Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000120 * 000133 CC 14 21 35 CT 10 2 12 TT 0 0 0 1.662 0.048 1.007 000261 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 000329 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 000330 AA 0 2 2 AG 1 9 10 GG 23 12 35 0.011 0.028 1.214 000425 AA 24 13 37 AG 0 7 7 GG 0 3 3 0.000 1.431 6.614 000682 CC 13 4 17 CT 8 9 17 TT 3 9 12 0.897 0.414 2.922 000826 AA 18 21 39 AG 6 2 8 GG 0 0 0 0.490 0.048 0.407 000973 GG 2 0 2 GT 12 0 12 TT 10 23 33 0.375 0.000 0.435 001694 AA 22 23 45 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 002633 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 002695 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 19 23 42 0.324 0.000 0.148 002917 CC 23 19 42 CT 1 3 4 TT 0 0 0 0.011 0.118 0.095 003117 AA 3 3 6 AG 11 11 22 GG 10 8 18 0.000 0.065 0.032 005823 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 19 39 0.012 0.000 0.006 006161 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 006245 AA 19 15 34 AC 5 5 10 CC 0 3 3 0.324 3.728 2.863 006399 AA 9 0 9 AG 9 3 12 GG 5 19 24 0.857 0.118 7.200 006445 AA 14 23 37 AG 8 0 8 GG 2 0 2 0.296 0.000 2.613 006455 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 007378 AA 2 2 4 AC 13 3 16 CC 6 9 15 1.702 2.571 0.007 007379 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 15 35 0.012 0.000 0.007 007570 AA 0 0 0 AG 0 5 5 GG 22 15 37 0.000 0.408 0.168 008133 CC 22 7 29 CT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.543 0.137 008206 AA 0 0 0 AG 9 0 9 GG 13 10 23 1.455 0.000 0.857 008728 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 20 43 0.000 0.050 0.023 008756 CC 15 14 29 CT 7 0 7 TT 0 0 0 0.787 0.000 0.418 008884 CC 0 0 0 CT 3 2 5 TT 19 12 31 0.118 0.083 0.200 008990 CC 21 7 28 CT 0 4 4 TT 0 1 1 0.000 0.148 2.347 010426 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 20 15 35 0.012 0.066 0.064 011182 CC 0 2 2 CT 5 4 9 TT 14 12 26 0.436 2.296 0.949 011298 AA 12 20 32 AG 5 1 6 GG 1 0 1 0.231 0.012 1.053 011724 CC 19 21 40 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.013 0.012 0.025 011753 AA 0 0 0 AG 0 4 4 GG 21 19 40 0.000 0.209 0.100 011797 GG 21 21 42 GT 2 2 4 TT 0 0 0 0.048 0.048 0.095 012012 -- 12 21 33 +- 7 1 8 ++ 3 0 3 1.223 0.012 4.519 012354 AA 5 0 5 AG 8 5 13 GG 4 17 21 0.052 0.362 1.535 012580 AA 12 17 29 AG 6 1 7 GG 2 0 2 0.800 0.015 2.489 012648 CC 10 16 26 CT 6 0 6 TT 3 1 4 1.377 17.000 7.884 012717 AA 15 13 28 AG 4 3 7 GG 0 1 1 0.263 1.495 0.444 013187 AA 5 1 6 AG 8 5 13 GG 3 16 19 0.004 0.499 1.925 016414 AA 0 0 0 AG 8 1 9 GG 9 21 30 1.609 0.012 0.664 016616 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 23 21 44 0.011 0.048 0.051 016862 CC 2 0 2 CG 8 3 11 GG 14 20 34 0.296 0.112 0.763 016872 AA 18 23 41 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.218 016897 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 24 22 46 0.000 0.011 0.005 016915 AA 24 18 42 AT 0 5 5 TT 0 0 0 0.000 0.342 0.148 016928 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 017034 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 017157 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 017257 AA 0 0 0 AG 1 2 3 GG 23 21 44 0.011 0.048 0.051 017516 CC 0 0 0 CT 4 9 13 TT 16 14 30 0.247 1.361 1.364 017752 CC 19 21 40 CT 5 2 7 TT 0 0 0 0.324 0.048 0.304 017868 AA 0 2 2 AG 3 7 10 GG 21 14 35 0.107 0.616 1.214 017995 -- 0 0 0 +- 11 0 11 ++ 13 23 36 2.121 0.000 0.826 018027 AA 22 13 35 AG 2 7 9 GG 0 3 3 0.045 1.431 3.846 018113 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 018117 CC 17 23 40 CG 5 0 5 GG 0 0 0 