Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000290 AA 0 0 0 AG 5 7 12 GG 19 14 33 0.324 0.840 1.065 000370 CC 23 20 43 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.012 0.023 000575 AA 7 1 8 AG 7 5 12 GG 7 16 23 2.333 0.499 5.714 000622 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 22 21 43 0.000 0.012 0.006 000681 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 000784 AA 0 1 1 AG 8 2 10 GG 15 20 35 1.019 4.707 0.080 000925 AA 7 17 24 AG 10 5 15 GG 7 1 8 0.667 0.571 3.633 000970 CC 20 22 42 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 000994 -- 15 21 36 +- 3 0 3 ++ 0 0 0 0.149 0.000 0.062 001039 CC 0 0 0 CT 0 3 3 TT 18 18 36 0.000 0.124 0.062 001051 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 17 21 38 0.015 0.000 0.007 001061 GG 17 17 34 GT 1 4 5 TT 0 0 0 0.015 0.233 0.183 001064 GG 15 21 36 GT 3 0 3 TT 0 0 0 0.149 0.000 0.062 001467 AA 5 1 6 AG 7 4 11 GG 5 16 21 0.529 1.037 3.751 001513 CC 14 21 35 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.159 0.000 0.064 001564 AA 3 1 4 AC 5 3 8 CC 7 16 23 1.195 1.976 4.333 002579 CC 6 14 20 CT 11 8 19 TT 6 1 7 0.043 0.011 0.481 002597 AA 10 1 11 AG 10 8 18 GG 3 14 17 0.040 0.011 1.911 002599 AA 7 1 8 AG 10 8 18 GG 6 14 20 0.381 0.011 1.181 002653 CC 8 13 21 CT 11 8 19 TT 4 1 5 0.004 0.027 0.050 002654 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 19 23 42 0.209 0.000 0.095 003003 CC 0 0 0 CG 6 0 6 GG 16 23 39 0.548 0.000 0.230 003030 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 17 23 40 0.059 0.000 0.025 003076 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 16 23 39 0.548 0.000 0.230 003106 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 18 23 41 0.490 0.000 0.218 003186 AA 17 22 39 AC 5 0 5 CC 0 0 0 0.362 0.000 0.160 003187 AA 0 0 0 AC 5 0 5 CC 17 22 39 0.362 0.000 0.160 003211 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 17 22 39 0.362 0.000 0.160 003385 AA 0 0 0 AC 6 0 6 CC 18 23 41 0.490 0.000 0.218 003442 GG 20 23 43 GT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 003451 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 18 23 41 0.490 0.000 0.218 003470 AA 18 23 41 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.490 0.000 0.218 003837 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 21 23 44 0.048 0.000 0.023 004512 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 18 39 0.012 0.000 0.006 004922 AA 18 23 41 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.124 0.000 0.055 004991 AA 14 16 30 AC 3 7 10 CC 0 0 0 0.159 0.741 0.816 005008 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 14 22 36 0.159 0.000 0.062 005195 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 18 20 38 0.055 0.000 0.026 005415 AA 0 0 0 AC 2 5 7 CC 21 17 38 0.048 0.362 0.320 005424 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 005536 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 005609 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 21 23 44 0.048 0.000 0.023 005832 -- 14 19 33 +- 7 0 7 ++ 1 0 1 0.011 0.000 0.654 005852 CC 15 16 31 CG 6 2 8 GG 1 1 2 0.153 3.698 1.967 006090 AA 18 18 36 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.007 006115 CC 15 18 33 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.263 0.000 0.121 006181 -- 19 18 37 +- 2 0 2 ++ 0 0 0 0.053 0.000 0.027 006427 CC 22 16 38 CT 2 7 9 TT 0 0 0 0.045 0.741 0.527 006586 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 006931 AA 0 0 0 AG 8 0 8 GG 16 23 39 0.960 0.000 0.407 007090 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 17 21 38 0.131 0.000 0.059 007098 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 16 21 37 0.247 0.000 0.108 007450 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 19 22 41 0.053 0.000 0.024 007499 CC 20 22 42 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 008143 AA 18 21 39 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.220 0.000 0.102 008147 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 008401 CC 22 18 40 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 008662 AA 22 19 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 008744 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 18 42 0.000 0.014 0.006 008873 AA 15 13 28 AG 8 7 15 GG 1 0 1 0.003 0.900 0.386 008947 AA 13 20 33 AG 8 1 9 GG 2 0 2 0.221 0.012 1.550 009091 CC 20 20 40 