Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000700 C 0.05 0.29 0.06 0.00 0.11 T 0.95 0.71 0.94 1.00 0.89 0.10 0.41 0.12 0.00 0.20 000823 G 0.04 0.28 0.06 0.00 0.11 C 0.96 0.72 0.94 1.00 0.89 0.07 0.40 0.12 0.00 0.19 001802 T 0.09 0.25 0.09 0.00 0.11 C 0.91 0.75 0.91 1.00 0.89 0.17 0.38 0.17 0.00 0.19 002003 - 0.12 0.11 0.07 0.02 0.08 + 0.88 0.89 0.93 0.98 0.92 0.22 0.20 0.13 0.04 0.15 068919 A 0.00 0.06 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.94 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.00 0.13 0.06 068952 G 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 A 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.20 069381 T 0.08 0.23 0.07 0.00 0.10 C 0.92 0.77 0.93 1.00 0.90 0.15 0.35 0.13 0.00 0.18 069445 G 0.02 0.20 0.18 0.39 0.20 A 0.98 0.80 0.82 0.61 0.80 0.04 0.31 0.30 0.47 0.31 077584 T 0.08 0.25 0.09 0.02 0.11 G 0.92 0.75 0.91 0.98 0.89 0.15 0.38 0.17 0.04 0.20 077597 C 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 077611 C 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 077764 - 0.08 0.25 0.09 0.04 0.12 + 0.92 0.75 0.91 0.96 0.88 0.15 0.38 0.17 0.08 0.21 078207 + 0.08 0.24 0.07 0.00 0.10 - 0.92 0.76 0.93 1.00 0.90 0.15 0.36 0.13 0.00 0.18 078401 C 0.08 0.26 0.11 0.00 0.11 T 0.92 0.74 0.89 1.00 0.89 0.15 0.39 0.19 0.00 0.20 078597 T 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 C 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 078818 A 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 G 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 078976 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 079168 G 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 A 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 079194 G 0.04 0.00 0.02 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 0.00 0.03 079218 C 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 079550 A 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 G 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 079589 G 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 A 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.25 0.00 0.00 0.00 0.07 079608 A 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 G 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 079663 A 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 C 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 079731 C 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 079855 C 0.23 0.00 0.00 0.00 0.06 T 0.77 1.00 1.00 1.00 0.94 0.35 0.00 0.00 0.00 0.11 080091 T 0.08 0.24 0.10 0.00 0.10 G 0.92 0.76 0.90 1.00 0.90 0.15 0.36 0.18 0.00 0.19 080096 C 0.08 0.35 0.62 0.71 0.43 G 0.92 0.65 0.38 0.29 0.57 0.15 0.46 0.47 0.41 0.49 080118 G 0.08 0.23 0.10 0.02 0.11 A 0.92 0.77 0.90 0.98 0.89 0.15 0.35 0.18 0.04 0.19 080496 C 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 T 0.81 1.00 1.00 1.00 0.95 0.30 0.00 0.00 0.00 0.09 080598 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 080672 A 0.10 0.35 0.53 0.38 0.35 G 0.90 0.65 0.47 0.62 0.65 0.18 0.45 0.50 0.47 0.46 080677 T 0.33 0.22 0.13 0.06 0.18 A 0.67 0.78 0.87 0.94 0.82 0.44 0.34 0.23 0.11 0.30 080856 G 0.09 0.23 0.09 0.00 0.10 C 0.91 0.77 0.91 1.00 0.90 0.16 0.35 0.17 0.00 0.18 080857 G 0.09 0.23 0.09 0.00 0.10 T 0.91 0.77 0.91 1.00 0.90 0.16 0.35 0.17 0.00 0.18 080880 G 0.09 0.23 