0.362 0.000 0.156 018143 CC 3 2 5 CT 7 10 17 TT 7 11 18 0.279 0.017 0.098 019285 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 18 20 38 0.000 0.012 0.007 019590 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 019652 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 019798 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 019826 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 019874 AA 24 15 39 AG 0 8 8 GG 0 0 0 0.000 1.019 0.407 019962 CC 19 19 38 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.013 0.000 0.007 020048 AA 1 0 1 AC 1 0 1 CC 15 21 36 6.842 0.000 16.202 020081 CC 17 21 38 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.015 0.000 0.007 020137 AA 0 1 1 AG 0 0 0 GG 20 19 39 0.000 20.000 40.000 020207 AA 0 1 1 AG 0 0 0 GG 19 19 38 0.000 20.000 39.000 020319 CC 0 0 0 CT 0 5 5 TT 23 8 31 0.000 0.737 0.200 020701 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 020835 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 021144 AA 1 0 1 AG 6 0 6 GG 11 20 31 0.023 0.000 0.994 021189 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 16 20 36 0.016 0.000 0.007 021239 GG 14 21 35 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.159 0.000 0.064 022680 CC 12 23 35 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.327 0.000 0.114 022681 AA 1 7 8 AG 5 9 14 GG 9 7 16 0.070 1.087 1.993 022874 CC 17 22 39 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 022902 CC 12 21 33 CG 5 0 5 GG 0 0 0 0.505 0.000 0.188 023118 AA 13 21 34 AC 4 0 4 CC 0 0 0 0.302 0.000 0.117 023138 AA 11 12 23 AC 6 8 14 CC 0 1 1 0.781 0.053 0.446 023152 CC 0 2 2 CT 0 8 8 TT 17 11 28 0.000 0.093 1.649 023223 CC 2 8 10 CT 9 8 17 TT 6 4 10 0.248 0.556 0.243 023377 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 023454 CC 0 0 0 CG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 024248 AA 0 1 1 AG 8 6 14 GG 7 16 23 1.983 0.195 0.446 024287 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 13 23 36 0.077 0.000 0.028 024723 CC 2 0 2 CT 7 5 12 TT 8 11 19 0.060 0.549 0.003 024814 GG 18 20 38 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.055 0.000 0.026 024967 AA 1 0 1 AT 4 0 4 TT 9 22 31 0.321 0.000 2.678 024968 AA 0 0 0 AT 7 0 7 TT 7 22 29 1.556 0.000 0.418 025053 -- 0 0 0 +- 0 5 5 ++ 12 17 29 0.000 0.362 0.214 025365 AA 2 0 2 AC 7 0 7 CC 11 14 25 0.299 0.000 1.972 025606 AA 11 13 24 AC 7 0 7 CC 2 0 2 0.299 0.000 1.844 029829 AA 13 12 25 AC 6 1 7 CC 1 0 1 0.078 0.021 0.326 030123 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 17 20 37 0.362 0.000 0.168 030293 CC 16 20 36 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.050 0.028 030489 CC 0 1 1 CT 1 8 9 TT 19 11 30 0.013 0.089 0.106 030490 AA 0 1 1 AG 3 9 12 GG 16 10 26 0.140 0.330 0.078 030712 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 16 12 28 0.548 0.000 0.318 030769 AA 0 0 0 AT 1 3 4 TT 21 8 29 0.012 0.274 0.137 031041 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 13 21 34 0.077 0.000 0.029 035852 AA 12 20 32 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.083 0.000 0.031 036251 AA 3 11 14 AC 12 6 18 CC 7 1 8 0.362 0.023 0.251 036415 AA 14 15 29 AG 0 5 5 GG 0 2 2 0.000 2.001 4.798 036467 CC 9 12 21 CT 4 8 12 TT 0 1 1 0.430 0.053 0.214 036494 CC 11 22 33 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.090 0.000 0.030 036541 CC 10 22 32 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.389 0.000 0.125 036615 AA 0 0 0 AG 10 5 15 GG 9 16 25 2.423 0.383 2.130 036658 CC 0 3 3 CT 4 12 16 TT 16 7 23 0.247 0.362 0.009 036742 AA 19 18 37 AT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.220 