Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000120 * 000133 T 0.21 0.04 0.13 C 0.79 0.96 0.87 0.33 0.08 0.22 000261 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 000329 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000330 A 0.02 0.28 0.15 G 0.98 0.72 0.85 0.04 0.41 0.25 000425 G 0.00 0.28 0.14 A 1.00 0.72 0.86 0.00 0.41 0.24 000682 T 0.29 0.61 0.45 C 0.71 0.39 0.55 0.41 0.47 0.49 000826 G 0.12 0.04 0.09 A 0.88 0.96 0.91 0.22 0.08 0.16 000973 G 0.33 0.00 0.17 T 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 001694 T 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 002633 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002695 C 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 002917 T 0.02 0.07 0.04 C 0.98 0.93 0.96 0.04 0.13 0.08 003117 A 0.35 0.39 0.37 G 0.65 0.61 0.63 0.46 0.47 0.47 005823 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 006161 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006245 C 0.10 0.24 0.17 A 0.90 0.76 0.83 0.19 0.36 0.28 006399 A 0.59 0.07 0.33 G 0.41 0.93 0.67 0.48 0.13 0.44 006445 G 0.25 0.00 0.13 A 0.75 1.00 0.87 0.38 0.00 0.22 006455 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007378 A 0.40 0.25 0.34 C 0.60 0.75 0.66 0.48 0.38 0.45 007379 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 007570 A 0.00 0.12 0.06 G 1.00 0.88 0.94 0.00 0.22 0.11 008133 T 0.00 0.18 0.06 C 1.00 0.82 0.94 0.00 0.30 0.11 008206 A 0.20 0.00 0.14 G 0.80 1.00 0.86 0.33 0.00 0.24 008728 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 008756 T 0.16 0.00 0.10 C 0.84 1.00 0.90 0.27 0.00 0.18 008884 C 0.07 0.07 0.07 T 0.93 0.93 0.93 0.13 0.13 0.13 008990 T 0.00 0.25 0.09 C 1.00 0.75 0.91 0.00 0.38 0.17 010426 A 0.02 0.06 0.04 G 0.98 0.94 0.96 0.05 0.11 0.08 011182 C 0.13 0.22 0.18 T 0.87 0.78 0.82 0.23 0.35 0.29 011298 G 0.19 0.02 0.10 A 0.81 0.98 0.90 0.31 0.05 0.18 011724 T 0.03 0.02 0.02 C 0.97 0.98 0.98 0.05 0.04 0.05 011753 A 0.00 0.09 0.05 G 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.09 011797 T 0.04 0.04 0.04 G 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 012012 + 0.30 0.02 0.16 - 0.70 0.98 0.84 0.42 0.04 0.27 012354 A 0.53 0.11 0.29 G 0.47 0.89 0.71 0.50 0.20 0.42 012580 G 0.25 0.03 0.14 A 0.75 0.97 0.86 0.38 0.05 0.25 012648 T 0.32 0.06 0.19 C 0.68 0.94 0.81 0.43 0.11 0.31 012717 G 0.11 0.15 0.12 A 0.89 0.85 0.88 0.19 0.25 0.22 013187 A 0.56 0.16 0.33 G 0.44 0.84 0.67 0.49 0.27 0.44 016414 A 0.24 0.02 0.12 G 0.76 0.98 0.88 0.36 0.04 0.20 016616 A 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 016862 C 0.25 0.07 0.16 G 0.75 0.93 0.84 0.38 0.12 0.27 016872 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 016897 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016915 T 0.00 0.11 0.05 A 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 016928 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017034 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017157 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 017257 A 0.02 0.04 0.03 G 0.98 0.96 0.97 0.04 0.08 0.06 017516 C 0.10 0.20 0.15 T 0.90 0.80 0.85 0.18 0.31 0.26 017752 T 0.10 0.04 0.07 C 0.90 0.96 0.93 0.19 0.08 0.14 017868 A 0.06 0.24 0.15 G 0.94 0.76 0.85 0.12 0.36 0.25 017995 - 0.23 0.00 0.12 + 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 018027 G 0.04 0.28 0.16 A 0.96 0.72 0.84 0.08 0.41 0.27 018113 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018117 G 0.11 0.00 0.06 C 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.10 018143 C 0.38 0.30 0.34 T 0.62 0.70 0.66 0.47 0.42 0.45 019285 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.03 019590 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019652 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019798 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019826 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019874 G 0.00 0.17 0.09 A 1.00 0.83 0.91 0.00 0.29 0.16 019962 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 020048 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 