Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000124 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 000241 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000443 G 0.00 0.11 0.05 A 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 001339 C 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 001350 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001428 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001561 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 002767 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002787 - 0.00 0.10 0.05 + 1.00 0.90 0.95 0.00 0.18 0.09 022512 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022657 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023541 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 036166 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 036594 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 036788 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 038582 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038594 - 0.06 0.00 0.03 + 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 038697 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 038890 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039495 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039509 - 0.02 0.02 0.02 + 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 040590 A 0.25 0.04 0.14 T 0.75 0.96 0.86 0.38 0.08 0.25 040655 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 040721 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 040926 A 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 041073 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 041386 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 041400 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 041696 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 042007 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042601 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042607 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042624 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043117 A 0.00 0.11 0.05 C 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 043188 T 0.29 0.52 0.40 G 0.71 0.48 0.60 0.41 0.50 0.48 053949 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 054222 T 0.06 0.02 0.04 A 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 054284 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 054669 G 0.19 0.53 0.37 A 0.81 0.47 0.63 0.31 0.50 0.47 054717 G 0.25 0.53 0.39 T 0.75 0.47 0.61 0.38 0.50 0.48 054946 A 0.19 0.52 0.35 G 0.81 0.48 0.65 0.30 0.50 0.46 055111 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 055805 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.18 0.00 0.09 055915 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 055930 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 056195 T 0.07 0.04 0.05 C 0.93 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 059457 T 0.54 0.20 0.37 C 0.46 0.80 0.63 0.50 0.31 0.47 059980 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 061547 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 061833 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 061916 - 0.10 0.28 0.19 + 0.90 0.72 0.81 0.19 0.41 0.31 070766 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 070923 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 071021 T 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 071143 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 072032 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 072598 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 072902 + 0.16 0.27 0.22 - 0.84 0.73 0.78 0.27 0.40 0.34 073220 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 092450 T 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 092459 A 0.28 0.00 0.16 G 0.72 1.00 0.84 0.41 0.00 0.27 092472 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 092571 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 092610 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 092645 A 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 092763 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 092772 T 0.25 0.00 0.13 C 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 093257 T 0.06 0.24 0.15 C 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 093277 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 093420 G 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 093455 C 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 094305 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 094480 T 0.19 0.07 0.13 C 0.81 0.93 0.87 0.30 0.12 0.22 094531 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 094690 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 094833 T 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 094917 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 094951 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 094981 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 095387 T 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 095522 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 095694 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 095790 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 096103 G 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 096199 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 096361 - 0.11 0.00 0.05 + 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.09 096750 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 096943 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 097239 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 097591 C 0.06 0.24 0.15 A 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 097592 C 0.21 0.00 0.11 T 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 097623 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000124: TTG 001561: t 002767: tat 002787: ta 038594: GTTT 038697: AG 038890: agtgaact 039495: GCTTCTATG 039509: TT 061916: tatt 072902: T 096361: C