Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000100 -- 0 0 0 +- 0 1 1 ++ 24 22 46 0.000 0.011 0.005 000104 CC 0 0 0 CG 1 2 3 GG 22 21 43 0.011 0.048 0.052 000108 GG 0 0 0 GT 5 2 7 TT 19 21 40 0.324 0.048 0.304 000147 CC 0 0 0 CT 0 9 9 TT 24 13 37 0.000 1.455 0.541 000279 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 000385 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 001065 AA 21 21 42 AT 2 0 2 TT 1 0 1 4.959 0.000 10.228 001161 CC 22 21 43 CG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.023 001371 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 001438 CC 22 23 45 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.045 0.000 0.022 001509 AA 22 22 44 AC 0 1 1 CC 0 0 0 0.000 0.011 0.006 001511 CC 0 1 1 CT 6 8 14 TT 15 14 29 0.583 0.011 0.212 001724 AA 19 23 42 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.118 0.000 0.054 001792 -- 14 13 27 +- 6 8 14 ++ 1 1 2 0.114 0.027 0.011 001852 -- 0 1 1 +- 1 8 9 ++ 14 13 27 0.018 0.027 0.056 002099 AA 7 2 9 AG 8 16 24 GG 9 5 14 2.593 3.969 0.051 002284 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 19 41 0.011 0.000 0.006 002385 CC 0 0 0 CT 0 3 3 TT 23 17 40 0.000 0.131 0.056 002400 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 20 41 0.048 0.000 0.024 002417 GG 0 0 0 GT 0 9 9 TT 23 11 34 0.000 1.686 0.587 002566 -- 21 20 41 +- 2 0 2 ++ 0 0 0 0.048 0.000 0.024 002960 CC 0 1 1 CG 6 8 14 GG 16 14 30 0.548 0.011 0.185 003158 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 003381 AA 8 2 10 AG 12 15 27 GG 4 6 10 0.020 2.738 1.043 003449 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 003517 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 17 22 39 0.233 0.000 0.102 003566 AA 0 0 0 AG 1 6 7 GG 20 16 36 0.012 0.548 0.338 003785 CC 20 21 41 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 008710 AA 1 1 2 AG 5 8 13 GG 18 14 32 0.644 0.011 0.208 032139 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 23 44 0.012 0.000 0.006 032314 CC 15 18 33 CT 6 5 11 TT 1 0 1 0.153 0.342 0.005 032445 CC 7 0 7 CT 9 5 14 TT 6 18 24 0.714 0.342 3.383 032549 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 033490 CC 0 0 0 CG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 033707 AA 7 17 24 AG 10 6 16 GG 7 0 7 0.667 0.517 2.206 034234 CC 1 0 1 CT 7 4 11 TT 15 18 33 0.025 0.220 0.005 034255 AA 21 22 43 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.048 0.000 0.023 034334 -- 15 18 33 +- 3 0 3 ++ 0 0 0 0.149 0.000 0.068 034340 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 034357 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 034607 CC 0 0 0 CG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 035174 CC 16 18 34 CT 7 5 12 TT 1 0 1 0.044 0.342 0.002 035260 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 035555 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 035594 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 035862 AA 8 18 26 AG 12 5 17 GG 4 0 4 0.020 0.342 0.255 036423 GG 0 0 0 GT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 036929 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 036941 AA 22 23 45 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.045 0.000 0.022 037470 CC 20 23 43 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.112 0.000 0.052 037908 AA 1 0 1 AG 7 5 12 GG 14 18 32 0.011 0.342 0.010 037960 CC 15 23 38 CT 6 0 6 TT 1 0 1 0.153 0.000 1.407 038235 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 18 21 39 0.014 0.000 0.006 042540 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 042606 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 20 23 43 0.198 0.000 0.093 042642 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 042669 CC 1 0 1 CT 7 0 7 TT 16 23 39 0.044 0.000 0.919 043046 AA 0 0 0 AG 4 0 4 GG 20 23 43 0.198 0.000 0.093 043347 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 043402 