Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000099 C 0.00 0.12 0.04 T 1.00 0.88 0.96 0.00 0.22 0.07 000111 A 0.50 0.38 0.46 C 0.50 0.62 0.54 0.50 0.47 0.50 001033 T 0.06 0.33 0.19 C 0.94 0.67 0.81 0.12 0.44 0.31 001247 C 0.38 0.48 0.43 G 0.62 0.52 0.57 0.47 0.50 0.49 001400 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 001458 T 0.33 0.18 0.27 C 0.67 0.82 0.73 0.44 0.30 0.39 002190 T 0.35 0.52 0.43 C 0.65 0.48 0.57 0.45 0.50 0.49 002248 A 0.20 0.00 0.10 G 0.80 1.00 0.90 0.33 0.00 0.18 002918 C 0.19 0.13 0.16 G 0.81 0.87 0.84 0.30 0.23 0.27 005252 G 0.25 0.17 0.21 A 0.75 0.83 0.79 0.38 0.28 0.33 005561 C 0.00 0.15 0.09 T 1.00 0.85 0.91 0.00 0.26 0.16 006092 A 0.10 0.10 0.10 G 0.90 0.90 0.90 0.17 0.18 0.18 006152 T 0.07 0.00 0.04 C 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 006450 T 0.00 0.04 0.02 A 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 006456 T 0.20 0.05 0.12 C 0.80 0.95 0.88 0.31 0.09 0.21 006790 - 0.15 0.29 0.22 + 0.85 0.71 0.78 0.26 0.41 0.34 006845 G 0.46 0.33 0.40 T 0.54 0.67 0.60 0.50 0.44 0.48 007021 T 0.29 0.24 0.27 G 0.71 0.76 0.73 0.41 0.36 0.39 007086 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 009244 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009314 C 0.46 0.37 0.41 T 0.54 0.63 0.59 0.50 0.47 0.49 009482 T 0.26 0.64 0.44 A 0.74 0.36 0.56 0.39 0.46 0.49 009554 C 0.02 0.12 0.07 T 0.98 0.88 0.93 0.04 0.21 0.13 009632 T 0.31 0.18 0.25 G 0.69 0.82 0.75 0.43 0.30 0.38 009696 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 009779 C 0.28 0.05 0.17 A 0.72 0.95 0.83 0.41 0.09 0.28 009800 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 010060 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010127 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 010164 C 0.26 0.59 0.42 T 0.74 0.41 0.58 0.39 0.48 0.49 015028 G 0.07 0.11 0.09 A 0.93 0.89 0.91 0.14 0.19 0.16 015392 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 015691 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 015966 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 016703 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 016753 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 021225 G 0.17 0.05 0.11 C 0.83 0.95 0.89 0.29 0.09 0.20 021540 + 0.33 0.13 0.23 - 0.67 0.87 0.77 0.44 0.23 0.35 022061 G 0.35 0.46 0.40 A 0.65 0.54 0.60 0.46 0.50 0.48 022850 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 022911 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023078 A 0.17 0.27 0.22 C 0.83 0.73 0.78 0.28 0.40 0.34 023109 T 0.12 0.09 0.11 A 0.88 0.91 0.89 0.22 0.17 0.19 026741 G 0.14 0.28 0.21 A 0.86 0.72 0.79 0.24 0.41 0.33 026805 A 0.02 0.07 0.04 G 0.98 0.93 0.96 0.04 0.12 0.08 026937 C 0.08 0.00 0.04 T 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 027043 G 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 027064 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 027138 C 0.07 0.00 0.04 T 0.93 1.00 0.96 0.14 0.00 0.08 027419 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 027615 T 0.17 0.00 0.09 G 0.83 1.00 0.91 0.29 0.00 0.16 028379 + 0.08 0.00 0.04 - 0.92 1.00 0.96 0.15 0.00 0.08 028389 A 0.09 0.11 0.10 G 0.91 0.89 0.90 0.16 0.19 0.18 028520 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 028823 - 0.19 0.15 0.17 + 0.81 0.85 0.83 0.31 0.26 0.28 031888 A 0.19 0.33 0.26 G 0.81 0.67 0.74 0.30 0.44 0.38 031961 + 0.28 0.15 0.22 - 0.72 0.85 0.78 0.41 0.26 0.34 032047 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 032181 C 0.14 0.09 0.11 T 0.86 0.91 0.89 0.24 0.16 0.20 033241 T 