MC1R Color FASTA
The longest form of insertion/deletion sites is shown in the FASTA sequence and contain a '-' as the alternate allele in the variation tag.
*Display courtesy of GeneSNPs

AACACGAACG TCCTTGAAAT GTGAGGGGAC AGTGCTCTGG GGCAGGGGCT 50
GCTCACTGGT TCATGGCCAG AGGTGAGCGG GCTCTGGGTC TGGGTCTGTG 100 | var(100):[A:0.01]
AGGTGCTGTG GACGTCGGGG GTGCTCCTGG GGCAGGGACA CAGCCACGGC 150
CCTCACACCA GTGGAGCCGT CTTCCTTCCC GAGGCAGAGG CTTGGCCTTC 200
TCACACCTTG GGACCCTTCT CTCCCCTGTG CTCATGCTGG AAGCACAGCG 250
TGAGGGGGCA AAGGTCATGG GAGGCAAAAG GCTGGGCTGA GGCCGAGGCT 300
CTGTGGCTGT GGCCGGACAC CAGGTCCTGT GGTGGTGTGG GCAGGGCGCG 350 | var(318):[T:0.39]
CTCTCTCCTC TGAGCAGCCT GGGGCTGCGT GTGTGAACAG AAACAGGCCT 400
GCCGATTTGA AGATGGTTTG ACCAAGTCTC CCAAAGCTGA AGAGAGGTCC 450 | var(404):[A:0.26]
CTGCCCATGT CCCCCGGGTG GCAATCCACA GACGCACCTG TGTCCATCAG 500
ACGGTATCGT TGATAGGGAG TCTGAAGCCA CCCAGACGTG GTCTGTTCAC 550
GCCGTGGACA CCACGGTCTG AGGCAGACGG TTACAGCCAC CGGCATAGGC 600
GAATCTCAGC CAGAGAGAGT GAACTGGGAC ACCATTCACG TGATGGGCCA 650
GATGGGCTGG CAGCGCTCGC TGGAGCCGTC CGGGTGGGAA CGCTGTGTCT 700 | REPEAT
GTTGGTCTGG TGCTGCTTAT GTGGCTGGTT CAGGTCTGTC ATCCGTCAAC 750
CTGCATATTT ATCACTGGTG CATTTTCATG TATGTTGTAC CTCAATTAAA 800
ACATTTTAGG GCCGGGCGCG GTGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCACTGTG 850 | REPEAT | var(818):[A:0.02]
GGAGGCGGAG GCGGGAGGAT CATGAGGTCA GGAGATCAAG ACCGTCCTGG 900
CCAACATGGT GAAACCCCAT CTCTACTAAA AAAAATACAA AAATTTGCCG 950
GGTGTGGCGG CACGCGCCTG TAGTTCCAGC TACTCAGGAG GCTGAGGTAT 1000 | var(965):[T:0.02] | NOT SCANNED
GAGAATTACT TGAACCCAGT AGGCAGAGGC TACCGTGAGC CAAGATCATG 1050
CCACTGCACT CCAGCCTGGG TGACAGTGAG ACTTCGTCTC AAAAAAAAAA 1100
AAAAAAAAA
T TAAAGCAGAT GGGGTGTGGG GGCTCATCCC TGTAATCTCA 1150 | REPEAT
GCATTTTGGG AGGCTGAGGC GGACCGATCA CCTGAGGTCA GGAGTTCAAG 1200
ACCAGCCTGG TCAACATGGT GAAACCTCAT CTCTACAAAA AATACAAAAA 1250
ATAGCCAGGT GTGGTAGTGG GTGCCGTAGT CCCAGCTAGT TGGGAGGCTG 1300
AGGCATAAGT ATTGCTTGAA TCCAGAAGGT GGAGGTTGCA GTGAGCCAAG 1350
AATGCACCAC TACACTCCAG CCTGCGCGAC AGAGTGAAAC TGTCTCAAAA 1400
TAAATAAATA CATAAAA
TTA TATGTATATA TATATATATA TATATTTTTT 1450 | REPEAT
TGTATGTGAG ACTGGATCTC TGTTTCCCAG GCTGGAGTGC AGTGGTGTGA 1500
T
