Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000212 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000239 T 0.20 0.14 0.17 C 0.80 0.86 0.83 0.31 0.24 0.28 000380 G 0.20 0.16 0.18 T 0.80 0.84 0.82 0.33 0.27 0.30 000581 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000677 T 0.12 0.30 0.21 C 0.88 0.70 0.79 0.22 0.42 0.33 000684 A 0.23 0.20 0.21 T 0.77 0.80 0.79 0.35 0.31 0.33 000700 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000705 - 0.46 0.46 0.46 + 0.54 0.54 0.54 0.50 0.50 0.50 000719 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000978 T 0.07 0.27 0.17 C 0.93 0.73 0.83 0.12 0.40 0.28 001060 A 0.09 0.00 0.05 T 0.91 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 001496 G 0.25 0.20 0.22 A 0.75 0.80 0.78 0.38 0.31 0.35 001510 G 0.23 0.20 0.21 T 0.77 0.80 0.79 0.35 0.31 0.33 001645 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001821 C 0.27 0.21 0.24 T 0.73 0.79 0.76 0.40 0.34 0.37 002115 T 0.00 0.20 0.10 A 1.00 0.80 0.90 0.00 0.31 0.18 002375 A 0.33 0.20 0.26 G 0.67 0.80 0.74 0.44 0.31 0.39 002605 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002812 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 002981 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 003000 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 003169 T 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 004074 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004380 T 0.08 0.00 0.04 C 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 005686 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 005734 T 0.27 0.20 0.24 C 0.73 0.80 0.76 0.39 0.33 0.36 005815 C 0.27 0.20 0.24 T 0.73 0.80 0.76 0.39 0.33 0.36 005913 A 0.27 0.22 0.24 G 0.73 0.78 0.76 0.39 0.34 0.37 006449 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 006542 T 0.29 0.22 0.26 C 0.71 0.78 0.74 0.41 0.34 0.38 006585 - 0.08 0.02 0.05 + 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 007239 G 0.10 0.02 0.06 A 0.90 0.98 0.94 0.17 0.05 0.11 007668 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007802 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 007952 - 0.17 0.00 0.09 + 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 008068 G 0.09 0.00 0.04 T 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 008096 T 0.52 0.48 0.50 C 0.48 0.52 0.50 0.50 0.50 0.50 008338 G 0.10 0.02 0.06 C 0.90 0.98 0.94 0.17 0.04 0.11 008499 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008514 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008743 C 0.10 0.02 0.06 A 0.90 0.98 0.94 0.17 0.04 0.11 008778 T 0.43 0.43 0.43 G 0.57 0.57 0.57 0.49 0.49 0.49 009251 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009469 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009719 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009827 A 0.07 0.30 0.18 G 0.93 0.70 0.82 0.12 0.42 0.30 010245 G 0.27 0.48 0.37 A 0.73 0.52 0.63 0.40 0.50 0.47 010256 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 010319 T 0.09 0.02 0.06 G 0.91 0.98 0.94 0.17 0.05 0.11 010340 C 0.18 0.17 0.17 A 0.82 0.83 0.83 0.30 0.28 0.29 010362 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011006 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011527 C 0.10 0.02 0.06 T 0.90 0.98 0.94 0.17 0.04 0.11 011534 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011541 G 0.20 0.20 0.20 C 0.80 0.80 0.80 0.33 0.31 0.32 011838 C 0.11 0.36 0.23 T 0.89 0.64 0.77 0.19 0.46 0.36 011879 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011967 - 0.09 0.02 0.06 + 0.91 0.98 0.94 0.16 0.05 0.11 012082 A 0.05 0.33 0.20 T 0.95 0.67 0.80 0.10 0.44 0.32 012525 C 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 012788 C 0.48 0.43 0.46 T 0.52 0.57 0.54 0.50 0.49 0.50 013102 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 013122 T 0.20 0.00 0.10 C 0.80 1.00 0.90 0.31 0.00 0.18 013194 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013350 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015868 T 0.09 0.02 0.06 G 0.91 0.98 0.94 0.16 0.04 0.10 016307 G 0.26 0.52 0.39 A 0.74 0.48 0.61 0.39 0.50 0.47 016557 T 0.28 0.50 0.39 C 0.72 0.50 0.61 0.41 0.50 0.48 017364 T 0.08 0.03 0.06 G 0.92 0.97 0.94 0.15 0.05 0.11 017780 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017810 G 0.21 0.00 0.11 T 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 017828 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024836 G 0.00 0.18 0.09 T 1.00 0.82 0.91 0.00 0.30 0.17 025873 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025935 T 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 026022 A 0.09 0.02 0.05 G 0.91 0.98 0.95 0.16 0.04 0.10 026060 G 0.17 0.00 0.09 T 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 026609 T 0.09 0.03 0.06 G 0.91 0.97 0.94 0.16 0.05 0.11 026991 C 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 027163 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 027593 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 027820 A 0.08 0.02 0.06 G 0.92 0.98 0.94 0.15 0.05 0.10 027976 T 0.42 0.43 0.43 C 0.58 0.57 0.57 0.49 0.49 0.49 028277 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028393 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 028975 C 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 029066 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 029128 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 029147 T 0.23 0.00 0.12 G 0.78 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 029587 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 030029 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.33 0.00 0.18 030056 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 030588 G 0.42 0.43 0.43 A 0.58 0.57 0.57 0.49 0.49 0.49 030785 T 0.04 0.04 0.04 A 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 031011 A 0.29 0.02 0.16 G 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 031083 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031084 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031281 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 031553 T 0.00 0.13 0.06 C 