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 18 16 34 0.124 0.000 0.066 043431 -- 7 10 17 +- 10 13 23 ++ 7 0 7 0.667 3.569 0.030 043884 AA 15 18 33 AG 7 5 12 GG 1 0 1 0.025 0.342 0.006 043922 AA 12 18 30 AG 9 5 14 GG 2 0 2 0.028 0.342 0.050 044010 CC 0 0 0 CG 4 0 4 GG 19 23 42 0.209 0.000 0.095 044080 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 23 45 0.011 0.000 0.006 044326 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.048 0.000 0.023 048102 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 048103 -- 22 22 44 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.006 048364 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 048532 CC 7 18 25 CT 10 5 15 TT 7 0 7 0.667 0.342 2.984 048550 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 048637 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 21 44 0.000 0.048 0.023 049207 GG 12 23 35 GT 7 0 7 TT 4 0 4 2.175 0.000 9.004 049971 CC 1 11 12 CG 14 10 24 GG 8 2 10 2.685 0.017 0.095 050097 AA 4 2 6 AG 12 10 22 GG 7 11 18 0.087 0.017 0.032 060100 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 060125 -- 0 0 0 +- 3 4 7 ++ 20 18 38 0.112 0.220 0.320 060312 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 060410 AA 2 0 2 AG 8 0 8 GG 14 23 37 0.296 0.000 2.613 060418 AA 21 19 40 AG 3 4 7 GG 0 0 0 0.107 0.209 0.304 060494 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 060505 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 060537 CC 20 19 39 CT 3 4 7 TT 0 0 0 0.112 0.209 0.312 060564 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 23 45 0.011 0.000 0.006 060646 GG 22 22 44 GT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.011 0.023 060975 GG 14 22 36 GT 7 0 7 TT 2 0 2 0.616 0.000 3.404 061015 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 061053 CC 2 9 11 CT 7 9 16 TT 14 4 18 0.616 0.414 3.311 061276 GG 23 15 38 GT 1 8 9 TT 0 0 0 0.011 1.019 0.527 061681 -- 0 0 0 +- 2 0 2 ++ 22 23 45 0.045 0.000 0.022 061801 AA 1 1 2 AC 13 3 16 CC 10 19 29 1.630 2.457 0.012 061834 AA 0 0 0 AC 2 0 2 CC 22 23 45 0.045 0.000 0.022 061843 GG 0 0 0 GT 3 4 7 TT 21 19 40 0.107 0.209 0.304 061922 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 062109 AA 1 1 2 AG 13 3 16 GG 10 19 29 1.630 2.457 0.012 062252 CC 21 19 40 CG 3 4 7 GG 0 0 0 0.107 0.209 0.304 062265 AA 0 0 0 AG 3 3 6 GG 21 20 41 0.107 0.112 0.218 062360 AA 8 1 9 AG 14 3 17 GG 2 19 21 1.434 2.457 2.404 062427 -- 23 23 46 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.005 062546 CC 0 0 0 CT 3 4 7 TT 21 19 40 0.107 0.209 0.304 062738 AA 21 23 44 AC 3 0 3 CC 0 0 0 0.107 0.000 0.051 062812 CC 14 23 37 CT 8 0 8 TT 2 0 2 0.296 0.000 2.613 062836 CC 15 23 38 CT 7 0 7 TT 2 0 2 0.730 0.000 3.666 063044 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 063119 -- 0 0 0 +- 3 4 7 ++ 21 19 40 0.107 0.209 0.304 063188 GG 10 18 28 GT 11 4 15 TT 3 1 4 0.000 1.252 0.876 066443 CC 2 16 18 CT 10 4 14 TT 12 3 15 0.002 5.497 7.589 066462 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 066507 AA 2 16 18 AG 11 4 15 GG 11 3 14 0.107 5.497 5.992 066545 -- 2 0 2 +- 8 0 8 ++ 14 23 37 0.296 0.000 2.613 073623 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 074181 AA 23 23 46 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.005 074216 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 22 45 0.011 0.000 0.006 074244 -- 24 22 46 +- 0 1 1 ++ 0 0 0 0.000 0.011 0.005 075462 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 22 45 0.011 0.000 0.006 075740 CC 7 3 10 CG 11 6 17 GG 6 8 14 0.160 0.878 1.086 076279 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 21 23 44 0.012 0.000 0.006 076588 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 076679 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 076690 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 076879 GG 0 1 1 GT 4 7 11 TT 18 9 27 0.220 0.057 0.009 077071 GG 20 20 40 GT 2 3 5 TT 0 0 0 0.050 0.112 