CTCGGCTCA CTGCAACCTC CGCCTCCTGG GTTCAAGCAA TTCTGCCTCA 1550
GCCTCCCAAG TAGCTGGGAT TATAGGCGTG CGCCACCACG CCTGGCTAAT 1600 | var(1581):[T:0.49] | var(1598):[G:0.39]
TTTTGTATTT TTAGTAGAGA TGGAGTTTCA CCATATTACC CAAGCTGGTC 1650
TTGAACTCCT GACCTCATGA TCCGCCTGCC TCAGCCTCCC AAAGTGCTGA 1700 | var(1674):[A:0.01]
GATTATAGGG GTGAGCCACT GTGCCCGGCA ATAATAATTT TTTTTTTTTT 1750 | REPEAT
TGAGACAGAG TTTTGCTCTT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA ATGGTGCAAT 1800
CTCGGCTCAC GGCAACCTCC GCCTCTCATG TTCAAGCTAT TATCCTGACT 1850
CAGCTGGGAT TACAGGCACC CACCACCACA CCTGGCTGAT TTTGGTATTT 1900
TTAGTAGAGA CGGGGTTTCT CCATGTCGGC CAGGCTGGTC TCGAACTCCT 1950
GACCTCAGGT GATCCACCCG CCTTGGGCTC CCAAAGTGCT GGGATTACAG 2000
CCCTGAGCCA CCATGGCTGA CAATAATAAA AAATTTTAAA GCAAAACTAA 2050
AGATTTATAA ATTGTAAAAT GCGGTTGTAA CAAGTATTTA CTGTACCAGT 2100
AAATATGAAA AATATTAATG TCCTCACACA CATGGAGGTG GCTTGTGAGT 2150 | var(2132):[:0.36] | var(2146):[A:0.01]
GGTGTGAGCA TTTCATGGTC AGAGTTTGGC AGTTGGGCGA GAGACAGGAT 2200 | var(2187):[A:0.01]
GGATTTTAAC TCGAACATCG CAGACACAAA ACTGAAAACC CTGATGCGGT 2250
GCCTGCACCG TTGCCTCCTT TCCTGCAGCT GTAAATGGGA CGAGTAATTC 2300
CATCCCCCTC CCGCTTCCAC CCTTCAGCAC AGACGCAGTC TTCAGCAAGG 2350
AAGTGCTGGG AACGCCCTGG AGTGAACCCA GGAAGATGCC TGCAGTGGGT 2400
GCCAGGGCCC CTCCCCACCG TCCCTGCTGG GCTTCGGGGC CACGCCCGAC 2450 | var(2414):[T:0.41] | var(2422):[T:0.07]
TGCTGTGAAC GGCCTGCGGA GCACCACGTG CGACGGCTGG AGGCGAGAGG 2500
TCTGCCTTTG ATGTGGCTGT TGGTGCAGGG CCTGTGGTGC CTTCCGCAGC 2550 | var(2541):[G:0.02]
GGAAATGGCG CGCCGCCCGG GGAGGGCGGG AGCAGCGTCC CGGGTGCCCC 2600
TGTGAGGATG AGCGACGAGA TGACTGGAGG GTCCCTGAAG ACCTCACCAG 2650 | var(2648):[T:0.33]
GGTGCCCCCA GCCGGTCCGC TCCCAGGAAG CGACACCCCC ACAGCCCCAG 2700
GGCTGCAGCT GAGGGGGTCG CCACTCTGGC TGGGCGAGGC TGGGCCCTTG 2750
GGGGCAGGCG CCAGAGTGGC CTCAGGCTCT ACGAGATGCC TGAAAACACC 2800 | var(2783):[A:0.39]
AACCTCTCCA GGGCTCACTA GCATTGGACG CTTTCACGCT CTGCCCTGGC 2850
CGGAAGCCCC CTCACCCCGC GCGATGTGCA AACTCCTGCA GGGCTCACTC 2900 | REPEAT
AGTTTCCAGA ACTTTAATTA TTGGAAAGTT CTCCCTGGTC CAGCCCCCAA 2950
ATCTGCCGTG AACGTTGACA GCTGAGTTGC TGCTCCATGC GTGCTTTGGC 3000
TGAGAGCAGA GGGGACCCCT GTCCTCCCTG AGCTGCTGAC GAGGGGAGGG 3050
GTGAAGGGTG GGGCCTCTGG AGAGGGCAGG TCCCGGGGAA GCTCCGGACT 3100