0.33 0.59 0.46 C 0.67 0.41 0.54 0.44 0.48 0.50 038873 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039267 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 039426 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 039440 A 0.00 0.05 0.02 G 1.00 0.95 0.98 0.00 0.10 0.04 039534 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 039792 T 0.22 0.45 0.35 G 0.78 0.55 0.65 0.35 0.50 0.45 040059 + 0.17 0.09 0.12 - 0.83 0.91 0.88 0.28 0.16 0.22 040319 A 0.03 0.00 0.01 G 0.97 1.00 0.99 0.06 0.00 0.03 040528 A 0.35 0.15 0.24 C 0.65 0.85 0.76 0.46 0.26 0.37 041928 C 0.04 0.02 0.03 G 0.96 0.98 0.97 0.08 0.05 0.07 042046 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 042144 A 0.05 0.05 0.05 T 0.95 0.95 0.95 0.09 0.09 0.09 042389 A 0.07 0.04 0.05 G 0.93 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 042480 C 0.20 0.04 0.12 T 0.80 0.96 0.88 0.31 0.08 0.21 042850 T 0.42 0.35 0.38 C 0.58 0.65 0.62 0.49 0.45 0.47 043123 G 0.00 0.11 0.05 A 1.00 0.89 0.95 0.00 0.19 0.09 043536 - 0.03 0.00 0.01 + 0.97 1.00 0.99 0.05 0.00 0.03 053984 T 0.39 0.45 0.42 G 0.61 0.55 0.58 0.47 0.50 0.49 054005 G 0.05 0.00 0.02 T 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 054021 + 0.11 0.32 0.22 - 0.89 0.68 0.78 0.20 0.43 0.34 054058 G 0.39 0.45 0.42 A 0.61 0.55 0.58 0.48 0.50 0.49 054220 T 0.43 0.39 0.41 C 0.57 0.61 0.59 0.49 0.47 0.48 054231 T 0.28 0.38 0.33 C 0.72 0.62 0.67 0.40 0.47 0.44 054332 C 0.37 0.42 0.39 T 0.63 0.58 0.61 0.47 0.49 0.48 054402 T 0.17 0.34 0.26 G 0.82 0.66 0.74 0.29 0.45 0.38 054479 C 0.47 0.45 0.46 G 0.53 0.55 0.54 0.50 0.49 0.50 054498 T 0.07 0.05 0.06 C 0.93 0.95 0.94 0.14 0.10 0.12 054832 G 0.19 0.15 0.17 A 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 054859 C 0.19 0.15 0.17 T 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 054958 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 054984 T 0.19 0.15 0.17 C 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 055159 G 0.19 0.15 0.17 T 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 055289 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 055317 A 0.12 0.32 0.22 G 0.88 0.68 0.78 0.22 0.43 0.34 055352 C 0.17 0.16 0.16 T 0.83 0.84 0.84 0.28 0.27 0.27 055427 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 055743 T 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.05 055753 T 0.14 0.12 0.13 C 0.86 0.88 0.87 0.24 0.22 0.23 055756 + 0.20 0.16 0.18 - 0.80 0.84 0.82 0.31 0.27 0.29 055883 A 0.42 0.41 0.41 C 0.58 0.59 0.59 0.49 0.48 0.49 056153 - 0.00 0.13 0.06 + 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 056191 C 0.21 0.39 0.30 T 0.79 0.61 0.70 0.33 0.48 0.42 056311 C 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 056447 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 056522 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 056585 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 056920 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 056993 A 0.19 0.15 0.17 G 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 057035 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 057050 T 0.33 0.39 0.36 C 0.67 0.61 0.64 0.44 0.48 0.46 057106 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 057107 A 0.19 0.15 0.17 G 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 057114 G 0.06 0.04 0.05 A 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 057137 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 057156 C 0.19 0.15 0.17 T 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 057351 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 