Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 001152 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 001155 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 001923 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002386 A 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 002396 G 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 002544 T 0.05 0.00 0.03 C 0.95 1.00 0.97 0.10 0.00 0.05 002677 A 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 002822 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 003018 C 0.11 0.00 0.06 G 0.89 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 003247 C 0.10 0.00 0.05 T 0.90 1.00 0.95 0.17 0.00 0.09 003270 G 0.31 0.02 0.16 C 0.69 0.98 0.84 0.43 0.04 0.27 003649 C 0.19 0.00 0.08 G 0.81 1.00 0.92 0.30 0.00 0.15 003906 A 0.27 0.00 0.14 G 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 003970 G 0.27 0.00 0.14 A 0.73 1.00 0.86 0.39 0.00 0.24 005346 A 0.29 0.00 0.14 G 0.71 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 005478 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 005508 A 0.26 0.00 0.12 C 0.74 1.00 0.88 0.39 0.00 0.22 005832 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 005913 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006013 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006090 G 0.48 0.28 0.38 C 0.52 0.72 0.62 0.50 0.41 0.47 006137 C 0.29 0.00 0.15 T 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 006345 A 0.30 0.00 0.16 G 0.70 1.00 0.84 0.42 0.00 0.26 006590 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 006772 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.05 006891 A 0.28 0.00 0.19 G 0.72 1.00 0.81 0.41 0.00 0.30 006955 T 0.28 0.00 0.17 C 0.72 1.00 0.83 0.41 0.00 0.28 006984 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 007796 A 0.32 0.00 0.17 G 0.68 1.00 0.83 0.43 0.00 0.28 007804 A 0.20 0.00 0.11 G 0.80 1.00 0.89 0.33 0.00 0.20 007930 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 008441 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 008469 G 0.30 0.00 0.17 T 0.70 1.00 0.83 0.42 0.00 0.28 008484 G 0.30 0.00 0.17 T 0.70 1.00 0.83 0.42 0.00 0.28 009168 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 009190 G 0.31 0.00 0.15 C 0.69 1.00 0.85 0.43 0.00 0.26 009307 C 0.33 0.00 0.17 T 0.67 1.00 0.83 0.44 0.00 0.28 009379 A 0.14 0.00 0.07 G 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 009523 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 009592 G 0.07 0.00 0.03 A 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.06 009769 T 0.29 0.00 0.15 C 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.26 009858 T 0.19 0.00 0.10 G 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.18 010007 G 0.48 0.28 0.38 A 0.52 0.72 0.62 0.50 0.41 0.47 010073 C 0.29 0.00 0.15 T 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 010092 C 0.48 0.28 0.38 G 0.52 0.72 0.62 0.50 0.41 0.47 010337 C 0.29 0.00 0.15 G 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.26 010426 A 0.29 0.00 0.15 C 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.26 010500 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011556 G 0.29 0.00 0.15 A 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 011657 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011722 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 011817 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 011993 T 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012198 C 0.00 0.10 0.04 G 1.00 0.90 0.96 0.00 0.17 0.08 012253 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 012291 C 0.29 0.00 0.16 T 0.71 1.00 0.84 0.41 0.00 0.26 012381 T 0.29 0.00 0.16 C 0.71 1.00 0.84 0.41 0.00 0.26 012419 G 0.29 0.00 0.16 A 0.71 1.00 0.84 0.41 0.00 0.26 012987 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012999 C 0.25 0.00 0.12 T 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.21 013130 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013132 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013138 C 0.21 0.00 0.10 T 0.79 1.00 0.90 0.34 0.00 0.18 013140 G 0.24 0.00 0.11 A 0.76 1.00 0.89 0.36 0.00 0.20 013190 A 0.24 0.00 0.11 G 0.76 1.00 0.89 0.36 0.00 0.20 013315 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 013754 C 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 013778 C 0.25 0.00 0.12 G 0.75 1.00 0.88 0.38 0.00 0.21 013974 C 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 014189 C 0.23 0.00 0.10 T 0.77 1.00 0.90 0.36 0.00 0.17 014228 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.07 0.00 0.03 014275 G 0.23 0.00 0.10 A 0.77 1.00 0.90 0.36 0.00 0.17 014479 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.07 0.00 0.03 014654 A 0.20 0.00 0.11 G 0.80 1.00 0.89 0.32 0.00 0.19 014697 C 0.03 0.00 0.02 T 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 014926 C 0.03 0.00 0.02 G 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 015368 G 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 015421 C 0.24 0.00 0.12 A 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 015547 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 015607 A 0.30 0.00 0.14 G 0.70 1.00 0.86 