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 031780 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 031942 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 031966 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 032039 G 0.21 0.00 0.11 A 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 032529 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 032555 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 032706 T 0.22 0.24 0.23 C 0.78 0.76 0.78 0.34 0.36 0.35 032923 C 0.09 0.02 0.06 A 0.91 0.98 0.94 0.16 0.04 0.10 033034 A 0.09 0.02 0.06 G 0.91 0.98 0.94 0.16 0.04 0.10 033075 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 033107 A 0.41 0.50 0.46 C 0.59 0.50 0.54 0.48 0.50 0.50 033900 C 0.21 0.00 0.11 T 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 034191 C 0.06 0.03 0.05 T 0.94 0.97 0.95 0.12 0.05 0.09 034719 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 034784 A 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 034803 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 035231 A 0.42 0.48 0.45 C 0.58 0.52 0.55 0.49 0.50 0.49 035354 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 035412 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 035533 C 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 035917 T 0.42 0.39 0.41 C 0.58 0.61 0.59 0.49 0.48 0.48 035981 T 0.08 0.02 0.06 A 0.92 0.98 0.94 0.15 0.05 0.10 036561 A 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 036625 G 0.21 0.20 0.20 A 0.79 0.80 0.80 0.33 0.31 0.32 036763 A 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 036799 C 0.29 0.02 0.16 T 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 037120 A 0.02 0.11 0.06 G 0.98 0.89 0.94 0.04 0.19 0.12 037122 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037246 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 037261 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 037392 A 0.09 0.02 0.06 G 0.91 0.98 0.94 0.16 0.04 0.10 037590 G 0.31 0.50 0.41 A 0.69 0.50 0.59 0.43 0.50 0.48 038346 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 038810 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 038883 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 038981 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039236 T 0.29 0.50 0.39 C 0.71 0.50 0.61 0.41 0.50 0.48 039500 * 039548 C 0.21 0.00 0.11 T 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 039676 C 0.06 0.30 0.18 T 0.94 0.70 0.82 0.12 0.42 0.30 039752 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039900 G 0.27 0.50 0.38 A 0.73 0.50 0.62 0.39 0.50 0.47 040512 G 0.08 0.30 0.19 A 0.92 0.70 0.81 0.15 0.42 0.31 040704 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 040907 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 041102 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 041380 G 0.29 0.04 0.17 C 0.71 0.96 0.83 0.41 0.08 0.28 041732 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 041740 G 0.09 0.02 0.05 A 0.91 0.98 0.95 0.16 0.04 0.10 041808 T 0.08 0.02 0.05 C 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 042020 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042039 T 0.15 0.00 0.07 A 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 042350 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 042400 T 0.15 0.00 0.08 C 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 042471 A 0.07 0.30 0.18 G 0.93 0.70 0.82 0.12 0.42 0.30 042538 + 0.08 0.02 0.05 - 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 042896 T 0.10 0.03 0.06 C 0.90 0.97 0.94 0.17 0.05 0.11 043172 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 043610 A 0.07 0.03 0.05 C 0.93 0.97 0.95 0.13 0.05 0.10 043756 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 043961 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044027 G 0.18 0.00 0.09 C 0.82 1.00 0.91 0.30 0.00 0.17 044250 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 044275 C 0.09 0.02 0.06 A 0.91 0.98 0.94 0.17 0.04 0.11 044419 T 0.18 0.18 0.18 G 0.82 0.82 0.82 0.30 0.30 0.30 044733 C 0.09 0.02 0.06 T 0.91 0.98 0.94 0.17 0.04 0.10 045023 C 0.08 0.02 0.06 G 0.92 0.98 0.94 0.15 0.05 0.10 045169 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 045186 A 0.06 0.31 0.18 G 0.94 0.69 0.82 0.12 0.43 0.29 045276 A 0.08 0.02 0.06 T 0.92 0.98 0.94 0.15 0.05 0.10 045358 C 0.08 0.02 0.06 G 0.92 0.98 0.94 0.15 0.05 0.10 045486 T 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 045966 G 0.42 0.43 0.43 A 0.58 0.57 0.57 0.49 0.49 0.49 046141 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046279 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046834 T 0.00 0.05 0.02 C 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 046845 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 046879 T 0.29 0.02 0.16 G 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 046921 A 0.21 0.20 0.21 G 0.79 0.80 0.79 0.33 0.33 0.33 046936 T 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 047145 T 0.08 0.02 0.05 C 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 047216 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 047397 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 047579 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 047599 A 0.08 0.02 0.05 C 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 047638 A 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 047845 C 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 048174 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 049368 - 0.09 0.02 0.05 + 0.91 0.98 0.95 0.16 0.04 0.10 049569 A 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 049725 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 049735 T 0.06 0.30 0.18 A 0.94 0.70 0.82 0.12 0.42 0.30 050281 - 0.21 0.18 0.20 + 0.79 0.82 0.80 0.33 0.30 0.31 050382 C 0.14 0.00 0.07 A 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 050400 T 0.14 0.00 0.07 C 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 050839 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 050942 T 0.08 0.02 0.05 C 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 050943 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 