0.09 0.00 0.10 A 0.91 0.77 0.91 1.00 0.90 0.16 0.35 0.17 0.00 0.18 081114 G 0.08 0.24 0.09 0.00 0.10 A 0.92 0.76 0.91 1.00 0.90 0.15 0.36 0.17 0.00 0.19 081192 A 0.08 0.24 0.09 0.00 0.10 G 0.92 0.76 0.91 1.00 0.90 0.15 0.36 0.17 0.00 0.19 081198 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 081208 - 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 + 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 081277 C 0.08 0.23 0.09 0.00 0.10 T 0.92 0.77 0.91 1.00 0.90 0.15 0.35 0.17 0.00 0.18 081398 T 0.02 0.05 0.03 0.10 0.05 C 0.98 0.95 0.97 0.90 0.95 0.04 0.10 0.05 0.17 0.09 081516 A 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 081552 A 0.09 0.25 0.09 0.00 0.11 G 0.91 0.75 0.91 1.00 0.89 0.16 0.38 0.17 0.00 0.19 081555 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 081761 T 0.00 0.00 0.00 0.06 0.02 C 1.00 1.00 1.00 0.94 0.98 0.00 0.00 0.00 0.12 0.03 081820 T 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 C 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99 0.04 0.00 0.00 0.04 0.02 081893 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 082001 G 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 A 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 083864 G 0.09 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.91 0.75 0.91 1.00 0.89 0.17 0.38 0.17 0.00 0.20 083939 T 0.09 0.25 0.09 0.00 0.11 C 0.91 0.75 0.91 1.00 0.89 0.16 0.38 0.17 0.00 0.19 083964 G 0.67 0.42 0.27 0.15 0.38 A 0.33 0.58 0.73 0.85 0.62 0.44 0.49 0.40 0.26 0.47 084151 A 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 084906 A 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 084915 T 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 A 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 085208 G 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 A 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 085365 C 0.25 0.18 0.14 0.15 0.18 G 0.75 0.82 0.86 0.85 0.82 0.38 0.30 0.24 0.25 0.29 085506 G 0.08 0.27 0.09 0.00 0.11 A 0.92 0.73 0.91 1.00 0.89 0.15 0.40 0.17 0.00 0.19 085701 C 0.08 0.27 0.07 0.00 0.11 T 0.92 0.73 0.93 1.00 0.89 0.15 0.40 0.13 0.00 0.19 085702 A 0.08 0.27 0.07 0.00 0.10 G 0.92 0.73 0.93 1.00 0.90 0.15 0.40 0.13 0.00 0.19 085891 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 A 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 085960 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 086035 A 0.08 0.27 0.09 0.00 0.11 G 0.92 0.73 0.91 1.00 0.89 0.15 0.40 0.17 0.00 0.19 086101 A 0.08 0.25 0.07 0.00 0.10 G 0.92 0.75 0.93 1.00 0.90 0.15 0.38 0.14 0.00 0.18 088279 T 0.02 0.17 0.14 0.08 0.10 A 0.98 0.83 0.86 0.92 0.90 0.04 0.28 0.24 0.15 0.18 088484 T 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 C 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 089517 A 0.10 0.23 0.09 0.00 0.10 G 0.90 0.77 0.91 1.00 0.90 0.17 0.35 0.17 0.00 0.19 089597 T 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.05 0.01 089641 T 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 089678 A 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 089737 C 0.00 0.02 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.00 0.05 0.02 089761 A 0.02 0.04 0.00 0.00 0.02 G 0.98 0.96 1.00 1.00 0.98 0.04 0.08 0.00 0.00 0.03 090044 T 0.08 0.25 0.09 0.02 0.11 C 0.92 0.75 0.91 0.98 0.89 0.15 0.38 0.17 0.04 0.20 090076 A 