CCTAGAGGGG CGGCCAGGTG GGGGCCCTGG TGACCAGGAC AGACTGTGGT 3150
GTTTTTTAAC GTAAAGGAGA TCCGCGGTGT GAGGGACCCC CTGGGTCCTG 3200 | var(3175):[T:0.01]
CACGCCGCCT GGTGGCAGGC CGGGCCATGG TGGGTGCTCA CGCCCCCGGC 3250 | var(3221):[T:0.45]
ATGTGGCCGC CCTCAGTGGG AGGGGCTCTG AGAACGACTT TTTAAAACGC 3300 | var(3261):[T:0.01] | var(3266):[A:0.30]
AGAGAAAAGC TCCATTCTTC CCAGGACCTC AGCGCAGCCC TGGCCCAGGA 3350
AGGCAGGAGA CAGAGGCCAG GACGGTCCAG AGGTGTCGAA ATGTCCTGGG 3400 | var(3388):[A:0.01]
GACCTGAGCA GCAGCCACCA GGGAAGAGGC AGGGAGGGAG CTGAGGACCA 3450
GGCTTGGTTG TGAGAATCCC TGAGCCCAGG CGGTAGATGC CAGGAGGTGT 3500 | var(3485):[T:0.38]
CTGGACTGGC TGGGCCATGC CTGGGCTGAC CTGTCCAGCC AGGGAGAGGG 3550 | Exon 1 | UTR
TGTGAGGGCA GATCTGGGGG TGCCCAGATG GAAGGAGGCA GGCATGGGGG 3600
ACACCCAAGG CCCCCTGGCA GCACCATGAA CTAAGCAGGA CACCTGGAGG 3650
GGAAGAACTG TGGGGACCTG GAGGCCTCCA ACGACTCCTT CCTGCTTCCT 3700
GGACAGGACT A
TGGCTGTGC AGGGATCCCA GAGAAGACTT CTGGGCTCCC 3750
            M  A  V   Q  G  S  Q   R  R  L   L  G  S   13
TCAACTCCAC CCCCACAGCC ATCCCCCAGC TGGGGCTGGC TGCCAACCAG 3800
L  N  S  T   P  T  A   I  P  Q   L  G  L  A   A  N  Q  30
ACAGGAGCCC GGTGCCTGGA GGTGTCCATC TCTGACGGGC TCTTCCTCAG 3850
 T  G  A   R  C  L  E   V  S  I   S  D  G   L  F  L  S 47
CCTGGGGCTG GTGAGCTTGG TGGAGAACGC GCTGGTGGTG GCCACCATCG 3900 | var(3888):[T:0.06]
  L  G  L   V  S  L   V  E  N  A   L  V  V   A  T  I   63
CCAAGAACCG GAACCTGCAC TCACCCATGT ACTGCTTCAT CTGCTGCCTG 3950
A  K  N  R   N  L  H   S  P  M   Y  C  F  I   C  C  L  80
GCCTTGTCGG ACCTGCTGGT GAGCGGGAGC AACGTGCTGG AGACGGCCGT 4000 | var(3984):[A:0.03]
 A  L  S   D  L  L  V   S  G  S   N  V  L   E  T  A  V 97
CATCCTCCTG CTGGAGGCCG GTGCACTGGT GGCCCGGGCT GCGGTGCTGC 4050 | var(4028):[A:0.02]
  I  L  L   L  E  A   G  A  L  V   A  R  A   A  V  L   113
AGCAGCTGGA CAATGTCATT GACGTGATCA CCTGCAGCTC CATGCTGTCC 4100
Q  Q  L  D   N  V  I   D  V  I   T  C  S  S   M  L  S  130
AGCCTCTGCT TCCTGGGCGC CATCGCCGTG GACCGCTACA TCTCCATCTT 4150
 S  L  C   F  L  G  A   I  A  V   D  R  Y   I  S  I  F 147
CTACGCACTG CGCTACCACA GCATCGTGAC CCTGCCGCGG GCGCGGCGAG 4200 | var(4161):[T:0.05] | var(4174):[C:0.01] | var(4176):[C:0.01] | var(4188):[T:0.04] | var(4198):[A:0.02]
