Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000124 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 17 39 0.045 0.000 0.026 000241 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 17 40 0.011 0.000 0.006 000443 AA 24 18 42 AG 0 5 5 GG 0 0 0 0.000 0.342 0.148 001339 CC 0 0 0 CT 3 0 3 TT 21 23 44 0.107 0.000 0.051 001350 CC 22 23 45 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001428 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001561 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 21 19 40 0.048 0.000 0.025 002767 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 20 42 0.011 0.000 0.006 002787 -- 0 2 2 +- 0 0 0 ++ 22 18 40 0.000 20.000 42.000 022512 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 022657 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 023541 CC 22 21 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.023 036166 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 036594 AA 18 21 39 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.006 036788 AA 18 20 38 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.007 038582 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 038594 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 21 22 43 0.107 0.000 0.052 038697 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 038890 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 039495 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 039509 -- 0 0 0 +- 1 1 2 ++ 22 22 44 0.011 0.011 0.023 040590 AA 1 0 1 AT 9 2 11 TT 12 21 33 0.182 0.048 0.005 040655 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 20 20 40 0.000 0.012 0.006 040721 AA 20 21 41 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.012 0.000 0.006 040926 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 18 20 38 0.055 0.000 0.026 041073 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 041386 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 041400 AA 24 20 44 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.112 0.051 041696 AA 21 23 44 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.107 0.000 0.051 042007 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 042601 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 042607 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 042624 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 043117 AA 0 1 1 AC 0 3 3 CC 24 19 43 0.000 2.457 6.306 043188 GG 11 6 17 GT 12 10 22 TT 1 7 8 1.059 0.381 0.037 053949 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 054222 AA 21 22 43 AT 3 1 4 TT 0 0 0 0.107 0.011 0.093 054284 AA 20 22 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 054669 AA 11 5 16 AG 7 9 16 GG 0 6 6 1.049 0.191 0.345 054717 GG 0 6 6 GT 9 9 18 TT 9 5 14 2.000 0.191 0.003 054946 AA 0 7 7 AG 9 10 19 GG 15 6 21 1.278 0.381 0.598 055111 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 055805 CC 16 23 39 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.247 0.000 0.102 055915 GG 20 19 39 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 055930 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 056195 CC 20 21 41 CT 3 2 5 TT 0 0 0 0.112 0.048 0.152 059457 CC 4 14 18 CT 14 9 23 TT 6 0 6 0.734 1.361 0.104 059980 CC 21 23 44 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 061547 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 061833 CC 24 22 46 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 061916 -- 0 2 2 +- 5 9 14 ++ 19 12 31 0.324 0.028 0.068 070766 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 070923 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 071021 AA 20 23 43 AT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 071143 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 072032 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 072598 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 072902 -- 15 12 27 +- 7 8 15 ++ 0 2 2 0.787 0.153 0.002 073220 AA 1 0 1 AG 5 0 5 GG 18 23 41 0.644 0.000 2.448 092450 CC 18 18 36 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.173 092459 AA 2 0 2 AG 9 0 9 GG 12 18 30 0.028 0.000 1.288 092472 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 18 18 36 0.342 0.000 0.173 092571 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 21 43 0.011 0.000 0.006 092610 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 18 21 39 0.342 0.000 0.160 092645 AA 0 0 0 AC 5 0 5 CC 18 22 40 0.342 0.000 0.156 092763 CC 0 0 0 CG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 092772 CC 13 23 36 CT 10 0 10 TT 1 0 1 0.296 0.000 0.094 093257 CC 22 13 35 CT 1 9 10 TT 1 1 2 9.967 0.130 1.214 093277 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 093420 GG 0 0 0 GT 5 0 5 TT 18 22 40 0.342 0.000 0.156 093455 CC 1 0 1 CG 5 0 5 GG 18 22 40 0.644 0.000 2.368 094305 CC 18 23 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 094480 CC 15 20 35 CT 9 3 12 TT 0 0 0 1.278 0.112 1.007 094531 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 094690 GG 19 23 42 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 094833 CC 18 22 40 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.156 094917 AA 22 23 45 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 094951 AA 22 22 44 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 094981 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 095387 GG 19 23 42 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 095522 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 095694 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 095790 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 20 23 43 0.198 0.000 0.093 096103 CC 19 23 42 CG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 096199 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 096361 -- 0 0 0 +- 4 0 4 ++ 15 22 37 0.263 0.000 0.108 096750 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 096943 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 097239 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 17 23 40 0.362 0.000 0.156 097591 AA 22 13 35 AC 1 9 10 CC 1 1 2 9.967 0.130 1.214 097592 CC 1 0 1 CT 8 0 8 TT 15 23 38 0.003 0.000 0.516 097623 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000124: TTG 001561: t 002767: tat 002787: ta 038594: GTTT 038697: AG 038890: agtgaact 039495: GCTTCTATG 039509: TT 061916: tatt 072902: T 096361: C