0.156 077283 AA 12 22 34 AG 4 0 4 GG 5 0 5 6.857 0.000 18.659 077379 -- 0 0 0 +- 9 0 9 ++ 13 20 33 1.455 0.000 0.605 077659 AA 13 23 36 AT 7 0 7 TT 3 0 3 1.431 0.000 6.398 104484 AA 13 23 36 AC 6 0 6 CC 5 0 5 4.594 0.000 14.118 104576 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 23 23 46 0.011 0.000 0.005 104631 CC 16 8 24 CT 6 12 18 TT 2 3 5 1.407 0.209 0.335 104747 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 23 21 44 0.011 0.012 0.023 104752 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 22 45 0.011 0.000 0.006 104867 CC 4 18 22 CG 12 4 16 GG 8 1 9 0.020 1.252 3.245 104900 -- 4 17 21 +- 12 4 16 ++ 8 2 10 0.020 3.584 3.677 104978 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 104983 AA 12 17 29 AG 12 4 16 GG 0 2 2 2.667 3.584 0.012 105046 CC 12 17 29 CT 12 4 16 TT 0 2 2 2.667 3.584 0.012 105054 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 105073 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 105345 AA 5 0 5 AG 6 0 6 GG 13 23 36 4.594 0.000 14.118 105503 CC 5 0 5 CT 6 0 6 TT 13 23 36 4.594 0.000 14.118 105823 -- 23 23 46 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.011 0.000 0.005 106190 AA 4 17 21 AG 12 4 16 GG 8 2 10 0.020 3.584 3.677 106721 AA 22 22 44 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.011 0.000 0.006 106969 CC 8 2 10 CT 12 4 16 TT 4 17 21 0.020 3.584 3.677 107370 GG 14 6 20 GT 8 12 20 TT 2 5 7 0.296 0.048 0.289 107602 CC 0 2 2 CT 12 4 16 TT 12 17 29 2.667 3.584 0.012 107623 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 108102 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 108218 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 108245 CC 16 23 39 CT 5 0 5 TT 3 0 3 4.041 0.000 11.065 112335 GG 1 0 1 GT 1 0 1 TT 22 21 43 9.967 0.000 19.316 112528 CC 23 21 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 112726 CC 23 21 44 CG 1 1 2 GG 0 0 0 0.011 0.012 0.023 112859 CC 23 21 44 CT 1 1 2 TT 0 0 0 0.011 0.012 0.023 112900 AA 3 7 10 AG 8 9 17 GG 8 5 13 0.172 0.383 0.843 113058 AA 12 7 19 AC 9 10 19 CC 3 6 9 0.389 0.381 1.102 113168 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 113457 CC 0 0 0 CG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 113644 GG 6 2 8 GT 5 4 9 TT 12 16 28 6.546 3.327 11.319 113747 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 22 44 0.011 0.000 0.006 113933 CC 21 22 43 CT 2 1 3 TT 0 0 0 0.048 0.011 0.052 113945 AA 23 20 43 AC 0 3 3 CC 0 0 0 0.000 0.112 0.052 114378 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 114391 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 114691 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 114949 AA 23 20 43 AG 1 3 4 GG 0 0 0 0.011 0.112 0.093 114995 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 23 22 45 0.011 0.011 0.022 115400 AA 10 17 27 AG 8 5 13 GG 6 1 7 2.371 0.571 4.949 115533 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 22 46 0.000 0.011 0.005 115539 CC 21 12 33 CT 3 10 13 TT 0 1 1 0.107 0.374 0.046 116165 -- 2 6 8 +- 8 10 18 ++ 14 7 21 0.296 0.381 1.368 116249 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 116402 AA 23 22 45 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 116459 CC 20 23 43 CG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 116992 CC 22 16 38 CT 0 4 4 TT 0 0 0 0.000 0.247 0.105 117185 -- 0 1 1 +- 3 12 15 ++ 19 7 26 0.118 2.031 0.474 117238 CC 21 20 41 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 117418 AA 20 20 40 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.025 117517 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 20 20 40 0.050 0.000 0.025 128078 CC 0 0 0 CT 1 1 2 TT 23 22 45 0.011 0.011 0.022 128402 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 128439 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 128511 CC 0 0 0 CT 11 0 11 TT 13 23 36 2.121 0.000 0.826 128772 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 22 20 