  Y  A  L   R  Y  H   S  I  V  T   L  P  R   A  R  R   163
CCGTTGCGGC CATCTGGGTG GCCAGTGTCG TCTTCAGCAC GCTCTTCATC 4250
A  V  A  A   I  W  V   A  S  V   V  F  S  T   L  F  I  180
GCCTACTACG ACCACGTGGC CGTCCTGCTG TGCCTCGTGG TCTTCTTCCT 4300 | var(4296):[C:0.03]
 A  Y  Y   D  H  V  A   V  L  L   C  L  V   V  F  F  L 197
GGCTATGCTG GTGCTCATGG CCGTGCTGTA CGTCCACATG CTGGCCCGGG 4350
  A  M  L   V  L  M   A  V  L  Y   V  H  M   L  A  R   213
CCTGCCAGCA CGCCCAGGGC ATCGCCCGGC TCCACAAGAG GCAGCGCCCG 4400
A  C  Q  H   A  Q  G   I  A  R   L  H  K  R   Q  R  P  230
GTCCACCAGG GCTTTGGCCT TAAAGGCGCT GTCACCCTCA CCATCCTGCT 4450
 V  H  Q   G  F  G  L   K  G  A   V  T  L   T  I  L  L 247
GGGCATTTTC TTCCTCTGCT GGGGCCCCTT CTTCCTGCAT CTCACACTCA 4500
  G  I  F   F  L  C   W  G  P  F   F  L  H   L  T  L   263
TCGTCCTCTG CCCCGAGCAC CCCACGTGCG GCTGCATCTT CAAGAACTTC 4550
I  V  L  C   P  E  H   P  T  C   G  C  I  F   K  N  F  280
AACCTCTTTC TCGCCCTCAT CATCTGCAAT GCCATCATCG ACCCCCTCAT 4600
 N  L  F   L  A  L  I   I  C  N   A  I  I   D  P  L  I 297
CTACGCCTTC CACAGCCAGG AGCTCCGCAG GACGCTCAAG GAGGTGCTGA 4650 | var(4610):[T:0.01]
  Y  A  F   H  S  Q   E  L  R  R   T  L  K   E  V  L   313
CATGCTCCTG GTGAGCGCGG TGCACGCGGC TTTAAGTGTG CTGGGCAGAG 4700 | var(4652):[G:0.26] | UTR | var(4676):[A:0.04]
T  C  S  W                                             317
GGAGGTGGTG ATATTGTGTG GTCTGGTTCC TGTGTGACCC TGGGCAGTTC 4750 | REPEAT
CTTACCTCCC TGGTCCCCGT TTGTCAAAGA GGATGGACTA AATGATCTCT 4800
GAAAGT
GTTG AAG
CGCGGAC CCTTCTGGGT CCAGGGAGGG GTCCCTGCAA 4850 | var(4804):[G:0.22] | var(4821):[A:0.05]
AACTCCAGGC AGGACTTCTC ACCAGCAGTC GTGGGGAACG GAGGAGGACA 4900
TGGGGAGGTT GTGGGGCCTC AGGCTCCGGG CACCAGGGGC CAACCTCAGG 4950
CTCCTAAAGA GACATTTTCC GCCCACTCCT GGGACACTCC GTCTGCTCCA 5000
ATGACTGAGC AGCATCCACC CCACCCCATC TTTGCTGCCA GCTCTCAGGA 5050
CCGTGCCCTC GTCAGCTGGG ATGTGAAGTC TCTGGGTGGA AGTGTGTGCC 5100
AAGAGCTACT CCCACAGCAG CCCCAGGAGA AGGGGCTTTG TGACCAGAAA 5150
GCTTCATCCA CAGCCTTGCA GCGGCTCCTG CAAAAGGAGG TGAAATCCCT 5200
GCCTCAGGCC AAGGGACCAG GTTTGCAGGA GCCCCCCTAG TGGTATGGGG 5250 | var(5245):[G:0.18]
CTGAGCCCTC CTGAGGGCCG GTTCTAAGGC TCAGACTGGG CACTGGGGCC 5300
TCAGCCTGCT TTCCTGCAGC AGTCGCCCAA GCAGACAGCC CTGGCAAATG 5350
