Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000288 T 0.23 0.21 0.22 C 0.77 0.79 0.78 0.35 0.34 0.34 000430 G 0.16 0.50 0.33 A 0.84 0.50 0.67 0.27 0.50 0.44 000543 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000626 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 000804 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 001194 T 0.25 0.18 0.22 G 0.75 0.82 0.78 0.38 0.30 0.34 001368 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006952 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007052 - 0.02 0.09 0.05 + 0.98 0.91 0.95 0.04 0.16 0.10 012189 C 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 012241 G 0.02 0.06 0.04 A 0.98 0.94 0.96 0.04 0.10 0.07 012267 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 012369 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012612 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013154 A 0.09 0.20 0.14 G 0.91 0.80 0.86 0.17 0.31 0.25 013616 T 0.04 0.09 0.07 A 0.96 0.91 0.93 0.08 0.17 0.12 014310 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 014351 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017983 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018079 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 018163 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026890 C 0.05 0.09 0.07 T 0.95 0.91 0.93 0.10 0.16 0.13 027862 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 028013 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028478 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028819 C 0.03 0.09 0.06 T 0.97 0.91 0.94 0.05 0.17 0.12 033464 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033556 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 033585 A 0.14 0.52 0.33 G 0.86 0.48 0.67 0.24 0.50 0.44 040139 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 040453 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040570 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040667 T 0.10 0.20 0.15 C 0.90 0.80 0.85 0.19 0.31 0.25 040737 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 047379 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 048263 A 0.17 0.48 0.32 G 0.83 0.52 0.68 0.28 0.50 0.43 049497 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049612 A 0.28 0.15 0.21 G 0.72 0.85 0.79 0.40 0.26 0.33 050056 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 050103 T 0.15 0.48 0.31 C 0.85 0.52 0.69 0.26 0.50 0.43 056642 C 0.15 0.50 0.32 T 0.85 0.50 0.68 0.25 0.50 0.43 057197 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 057210 A 0.02 0.11 0.06 G 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 057521 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 061769 A 0.12 0.50 0.31 C 0.88 0.50 0.69 0.22 0.50 0.43 062027 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 062309 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 062460 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 062632 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 062844 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 062966 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 064874 A 0.05 0.50 0.28 G 0.95 0.50 0.72 0.09 0.50 0.41 065858 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 065992 + 0.02 0.11 0.06 - 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 066205 A 0.24 0.61 0.43 T 0.76 0.39 0.57 0.36 0.48 0.49 066367 G 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 066847 C 0.32 0.13 0.21 T 0.68 0.87 0.79 0.43 0.23 0.34 066883 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.03 067322 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 067486 A 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 068671 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 068897 A 0.12 0.52 0.32 C 0.88 0.48 0.68 0.22 0.50 0.43 068931 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 069323 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 071188 G 0.23 0.07 0.15 C 0.77 0.93 0.85 0.35 0.12 0.25 072749 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 073465 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 074073 C 0.02 0.11 0.06 A 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 074126 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 074127 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 074345 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 075217 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 075797 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 079897 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 080591 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 081344 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 081483 A 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 081567 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 082292 G 0.05 0.00 0.03 A 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 083955 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 084046 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 084466 C 0.10 0.20 0.15 A 0.90 0.80 0.85 0.19 0.33 0.26 084806 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 084855 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 086503 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 086961 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 088737 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 088922 G 0.23 0.07 0.15 A 0.77 0.93 0.85 0.35 0.12 0.25 089535 C 0.06 0.20 0.13 T 0.94 0.80 0.87 0.12 0.31 0.22 090344 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 090535 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 090893 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 091734 C 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000543: TTAA 007052: T 047379: T 065992: A 068671: c 075797: AT