Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000122 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 000234 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 000263 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 20 23 43 0.112 0.000 0.052 000457 CC 0 0 0 CG 0 2 2 GG 23 19 42 0.000 0.053 0.024 000463 AA 22 19 41 AG 1 2 3 GG 0 0 0 0.011 0.053 0.055 000476 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 000542 CC 23 17 40 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.059 0.025 000603 CC 0 0 0 CT 10 2 12 TT 11 16 27 2.051 0.062 1.289 000861 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 001193 AA 10 0 10 AT 11 6 17 TT 3 17 20 0.000 0.517 2.759 001194 AA 3 17 20 AT 11 6 17 TT 10 0 10 0.000 0.517 2.759 001282 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 21 45 0.000 0.012 0.006 001353 CC 16 22 38 CT 8 0 8 TT 0 0 0 0.960 0.000 0.417 001418 CC 10 0 10 CT 11 6 17 TT 3 16 19 0.000 0.548 2.464 001488 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 001561 AA 1 0 1 AG 11 0 11 GG 12 23 35 0.618 0.000 0.015 001876 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 001901 CC 16 19 35 CT 8 1 9 TT 0 0 0 0.960 0.013 0.571 002067 AA 4 16 20 AG 10 4 14 GG 10 3 13 0.296 5.497 7.176 002161 CC 17 23 40 CT 7 0 7 TT 0 0 0 0.700 0.000 0.304 002199 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 002259 AA 3 0 3 AG 12 6 18 GG 9 17 26 0.107 0.517 0.002 002315 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 002621 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 002944 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 003008 AA 2 0 2 AG 7 4 11 GG 15 19 34 0.730 0.209 0.763 003318 AA 2 18 20 AG 8 3 11 GG 12 0 12 0.153 0.124 9.500 003349 GG 1 0 1 GT 7 3 10 TT 14 18 32 0.011 0.124 0.043 003372 CC 22 20 42 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 003397 CC 9 21 30 CT 9 0 9 TT 3 0 3 0.093 0.000 3.052 003526 AA 13 20 33 AG 7 0 7 GG 0 0 0 0.900 0.000 0.368 003585 AA 17 20 37 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.362 0.000 0.168 003664 CC 0 0 0 CG 8 0 8 GG 14 20 34 1.086 0.000 0.465 004122 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 004268 CC 0 0 0 CG 7 0 7 GG 16 23 39 0.741 0.000 0.312 004297 CC 0 0 0 CT 7 0 7 TT 16 23 39 0.741 0.000 0.312 004346 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 20 23 43 0.112 0.000 0.052 004373 CC 16 23 39 CT 7 0 7 TT 0 0 0 0.741 0.000 0.312 004690 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 23 43 0.198 0.000 0.093 004842 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 004862 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 006188 CC 16 23 39 CT 8 0 8 TT 0 0 0 0.960 0.000 0.407 006236 CC 16 23 39 CT 8 0 8 TT 0 0 0 0.960 0.000 0.407 006437 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 006500 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 006890 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 007021 CC 0 0 0 CT 0 4 4 TT 24 19 43 0.000 0.209 0.093 007088 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 007261 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 22 46 0.000 0.011 0.005 007395 CC 11 21 32 CG 4 0 4 GG 0 0 0 0.355 0.000 0.125 007448 CC 14 21 35 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.018 0.000 0.007 007463 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 15 20 35 0.000 0.012 0.007 007640 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 13 21 34 0.077 0.000 0.029 007745 -- 11 17 28 +- 2 4 6 ++ 2 0 2 5.104 0.233 3.310 007775 AA 8 0 8 AG 4 4 8 GG 3 18 21 2.400 0.220 9.498 007986 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 14 22 36 0.018 0.000 0.007 008189 CC 1 0 1 CT 5 0 5 TT 13 23 36 0.294 0.000 2.047 008299 -- 12 19 31 +- 6 4 10 ++ 1 0 1 0.048 0.209 0.032 009090 CC 1 0 1 CG 5 4 9 GG 13 19 32 0.294 0.209 0.144 009252 AA 6 19 25 AG 11 4 15 GG 2 0 2 0.851 0.209 0.017 009260 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 19 22 41 0.000 0.011 0.006 009300 CC 18 23 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 012494 AA 21 18 39 AG 0 4 4 GG 0 0 0 0.000 0.220 0.102 012507 CC 19 22 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.024 012789 AA 1 0 1 AC 7 0 7 CC 13 22 35 0.002 0.000 0.741 013006 AA 0 0 0 AG 0 4 4 GG 24 19 43 0.000 0.209 0.093 013144 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 24 21 45 0.000 0.012 0.006 013198 AA 24 19 43 AG 0 4 4 GG 0 0 0 0.000 0.209 0.093 013204 CC 24 19 43 CT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.209 0.093 013207 AA 0 0 0 AG 0 4 4 GG 24 19 43 0.000 0.209 0.093 013209 CC 24 19 43 CT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.209 0.093 013211 CC 0 0 0 CT 0 4 4 TT 24 19 43 0.000 0.209 0.093 013291 CC 0 0 0 CT 0 3 3 TT 24 19 43 0.000 0.118 0.052 013334 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 013452 CC 24 17 41 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.059 0.024 013730 GG 0 0 0 GT 2 2 4 TT 22 18 40 0.045 0.055 0.100 013874 AA 24 18 42 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.055 0.024 013944 GG 20 17 37 GT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.059 0.027 014263 CC 19 19 38 CG 0 4 4 GG 0 0 0 0.000 0.209 0.105 014361 CC 13 23 36 CT 5 0 5 TT 1 0 1 0.294 0.000 2.047 014869 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 015256 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 015281 GG 7 1 8 GT 11 4 15 TT 6 18 24 0.160 1.252 3.633 015422 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 015659 CC 18 22 40 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.156 015878 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 20 22 42 0.112 0.000 0.054 016094 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 016182 CC 23 19 42 CT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.209 0.095 016190 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 016314 AA 11 23 34 AT 8 0 8 TT 3 0 3 0.577 0.000 4.704 016336 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 19 23 42 0.053 0.000 0.024 017942 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 20 42 0.011 0.000 0.006 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 007745: AGTTCTAGGCCAG 008299: T