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 G 0.98 1.00 1.00 0.98 0.99 0.04 0.00 0.00 0.04 0.02 090126 G 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 090128 G 0.00 0.06 0.00 0.00 0.02 A 1.00 0.94 1.00 1.00 0.98 0.00 0.12 0.00 0.00 0.03 090187 A 0.00 0.04 0.05 0.02 0.03 G 1.00 0.96 0.95 0.98 0.97 0.00 0.08 0.09 0.04 0.05 090292 A 0.09 0.26 0.09 0.00 0.11 G 0.91 0.74 0.91 1.00 0.89 0.16 0.39 0.17 0.00 0.20 090294 T 0.09 0.09 0.30 0.21 0.17 C 0.91 0.91 0.70 0.79 0.83 0.16 0.16 0.42 0.34 0.28 090305 C 0.08 0.25 0.09 0.02 0.11 T 0.92 0.75 0.91 0.98 0.89 0.15 0.38 0.17 0.04 0.20 090392 T 0.14 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.86 1.00 1.00 1.00 0.97 0.24 0.00 0.00 0.00 0.06 090547 T 0.08 0.25 0.10 0.00 0.10 C 0.92 0.75 0.90 1.00 0.90 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 090586 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 090603 - 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 + 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.05 0.00 0.00 0.01 093108 T 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 C 1.00 1.00 0.95 1.00 0.99 0.00 0.00 0.10 0.00 0.02 093395 A 0.00 0.02 0.05 0.00 0.02 G 1.00 0.98 0.95 1.00 0.98 0.00 0.04 0.10 0.00 0.03 093477 A 0.08 0.25 0.08 0.00 0.10 G 0.92 0.75 0.92 1.00 0.90 0.15 0.38 0.15 0.00 0.19 093572 T 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 C 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 093603 C 0.08 0.25 0.10 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.90 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 094532 T 0.50 0.48 0.39 0.26 0.41 C 0.50 0.52 0.61 0.74 0.59 0.50 0.50 0.48 0.39 0.48 094595 - 0.00 0.00 0.09 0.00 0.02 + 1.00 1.00 0.91 1.00 0.98 0.00 0.00 0.17 0.00 0.04 094672 G 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 A 1.00 0.98 1.00 1.00 0.99 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 094783 A 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 C 0.85 1.00 1.00 1.00 0.96 0.25 0.00 0.00 0.00 0.07 094977 * 095009 T 0.09 0.24 0.07 0.00 0.10 C 0.91 0.76 0.93 1.00 0.90 0.16 0.36 0.14 0.00 0.18 095010 A 0.13 0.24 0.38 0.50 0.31 G 0.87 0.76 0.62 0.50 0.69 0.23 0.36 0.47 0.50 0.43 095159 G 0.04 0.00 0.03 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.97 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 0.00 0.03 095170 T 0.09 0.24 0.07 0.00 0.10 C 0.91 0.76 0.93 1.00 0.90 0.16 0.36 0.14 0.00 0.18 095357 A 0.09 0.24 0.07 0.00 0.10 T 0.91 0.76 0.93 1.00 0.90 0.16 0.36 0.13 0.00 0.18 095583 - 0.00 0.00 0.13 0.04 0.04 + 1.00 1.00 0.87 0.96 0.96 0.00 0.00 0.23 0.08 0.08 095903 G 0.09 0.28 0.09 0.00 0.11 C 0.91 0.72 0.91 1.00 0.89 0.17 0.40 0.16 0.00 0.20 096130 - 0.09 0.31 0.09 0.00 0.11 + 0.91 0.69 0.91 1.00 0.89 0.17 0.42 0.17 0.00 0.20 096265 T 0.07 0.24 0.10 0.00 0.10 C 0.93 0.76 0.90 1.00 0.90 0.13 0.36 0.17 0.00 0.18 096316 A 0.07 0.24 0.09 0.00 0.10 G 0.93 0.76 0.91 1.00 0.90 0.13 0.36 0.17 0.00 0.17 096652 C 0.28 0.25 0.52 0.74 0.45 T 0.72 0.75 0.48 0.26 0.55 0.41 0.38 0.50 0.39 0.50 096670 C 0.09 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.91 0.75 0.91 1.00 0.89 0.16 0.38 0.17 0.00 0.19 098118 C 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 098194 A 0.07 0.25 0.07 0.00 0.10 G 0.93 0.75 0.93 1.00 0.90 0.13 0.38 0.14 0.00 0.19 098198 A 