020081 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 020137 A 0.00 0.05 0.03 G 1.00 0.95 0.97 0.00 0.10 0.05 020207 A 0.00 0.05 0.03 G 1.00 0.95 0.97 0.00 0.10 0.05 020319 C 0.00 0.19 0.07 T 1.00 0.81 0.93 0.00 0.31 0.13 020701 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 020835 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 021144 A 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.35 0.00 0.19 021189 C 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 021239 T 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 022680 T 0.12 0.00 0.05 C 0.88 1.00 0.95 0.22 0.00 0.10 022681 A 0.23 0.50 0.39 G 0.77 0.50 0.61 0.36 0.50 0.48 022874 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 022902 G 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.12 023118 C 0.12 0.00 0.05 A 0.88 1.00 0.95 0.21 0.00 0.10 023138 C 0.18 0.24 0.21 A 0.82 0.76 0.79 0.29 0.36 0.33 023152 C 0.00 0.29 0.16 T 1.00 0.71 0.84 0.00 0.41 0.27 023223 T 0.62 0.40 0.50 C 0.38 0.60 0.50 0.47 0.48 0.50 023377 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 023454 C 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 024248 A 0.27 0.17 0.21 G 0.73 0.83 0.79 0.39 0.29 0.33 024287 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.05 024723 C 0.32 0.16 0.24 T 0.68 0.84 0.76 0.44 0.26 0.37 024814 T 0.05 0.00 0.03 G 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 024967 A 0.21 0.00 0.08 T 0.79 1.00 0.92 0.34 0.00 0.15 024968 A 0.25 0.00 0.10 T 0.75 1.00 0.90 0.38 0.00 0.18 025053 - 0.00 0.11 0.07 + 1.00 0.89 0.93 0.00 0.20 0.14 025365 A 0.28 0.00 0.16 C 0.72 1.00 0.84 0.40 0.00 0.27 025606 C 0.28 0.00 0.17 A 0.72 1.00 0.83 0.40 0.00 0.28 029829 C 0.20 0.04 0.14 A 0.80 0.96 0.86 0.32 0.07 0.24 030123 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 030293 T 0.00 0.05 0.03 C 1.00 0.95 0.97 0.00 0.09 0.05 030489 C 0.03 0.25 0.14 T 0.97 0.75 0.86 0.05 0.38 0.24 030490 A 0.08 0.28 0.18 G 0.92 0.72 0.82 0.15 0.40 0.29 030712 A 0.14 0.00 0.09 G 0.86 1.00 0.91 0.24 0.00 0.16 030769 A 0.02 0.14 0.06 T 0.98 0.86 0.94 0.04 0.24 0.11 031041 C 0.07 0.00 0.03 T 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.05 035852 C 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 036251 C 0.59 0.22 0.42 A 0.41 0.78 0.57 0.48 0.35 0.49 036415 G 0.00 0.20 0.12 A 1.00 0.80 0.88 0.00 0.33 0.22 036467 T 0.15 0.24 0.21 C 0.85 0.76 0.79 0.26 0.36 0.33 036494 T 0.08 0.00 0.03 C 0.92 1.00 0.97 0.14 0.00 0.06 036541 T 0.14 0.00 0.06 C 0.86 1.00 0.94 0.24 0.00 0.10 036615 A 0.26 0.12 0.19 G 0.74 0.88 0.81 0.39 0.21 0.30 036658 C 0.10 0.41 0.26 T 0.90 0.59 0.74 0.18 0.48 0.39 036742 T 0.00 0.09 0.05 A 1.00 0.91 0.95 0.00 0.17 0.09 036881 C 0.11 0.23 0.17 T 0.89 0.77 0.83 0.19 0.35 0.28 038782 C 0.56 0.29 0.41 A 0.44 0.71 0.59 0.49 0.41 0.48 038811 C 0.53 0.29 0.40 T 0.47 0.71 0.60 0.50 0.41 0.48 039219 T 0.29 0.37 0.33 C 0.71 0.63 0.67 0.41 0.47 0.44 039220 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 039289 T 0.17 0.00 0.09 C 0.83 1.00 0.91 0.28 0.00 0.16 040691 G 0.69 0.17 0.40 A 0.31 0.82 0.60 0.43 0.29 0.48 040871 T 0.08 0.00 0.03 C 0.92 1.00 0.97 0.14 0.00 0.06 041370 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 043992 A 0.25 0.16 0.20 G 0.75 0.84 0.80 0.38 0.27 0.32 044235 G 0.17 0.43 0.32 A 0.83 0.57 0.68 0.28 0.49 0.44 045071 A 0.00 0.16 0.09 G 1.00 0.84 0.91 0.00 0.27 0.16 045084 C 0.21 0.00 0.07 G 0.79 1.00 0.93 0.33 0.00 0.13 045374 T 0.05 0.15 0.12 A 0.95 0.85 0.88 0.09 0.26 0.21 046244 C 0.03 0.00 0.01 T 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 046378 C 0.00 0.05 0.03 T 1.00 0.95 0.97 0.00 0.10 0.05 046762 A 0.05 0.07 0.06 G 0.95 0.93 0.94 0.10 0.13 0.11 048462 T 0.08 0.00 0.05 C 0.92 1.00 0.95 0.15 0.00 0.09 048566 C 0.18 0.00 0.11 T 0.82 1.00 0.89 0.30 0.00 0.20 049290 T 0.13 0.07 0.10 C 0.87 0.93 0.90 0.23 0.12 0.18 049372 G 0.13 0.15 0.14 A 0.87 0.85 0.86 0.23 0.26 0.24 049607 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049845 C 0.05 0.05 0.05 T 0.95 0.95 0.95 0.09 0.09 0.09 