CCTGACTCAG TGACCAGTGC CTGTGAGCAT GGGGCCAGGA AAGTCTGGTA 5400
ATAAATGTGA CTCAGCATCA CCCACCTTAG CCCCTTCCAG AAAGTGCTTG 5450
AAGTTTGCGG GTGGAGGGAT GGGGGAGGGG AAGGTGGGCA GGGGTGAGAG 5500
TCGAGAGGGA AGAAAGGAGT CCCGGAAAAC GTGGCTGCCT CCCCAGGTGA 5550
GGAAGCCACA GCCCCAGAGG CCCCAAATGC CTGGGGAGTG TGGAGGTCCC 5600
AACCAGGCTT GCGCTGACCC TGCTTCTCGG TTTTCTCTCC GTGCTGACAA 5650
ACCCCAGCCT AGAGGAAGGA CGAGCAGGTG CAGCAGGGCC CCAGTCCCCT 5700
CCACTCTTGA CGCTGTCCTA GCTGCAGAAG AGGCGGGTTC CCAGCCTTCC 5750
CTGTGACCAC ATGTGACCTC AGCCGGGACA CATCCCTTTG CTGGCCCTGG 5800 | var(5773):[G:0.02]
CCCTGAGTCC CTCCAGCCAT GATGAGCCGT GAATGGGACC ATCCCTGTCC 5850
ACTCTGAGAT GCCTGGAAGG GGGCTCAGTG CAGGTGGGCT GGGGGCTGGG 5900
TCTGCTGTCT GCCCAGCACT GCCATTCTGG GAGTAGGCAG GTGGGGAAGG 5950
GGTCGGGGGT GGAGGGTCTG TGTTCAGCCA GTCCTGGGAA ATGCTTGATG 6000
TGAGGCTTCT GAAGATGGCA GTGAGGCAGA GGCCCAGCCG GCGGAGAAGT 6050 | var(6027):[G:0.03]
CCCTGGGAGT GAGTACCTGG GGATGAACTA TGCTGCCTGG TGCTGGGGAG 6100
CAGTGGCGCC CCTGGGCCAT CCCTCTGCTG AAACCTGGGC GTCTCGCTGA 6150 | var(6133):[G:0.06]
AGAGACCACC TCCATTTCCT CTGCAGAGAC TGAGCACTCA GTCAGCCCCC 6200
TTCCTGGGAC AGGCTCAATG GAGGCTGCAG GGCCATCAGC CGACTCCTAC 6250
GCAGGCTCAG TCAGCAGCCC CCTGGCCAGC CCCACCCCTG ACTGCCGGCC 6300
TCAGAACTGG GAGCTGCTTC CTGGCAGGGC CCGCCTCTGC TGGGAGACCG 6350
GACGGTGAGT CAGCCTTAAG CCCGGCACCA GACCCCTCTG AGGATGGAGC 6400
AGGAGCTGGC TGCCCTGAGG CTGCAAAACT TCTTCCCTCG TGGAGACAGG 6450
GAGGCACCTC AGACACTCAC CCCGGACTCC CTTGAACAGG GACAGGGAGG 6500
AACCCCAGGC AGCTAGACCC CAGCAGCAGC CACACGAGCA CACTGTGGGG 6550
CAGGGAGGGG CATCTCTTGA GAACAAAAGA TCCATTTCTC GACTTTCCAA 6600 | var(6590):[A:0.03]
ACTGGAGAGC TTCTTGAGAG AAAAGAGAGA GACAGGTACA GGTCCACGCC 6650 | var(6620):[C:0.01]
ACCCACACAC AGCCCTGTGC ACACAGACCG GACACAGGCG TCCACAGGCA 6700 | var(6690):[A:0.01]
AGTTCGCAGC TGCTCATTTT GTGAAGTGAA TGCTGATTTG GGGGCCGGGT 6750
GGGGTTCGTC TGTACATCGT GCACTGTCAG ACCCTTCCTG AAGGATTTTT 6800
GTTACTGAAG TATCAGAAGG CCCTTGTTCT AAGGTGGTGG CACTGTAATA 6850
TCTGGCCCAG GAGGAGGTCA GTGCCGTGCC GGCGAGTCCT TTGCTCCCTT 6900
CCTTCTCTGA CCAGTAAACG CATCTCCAGT CGCTCCCCCG AGGCCCCCCT 6950
GCACGCAGTC TCCGACCTCA GAGAGTGAGT CAGATAGAAG CCGCTGCCCA 7000
CCCTCCCCCA CCCTGGCCGG GTTCTTGCCT GGCTTGTGCG TCCTTG