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.88 1.00 1.00 1.00 0.97 0.21 0.00 0.00 0.00 0.06 098646 T 0.08 0.26 0.08 0.00 0.12 G 0.92 0.74 0.92 1.00 0.88 0.14 0.39 0.15 0.00 0.21 098775 + 0.07 0.02 0.00 0.00 0.02 - 0.93 0.98 1.00 1.00 0.98 0.12 0.04 0.00 0.00 0.04 099039 G 0.11 0.21 0.09 0.00 0.11 A 0.89 0.79 0.91 1.00 0.89 0.19 0.34 0.17 0.00 0.19 099111 A 0.11 0.24 0.09 0.00 0.11 G 0.89 0.76 0.91 1.00 0.89 0.19 0.36 0.16 0.00 0.20 099124 T 0.00 0.00 0.15 0.13 0.07 C 1.00 1.00 0.85 0.87 0.93 0.00 0.00 0.25 0.23 0.12 099175 G 0.13 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.87 1.00 1.00 1.00 0.97 0.23 0.00 0.00 0.00 0.06 099241 G 0.11 0.26 0.09 0.00 0.12 C 0.89 0.74 0.91 1.00 0.88 0.19 0.39 0.16 0.00 0.21 099668 T 0.03 0.04 0.06 0.10 0.06 C 0.97 0.96 0.94 0.90 0.94 0.06 0.08 0.11 0.17 0.11 099816 A 0.12 0.20 0.12 0.00 0.11 G 0.88 0.80 0.88 1.00 0.89 0.22 0.31 0.21 0.00 0.19 099854 G 0.44 0.41 0.53 0.57 0.49 A 0.56 0.59 0.47 0.43 0.51 0.49 0.48 0.50 0.49 0.50 099963 + 0.06 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.94 1.00 1.00 1.00 0.99 0.12 0.00 0.00 0.00 0.03 101860 A 0.17 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.83 1.00 1.00 1.00 0.97 0.28 0.00 0.00 0.00 0.05 102071 T 0.00 0.07 0.00 0.00 0.02 C 1.00 0.93 1.00 1.00 0.98 0.00 0.14 0.00 0.00 0.04 102126 C 0.08 0.25 0.10 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.90 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 102139 A 0.08 0.00 0.00 0.02 0.02 G 0.92 1.00 1.00 0.98 0.98 0.15 0.00 0.00 0.04 0.04 102153 G 0.08 0.25 0.10 0.00 0.11 C 0.92 0.75 0.90 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 102256 G 0.09 0.25 0.10 0.00 0.11 A 0.91 0.75 0.90 1.00 0.89 0.17 0.38 0.17 0.00 0.19 102299 A 0.10 0.28 0.10 0.00 0.12 G 0.90 0.72 0.90 1.00 0.88 0.18 0.40 0.17 0.00 0.21 102334 G 0.10 0.25 0.07 0.00 0.10 T 0.90 0.75 0.93 1.00 0.90 0.18 0.38 0.13 0.00 0.18 103006 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 103245 C 0.08 0.23 0.09 0.00 0.10 T 0.92 0.77 0.91 1.00 0.90 0.15 0.35 0.17 0.00 0.18 103290 A 0.02 0.08 0.00 0.00 0.03 G 0.98 0.92 1.00 1.00 0.97 0.04 0.15 0.00 0.00 0.05 103405 A 0.00 0.04 0.09 0.00 0.03 G 1.00 0.96 0.91 1.00 0.97 0.00 0.08 0.17 0.00 0.06 103707 G 0.10 0.25 0.10 0.00 0.11 C 0.90 0.75 0.90 1.00 0.89 0.17 0.38 0.18 0.00 0.20 103853 G 0.10 0.25 0.10 0.02 0.12 A 0.90 0.75 0.90 0.98 0.88 0.17 0.38 0.18 0.04 0.21 103858 A 0.02 0.16 0.12 0.05 0.09 G 0.98 0.84 0.88 0.95 0.91 0.05 0.27 0.22 0.09 0.16 104347 A 0.02 0.02 0.02 0.00 0.02 G 0.98 0.98 0.98 1.00 0.98 0.04 0.04 0.05 0.00 0.03 104371 C 0.08 0.29 0.10 0.00 0.11 T 0.92 0.71 0.90 1.00 0.89 0.15 0.41 0.17 0.00 0.20 104382 T 0.08 0.29 0.10 0.00 0.11 A 0.92 0.71 0.90 1.00 0.89 0.15 0.41 0.17 0.00 0.20 116109 C 0.00 0.00 0.03 0.00 0.01 T 1.00 1.00 0.97 1.00 0.99 0.00 0.00 0.05 0.00 0.01 116119 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 116772 A 0.33 0.19 0.34 0.04 0.22 G 0.67 0.81 0.66 0.96 0.78 0.44 0.30 0.45 0.08 0.35 116780 A 0.00 0.02 0.02 0.00 0.01 G 1.00 0.98 0.98 1.00 0.99 0.00 0.04 0.04 0.00 0.02 116901 A 0.00 0.00 0.20 0.25 0.11 C 1.00 1.00 0.80 0.75 0.89 0.00 0.00 0.33 0.38 0.20 118044 A 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 C 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 118198 T 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 C 