 002043 CC 8 16 24 CT 10 4 14 TT 3 1 4 0.002 1.037 0.798 002131 AA 0 0 0 AC 0 4 4 CC 24 18 42 0.000 0.220 0.095 002161 AA 0 0 0 AG 1 4 5 GG 23 18 41 0.011 0.220 0.152 002238 -- 23 18 41 +- 0 4 4 ++ 0 0 0 0.000 0.220 0.097 002239 AA 21 19 40 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.025 002248 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 20 18 38 0.112 0.000 0.059 002272 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 18 40 0.011 0.000 0.006 002408 AA 6 1 7 AG 13 6 19 GG 5 16 21 0.174 0.195 0.598 002414 CC 1 0 1 CT 6 1 7 TT 17 22 39 0.240 0.011 0.919 002471 CC 4 1 5 CT 12 6 18 TT 8 16 24 0.020 0.195 0.335 002633 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 002665 GG 21 23 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 002845 AA 23 18 41 AG 1 5 6 GG 0 0 0 0.011 0.342 0.218 002848 AA 23 18 41 AG 1 5 6 GG 0 0 0 0.011 0.342 0.218 003183 -- 1 0 1 +- 8 1 9 ++ 14 15 29 0.011 0.017 0.088 003641 CC 0 0 0 CT 1 4 5 TT 23 19 42 0.011 0.209 0.148 003689 AA 23 18 41 AC 1 4 5 CC 0 0 0 0.011 0.220 0.152 003788 CC 0 0 0 CT 1 4 5 TT 23 18 41 0.011 0.220 0.152 003896 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 003993 AA 0 0 0 AT 1 5 6 TT 23 18 41 0.011 0.342 0.218 004247 AA 0 2 2 AG 4 9 13 GG 20 12 32 0.198 0.028 0.208 004464 CC 9 1 10 CT 11 5 16 TT 4 14 18 0.042 0.360 2.703 004503 -- 1 6 7 +- 12 8 20 ++ 10 4 14 1.239 0.180 0.001 004594 GG 0 0 0 GT 4 0 4 TT 20 21 41 0.198 0.000 0.097 004611 CC 21 21 42 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.054 004670 -- 0 0 0 +- 1 5 6 ++ 23 18 41 0.011 0.342 0.218 004687 AA 0 0 0 AG 1 5 6 GG 23 18 41 0.011 0.342 0.218 004920 GG 21 20 41 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.055 004930 CC 12 7 19 CT 11 9 20 TT 1 4 5 0.618 0.126 0.006 004970 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 20 41 0.107 0.000 0.055 005668 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 005828 AA 1 5 6 AG 10 11 21 GG 13 7 20 0.296 0.030 0.018 005924 AA 0 3 3 AC 4 10 14 CC 20 10 30 0.198 0.040 0.577 005960 CC 0 0 0 CT 1 5 6 TT 23 18 41 0.011 0.342 0.218 005989 AA 22 23 45 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.022 006092 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 006102 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 006219 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 006747 AA 7 20 27 AG 14 3 17 GG 2 0 2 1.775 0.112 0.110 007003 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 007158 AA 7 20 27 AG 14 3 17 GG 3 0 3 0.960 0.112 0.022 007305 AA 3 0 3 AG 14 3 17 GG 7 20 27 0.960 0.112 0.022 007532 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 21 20 41 0.048 0.000 0.024 007583 AA 21 15 36 AG 1 4 5 GG 0 0 0 0.012 0.263 0.173 007632 AA 0 0 0 AT 0 2 2 TT 22 18 40 0.000 0.055 0.025 007673 CC 0 0 0 CT 1 5 6 TT 22 16 38 0.011 0.383 0.236 007803 CC 17 21 38 CT 6 1 7 TT 1 0 1 0.240 0.012 0.875 007995 AA 0 0 0 AT 1 5 6 TT 22 17 39 0.011 0.362 0.230 008517 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 19 21 40 0.053 0.000 0.025 008716 CC 0 0 0 CT 1 5 6 TT 20 16 36 0.012 0.383 0.249 008765 CC 19 21 40 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.025 008804 CC 20 21 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 008879 CC 21 19 40 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.025 008934 CC 22 20 42 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 009187 CC 11 20 31 CG 10 3 13 GG 3 0 3 0.094 0.112 0.954 009225 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 009258 AA 23 20 43 AT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.023 009368 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 009639 AA 21 22 43 AT 3 1 4 TT 0 0 0 0.107 0.011 0.093 009831 CC 1 0 1 CT 6 1 7 TT 17 22 39 0.240 0.011 0.919 010024 -- 0 0 0 +- 1 4 5 ++ 23 19 42 0.011 0.209 0.148 010054 AA 17 5 22 AG 6 11 17 GG 0 3 3 0.517 0.555 0.013 010087 AA 3 0 3 AT 9 1 10 TT 11 18 29 0.277 0.014 2.182 010130 CC 5 0 5 CT 15 1 16 TT 3 18 21 2.272 0.014 0.497 010728 CC 19 22 41 CT 4 0 4 TT 1 0 1 1.361 0.000 3.784 010899 CC 22 20 42 CT 2 3 5 TT 0 0 0 0.045 0.112 0.148 011028 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011029 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 012037 CC 0 0 0 CT 0 5 5 TT 23 18 41 0.000 0.342 0.152 012228 AA 11 20 31 AG 10 3 13 GG 3 0 3 0.094 0.112 0.954 012618 AA 2 16 18 AG 13 6 19 GG 6 1 7 1.702 0.195 0.273 012629 CC 23 18 41 CG 1 5 6 GG 0 0 0 0.011 0.342 0.218 013014 CC 21 21 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.054 013083 AA 24 19 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.013 0.006 013249 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 013252 CC 6 1 7 CG 15 5 20 GG 3 17 20 1.748 0.571 0.289 013311 CC 0 3 3 CT 5 10 15 TT 19 9 28 0.324 0.007 0.255 013432 -- 2 0 2 +- 11 3 14 ++ 11 19 30 0.107 0.118 0.050 013434 CC 21 22 43 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.052 013435 CC 19 21 40 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.013 0.000 0.006 013529 AA 0 0 0 AC 1 5 6 CC 22 18 40 0.011 0.342 0.224 013531 CC 6 16 22 CT 14 7 21 TT 3 0 3 1.308 0.741 0.468 013571 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002238: a 003183: AC 004503: ca 004670: t 010024: TTA 013432: c