0.42 0.00 0.25 015610 C 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015772 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 015950 G 0.29 0.00 0.15 T 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 016046 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016182 C 0.27 0.00 0.14 T 0.73 1.00 0.86 0.40 0.00 0.24 016183 A 0.27 0.00 0.14 G 0.73 1.00 0.86 0.40 0.00 0.24 016624 A 0.14 0.00 0.07 G 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.12 016748 T 0.21 0.00 0.11 C 0.79 1.00 0.89 0.33 0.00 0.19 016775 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016921 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 016963 C 0.23 0.00 0.12 T 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 017012 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 017456 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017513 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 017716 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017736 C 0.29 0.00 0.15 T 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.26 017737 T 0.30 0.00 0.16 C 0.70 1.00 0.84 0.42 0.00 0.27 017777 T 0.29 0.00 0.15 C 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.26 018005 A 0.05 0.00 0.03 T 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 018088 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 018125 A 0.29 0.00 0.15 G 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 018148 G 0.19 0.00 0.10 C 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 018484 G 0.30 0.00 0.14 A 0.70 1.00 0.86 0.42 0.00 0.25 018731 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 019446 G 0.05 0.00 0.02 C 0.95 1.00 0.98 0.10 0.00 0.05 019727 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 019751 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 019803 T 0.29 0.00 0.15 C 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.26 019943 G 0.00 0.07 0.03 A 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 019991 * 020502 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 020559 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020635 C 0.29 0.00 0.14 G 0.71 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 020637 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 021010 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.32 0.00 0.18 021656 C 0.30 0.00 0.16 T 0.70 1.00 0.84 0.42 0.00 0.26 021683 G 0.30 0.00 0.16 A 0.70 1.00 0.84 0.42 0.00 0.26 021722 C 0.24 0.00 0.12 T 0.76 1.00 0.88 0.36 0.00 0.21 021815 A 0.30 0.00 0.16 G 0.70 1.00 0.84 0.42 0.00 0.26 021979 A 0.02 0.25 0.13 G 0.98 0.75 0.87 0.04 0.38 0.23 022212 T 0.19 0.00 0.10 G 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 022322 T 0.23 0.00 0.12 A 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 022505 A 0.28 0.00 0.14 G 0.72 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 022715 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 022884 G 0.23 0.00 0.12 A 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 023026 T 0.28 0.00 0.14 A 0.72 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 023073 A 0.28 0.00 0.14 G 0.72 1.00 0.86 0.41 0.00 0.24 023121 G 0.08 0.00 0.04 A 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 023139 T 0.29 0.00 0.15 C 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 023158 G 0.29 0.00 0.15 A 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 023278 C 0.29 0.00 0.15 T 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 023441 T 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 023504 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 023797 G 0.03 0.00 0.01 A 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 023809 C 0.22 0.00 0.11 A 0.78 1.00 0.89 0.35 0.00 0.20 023920 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.10 0.00 0.06 024371 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 024733 G 0.23 0.00 0.12 A 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 025175 G 0.07 0.00 0.04 A 0.93 1.00 0.96 0.14 0.00 0.07 025520 T 0.03 0.00 0.01 C 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 025577 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025857 T 0.23 0.00 0.12 G 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 026022 G 0.23 0.00 0.12 A 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 026152 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 026334 A 0.00 0.06 0.02 G 1.00 0.94 0.98 0.00 0.10 0.03 026467 C 0.05 0.00 0.03 T 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.06 026671 G 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 026720 A 0.23 0.00 0.12 C 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 026769 A 0.48 0.28 0.38 T 0.52 0.72 0.62 0.50 0.41 0.47 026798 C 0.29 0.00 0.15 T 0.71 1.00 0.85 0.41 0.00 0.25 026865 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 026874 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 026884 G 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 026955 C 0.23 0.00 0.12 T 0.77 1.00 0.88 0.35 0.00 0.21 027082 G 0.19 0.00 0.10 A 0.81 1.00 0.90 0.30 0.00 0.17 027329 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 019991 G 0.06 0.00 0.03 C 0.23 0.00 0.12 T 0.71 1.00 0.85