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 118209 C 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 G 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 120996 A 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 G 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 121052 A 0.08 0.31 0.16 0.54 0.28 G 0.92 0.69 0.84 0.46 0.72 0.15 0.43 0.27 0.50 0.40 121158 T 0.45 0.26 0.09 0.00 0.20 C 0.55 0.74 0.91 1.00 0.80 0.50 0.39 0.17 0.00 0.32 124598 G 0.00 0.00 0.20 0.28 0.12 C 1.00 1.00 0.80 0.72 0.88 0.00 0.00 0.33 0.40 0.21 124617 A 0.09 0.28 0.09 0.00 0.11 C 0.91 0.72 0.91 1.00 0.89 0.17 0.40 0.17 0.00 0.20 124749 C 0.09 0.28 0.32 0.28 0.24 T 0.91 0.72 0.68 0.72 0.76 0.17 0.40 0.43 0.40 0.36 124771 T 0.00 0.03 0.02 0.00 0.01 C 1.00 0.97 0.98 1.00 0.99 0.00 0.05 0.04 0.00 0.02 124851 A 0.10 0.21 0.09 0.00 0.09 G 0.90 0.79 0.91 1.00 0.91 0.17 0.34 0.17 0.00 0.17 124942 G 0.10 0.21 0.09 0.00 0.09 T 0.90 0.79 0.91 1.00 0.91 0.17 0.34 0.17 0.00 0.17 125006 + 0.00 0.17 0.00 0.00 0.04 - 1.00 0.83 1.00 1.00 0.96 0.00 0.28 0.00 0.00 0.08 125487 C 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 G 0.92 1.00 1.00 1.00 0.98 0.15 0.00 0.00 0.00 0.04 130186 G 0.11 0.25 0.10 0.00 0.11 A 0.89 0.75 0.90 1.00 0.89 0.20 0.38 0.17 0.00 0.20 130196 T 0.11 0.25 0.10 0.00 0.11 C 0.89 0.75 0.90 1.00 0.89 0.20 0.38 0.17 0.00 0.20 130284 G 0.10 0.25 0.10 0.00 0.11 A 0.90 0.75 0.90 1.00 0.89 0.18 0.38 0.17 0.00 0.19 130843 C 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 130893 A 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 G 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 131056 + 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 - 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 131129 - 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 + 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 131152 G 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 A 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 131282 A 0.00 0.02 0.09 0.00 0.03 G 1.00 0.98 0.91 1.00 0.97 0.00 0.04 0.17 0.00 0.05 131699 C 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 T 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 131725 + 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 - 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 131867 T 0.10 0.00 0.00 0.00 0.03 C 0.90 1.00 1.00 1.00 0.97 0.19 0.00 0.00 0.00 0.05 131887 C 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 T 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 131966 + 0.43 0.33 0.42 0.42 0.40 - 0.57 0.67 0.58 0.58 0.60 0.49 0.44 0.49 0.49 0.48 132028 + 0.09 0.25 0.09 0.00 0.11 - 0.91 0.75 0.91 1.00 0.89 0.16 0.38 0.17 0.00 0.19 132150 C 0.08 0.25 0.09 0.00 0.11 A 0.92 0.75 0.91 1.00 0.89 0.15 0.38 0.17 0.00 0.19 132218 C 0.08 0.24 0.09 0.00 0.10 T 0.92 0.76 0.91 1.00 0.90 0.15 0.36 0.17 0.00 0.18 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent HD: Hispanic_Descent XD: Asian_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 002003: G 077764: a 078207: accacta 081208: G 090603: cctcccagg 094595: TTCA 095583: tagtg 096130: a 098775: a 099963: c 125006: a 131056: t 131129: t 131725: CT 131966: T 132028: T Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop 094977 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.13 0.00 0.03 0.00 0.04 A 0.85 1.00 0.97 1.00 0.96