Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000083 CC 20 21 41 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.097 000155 ++ 0 0 0 +- 1 0 1 -- 23 22 45 0.011 0.000 0.006 000169 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 20 43 0.000 0.050 0.023 000581 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 21 44 0.011 0.000 0.006 001026 AA 18 22 40 AC 3 1 4 CC 0 0 0 0.124 0.011 0.100 001064 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 19 23 42 0.013 0.000 0.006 001504 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 21 19 40 0.000 0.053 0.025 001562 AA 0 2 2 AG 3 9 12 GG 20 11 31 0.112 0.007 0.347 001641 CC 21 23 44 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 001687 AA 23 22 45 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.006 001810 CC 21 23 44 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 001915 AA 21 23 44 AT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 002002 AA 0 0 0 AG 5 1 6 GG 18 22 40 0.342 0.011 0.224 002205 CC 1 2 3 CT 10 10 20 TT 8 9 17 0.903 0.107 0.780 002529 AA 20 18 38 AC 0 5 5 CC 0 0 0 0.000 0.342 0.164 002588 CC 16 22 38 CT 5 1 6 TT 0 0 0 0.383 0.011 0.236 002765 GG 16 18 34 GT 5 1 6 TT 0 0 0 0.383 0.014 0.263 003123 AA 17 23 40 AG 0 0 0 GG 1 0 1 18.000 0.000 41.000 003451 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 003547 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 003734 CC 17 22 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.015 0.000 0.006 003930 CC 1 0 1 CT 5 0 5 TT 18 22 40 0.644 0.000 2.368 003939 GG 21 12 33 GT 2 9 11 TT 1 2 3 4.959 0.028 2.074 004001 AA 0 0 0 AC 1 2 3 CC 21 21 42 0.012 0.048 0.054 004111 CC 9 9 18 CG 6 12 18 GG 3 2 5 1.125 0.517 0.023 004191 AA 5 9 14 AG 12 12 24 GG 1 2 3 2.918 0.517 2.804 004378 ++ 0 2 2 +- 3 8 11 -- 14 12 26 0.159 0.153 0.331 004662 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 21 20 41 0.012 0.000 0.006 004733 CC 22 21 43 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 004795 CC 23 21 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 005681 ++ 0 0 0 +- 3 0 3 -- 20 18 38 0.112 0.000 0.059 005810 CC 19 22 41 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.053 0.000 0.024 006232 AA 0 0 0 AG 7 0 7 GG 15 21 36 0.787 0.000 0.338 006353 CC 11 8 19 CT 10 9 19 TT 0 1 1 2.051 0.571 2.211 006387 CC 17 18 35 CG 4 1 5 GG 0 0 0 0.233 0.014 0.178 006419 AA 0 1 1 AC 10 11 21 CC 11 7 18 2.051 1.556 3.169 006567 AA 0 1 1 AG 0 1 1 GG 21 18 39 0.000 8.183 17.537 006624 AA 0 0 0 AG 2 1 3 GG 18 20 38 0.055 0.012 0.059 006799 CC 10 8 18 CT 12 11 23 TT 0 2 2 3.094 0.416 2.512 006827 CC 7 8 15 CG 13 11 24 GG 2 2 4 1.333 0.416 1.626 006922 AA 0 0 0 AG 4 1 5 GG 20 20 40 0.198 0.012 0.156 006939 CC 18 22 40 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.156 007068 AA 18 11 29 AG 5 9 14 GG 1 2 3 0.644 0.007 0.513 007079 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 007200 CC 21 23 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 007209 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 007421 AA 0 2 2 AG 3 9 12 GG 20 12 32 0.112 0.028 0.390 007464 AA 17 11 28 AG 5 7 12 GG 0 2 2 0.362 0.299 0.227 007486 AA 20 12 32 AT 2 8 10 TT 0 2 2 0.050 0.153 0.998 007508 AA 20 12 32 AG 2 9 11 GG 0 2 2 0.050 0.028 0.648 007510 GG 20 12 32 GT 2 9 11 TT 0 2 2 0.050 0.028 0.648 007988 AA 17 10 27 AG 4 10 14 GG 0 2 2 0.233 0.050 0.011 008026 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 22 43 0.012 0.000 0.006 008030 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 008089 AA 8 2 10 AG 9 11 20 GG 7 7 14 1.484 0.601 0.306 008339 CC 13 12 25 CT 11 9 20 TT 0 1 1 2.121 0.182 1.746 008347 CC 24 21 45 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.012 0.006 008381 ++ 8 8 16 +- 14 12 26 -- 2 2 4 1.434 0.702 2.087 008515 CC 14 19 33 CT 4 1 5 TT 0 0 0 0.281 0.013 0.188 008529 CC 6 6 12 CT 11 9 20 TT 0 5 5 3.888 0.191 0.544 008628 CC 0 0 0 CT 3 1 4 TT 20 22 42 0.112 0.011 0.095 008817 CC 20 23 43 CT 3 0 3 TT 1 0 1 2.617 0.000 6.306 009085 AA 0 1 1 AG 1 0 1 GG 14 13 27 0.018 14.000 12.195 009345 CC 0 0 0 CT 4 1 5 TT 13 12 25 0.302 0.021 0.248 009388 ++ 14 9 23 +- 7 12 19 -- 3 2 5 1.642 0.517 0.130 009460 CC 18 23 41 CT 6 0 6 TT 0 0 0 0.490 0.000 0.218 009535 AA 3 5 8 AG 14 12 26 GG 7 6 13 0.960 0.048 0.666 009639 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 23 41 0.490 0.000 0.218 009735 AA 0 6 6 AC 11 9 20 CC 10 2 12 2.644 0.248 0.240 009762 CC 11 7 18 CT 7 10 17 TT 3 1 4 1.018 1.125 0.000 009892 ++ 21 18 39 +- 3 4 7 -- 0 1 1 0.107 1.252 0.919 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000155: + 004378: + 005681: + 008381: + 009388: + 009892: +