0.108 036881 CC 0 2 2 CT 4 6 10 TT 15 14 29 0.263 1.099 0.788 038782 AA 4 10 14 AC 8 10 18 CC 6 1 7 0.180 0.583 0.083 038811 CC 5 0 5 CT 9 12 21 TT 4 9 13 0.000 3.360 0.602 039219 CC 12 12 24 CT 10 5 15 TT 2 6 8 0.002 6.546 3.633 039220 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 039289 CC 17 23 40 CT 6 0 6 TT 1 0 1 0.240 0.000 1.527 040691 AA 2 14 16 AG 6 5 11 GG 8 1 9 0.259 0.360 4.793 040871 CC 11 20 31 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.090 0.000 0.032 041370 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 043992 AA 2 2 4 AG 4 3 7 GG 10 17 27 1.778 5.290 6.658 044235 AA 10 9 19 AG 5 7 12 GG 0 6 6 0.600 2.719 2.501 045071 AA 0 1 1 AG 0 5 5 GG 17 16 33 0.000 0.499 1.808 045084 CC 1 0 1 CG 3 0 3 GG 8 23 31 0.703 0.000 4.382 045374 AA 10 17 27 AT 1 5 6 TT 0 1 1 0.025 0.571 0.765 046244 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 16 20 36 0.016 0.000 0.007 046378 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 16 18 34 0.000 0.055 0.029 046762 AA 0 0 0 AG 2 3 5 GG 17 19 36 0.059 0.118 0.173 048462 CC 16 12 28 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.140 0.000 0.080 048566 CC 0 0 0 CT 7 0 7 TT 12 12 24 0.969 0.000 0.502 049290 CC 18 20 38 CT 4 3 7 TT 1 0 1 1.252 0.112 0.875 049372 AA 18 17 35 AG 4 5 9 GG 1 1 2 1.252 0.571 1.727 049607 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 049845 CC 0 0 0 CT 2 2 4 TT 20 20 40 0.050 0.050 0.100 049873 AA 15 22 37 AG 7 0 7 GG 1 0 1 0.025 0.000 0.830 050828 AA 0 0 0 AC 6 0 6 CC 16 20 36 0.548 0.000 0.249 051091 CC 10 18 28 CG 1 3 4 GG 0 0 0 0.025 0.124 0.142 051531 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 20 22 42 0.000 0.011 0.006 051764 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 052206 GG 0 1 1 GT 0 2 2 TT 22 20 42 0.000 4.707 10.228 052269 -- 0 1 1 +- 3 6 9 ++ 20 13 33 0.112 0.078 0.164 052294 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 052479 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.048 0.000 0.023 053000 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 053167 -- 1 6 7 +- 10 4 14 ++ 6 13 19 1.409 8.746 2.130 053196 CC 0 1 1 CT 0 2 2 TT 17 20 37 0.000 4.707 8.975 057305 AA 6 9 15 AG 11 5 16 GG 2 8 10 0.851 6.523 1.769 057443 AA 20 22 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 057890 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 058351 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 058603 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 17 21 38 0.000 0.048 0.026 058643 CC 0 1 1 CT 0 2 2 TT 17 20 37 0.000 4.707 8.975 058829 GG 2 7 9 GT 13 4 17 TT 6 12 18 1.702 9.272 1.648 058856 AA 23 21 44 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.023 060067 AA 19 21 40 AG 0 1 1 GG 0 1 1 0.000 9.521 17.982 060486 CC 18 23 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 061631 AA 18 21 39 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.055 0.000 0.026 061634 GG 0 1 1 GT 0 2 2 TT 20 18 38 0.000 4.203 9.226 061652 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 20 21 41 0.000 0.012 0.006 062222 CC 22 20 42 CT 0 2 2 TT 0 1 1 0.000 4.707 10.228 062253 CC 22 21 43 CG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.023 062311 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 062669 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 16 22 38 0.016 0.000 0.007 062783 AA 20 18 38 AG 0 2 2 GG 0 1 1 0.000 4.203 9.226 062964 GG 17 21 38 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.059 0.000 0.026 063070 AA 17 20 37 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.059 0.000 0.027 