Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 001152 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001155 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 001923 AA 21 22 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 002386 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 18 18 36 0.014 0.000 0.007 002396 CC 18 18 36 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.007 002544 CC 17 18 35 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.059 0.000 0.029 002677 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 15 17 32 0.263 0.000 0.125 002822 CC 18 18 36 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.007 003018 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 15 17 32 0.263 0.000 0.125 003247 CC 0 0 0 CT 4 0 4 TT 17 22 39 0.233 0.000 0.102 003270 CC 10 21 31 CG 9 1 10 GG 2 0 2 0.000 0.012 0.927 003649 CC 1 0 1 CG 4 0 4 GG 11 22 33 0.515 0.000 2.899 003906 AA 2 0 2 AG 9 0 9 GG 13 23 36 0.061 0.000 1.816 003970 AA 13 23 36 AG 9 0 9 GG 2 0 2 0.061 0.000 1.816 005346 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 11 23 34 0.093 0.000 2.289 005478 AA 20 23 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 005508 AA 2 0 2 AC 7 0 7 CC 12 23 35 0.399 0.000 3.273 005832 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 005913 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 006013 GG 22 23 45 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 006090 CC 7 11 18 CG 11 11 22 GG 6 1 7 0.160 0.741 0.004 006137 CC 2 0 2 CT 10 0 10 TT 12 23 35 0.002 0.000 1.214 006345 AA 2 0 2 AG 10 0 10 GG 11 22 33 0.017 0.000 1.069 006590 AA 22 19 41 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.024 006772 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 18 39 0.048 0.000 0.026 006891 AA 2 0 2 AG 9 0 9 GG 12 12 24 0.028 0.000 0.785 006955 CC 12 16 28 CT 9 0 9 TT 2 0 2 0.028 0.000 1.117 006984 AA 23 14 37 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.018 0.007 007796 AA 2 0 2 AG 10 0 10 GG 10 20 30 0.050 0.000 0.857 007804 AA 1 0 1 AG 7 0 7 GG 14 19 33 0.011 0.000 0.654 007930 CC 20 20 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 008441 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 16 38 0.000 0.016 0.007 008469 GG 2 0 2 GT 9 0 9 TT 11 17 28 0.007 0.000 1.117 008484 GG 2 0 2 GT 9 0 9 TT 11 17 28 0.007 0.000 1.117 009168 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 20 21 41 0.012 0.000 0.006 009190 CC 10 21 31 CG 9 0 9 GG 2 0 2 0.000 0.000 1.375 009307 CC 3 0 3 CT 8 0 8 TT 10 21 31 0.429 0.000 4.149 009379 AA 1 0 1 AG 4 0 4 GG 16 21 37 1.037 0.000 3.341 009523 AA 20 21 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 009592 AA 19 23 42 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.118 0.000 0.054 009769 CC 12 22 34 CT 10 0 10 TT 2 0 2 0.002 0.000 1.141 009858 GG 16 22 38 GT 7 0 7 TT 1 0 1 0.044 0.000 0.875 010007 AA 7 11 18 AG 11 11 22 GG 6 1 7 0.160 0.741 0.004 010073 CC 2 0 2 CT 10 0 10 TT 12 23 35 0.002 0.000 1.214 010092 CC 6 1 7 CG 11 11 22 GG 7 11 18 0.160 0.741 0.004 010337 CC 2 0 2 CG 10 0 10 GG 12 22 34 0.002 0.000 1.141 010426 AA 2 0 2 AC 10 0 10 CC 12 22 34 0.002 0.000 1.141 010500 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 011556 AA 12 23 35 AG 10 0 10 GG 2 0 2 0.002 0.000 1.214 011657 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 011722 CC 17 23 40 CT 7 0 7 TT 0 0 0 0.700 0.000 0.304 011817 CC 0 0 0 CT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 