CT 0 0 0 TT 1 0 1 21.000 0.000 41.000 009591 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 20 43 0.011 0.000 0.006 009758 AA 0 0 0 AC 6 0 6 CC 18 23 41 0.490 0.000 0.218 009811 -- 0 0 0 +- 5 0 5 ++ 19 23 42 0.324 0.000 0.148 009971 CC 0 0 0 CT 6 0 6 TT 18 23 41 0.490 0.000 0.218 010025 AA 1 0 1 AG 0 0 0 GG 23 23 46 24.000 0.000 47.000 010059 CC 3 3 6 CT 10 14 24 TT 11 6 17 0.094 1.308 0.304 010192 AA 21 23 44 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.048 0.000 0.023 010196 CC 6 3 9 CT 12 14 26 TT 6 6 12 0.000 1.308 0.578 010233 AA 0 0 0 AG 6 0 6 GG 17 23 40 0.517 0.000 0.224 010411 AA 15 11 26 AG 9 9 18 GG 0 3 3 1.278 0.277 0.002 010734 -- 21 23 44 +- 2 0 2 ++ 0 0 0 0.048 0.000 0.023 011121 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 011413 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 011552 CC 20 17 37 CT 4 6 10 TT 0 0 0 0.198 0.517 0.666 011662 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011910 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 21 18 39 0.000 0.055 0.026 012552 CC 20 23 43 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 012706 AA 2 2 4 AT 11 13 24 TT 10 8 18 0.179 1.043 1.035 013323 CC 0 0 0 CT 0 2 2 TT 19 19 38 0.000 0.053 0.026 014679 AA 0 0 0 AG 4 6 10 GG 19 17 36 0.209 0.517 0.684 014784 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 014798 CC 16 23 39 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.383 0.000 0.160 015236 AA 3 8 11 AG 9 11 20 GG 11 4 15 0.277 0.004 0.705 015601 CC 4 4 8 CT 13 11 24 TT 7 8 15 0.243 0.004 0.093 015622 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 015647 CC 20 23 43 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.198 0.000 0.093 015669 CC 0 1 1 CT 4 9 13 TT 20 13 33 0.198 0.130 0.046 015679 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 015780 CC 13 9 22 CT 6 8 14 TT 0 1 1 0.668 0.209 0.501 016313 AA 7 7 14 AG 10 10 20 GG 4 4 8 0.016 0.016 0.032 016353 AA 16 20 36 AG 6 0 6 GG 0 0 0 0.548 0.000 0.249 016434 CC 2 1 3 CG 11 12 23 GG 10 8 18 0.179 1.714 1.472 016464 GG 2 1 3 GT 11 13 24 TT 10 7 17 0.179 2.545 2.011 016765 CC 19 13 32 CT 3 5 8 TT 0 3 3 0.118 3.099 4.334 016791 CC 18 12 30 CG 4 5 9 GG 0 3 3 0.220 2.783 3.052 017085 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 017298 GG 0 1 1 GT 5 8 13 TT 19 13 32 0.324 0.027 0.058 017511 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 15 21 36 0.149 0.000 0.062 017637 -- 19 21 40 +- 2 0 2 ++ 0 0 0 0.053 0.000 0.025 017708 CC 20 22 42 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 017803 AA 15 17 32 AT 5 5 10 TT 1 0 1 0.429 0.362 0.043 017806 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 20 21 41 0.012 0.000 0.006 017858 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 21 44 0.000 0.012 0.006 018122 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 018183 -- 1 0 1 +- 7 2 9 ++ 15 21 36 0.025 0.048 0.230 018212 AA 9 5 14 AG 6 12 18 GG 1 4 5 0.000 0.444 0.043 018375 AA 0 0 0 AC 0 1 1 CC 23 22 45 0.000 0.011 0.006 019312 AA 20 21 41 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.012 0.000 0.006 019424 CC 9 9 18 CG 8 10 18 GG 2 2 4 0.012 0.107 0.026 019452 AA 18 17 35 AG 2 2 4 GG 0 0 0 0.055 0.059 0.114 019551 AA 21 21 42 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.024 019685 AA 22 23 45 AC 2 0 2 CC 0 0 0 0.045 0.000 0.022 019825 AA 2 0 2 AG 10 4 14 GG 9 19 28 0.107 0.209 0.022 019853 AA 2 0 2 AG 14 5 19 GG 8 18 26 1.434 0.342 0.413 020095 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 020182 CC 10 6 16 CT 14 9 23 TT 0 8 8 4.069 1.028 0.003 020197 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 020248 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 020283 -- 2 0 2 +- 10 4 14 ++ 12 19 31 0.002 0.209 0.068 020507 AA 3 0 3 AC 14 5 19 CC 7 18 25 0.960 0.342 0.059 020996 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 021174 CC 22 23 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 021256 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 18 13 31 0.000 0.077 0.032 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000994: C 003030: C 005832: TGTA 006181: T 007090: TGTC 009811: TTAT 010734: C 017637: AAAT 018183: CCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCTCTACAAACAATACAAGCAATAGCCGGTGTGGTGACATGCACCTGTGGTTTCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTGGAA 020283: CTCT