42 0.011 0.000 0.006 128801 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 18 20 38 0.342 0.000 0.164 128977 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 129209 CC 0 0 0 CG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 129371 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 129440 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 18 20 38 0.014 0.000 0.007 129464 AA 18 20 38 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.014 0.000 0.007 134269 AA 0 0 0 AG 1 1 2 GG 21 22 43 0.012 0.011 0.023 134283 AA 4 0 4 AG 9 4 13 GG 9 19 28 0.414 0.209 1.668 134439 CC 19 23 42 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.054 134667 GG 11 23 34 GT 8 0 8 TT 0 0 0 1.351 0.000 0.465 135040 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 135374 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 144562 CC 23 21 44 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 144589 GG 21 19 40 GT 2 2 4 TT 1 0 1 4.959 0.053 3.673 144717 CC 0 0 0 CT 5 0 5 TT 19 21 40 0.324 0.000 0.156 144748 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 21 44 0.011 0.000 0.006 144753 CC 24 19 43 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.053 0.023 144755 CC 23 22 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 145164 CC 0 0 0 CT 1 3 4 TT 21 20 41 0.012 0.112 0.097 145316 CC 21 23 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 145591 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 146198 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 146236 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 146395 CC 9 20 29 CG 11 3 14 GG 4 0 4 0.042 0.112 1.345 146407 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 22 23 45 0.045 0.000 0.022 146460 AA 4 0 4 AG 11 3 14 GG 9 20 29 0.042 0.112 1.345 146486 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 146492 CC 9 20 29 CT 11 3 14 TT 4 0 4 0.042 0.112 1.345 146588 CC 22 22 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 146619 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 22 22 44 0.011 0.000 0.006 146726 AA 8 18 26 AC 12 4 16 CC 3 0 3 0.209 0.220 0.063 146733 -- 0 0 0 +- 0 2 2 ++ 22 19 41 0.000 0.053 0.024 146897 AA 12 20 32 AG 9 3 12 GG 2 0 2 0.028 0.112 0.390 147062 CC 21 21 42 CT 1 2 3 TT 0 0 0 0.012 0.048 0.054 147094 GG 12 20 32 GT 9 3 12 TT 2 0 2 0.028 0.112 0.390 147151 AA 1 0 1 AG 2 3 5 GG 20 20 40 4.707 0.112 2.368 147160 CC 4 0 4 CT 11 5 16 TT 8 18 26 0.004 0.342 0.442 147198 CC 23 18 41 CT 0 5 5 TT 0 0 0 0.000 0.342 0.152 147624 -- 21 19 40 +- 1 0 1 ++ 0 0 0 0.012 0.000 0.006 147770 AA 20 21 41 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 147797 AA 2 0 2 AG 10 2 12 GG 10 18 28 0.050 0.055 0.227 148117 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 148199 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 24 22 46 0.000 0.011 0.005 148343 CC 19 10 29 CG 3 10 13 GG 0 3 3 0.118 0.040 0.792 148367 AA 19 23 42 AC 1 0 1 CC 0 0 0 0.013 0.000 0.006 148465 -- 20 23 43 +- 4 0 4 ++ 0 0 0 0.198 0.000 0.093 148476 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 148598 AA 21 20 41 AC 2 3 5 CC 1 0 1 4.959 0.112 2.448 148609 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 21 23 44 0.107 0.000 0.051 149110 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 20 23 43 0.050 0.000 0.023 149617 AA 1 0 1 AC 2 0 2 CC 20 23 43 4.707 0.000 10.478 149951 AA 3 0 3 AC 12 3 15 CC 9 20 29 0.107 0.112 0.303 149952 CC 0 3 3 CG 3 10 13 GG 21 10 31 0.107 0.040 0.954 162909 AA 6 10 16 AG 11 12 23 GG 4 1 5 0.069 1.239 0.583 162943 * 162974 CC 4 1 5 CT 11 12 23 TT 6 10 16 0.069 1.239 0.583 162975 GG 6 10 16 GT 11 12 23 TT 4 1 5 0.069 1.239 0.583 163064 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 21 22 43 0.000 0.011 0.006 163114 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 23 43 0.012 0.000 0.006 163375 CC 0 1 1 CT 4 12 16 TT 17 10 27 0.233 1.239 0.607 163654 AA 16 23 39 