Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000926 C 0.35 0.00 0.03 0.02 0.10 G 0.65 1.00 0.97 0.98 0.90 0.45 0.00 0.05 0.04 0.18 001008 T 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 001070 C 0.00 0.02 0.03 0.00 0.01 G 1.00 0.98 0.97 1.00 0.99 0.00 0.04 0.05 0.00 0.02 001173 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001248 C 0.16 0.00 0.00 0.00 0.04 T 0.84 1.00 1.00 1.00 0.96 0.27 0.00 0.00 0.00 0.07 001315 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.01 001533 A 0.18 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.82 1.00 1.00 1.00 0.97 0.30 0.00 0.00 0.00 0.06 001606 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 001705 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.02 002614 C 0.38 0.00 0.02 0.02 0.11 T 0.62 1.00 0.98 0.98 0.89 0.47 0.00 0.04 0.04 0.20 002659 T 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.09 002980 A 0.42 0.00 0.02 0.02 0.12 C 0.58 1.00 0.98 0.98 0.88 0.49 0.00 0.04 0.04 0.21 003012 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024015 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 024526 A 0.02 0.00 0.03 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.97 1.00 0.99 0.04 0.00 0.05 0.00 0.02 024860 C 0.20 0.00 0.00 0.00 0.05 G 0.80 1.00 1.00 1.00 0.95 0.31 0.00 0.00 0.00 0.09 033669 A 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 G 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.29 0.00 0.00 0.00 0.09 033871 T 0.17 0.00 0.00 0.00 0.05 C 0.83 1.00 1.00 1.00 0.95 0.29 0.00 0.00 0.00 0.09 033910 T 0.02 0.02 0.00 0.00 0.01 C 0.98 0.98 1.00 1.00 0.99 0.04 0.05 0.00 0.00 0.02 034175 G 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 A 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.31 0.00 0.00 0.00 0.10 034287 C 0.20 0.00 0.00 0.00 0.05 T 0.80 1.00 1.00 1.00 0.95 0.32 0.00 0.00 0.00 0.10 034359 G 0.18 0.00 0.00 0.00 0.05 T 0.82 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.09 034374 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 034450 - 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: deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 034450: tatt 034635: actt 056337: ttgt