011993 AA 23 23 46 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 012198 CC 0 0 0 CG 0 4 4 GG 24 17 41 0.000 0.233 0.097 012253 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 21 43 0.045 0.000 0.023 012291 CC 2 0 2 CT 10 0 10 TT 12 21 33 0.002 0.000 1.069 012381 CC 12 21 33 CT 10 0 10 TT 2 0 2 0.002 0.000 1.069 012419 AA 12 21 33 AG 10 0 10 GG 2 0 2 0.002 0.000 1.069 012987 GG 21 23 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 012999 CC 2 0 2 CT 7 0 7 TT 13 23 36 0.505 0.000 3.404 013130 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 013132 GG 21 23 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 013138 CC 2 0 2 CT 5 0 5 TT 14 23 37 1.802 0.000 6.392 013140 AA 13 23 36 AG 6 0 6 GG 2 0 2 0.948 0.000 4.593 013190 AA 2 0 2 AG 6 0 6 GG 13 23 36 0.948 0.000 4.593 013315 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 21 22 43 0.000 0.011 0.006 013754 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 22 42 0.050 0.000 0.024 013778 CC 1 0 1 CG 8 0 8 GG 11 21 32 0.089 0.000 0.324 013974 AA 21 21 42 AC 0 2 2 CC 0 0 0 0.000 0.048 0.024 014189 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 7 18 25 1.170 0.000 0.356 014228 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 12 18 30 0.021 0.000 0.008 014275 AA 7 18 25 AG 6 0 6 GG 0 0 0 1.170 0.000 0.356 014479 CC 12 18 30 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.021 0.000 0.008 014654 AA 0 0 0 AG 8 0 8 GG 12 18 30 1.250 0.000 0.526 014697 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 14 17 31 0.018 0.000 0.008 014926 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 15 17 32 0.017 0.000 0.008 015368 CC 20 23 43 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.052 015421 AA 14 23 37 AC 7 0 7 CC 2 0 2 0.616 0.000 3.535 015547 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 015607 AA 2 0 2 AG 9 0 9 GG 11 23 34 0.007 0.000 1.638 015610 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 22 22 44 0.000 0.011 0.006 015772 AA 22 21 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 015950 GG 2 0 2 GT 10 0 10 TT 12 23 35 0.002 0.000 1.214 016046 CC 22 23 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 016182 CC 2 0 2 CT 8 0 8 TT 12 22 34 0.153 0.000 2.289 016183 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 12 22 34 0.153 0.000 2.289 016624 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 16 23 39 0.548 0.000 0.230 016748 CC 14 23 37 CT 10 0 10 TT 0 0 0 1.662 0.000 0.666 016775 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 016921 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 016963 CC 1 0 1 CT 9 0 9 TT 14 23 37 0.091 0.000 0.253 017012 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 017456 AA 22 23 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 017513 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 23 22 45 0.000 0.011 0.006 017716 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 19 40 0.012 0.000 0.006 017736 CC 2 0 2 CT 8 0 8 TT 11 19 30 0.093 0.000 1.861 017737 CC 11 19 30 CT 9 0 9 TT 2 0 2 0.007 0.000 1.288 017777 CC 11 19 30 CT 8 0 8 TT 2 0 2 0.093 0.000 1.861 018005 AA 0 0 0 AT 2 0 2 TT 20 18 38 0.050 0.000 0.026 018088 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 018125 AA 2 0 2 AG 10 0 10 GG 12 23 35 0.002 0.000 1.214 018148 CC 16 23 39 CG 7 0 7 GG 1 0 1 0.044 0.000 0.919 018484 AA 11 23 34 AG 9 0 9 GG 2 0 2 0.007 0.000 1.638 018731 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 