049873 G 0.20 0.00 0.10 A 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 050828 A 0.14 0.00 0.07 C 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 051091 G 0.05 0.07 0.06 C 0.95 0.93 0.94 0.09 0.13 0.12 051531 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 051764 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 052206 G 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 052269 - 0.07 0.20 0.13 + 0.93 0.80 0.87 0.12 0.32 0.22 052294 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 052479 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 053000 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 053167 - 0.35 0.35 0.35 + 0.65 0.65 0.65 0.46 0.45 0.45 053196 C 0.00 0.09 0.05 T 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.10 057305 G 0.39 0.48 0.44 A 0.61 0.52 0.56 0.48 0.50 0.49 057443 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 057890 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 058351 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 058603 C 0.00 0.04 0.03 T 1.00 0.96 0.97 0.00 0.08 0.05 058643 C 0.00 0.09 0.05 T 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.10 058829 G 0.40 0.39 0.40 T 0.60 0.61 0.60 0.48 0.48 0.48 058856 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 060067 G 0.00 0.07 0.04 A 1.00 0.93 0.96 0.00 0.12 0.07 060486 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 061631 G 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 061634 G 0.00 0.10 0.05 T 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 061652 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 062222 T 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 062253 G 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 062311 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 062669 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 062783 G 0.00 0.10 0.05 A 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 062964 T 0.05 0.00 0.03 G 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 063070 T 0.05 0.00 0.03 A 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 063366 C 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 063467 C 0.04 0.09 0.06 T 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 063771 C 0.00 0.10 0.04 T 1.00 0.90 0.96 0.00 0.17 0.08 063838 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 063843 C 0.12 0.24 0.18 T 0.88 0.76 0.82 0.22 0.36 0.29 064244 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 064391 G 0.11 0.09 0.10 A 0.89 0.91 0.90 0.19 0.16 0.18 064635 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 064771 C 0.02 0.05 0.03 T 0.98 0.95 0.97 0.04 0.10 0.07 065690 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 065912 T 0.20 0.00 0.10 A 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 065990 C 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 066090 C 0.11 0.22 0.16 T 0.89 0.78 0.84 0.19 0.34 0.27 066318 G 0.15 0.09 0.12 A 0.85 0.91 0.88 0.25 0.16 0.21 066460 T 0.35 0.39 0.37 A 0.65 0.61 0.63 0.46 0.48 0.47 067022 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 067113 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 067134 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 067272 T 0.09 0.22 0.15 C 0.91 0.78 0.85 0.16 0.34 0.26 068150 G 0.00 0.10 0.05 A 1.00 0.90 0.95 0.00 0.18 0.09 068159 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.14 0.07 068309 A 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 068359 G 0.19 0.00 0.10 T 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 068371 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 068500 G 0.12 0.00 0.06 A 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 068648 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 068656 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 068689 T 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 068877 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.03 068950 T 0.14 0.00 0.06 G 0.86 1.00 0.94 0.24 0.00 0.11 069071 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 