063366 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 24 21 45 0.000 0.048 0.022 063467 CC 0 0 0 CT 2 4 6 TT 22 19 41 0.045 0.209 0.218 063771 CC 0 1 1 CT 0 2 2 TT 24 18 42 0.000 4.203 10.228 063838 CC 22 21 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 063843 CC 0 1 1 CT 6 8 14 TT 18 12 30 0.490 0.053 0.185 064244 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 23 44 0.012 0.000 0.006 064391 AA 19 19 38 AG 3 4 7 GG 1 0 1 2.457 0.209 0.875 064635 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 064771 CC 0 0 0 CT 1 2 3 TT 22 18 40 0.011 0.055 0.056 065690 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 24 22 46 0.000 0.011 0.005 065912 AA 15 23 38 AT 7 0 7 TT 1 0 1 0.025 0.000 0.875 065990 CC 0 1 1 CT 0 2 2 TT 23 20 43 0.000 4.707 10.478 066090 CC 0 1 1 CT 5 8 13 TT 18 14 32 0.342 0.011 0.058 066318 AA 18 19 37 AG 5 4 9 GG 1 0 1 0.644 0.209 0.253 066460 AA 9 12 21 AT 13 4 17 TT 2 7 9 0.813 9.272 2.404 067022 GG 21 23 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 067113 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 23 43 0.050 0.000 0.023 067134 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 23 44 0.012 0.000 0.006 067272 CC 19 14 33 CT 4 8 12 TT 0 1 1 0.209 0.011 0.006 068150 AA 21 17 38 AG 0 2 2 GG 0 1 1 0.000 3.951 9.226 068159 AA 23 18 41 AG 0 1 1 GG 0 1 1 0.000 8.183 18.427 068309 AA 0 1 1 AT 0 2 2 TT 24 20 44 0.000 4.707 10.729 068359 GG 1 0 1 GT 7 0 7 TT 16 23 39 0.044 0.000 0.919 068371 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 068500 AA 18 23 41 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.218 068648 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 15 23 38 0.017 0.000 0.007 068656 AA 15 23 38 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.017 0.000 0.007 068689 AA 15 23 38 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.017 0.000 0.007 068877 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 15 22 37 0.000 0.011 0.007 068950 GG 13 23 36 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.468 0.000 0.173 069071 CC 17 23 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.015 0.000 0.006 069116 GG 18 22 40 GT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 069439 AA 18 14 32 AT 5 6 11 TT 0 1 1 0.342 0.114 0.002 069759 AA 18 17 35 AC 5 4 9 CC 1 2 3 0.644 3.584 3.846 070061 CC 0 2 2 CT 0 2 2 TT 24 19 43 0.000 8.746 19.489 070186 CC 13 13 26 CT 10 7 17 TT 0 3 3 1.775 1.431 0.010 070238 CC 23 21 44 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.023 070396 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 23 45 0.011 0.000 0.006 070912 CC 0 1 1 CT 0 2 2 TT 21 19 40 0.000 4.455 9.727 071145 AA 22 22 44 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 071377 CC 14 19 33 CT 3 2 5 TT 0 2 2 0.159 8.746 5.596 071751 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 22 42 0.050 0.000 0.024 071801 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 21 43 0.000 0.012 0.006 072022 CC 24 22 46 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 072096 CC 14 19 33 CT 9 2 11 TT 1 2 3 0.091 8.746 2.074 072182 AA 1 1 2 AG 9 3 12 GG 14 19 33 0.091 2.457 0.435 072320 CC 24 20 44 CT 0 2 2 TT 0 1 1 0.000 4.707 10.729 072381 AA 15 9 24 AG 8 6 14 GG 1 8 9 0.003 5.239 5.328 072440 CC 0 1 1 CT 5 8 13 TT 19 14 33 0.324 0.011 0.046 072704 CC 0 0 0 CG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 073486 GG 21 23 44 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 073679 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 073692 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 073853 