19 20 39 0.013 0.000 0.006 019446 CC 18 21 39 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.055 0.000 0.026 019727 AA 21 22 43 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.052 019751 GG 22 22 44 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.023 019803 CC 12 22 34 CT 10 0 10 TT 2 0 2 0.002 0.000 1.141 019943 AA 24 19 43 AG 0 3 3 GG 0 0 0 0.000 0.118 0.052 019991 * 020502 CC 19 22 41 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.097 020559 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 21 22 43 0.107 0.000 0.052 020635 CC 2 0 2 CG 8 0 8 GG 11 22 33 0.093 0.000 2.181 020637 AA 20 22 42 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 021010 AA 1 0 1 AG 6 0 6 GG 13 20 33 0.078 0.000 1.111 021656 CC 2 0 2 CT 10 0 10 TT 11 22 33 0.017 0.000 1.069 021683 AA 11 22 33 AG 10 0 10 GG 2 0 2 0.017 0.000 1.069 021722 CC 1 0 1 CT 9 0 9 TT 13 22 35 0.130 0.000 0.207 021815 AA 2 0 2 AG 10 0 10 GG 11 22 33 0.017 0.000 1.069 021979 AA 0 1 1 AG 1 9 10 GG 22 12 34 0.011 0.182 0.067 022212 GG 16 23 39 GT 7 0 7 TT 1 0 1 0.044 0.000 0.919 022322 AA 14 23 37 AT 9 0 9 TT 1 0 1 0.091 0.000 0.253 022505 AA 2 0 2 AG 9 0 9 GG 12 23 35 0.028 0.000 1.727 022715 AA 24 22 46 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.005 022884 AA 14 23 37 AG 9 0 9 GG 1 0 1 0.091 0.000 0.253 023026 AA 12 23 35 AT 9 0 9 TT 2 0 2 0.028 0.000 1.727 023073 AA 2 0 2 AG 9 0 9 GG 12 23 35 0.028 0.000 1.727 023121 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 023139 CC 12 23 35 CT 10 0 10 TT 2 0 2 0.002 0.000 1.214 023158 AA 12 23 35 AG 10 0 10 GG 2 0 2 0.002 0.000 1.214 023278 CC 2 0 2 CT 10 0 10 TT 12 23 35 0.002 0.000 1.214 023441 AA 21 23 44 AT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 023504 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 023797 AA 17 17 34 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.015 0.000 0.007 023809 AA 11 17 28 AC 6 0 6 CC 1 0 1 0.023 0.000 0.822 023920 AA 16 17 33 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.062 0.000 0.030 024371 AA 21 23 44 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 024733 AA 14 21 35 AG 9 0 9 GG 1 0 1 0.091 0.000 0.207 025175 AA 17 22 39 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.131 0.000 0.058 025520 CC 19 22 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.013 0.000 0.006 025577 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 025857 GG 14 23 37 GT 9 0 9 TT 1 0 1 0.091 0.000 0.253 026022 AA 14 23 37 AG 9 0 9 GG 1 0 1 0.091 0.000 0.253 026152 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 026334 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 20 8 28 0.000 0.031 0.009 026467 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 19 9 28 0.053 0.000 0.036 026671 CC 14 23 37 CG 9 0 9 GG 1 0 1 0.091 0.000 0.253 026720 AA 1 0 1 AC 9 0 9 CC 14 23 37 0.091 0.000 0.253 026769 AA 6 1 7 AT 11 11 22 TT 7 11 18 0.160 0.741 0.004 026798 CC 2 0 2 CT 10 0 10 TT 12 23 35 0.002 0.000 1.214 026865 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 026874 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 026884 AA 15 23 38 AG 9 0 9 GG 0 0 0 1.278 0.000 0.527 026955 CC 1 0 1 CT 9 0 9 TT 14 23 37 0.091 0.000 0.253 027082 AA 16 23 39 AG 7 0 7 GG 1 0 1 0.044 0.000 0.919 027329 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop Total-pop 019991 CC 1 0 1 019991 CG 1 0 1 019991 CT 8 0 8 019991 GG 0 0 0 019991 GT 2 0 2 019991 TT 12 22 34