Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000176 CC 0 0 0 CT 4 4 8 TT 19 18 37 0.209 0.220 0.428 000327 AA 0 0 0 AG 4 4 8 GG 19 18 37 0.209 0.220 0.428 000384 CC 2 0 2 CT 13 8 21 TT 6 14 20 1.702 1.086 1.460 000528 AA 20 21 41 AT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.024 001007 AA 18 18 36 AG 5 3 8 GG 0 0 0 0.342 0.124 0.440 001094 AA 23 20 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 001119 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 20 43 0.011 0.000 0.006 001182 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 21 20 41 0.107 0.000 0.055 001218 AA 17 18 35 AG 5 2 7 GG 0 0 0 0.362 0.055 0.347 001605 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 20 43 0.011 0.000 0.006 001990 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 20 19 39 0.000 0.013 0.006 002175 CC 20 19 39 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.026 002203 CC 17 18 35 CT 6 4 10 TT 0 0 0 0.517 0.220 0.703 002411 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 002424 CC 1 0 1 CT 7 1 8 TT 16 22 38 0.044 0.011 0.516 002937 GG 16 23 39 GT 6 0 6 TT 1 0 1 0.195 0.000 1.467 003036 CC 1 0 1 CG 6 0 6 GG 17 22 39 0.240 0.000 1.467 003112 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 003344 AA 16 23 39 AT 5 0 5 TT 1 0 1 0.499 0.000 2.288 003950 AA 0 0 0 AG 5 6 11 GG 14 17 31 0.436 0.517 0.954 004185 CC 0 1 1 CT 1 2 3 TT 20 20 40 0.012 4.707 5.825 004236 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 15 23 38 0.583 0.000 0.236 004446 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 004487 CC 12 22 34 CT 8 0 8 TT 0 0 0 1.250 0.000 0.465 004624 CC 17 21 38 CT 3 1 4 TT 0 0 0 0.131 0.012 0.105 004643 CC 0 0 0 CG 8 0 8 GG 12 22 34 1.250 0.000 0.465 004774 CC 20 20 40 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.025 005143 CC 3 0 3 CT 11 1 12 TT 8 21 29 0.065 0.012 1.153 005426 CC 20 23 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 005580 AA 4 0 4 AG 9 2 11 GG 8 21 29 0.257 0.048 3.012 005977 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 19 23 42 0.053 0.000 0.024 006111 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 19 23 42 0.053 0.000 0.024 006207 CC 1 0 1 CT 12 0 12 TT 8 23 31 1.714 0.000 0.016 006215 AA 11 23 34 AC 10 0 10 CC 1 0 1 0.468 0.000 0.067 006320 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 18 18 36 0.220 0.000 0.111 006340 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 16 18 34 0.548 0.000 0.263 006368 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 18 38 0.050 0.000 0.026 006391 AA 19 15 34 AT 3 3 6 TT 0 0 0 0.118 0.149 0.263 006923 CC 22 22 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 007160 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 008616 CC 12 20 32 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.021 0.000 0.008 008902 AA 0 0 0 AG 7 1 8 GG 13 22 35 0.900 0.011 0.452 008937 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 19 23 42 0.013 0.000 0.006 008983 CC 20 23 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 009022 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 19 23 42 0.053 0.000 0.024 009196 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 21 22 43 0.000 0.011 0.006 009392 CC 3 0 3 CG 11 5 16 GG 6 18 24 0.314 0.342 0.022 009843 GG 20 20 40 GT 1 1 2 TT 0 0 0 0.012 0.012 0.025 010403 CC 1 0 1 CT 6 4 10 TT 17 15 32 0.240 0.263 0.043 010478 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 19 41 0.045 0.000 0.024 010482 GG 17 15 32 GT 6 4 10 TT 1 0 1 0.240 0.263 0.043 010793 -- 0 0 0 +- 4 0 4 ++ 18 19 37 0.220 0.000 0.108 011056 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 17 18 35 0.233 0.000 0.114 011177 AA 6 0 6 AG 9 4 13 GG 8 13 21 1.028 0.302 2.374 011693 GG 19 23 42 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 011757 CC 5 19 24 CT 11 4 15 TT 8 0 8 0.114 0.209 3.633 011843 CC 7 0 7 CT 11 4 15 TT 6 19 25 0.160 0.209 2.984 011916 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 011973 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 012080 CC 6 19 25 CG 11 4 15 GG 7 0 7 0.160 0.209 2.984 012488 AA 8 0 8 AC 10 4 14 CC 6 19 25 0.621 0.209 4.651 012669 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 20 20 40 0.000 0.012 0.006 012841 AA 0 0 0 AG 0 3 3 GG 20 20 40 0.000 0.112 0.056 013054 AA 5 18 23 AG 9 4 13 GG 5 0 5 0.053 0.220 1.885 013119 CC 3 0 3 CG 10 4 14 GG 6 18 24 0.120 0.220 0.226 013615 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 22 44 0.045 0.000 0.023 013637 CC 1 0 1 CT 4 3 7 TT 19 19 38 1.361 0.118 0.875 014439 CC 7 0 7 CT 12 4 16 TT 4 15 19 0.087 0.263 1.219 014807 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 