069116 T 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 069439 T 0.11 0.19 0.15 A 0.89 0.81 0.85 0.19 0.31 0.25 069759 C 0.15 0.17 0.16 A 0.85 0.83 0.84 0.25 0.29 0.27 070061 C 0.00 0.13 0.06 T 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 070186 T 0.22 0.28 0.25 C 0.78 0.72 0.75 0.34 0.41 0.38 070238 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 070396 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 070912 C 0.00 0.09 0.05 T 1.00 0.91 0.95 0.00 0.17 0.09 071145 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 071377 T 0.09 0.13 0.11 C 0.91 0.87 0.89 0.16 0.23 0.20 071751 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 071801 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 072022 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 072096 T 0.23 0.13 0.18 C 0.77 0.87 0.82 0.35 0.23 0.30 072182 A 0.23 0.11 0.17 G 0.77 0.89 0.83 0.35 0.19 0.28 072320 T 0.00 0.09 0.04 C 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 072381 G 0.21 0.48 0.34 A 0.79 0.52 0.66 0.33 0.50 0.45 072440 C 0.10 0.22 0.16 T 0.90 0.78 0.84 0.19 0.34 0.27 072704 C 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 073486 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 073679 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 073692 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 073853 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 073977 A 0.03 0.00 0.02 G 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 073980 A 0.03 0.00 0.02 T 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 074608 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 074759 C 0.21 0.00 0.10 T 0.79 1.00 0.90 0.34 0.00 0.18 074821 A 0.26 0.13 0.19 G 0.74 0.87 0.81 0.39 0.23 0.31 074885 T 0.07 0.13 0.10 C 0.93 0.87 0.90 0.13 0.23 0.18 075215 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 075266 G 0.00 0.09 0.04 A 1.00 0.91 0.96 0.00 0.17 0.08 075628 A 0.53 0.13 0.29 G 0.47 0.87 0.71 0.50 0.23 0.41 075824 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 075898 G 0.65 0.22 0.42 A 0.35 0.78 0.58 0.45 0.34 0.49 076296 C 0.00 0.18 0.09 T 1.00 0.82 0.91 0.00 0.30 0.16 076376 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 076678 C 0.68 0.18 0.39 T 0.32 0.82 0.61 0.44 0.30 0.48 077781 A 0.00 0.17 0.09 G 1.00 0.83 0.91 0.00 0.29 0.16 077912 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 078024 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 078043 A 0.02 0.41 0.21 G 0.98 0.59 0.79 0.04 0.48 0.33 078183 A 0.18 0.48 0.33 G 0.82 0.52 0.67 0.30 0.50 0.44 078295 T 0.02 0.02 0.02 C 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 078552 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 078580 C 0.09 0.21 0.15 G 0.91 0.79 0.85 0.17 0.34 0.26 078703 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 078998 T 0.04 0.09 0.06 C 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 079131 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 079697 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 079953 T 0.22 0.48 0.35 C 0.78 0.52 0.65 0.34 0.50 0.45 079997 C 0.11 0.07 0.09 A 0.89 0.93 0.91 0.20 0.13 0.17 080525 A 0.23 0.13 0.18 G 0.77 0.87 0.82 0.35 0.23 0.30 080580 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 080596 A 0.44 0.30 0.37 G 0.56 0.70 0.63 0.49 0.42 0.47 080753 + 0.58 0.39 0.49 - 0.42 0.61 0.51 0.49 0.48 0.50 080892 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 080948 C 0.44 0.35 0.39 T 0.56 0.65 0.61 0.49 0.45 0.48 081067 G 0.15 0.09 0.12 A 0.85 0.91 0.88 0.25 0.16 0.21 081457 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 081994 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 082005 A 0.04 0.09 0.06 G 0.96 0.91 0.94 0.08 0.16 0.12 082114 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 082203 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 082216 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 085386 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.07 085609 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 