Site      Allele1   AD-pop    ED-pop    Total-pop Allele2   AD-pop    ED-pop    Total-pop AD-hz     ED-hz     Total-hz  
000179    T         0.02      0.00      0.01      C         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
000783    G         0.02      0.00      0.01      T         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
000969    T         0.00      0.07      0.03      C         1.00      0.93      0.97      0.00      0.12      0.06      
002382    T         0.04      0.00      0.02      C         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
002481    A         0.00      0.02      0.01      G         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
002792    C         0.04      0.00      0.02      G         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
002834    G         0.00      0.02      0.01      A         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
002910    T         0.00      0.02      0.01      C         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
002931    T         0.00      0.02      0.01      C         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
002972    T         0.02      0.00      0.01      C         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
003020    G         0.02      0.00      0.01      C         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
003350    T         0.08      0.00      0.04      A         0.92      1.00      0.96      0.15      0.00      0.08      
003544    A         0.06      0.00      0.03      G         0.94      1.00      0.97      0.12      0.00      0.06      
003549    C         0.02      0.00      0.01      G         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
003625    A         0.04      0.00      0.02      G         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
004020    G         0.02      0.00      0.01      A         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
004055    A         0.00      0.37      0.18      G         1.00      0.63      0.82      0.00      0.47      0.30      
004085    A         0.00      0.02      0.01      G         1.00      0.98      0.99      0.00      0.04      0.02      
004312    T         0.00      0.37      0.18      G         1.00      0.63      0.82      0.00      0.47      0.30      
005390    A         0.02      0.00      0.01      G         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
005397    -         0.08      0.00      0.04      +         0.92      1.00      0.96      0.15      0.00      0.08      
005664    A         0.00      0.10      0.05      G         1.00      0.90      0.95      0.00      0.18      0.09      
005932    C         0.04      0.00      0.02      G         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
006251    C         0.02      0.00      0.01      T         0.98      1.00      0.99      0.04      0.00      0.02      
006589    A         0.00      0.36      0.17      G         1.00      0.64      0.83      0.00      0.46      0.28      
006757    C         0.04      0.00      0.02      T         0.96      1.00      0.98      0.08      0.00      0.04      
006776    T         0.00      0.05      0.02      C         1.00      0.95      0.98      0.00      0.09      0.04      

Note:

AD: African_Descent
ED: European_Descent
Total: All_population
pop : population

Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as:

+ : insertion allele
- : deletion allele

The + (inserted) allele for each site is listed below:

005397: a