14 23 37 0.296 0.000 2.613 014908 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 015065 CC 7 0 7 CT 10 6 16 TT 7 17 24 0.667 0.517 2.206 015075 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 015168 AA 24 21 45 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.022 015174 CC 22 16 38 CT 2 6 8 TT 0 0 0 0.045 0.548 0.417 015397 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 15 23 38 0.583 0.000 0.236 015591 CC 4 16 20 CT 11 4 15 TT 7 0 7 0.008 0.247 1.853 015639 CC 5 15 20 CT 9 6 15 TT 8 0 8 0.609 0.583 2.548 015676 GG 8 0 8 GT 11 6 17 TT 5 15 20 0.114 0.583 1.567 015801 AA 0 0 0 AG 9 0 9 GG 15 21 36 1.278 0.000 0.556 016145 AA 5 16 21 AC 11 6 17 CC 8 0 8 0.114 0.548 1.780 016158 CC 8 0 8 CG 11 6 17 GG 5 16 21 0.114 0.548 1.780 016228 CC 8 0 8 CT 11 6 17 TT 5 16 21 0.114 0.548 1.780 016332 GG 23 22 45 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016383 AA 8 0 8 AG 11 6 17 GG 5 16 21 0.114 0.548 1.780 016567 AA 5 17 22 AG 10 6 16 GG 7 0 7 0.153 0.517 1.800 016587 CC 1 0 1 CT 7 0 7 TT 13 23 36 0.002 0.000 0.786 016616 GG 11 15 26 GT 7 5 12 TT 2 0 2 0.299 0.408 0.156 016627 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 18 20 38 0.014 0.000 0.007 017267 GG 15 22 37 GT 9 0 9 TT 0 0 0 1.278 0.000 0.541 017292 AA 15 22 37 AG 8 0 8 GG 1 0 1 0.003 0.000 0.483 017328 AA 5 17 22 AG 11 5 16 GG 8 0 8 0.114 0.362 2.504 018654 CC 3 0 3 CT 9 7 16 TT 10 16 26 0.177 0.741 0.063 018666 AA 4 15 19 AG 10 8 18 GG 7 0 7 0.016 1.019 0.593 018699 GG 3 0 3 GT 8 7 15 TT 11 16 27 0.577 0.741 0.210 018769 AA 0 0 0 AG 9 1 10 GG 14 22 36 1.361 0.011 0.684 019123 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 22 19 41 0.011 0.013 0.024 019177 GG 0 0 0 GT 5 0 5 TT 18 20 38 0.342 0.000 0.164 019199 AA 0 0 0 AT 9 0 9 TT 14 20 34 1.361 0.000 0.587 019213 AA 0 0 0 AG 9 0 9 GG 14 22 36 1.361 0.000 0.556 020663 CC 0 0 0 CT 10 0 10 TT 13 22 35 1.775 0.000 0.703 020695 CC 0 0 0 CT 10 0 10 TT 13 22 35 1.775 0.000 0.703 020810 CC 0 0 0 CT 10 0 10 TT 13 22 35 1.775 0.000 0.703 020936 AA 16 22 38 AT 7 0 7 TT 0 0 0 0.741 0.000 0.320 020994 CC 0 0 0 CG 9 0 9 GG 13 21 34 1.455 0.000 0.587 021644 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 021665 AA 6 22 28 AG 12 0 12 GG 6 0 6 0.000 0.000 4.815 021674 CC 22 16 38 CT 2 6 8 TT 0 0 0 0.045 0.548 0.417 021688 CC 20 22 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.095 021697 AA 0 0 0 AC 10 0 10 CC 14 22 36 1.662 0.000 0.684 021825 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 021864 AA 14 22 36 AT 10 0 10 TT 0 0 0 1.662 0.000 0.684 022048 AA 0 0 0 AG 10 0 10 GG 14 22 36 1.662 0.000 0.684 022120 CC 0 0 0 CT 10 0 10 TT 14 22 36 1.662 0.000 0.684 022137 AA 0 0 0 AG 10 0 10 GG 14 22 36 1.662 0.000 0.684 022701 -- 18 23 41 +- 2 0 2 ++ 2 0 2 8.295 0.000 18.597 023011 GG 0 0 0 GT 10 0 10 TT 14 23 37 1.662 0.000 0.666 023136 CC 0 0 0 CT 10 0 10 TT 14 23 37 1.662 0.000 0.666 023217 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 023232 CC 1 0 1 CT 9 0 9 TT 14 23 37 0.091 0.000 0.253 023607 AA 0 0 0 AC 10 0 10 CC 14 23 37 1.662 0.000 0.666 023884 GG 0 0 0 GT 9 0 9 TT 15 23 38 1.278 0.000 0.527 023961 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 024010 AA 9 22 31 AC 12 0 12 CC 3 0 3 0.107 0.000 1.348 024105 AA 8 19 27 AG 13 1 14 GG 3 0 3 0.421 0.013 0.390 024382 AA 9 18 27 AG 12 0 12 GG 3 0 3 0.107 0.000 0.964 024483 GG 8 18 26 GT 12 0 12 TT 3 0 3 0.209 0.000 0.872 024486 CC 8 18 26 CG 12 0 12 GG 3 0 3 0.209 0.000 0.872 024554 AA 19 18 37 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.209 0.000 0.108 024627 CC 0 0 0 CG 1 1 2 GG 22 17 39 0.011 0.015 0.026 024986 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 025070 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 025895 AA 0 0 0 AC 2 5 7 CC 22 15 37 0.045 0.408 0.329 026002 CC 20 19 39 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.050 0.000 0.026 026013 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 21 18 39 0.012 0.014 0.026 026054 GG 19 19 38 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.026 026207 GG 0 0 0 GT 2 0 2 TT 22 21 43 0.045 0.000 0.023 026245 CC 21 21 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.054 026369 AA 22 21 43 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.023 026415 GG 0 0 0 GT 1 1 2 TT 23 21 44 0.011 0.012 0.023 028192 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 23 43 0.012 0.000 0.006 028218 AA 2 0 2 AG 13 1 14 GG 7 22 29 1.333 0.011 0.035 028406 AA 21 23 44 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 028411 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 001182: A 010793: t 022701: G