Site Allele1 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop HD-pop XD-pop Total-pop AD-hz ED-hz HD-hz XD-hz Total-hz 000159 - 0.27 0.70 0.62 0.28 0.46 + 0.73 0.30 0.38 0.72 0.54 0.39 0.42 0.47 0.41 0.50 000533 A 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 G 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000583 G 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 C 1.00 1.00 1.00 0.96 0.99 0.00 0.00 0.00 0.08 0.02 000690 + 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 - 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 000908 C 0.26 0.72 0.62 0.26 0.46 T 0.74 0.28 0.38 0.74 0.54 0.39 0.41 0.47 0.39 0.50 001343 C 0.34 0.70 0.71 0.29 0.49 T 0.66 0.30 0.29 0.71 0.51 0.45 0.42 0.41 0.41 0.50 001443 C 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 001598 T 0.31 0.70 0.64 0.27 0.47 A 0.69 0.30 0.36 0.73 0.53 0.43 0.42 0.46 0.39 0.50 001636 T 0.31 0.70 0.64 0.27 0.47 G 0.69 0.30 0.36 0.73 0.53 0.43 0.42 0.46 0.39 0.50 002087 C 0.33 0.72 0.66 0.26 0.48 T 0.67 0.28 0.34 0.74 0.52 0.44 0.41 0.45 0.39 0.50 002128 G 0.35 0.72 0.65 0.25 0.49 A 0.65 0.28 0.35 0.75 0.51 0.45 0.41 0.45 0.38 0.50 002888 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 010279 T 0.10 0.69 0.59 0.27 0.42 C 0.90 0.31 0.41 0.73 0.58 0.17 0.43 0.48 0.39 0.49 010349 G 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.05 0.00 0.00 0.00 0.01 010508 A 0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 G 1.00 1.00 1.00 0.98 0.99 0.00 0.00 0.00 0.04 0.01 010592 C 0.02 0.00 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.04 0.00 0.02 010816 G 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 A 1.00 1.00 0.98 1.00 0.99 0.00 0.00 0.04 0.00 0.01 010950 A 0.09 0.69 0.59 0.27 0.41 G 0.91 0.31 0.41 0.73 0.59 0.16 0.43 0.48 0.39 0.48 011160 C 0.09 0.19 0.34 0.73 0.34 T 0.91 0.81 0.66 0.27 0.66 0.16 0.30 0.45 0.39 0.45 011177 T 0.13 0.00 0.00 0.00 0.03 A 0.87 1.00 1.00 1.00 0.97 0.23 0.00 0.00 0.00 0.06 011336 T 0.09 0.69 0.61 0.27 0.42 C 0.91 0.31 0.39 0.73 0.58 0.17 0.43 0.47 0.39 0.49 011360 A 0.65 0.12 0.05 0.00 0.20 G 0.35 0.88 0.95 1.00 0.80 0.45 0.22 0.09 0.00 0.33 011600 A 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 G 1.00 0.96 1.00 1.00 0.99 0.00 0.08 0.00 0.00 0.02 011905 T 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 C 0.98 1.00 1.00 1.00 0.99 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 012115 T 0.10 0.69 0.60 0.27 0.41 G 0.90 0.31 0.40 0.73 0.59 0.19 0.43 0.48 0.39 0.48 013214 C 0.04 0.00 0.00 0.00 0.01 T 0.96 1.00 1.00 1.00 0.99 0.08 0.00 0.00 0.00 0.02 013301 A 0.65 0.13 0.05 0.00 0.21 G 0.35 0.87 0.95 1.00 0.79 0.45 0.23 0.10 0.00 0.33 029861 - 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: deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000159: GT 000690: AGT 029861: a 040875: T 042870: TGAT