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 073977 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 14 18 32 0.018 0.000 0.008 073980 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 14 18 32 0.018 0.000 0.008 074608 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 23 43 0.012 0.000 0.006 074759 CC 1 0 1 CT 7 0 7 TT 13 23 36 0.002 0.000 0.786 074821 AA 1 2 3 AG 9 2 11 GG 11 19 30 0.247 8.746 1.725 074885 CC 18 19 37 CT 3 2 5 TT 0 2 2 0.124 8.746 6.392 075215 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 21 44 0.000 0.012 0.006 075266 AA 23 19 42 AG 0 2 2 GG 0 1 1 0.000 4.455 10.228 075628 AA 5 2 7 AG 6 2 8 GG 4 19 23 0.579 8.746 9.057 075824 AA 18 23 41 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.124 0.000 0.055 075898 AA 2 15 17 AG 10 6 16 GG 8 2 10 0.196 1.252 2.386 076296 CC 0 0 0 CT 0 8 8 TT 24 14 38 0.000 1.086 0.417 076376 CC 24 21 45 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 076678 CC 7 2 9 CT 5 3 8 TT 2 14 16 0.460 4.281 7.998 077781 AA 0 0 0 AG 0 8 8 GG 24 15 39 0.000 1.019 0.407 077912 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 078024 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 078043 AA 0 5 5 AG 1 9 10 GG 23 9 32 0.011 0.857 6.257 078183 AA 1 8 9 AG 6 6 12 GG 15 9 24 0.153 5.239 7.200 078295 CC 21 22 43 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.012 0.011 0.023 078552 CC 22 20 42 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 078580 CC 0 1 1 CG 4 7 11 GG 18 13 31 0.220 0.002 0.000 078703 AA 22 20 42 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.012 0.006 078998 CC 22 19 41 CT 2 4 6 TT 0 0 0 0.045 0.209 0.218 079131 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 079697 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 079953 CC 14 9 23 CT 8 6 14 TT 1 8 9 0.011 5.239 4.984 079997 AA 17 19 36 AC 5 3 8 CC 0 0 0 0.362 0.118 0.440 080525 AA 1 2 3 AG 9 2 11 GG 14 19 33 0.091 8.746 2.074 080580 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 080596 AA 5 2 7 AG 11 10 21 GG 8 11 19 0.114 0.017 0.091 080753 -- 4 10 14 +- 12 8 20 ++ 8 5 13 0.020 1.675 1.037 080892 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 080948 CC 5 3 8 CT 11 10 21 TT 8 10 18 0.114 0.040 0.193 081067 AA 18 19 37 AG 5 4 9 GG 1 0 1 0.644 0.209 0.253 081457 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 081994 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 082005 AA 0 0 0 AG 2 4 6 GG 22 19 41 0.045 0.209 0.218 082114 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 082203 CC 21 23 44 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 082216 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 085386 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 15 23 38 0.149 0.000 0.059 085609 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 085716 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 086375 AA 12 23 35 AG 7 0 7 GG 1 0 1 0.000 0.000 0.741 086534 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 17 23 40 0.059 0.000 0.025 086644 AA 19 20 39 AC 0 2 2 CC 0 1 1 0.000 4.707 9.476 086729 GG 2 2 4 GT 7 2 9 TT 10 19 29 0.207 8.746 4.749 086878 CC 1 1 2 CT 4 8 12 TT 14 14 28 0.825 0.011 0.227 086927 GG 14 10 24 GT 4 4 8 TT 1 8 9 0.825 8.824 12.378 086952 -- 0 2 2 +- 3 2 5 ++ 16 19 35 0.140 8.746 5.994 087151 -- 0 0 0 +- 0 2 2 ++ 19 18 37 0.000 0.055 0.027 088219 CC 16 14 30 CT 6 8 14 TT 1 1 2 0.195 0.011 0.050 088390 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 19 23 42 0.209 0.000 0.095 089067 CC 0 0 0 CG 2 4 6 GG 19 18 37 0.053 0.220 0.242 090717 -- 0 0 0 +- 5 1 6 ++ 19 22 