Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000114 T 0.00 0.11 0.05 C 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.10 000171 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000178 T 0.00 0.13 0.06 C 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 000251 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000290 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000345 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 000499 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000537 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 000614 G 0.20 0.46 0.33 A 0.80 0.54 0.67 0.31 0.50 0.44 000664 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 000749 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001284 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 001369 T 0.04 0.02 0.03 C 0.96 0.98 0.97 0.08 0.04 0.06 001393 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001432 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002020 A 0.43 0.26 0.35 G 0.57 0.74 0.65 0.49 0.39 0.46 002522 A 0.07 0.67 0.37 G 0.93 0.33 0.63 0.12 0.44 0.47 002678 + 0.09 0.00 0.04 - 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 002745 C 0.07 0.67 0.37 G 0.93 0.33 0.63 0.12 0.44 0.47 003620 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 003826 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005064 C 0.22 0.03 0.14 T 0.78 0.97 0.86 0.34 0.06 0.24 005236 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005534 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005582 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 005989 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006824 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006990 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007214 C 0.22 0.00 0.11 G 0.78 1.00 0.89 0.34 0.00 0.20 007280 T 0.10 0.55 0.32 C 0.90 0.45 0.68 0.19 0.50 0.43 007704 T 0.14 0.02 0.08 C 0.86 0.98 0.92 0.24 0.04 0.15 007743 G 0.00 0.68 0.34 T 1.00 0.32 0.66 0.00 0.43 0.45 007970 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 007996 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008132 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008337 T 0.21 0.00 0.11 C 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 010120 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 010268 T 0.31 0.00 0.16 C 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 010371 C 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 010737 C 0.15 0.50 0.32 T 0.85 0.50 0.68 0.25 0.50 0.43 010826 A 0.15 0.02 0.09 G 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 010891 A 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 011001 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011288 A 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 011453 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 011454 T 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 011497 G 0.02 0.02 0.02 A 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 011732 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 011762 A 0.15 0.32 0.23 G 0.85 0.68 0.77 0.25 0.43 0.35 011769 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012026 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 012115 A 0.17 0.35 0.26 G 0.83 0.65 0.74 0.28 0.45 0.38 012291 T 0.14 0.00 0.07 G 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.14 012593 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 012695 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 013655 C 0.02 0.30 0.15 T 0.98 0.70 0.85 0.04 0.42 0.26 013878 A 0.15 0.02 0.09 T 0.85 0.98 0.91 0.25 0.04 0.16 013932 G 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 014516 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 014522 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 014559 A 0.12 0.02 0.07 G 0.88 0.98 0.93 0.22 0.04 0.14 014693 A 0.21 0.00 0.11 T 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 014743 A 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 014915 A 0.21 0.00 0.11 G 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 014980 A 0.10 0.50 0.30 G 0.90 0.50 0.70 0.19 0.50 0.42 015016 C 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015025 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 015058 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015082 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015267 A 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 015296 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015525 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015641 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015720 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015778 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015857 T 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 015891 T 0.31 0.00 0.16 G 0.69 1.00 0.84 0.43 0.00 0.27 016866 G 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017019 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017211 A 0.08 0.00 0.04 G 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 017258 A 0.06 0.00 0.03 T 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 017506 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 017715 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017732 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017744 A 0.07 0.61 0.34 C 0.93 0.39 0.66 0.13 0.48 0.45 017901 A 0.16 0.00 0.08 G 0.84 1.00 0.92 0.27 0.00 0.14 018086 A 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.17 0.00 0.08 018238 T 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 018431 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 018665 A 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000664: t 002678: atga 018431: g