085716 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 086375 G 0.23 0.00 0.10 A 0.78 1.00 0.90 0.35 0.00 0.19 086534 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 086644 C 0.00 0.09 0.05 A 1.00 0.91 0.95 0.00 0.16 0.09 086729 G 0.29 0.13 0.20 T 0.71 0.87 0.80 0.41 0.23 0.32 086878 C 0.16 0.22 0.19 T 0.84 0.78 0.81 0.27 0.34 0.31 086927 T 0.16 0.45 0.32 G 0.84 0.55 0.68 0.27 0.50 0.43 086952 - 0.08 0.13 0.11 + 0.92 0.87 0.89 0.15 0.23 0.19 087151 - 0.00 0.05 0.03 + 1.00 0.95 0.97 0.00 0.10 0.05 088219 T 0.17 0.22 0.20 C 0.83 0.78 0.80 0.29 0.34 0.31 088390 C 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 089067 C 0.05 0.09 0.07 G 0.95 0.91 0.93 0.09 0.17 0.13 090717 - 0.10 0.02 0.06 + 0.90 0.98 0.94 0.19 0.04 0.12 090869 C 0.31 0.48 0.39 T 0.69 0.52 0.61 0.43 0.50 0.48 091135 T 0.00 0.09 0.04 G 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 091198 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 091355 A 0.46 0.37 0.41 G 0.54 0.63 0.59 0.50 0.47 0.48 091400 G 0.09 0.00 0.04 A 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 091528 G 0.46 0.37 0.41 A 0.54 0.63 0.59 0.50 0.47 0.48 091555 G 0.00 0.09 0.04 A 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 091915 G 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 092518 A 0.42 0.57 0.50 G 0.57 0.43 0.50 0.49 0.49 0.50 093010 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 093353 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 093725 C 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 093904 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 093997 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 094041 T 0.44 0.37 0.40 G 0.56 0.63 0.60 0.49 0.47 0.48 094134 A 0.39 0.59 0.49 G 0.61 0.41 0.51 0.48 0.48 0.50 094285 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 094362 - 0.28 0.50 0.39 + 0.72 0.50 0.61 0.41 0.50 0.48 094447 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 094491 T 0.00 0.10 0.05 A 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 094887 C 0.52 0.37 0.45 T 0.48 0.63 0.55 0.50 0.47 0.49 094944 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 095071 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 095239 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 095293 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 095828 C 0.05 0.00 0.02 A 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 095942 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 095972 G 0.04 0.07 0.05 T 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 096705 G 0.36 0.11 0.23 A 0.64 0.89 0.78 0.46 0.20 0.35 097460 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 098641 A 0.04 0.07 0.05 G 0.96 0.93 0.95 0.08 0.12 0.10 099012 T 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 099361 A 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 099382 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 099453 G 0.58 0.28 0.44 A 0.42 0.72 0.56 0.49 0.41 0.49 099655 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 099669 A 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 099954 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 100216 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 100275 C 0.00 0.09 0.04 T 1.00 0.91 0.96 0.00 0.16 0.08 100309 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 100709 A 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.02 100837 + 0.03 0.00 0.01 - 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 100954 + 0.67 0.35 0.49 - 0.33 0.65 0.51 0.44 0.45 0.50 101267 + 0.29 0.20 0.24 - 0.71 0.80 0.76 0.41 0.31 0.36 101721 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 101780 T 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 012012: t 016897: c 017995: T 025053: TT 052269: Tt 053000: a 053167: t 068648: aa 080753: g 086952: g 087151: a 090717: GT 093997: GTT 094362: ATA 097460: tcaa 100837: tca 100954: aagt 101267: aa 101721: agaa Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 000120 A 0.10 0.02 0.06 C 0.00 0.28 0.14 G 0.90 0.70 0.80