41 0.324 0.011 0.218 090869 CC 2 8 10 CT 11 6 17 TT 11 9 20 0.107 5.239 2.759 091135 GG 24 19 43 GT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.209 0.093 091198 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 091355 AA 5 3 8 AG 11 11 22 GG 7 9 16 0.030 0.016 0.009 091400 AA 19 23 42 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.209 0.000 0.095 091528 AA 7 9 16 AG 11 11 22 GG 5 3 8 0.030 0.016 0.009 091555 AA 23 20 43 AG 0 2 2 GG 0 1 1 0.000 4.707 10.478 091915 AA 23 21 44 AG 0 2 2 GG 0 0 0 0.000 0.048 0.023 092518 AA 3 9 12 AG 11 8 19 GG 6 6 12 0.314 1.965 0.581 093010 AA 20 23 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 093353 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 093725 CC 0 1 1 CT 0 2 2 TT 23 20 43 0.000 4.707 10.478 093904 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 093997 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 23 45 0.011 0.000 0.006 094041 GG 8 9 17 GT 11 11 22 TT 5 3 8 0.114 0.016 0.037 094134 AA 3 9 12 AG 12 8 20 GG 8 5 13 0.209 1.352 0.551 094285 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 094362 -- 1 8 9 +- 11 6 17 ++ 11 8 19 0.741 4.545 1.895 094447 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 21 41 0.012 0.000 0.006 094491 AA 21 17 38 AT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.233 0.105 094887 CC 7 3 10 CT 10 11 21 TT 6 9 15 0.381 0.016 0.266 094944 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 095071 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 23 44 0.048 0.000 0.023 095239 AA 21 23 44 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 095293 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 095828 AA 20 23 43 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.050 0.000 0.023 095942 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 095972 GG 0 0 0 GT 2 3 5 TT 22 20 42 0.045 0.112 0.148 096705 AA 8 18 26 AG 7 3 10 GG 3 1 4 0.445 2.296 3.207 097460 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 22 22 44 0.000 0.011 0.006 098641 AA 0 0 0 AG 2 3 5 GG 22 20 42 0.045 0.112 0.148 099012 AA 20 23 43 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.112 0.000 0.052 099361 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 099382 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 099453 AA 5 12 17 AG 10 9 19 GG 9 2 11 0.490 0.028 1.491 099655 CC 23 22 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 099669 AA 0 0 0 AT 0 3 3 TT 23 20 43 0.000 0.112 0.052 099954 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 100216 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 100275 CC 0 0 0 CT 0 4 4 TT 24 19 43 0.000 0.209 0.093 100309 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 100709 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 16 23 39 0.016 0.000 0.006 100837 -- 17 23 40 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.015 0.000 0.006 100954 -- 1 8 9 +- 10 14 24 ++ 7 1 8 1.125 2.685 1.205 101267 -- 11 15 26 +- 8 7 15 ++ 2 1 3 0.093 0.025 0.168 101721 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 18 20 38 0.014 0.000 0.007 101780 AA 18 20 38 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.007 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 012012: t 016897: c 017995: T 025053: TT 052269: Tt 053000: a 053167: t 068648: aa 080753: g 086952: g 087151: a 090717: GT 093997: GTT 094362: ATA 097460: tcaa 100837: tca 100954: aagt 101267: aa 101721: agaa Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop Total-pop 000120 AA 1 0 1 000120 AC 0 0 0 000120 AG 3 1 4 000120 CC 0 2 2 000120 CG 0 9 9 000120 GG 20 11 31