050962 C 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 051333 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 051391 A 0.29 0.02 0.16 G 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 051498 G 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 051517 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 052091 A 0.19 0.00 0.10 G 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.18 052187 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 052290 C 0.08 0.03 0.06 T 0.92 0.97 0.94 0.15 0.05 0.11 052338 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 052623 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 052808 G 0.09 0.02 0.06 A 0.91 0.98 0.94 0.16 0.04 0.10 052870 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 053071 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 053093 A 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 053226 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 053379 G 0.22 0.00 0.12 A 0.78 1.00 0.88 0.34 0.00 0.21 053556 A 0.42 0.45 0.43 G 0.58 0.55 0.57 0.49 0.50 0.49 053954 C 0.09 0.02 0.06 T 0.91 0.98 0.94 0.16 0.05 0.11 054048 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 054327 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 054397 G 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 054470 A 0.24 0.00 0.12 G 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 054513 T 0.29 0.02 0.16 C 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 054699 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 054786 G 0.26 0.50 0.38 T 0.74 0.50 0.62 0.39 0.50 0.47 054787 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 055069 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 055146 A 0.00 0.10 0.05 G 1.00 0.90 0.95 0.00 0.17 0.09 055183 A 0.41 0.43 0.42 G 0.59 0.57 0.58 0.48 0.49 0.49 055363 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 055645 C 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 055876 - 0.09 0.02 0.06 + 0.91 0.98 0.94 0.17 0.05 0.11 056279 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 056905 T 0.08 0.02 0.05 C 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 057100 G 0.21 0.00 0.11 A 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 057266 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 057456 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 057807 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 057965 C 0.00 0.04 0.02 T 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 058083 A 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 058274 A 0.08 0.02 0.05 G 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 058833 G 0.06 0.02 0.04 A 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 059727 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 059789 A 0.00 0.20 0.10 G 1.00 0.80 0.90 0.00 0.31 0.17 060671 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060718 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060784 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060794 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060860 G 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 061224 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 061568 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 061741 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 062113 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 062550 A 0.06 0.02 0.04 G 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 063016 T 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 063042 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 063049 G 0.08 0.02 0.05 A 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 063681 C 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 063809 T 0.08 0.02 0.05 C 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 063981 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 064415 G 0.07 0.02 0.05 A 0.93 0.98 0.95 0.13 0.04 0.09 064447 C 0.07 0.02 0.05 T 0.93 0.98 0.95 0.13 0.04 0.09 065983 G 0.21 0.18 0.20 A 0.79 0.82 0.80 0.33 0.30 0.31 066260 G 0.00 0.05 0.02 A 1.00 0.95 0.98 0.00 0.09 0.04 066319 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 066357 C 0.07 0.02 0.05 T 0.93 0.98 0.95 0.13 0.04 0.09 068375 C 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 068880 C 0.29 0.02 0.16 G 0.71 0.98 0.84 0.41 0.04 0.27 069393 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 069856 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 070769 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 070882 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 071325 C 0.20 0.18 0.19 T 0.80 0.82 0.81 0.33 0.30 0.31 071606 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 071665 C 0.08 0.02 0.05 T 0.92 0.98 0.95 0.15 0.04 0.10 071863 T 0.09 0.02 0.06 C 0.91 0.98 0.94 0.16 0.04 0.10 072705 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 073166 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 073285 T 0.13 0.00 0.07 G 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 073352 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 073522 T 0.31 0.07 0.19 G 0.69 0.93 0.81 0.43 0.12 0.31 073625 T 0.06 0.02 0.04 C 0.94 0.98 0.96 0.12 0.04 0.08 073627 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 073683 T 0.12 0.00 0.06 G 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.12 073838 T 0.52 0.22 0.37 C 0.48 0.78 0.63 0.50 0.34 0.47 073955 A 0.09 0.02 0.05 G 0.91 0.98 0.95 0.16 0.04 0.10 074142 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 074609 G 0.04 0.02 0.03 A 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 075161 - 0.24 0.20 0.22 + 0.76 0.80 0.78 0.36 0.31 0.34 076330 A 0.44 0.07 0.26 G 0.56 0.93 0.74 0.49 0.13 0.39 076451 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000705: t 006585: TC 007952: c 008499: ct 008514: t 011534: t 011967: g 025873: c 031083: a 042538: at 049368: aaaagt 049725: gctg 050281: a 052623: agtgtcctgctagtaaaggggt 055876: a 061568: catct 069856: t 073352: gcaaa 075161: gat Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 039500 A 0.00 0.02 0.01 C 0.17 0.00 0.09 T 0.83 0.98 0.90