Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000253 G 0.02 0.04 0.03 A 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 000466 C 0.17 0.02 0.10 A 0.83 0.98 0.90 0.29 0.04 0.18 000663 - 0.17 0.02 0.10 + 0.83 0.98 0.90 0.29 0.04 0.18 000703 G 0.17 0.20 0.18 A 0.83 0.80 0.82 0.29 0.31 0.30 000798 G 0.09 0.13 0.11 A 0.91 0.87 0.89 0.16 0.23 0.19 000842 G 0.11 0.00 0.05 A 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 000861 A 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 001115 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001228 C 0.29 0.24 0.27 G 0.71 0.76 0.73 0.41 0.36 0.39 001279 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001339 + 0.06 0.00 0.03 - 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001389 C 0.10 0.00 0.06 T 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 001833 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001934 G 0.00 0.05 0.03 C 1.00 0.95 0.97 0.00 0.10 0.05 002067 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002326 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 002331 T 0.17 0.21 0.20 C 0.82 0.79 0.80 0.29 0.34 0.31 002454 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 002548 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.05 002976 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 003135 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 003355 C 0.09 0.24 0.17 G 0.91 0.76 0.83 0.17 0.36 0.28 003479 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 004285 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004311 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004414 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 004958 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004964 - 0.09 0.17 0.13 + 0.91 0.83 0.87 0.17 0.29 0.23 004974 T 0.16 0.00 0.08 C 0.84 1.00 0.92 0.27 0.00 0.14 005072 C 0.14 0.00 0.07 A 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.12 005229 G 0.50 0.20 0.35 T 0.50 0.80 0.65 0.50 0.31 0.46 005625 A 0.31 0.17 0.24 G 0.69 0.83 0.76 0.43 0.29 0.37 005694 - 0.00 0.07 0.03 + 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 005883 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006064 C 0.12 0.17 0.15 T 0.88 0.83 0.85 0.22 0.29 0.25 006474 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006920 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007243 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007244 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007270 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007344 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007357 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007415 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 007602 C 0.17 0.00 0.09 T 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 008344 - 0.35 0.00 0.18 + 0.65 1.00 0.82 0.46 0.00 0.30 008494 C 0.57 0.30 0.43 T 0.43 0.70 0.57 0.49 0.42 0.49 008565 A 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 008696 C 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 009123 T 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 009402 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009943 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010279 G 0.02 0.07 0.04 T 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 010287 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010355 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 010494 T 0.38 0.02 0.20 C 0.62 0.98 0.80 0.47 0.04 0.32 010848 A 0.17 0.17 0.17 G 0.83 0.83 0.83 0.28 0.29 0.28 010849 A 0.17 0.17 0.17 C 0.83 0.83 0.83 0.28 0.29 0.28 010935 A 0.40 0.20 0.30 G 0.60 0.80 0.70 0.48 0.31 0.42 011027 G 0.02 0.11 0.07 A 0.98 0.89 0.93 0.05 0.19 0.13 011124 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011752 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011834 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012183 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012265 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012309 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012337 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000663: gt 001339: Tag 004964: CA 005694: ttta 008344: ttata