AC 7 0 7 CC 1 0 1 0.044 0.000 0.919 164094 CC 0 0 0 CT 7 0 7 TT 17 23 40 0.700 0.000 0.304 164176 CC 2 0 2 CT 8 0 8 TT 14 23 37 0.296 0.000 2.613 171676 AA 15 18 33 AC 8 4 12 CC 0 0 0 1.019 0.220 1.065 171728 GG 22 22 44 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 172005 GG 21 22 43 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 172157 AA 0 0 0 AG 1 5 6 GG 18 17 35 0.014 0.362 0.256 172161 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 19 21 40 0.000 0.012 0.006 172465 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 22 44 0.045 0.000 0.023 172533 AA 16 22 38 AG 7 0 7 GG 1 0 1 0.044 0.000 0.875 172555 CC 19 15 34 CT 5 8 13 TT 0 0 0 0.324 1.019 1.211 172668 CC 0 0 0 CT 8 4 12 TT 16 18 34 0.960 0.220 1.035 172677 CC 16 23 39 CT 7 0 7 TT 1 0 1 0.044 0.000 0.919 172730 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 173020 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 173238 CC 1 0 1 CT 6 0 6 TT 16 21 37 0.195 0.000 1.348 173239 AA 1 0 1 AG 6 0 6 GG 16 21 37 0.195 0.000 1.348 173246 AA 22 21 43 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 173274 AA 17 21 38 AC 6 0 6 CC 0 0 0 0.517 0.000 0.236 173294 CC 1 0 1 CT 6 0 6 TT 16 21 37 0.195 0.000 1.348 173502 CC 16 20 36 CT 6 0 6 TT 1 0 1 0.195 0.000 1.288 173609 -- 1 0 1 +- 6 0 6 ++ 16 21 37 0.195 0.000 1.348 173610 AA 16 21 37 AC 6 0 6 CC 1 0 1 0.195 0.000 1.348 173687 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 21 43 0.011 0.000 0.006 173758 CC 0 0 0 CT 6 4 10 TT 16 17 33 0.548 0.233 0.744 190232 AA 14 15 29 AG 7 7 14 GG 0 0 0 0.840 0.787 1.626 190248 AA 9 12 21 AG 11 10 21 GG 1 0 1 1.068 1.903 2.610 190276 CC 0 0 0 CG 5 7 12 GG 14 15 29 0.436 0.787 1.205 190280 CC 16 15 31 CT 5 7 12 TT 0 0 0 0.383 0.787 1.131 190309 CC 2 0 2 CG 3 0 3 GG 16 22 38 4.954 0.000 12.237 190441 AA 17 15 32 AG 5 7 12 GG 0 0 0 0.362 0.787 1.097 190592 AA 20 22 42 AG 2 0 2 GG 0 0 0 0.050 0.000 0.024 190596 CC 19 22 41 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.055 191115 AA 8 1 9 AG 7 8 15 GG 2 13 15 0.060 0.027 1.755 191146 CC 15 10 25 CT 3 10 13 TT 0 0 0 0.149 2.222 1.618 191340 CC 18 21 39 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.014 0.000 0.006 201974 AA 15 1 16 AG 7 9 16 GG 1 13 14 0.025 0.130 4.224 202061 AA 20 23 43 AT 1 0 1 TT 0 0 0 0.012 0.000 0.006 202103 AA 17 19 36 AG 6 4 10 GG 0 0 0 0.517 0.209 0.684 202789 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 202840 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 203218 AA 0 0 0 AC 4 0 4 CC 20 23 43 0.198 0.000 0.093 203247 AA 20 23 43 AG 4 0 4 GG 0 0 0 0.198 0.000 0.093 203475 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 203987 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 203996 CC 23 23 46 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 204091 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 204502 -- 0 0 0 +- 1 0 1 ++ 22 23 45 0.011 0.000 0.006 204654 GG 1 0 1 GT 2 0 2 TT 21 23 44 4.959 0.000 10.729 204828 CC 10 23 33 CT 9 0 9 TT 5 0 5 1.119 0.000 7.759 205094 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 22 23 45 0.011 0.000 0.006 205452 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 205912 AA 0 0 0 AG 2 3 5 GG 19 20 39 0.053 0.112 0.160 205914 AA 13 1 14 AG 7 9 16 GG 1 13 14 0.002 0.130 3.273 206240 AA 1 13 14 AG 7 9 16 GG 14 1 15 0.011 0.130 3.746 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000100: c 001792: C 001852: GGAG 002566: ATAG 034334: T 043431: CTTTTTATCATT 048103: TTAGCAA 048550: C 060125: aaagtatgac 061681: cacagttctggcagccagaa 062427: A 063119: AT 066545: AA 074216: at 074244: t 076279: A 077379: TAAAT 104576: act 104900: T 105823: A 116165: A 117185: t 146733: t 147624: ta 148465: G 173609: a 173687: aa 204502: A Tri-allelic sites: Site Genotype AD-pop ED-pop Total-pop 162943 AA 0 0 0 162943 AC 2 0 2 162943 AT 3 0 3 162943 CC 2 1 3 162943 CT 8 12 20 162943 TT 6 10 16