Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000086 A 0.02 0.06 0.04 G 0.98 0.94 0.96 0.04 0.10 0.07 000135 G 0.21 0.26 0.23 A 0.79 0.74 0.77 0.33 0.39 0.36 000194 C 0.08 0.39 0.22 G 0.92 0.61 0.78 0.15 0.48 0.34 000261 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 000413 G 0.02 0.10 0.05 A 0.98 0.90 0.95 0.04 0.18 0.10 000670 A 0.04 0.05 0.04 G 0.96 0.95 0.96 0.08 0.09 0.08 000758 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.03 001131 T 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 001169 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001279 G 0.02 0.07 0.04 T 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 001564 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 001586 G 0.02 0.05 0.03 A 0.98 0.95 0.97 0.05 0.09 0.07 001730 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 001774 G 0.48 0.17 0.32 A 0.52 0.83 0.68 0.50 0.28 0.44 001849 T 0.02 0.11 0.07 C 0.98 0.89 0.93 0.05 0.20 0.13 001976 T 0.02 0.10 0.06 G 0.98 0.90 0.94 0.05 0.17 0.11 002043 T 0.38 0.14 0.26 C 0.62 0.86 0.74 0.47 0.24 0.39 002131 A 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.17 0.08 002161 A 0.02 0.09 0.05 G 0.98 0.91 0.95 0.04 0.17 0.10 002238 + 0.00 0.09 0.04 - 1.00 0.91 0.96 0.00 0.17 0.08 002239 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 002248 C 0.07 0.00 0.04 T 0.93 1.00 0.96 0.12 0.00 0.07 002272 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002408 A 0.52 0.17 0.35 G 0.48 0.83 0.65 0.50 0.29 0.46 002414 C 0.17 0.02 0.10 T 0.83 0.98 0.90 0.28 0.04 0.17 002471 C 0.42 0.17 0.30 T 0.58 0.83 0.70 0.49 0.29 0.42 002633 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002665 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002845 G 0.02 0.11 0.06 A 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 002848 G 0.02 0.11 0.06 A 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 003183 - 0.22 0.03 0.14 + 0.78 0.97 0.86 0.34 0.06 0.24 003641 C 0.02 0.09 0.05 T 0.98 0.91 0.95 0.04 0.16 0.10 003689 C 0.02 0.09 0.05 A 0.98 0.91 0.95 0.04 0.17 0.10 003788 C 0.02 0.09 0.05 T 0.98 0.91 0.95 0.04 0.17 0.10 003896 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 003993 A 0.02 0.11 0.06 T 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 004247 A 0.08 0.28 0.18 G 0.92 0.72 0.82 0.15 0.41 0.30 004464 C 0.60 0.17 0.41 T 0.40 0.82 0.59 0.48 0.29 0.48 004503 - 0.30 0.56 0.41 + 0.70 0.44 0.59 0.42 0.49 0.49 004594 G 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 004611 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 004670 - 0.02 0.11 0.06 + 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 004687 A 0.02 0.11 0.06 G 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 004920 T 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 004930 T 0.27 0.42 0.34 C 0.73 0.57 0.66 0.39 0.49 0.45 004970 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 005668 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005828 A 0.25 0.46 0.35 G 0.75 0.54 0.65 0.38 0.50 0.46 005924 A 0.08 0.35 0.21 C 0.92 0.65 0.79 0.15 0.45 0.33 005960 C 0.02 0.11 0.06 T 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 005989 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006092 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006102 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006219 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006747 G 0.39 0.07 0.23 A 0.61 0.93 0.77 0.48 0.12 0.35 007003 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007158 G 0.42 0.07 0.24 A 0.58 0.93 0.76 0.49 0.12 0.37 007305 A 0.42 0.07 0.24 G 0.58 0.93 0.76 0.49 0.12 0.37 007532 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 007583 G 0.02 0.11 0.06 A 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.11 007632 A 0.00 0.05 0.02 T 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.05 007673 C 0.02 0.12 0.07 T 0.98 0.88 0.93 0.04 0.21 0.13 007803 T 0.17 0.02 0.10 C 0.83 0.98 0.90 0.28 0.04 0.18 007995 A 0.02 0.11 0.07 T 0.98 0.89 0.93 0.04 0.20 0.12 008517 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 008716 C 0.02 0.12 0.07 T 0.98 0.88 0.93 0.05 0.21 0.13 008765 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 008804 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008879 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 008934 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 009187 G 0.33 0.07 0.20 C 0.67 0.93 0.80 0.44 0.12 0.32 009225 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009258 T 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 009368 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009639 T 0.06 0.02 0.04 A 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 009831 C 0.17 0.02 0.10 T 0.83 0.98 0.90 0.28 0.04 0.17 010024 - 0.02 0.09 0.05 + 0.98 0.91 0.95 0.04 0.16 0.10 010054 G 0.13 0.45 0.27 A 0.87 0.55 0.73 0.23 0.49 0.40 010087 A 0.33 0.03 0.19 T 0.67 0.97 0.81 0.44 0.05 0.31 010130 C 0.54 0.03 0.31 T 0.46 0.97 0.69 0.50 0.05 0.43 010728 T 0.12 0.00 0.07 C 0.88 1.00 0.93 0.22 0.00 0.12 010899 T 0.04 0.07 0.05 C 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 011028 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011029 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012037 C 0.00 0.11 0.05 T 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 012228 G 0.33 0.07 0.20 A 0.67 0.93 0.80 0.44 0.12 0.32 012618 G 0.60 0.17 0.38 A 0.40 0.83 0.62 0.48 0.29 0.47 012629 G 0.02 0.11 0.06 C 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 013014 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013083 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 013249 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 013252 C 0.56 0.15 0.36 G 0.44 0.85 0.64 0.49 0.26 0.46 013311 C 0.10 0.36 0.23 T 0.90 0.64 0.77 0.19 0.46 0.35 013432 - 0.31 0.07 0.20 + 0.69 0.93 0.80 0.43 0.13 0.31 013434 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013435 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 013529 A 0.02 0.11 0.07 C 0.98 0.89 0.93 0.04 0.19 0.12 013531 T 0.43 0.15 0.29 C 0.57 0.85 0.71 0.49 0.26 0.41 013571 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002238: a 003183: AC 004503: ca 004670: t 010024: TTA 013432: c