057361 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 057389 T 0.19 0.15 0.17 C 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 057410 A 0.00 0.20 0.10 G 1.00 0.80 0.90 0.00 0.31 0.17 057412 G 0.19 0.15 0.17 T 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 057444 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 057683 + 0.00 0.02 0.01 - 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 057701 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 057752 T 0.06 0.05 0.05 C 0.94 0.95 0.95 0.12 0.09 0.10 058142 G 0.18 0.14 0.16 A 0.82 0.86 0.84 0.30 0.24 0.27 058188 G 0.16 0.14 0.15 T 0.84 0.86 0.85 0.27 0.24 0.26 058437 T 0.04 0.05 0.05 C 0.96 0.95 0.95 0.08 0.09 0.09 058472 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 058590 G 0.19 0.16 0.17 A 0.81 0.84 0.83 0.30 0.27 0.29 058821 T 0.17 0.28 0.22 G 0.83 0.72 0.78 0.29 0.40 0.34 058824 T 0.15 0.03 0.10 C 0.85 0.97 0.90 0.26 0.05 0.18 059160 T 0.25 0.14 0.20 C 0.75 0.86 0.80 0.38 0.24 0.32 059185 A 0.17 0.03 0.10 G 0.83 0.97 0.90 0.28 0.06 0.18 059189 T 0.33 0.34 0.33 C 0.68 0.66 0.67 0.44 0.45 0.44 059317 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 059349 C 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 059403 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 059486 T 0.19 0.15 0.17 G 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 059497 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 059514 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 059562 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 059575 A 0.17 0.20 0.18 G 0.83 0.80 0.82 0.28 0.31 0.30 059837 T 0.23 0.20 0.21 A 0.77 0.80 0.79 0.35 0.31 0.33 059875 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060265 G 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 060266 A 0.02 0.02 0.02 G 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 060433 C 0.30 0.32 0.31 G 0.70 0.68 0.69 0.42 0.43 0.43 060528 T 0.06 0.04 0.05 C 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 060638 G 0.17 0.15 0.16 A 0.83 0.85 0.84 0.29 0.26 0.27 060705 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060870 A 0.19 0.15 0.17 G 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 060879 T 0.19 0.15 0.17 C 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 060949 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 060978 T 0.12 0.30 0.21 C 0.88 0.70 0.79 0.22 0.42 0.33 061017 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 061057 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 061123 A 0.19 0.15 0.17 G 0.81 0.85 0.83 0.30 0.26 0.28 061687 A 0.19 0.35 0.26 G 0.81 0.65 0.74 0.30 0.45 0.39 061857 A 0.23 0.12 0.18 G 0.77 0.88 0.82 0.35 0.21 0.29 061912 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 061914 T 0.50 0.46 0.49 C 0.50 0.54 0.51 0.50 0.50 0.50 062112 G 0.12 0.22 0.17 T 0.88 0.78 0.83 0.22 0.34 0.28 062144 - 0.26 0.12 0.20 + 0.74 0.88 0.80 0.39 0.22 0.32 062150 T 0.22 0.05 0.14 C 0.78 0.95 0.86 0.34 0.09 0.24 062297 A 0.25 0.28 0.27 G 0.75 0.72 0.73 0.38 0.41 0.39 062324 G 0.21 0.09 0.15 A 0.79 0.91 0.85 0.33 0.16 0.25 062407 T 0.50 0.35 0.43 C 0.50 0.65 0.57 0.50 0.45 0.49 062409 C 0.50 0.35 0.43 G 0.50 0.65 0.57 0.50 0.45 0.49 062410 A 0.21 0.09 0.15 C 0.79 0.91 0.85 0.33 0.16 0.25 062615 + 0.02 0.00 0.02 - 0.98 1.00 0.98 0.04 0.00 0.03 062855 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 062882 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 062946 T 0.25 0.11 0.18 C 0.75 0.89 0.82 0.38 0.20 0.30 063092 C 0.22 0.11 0.16 T 0.78 0.89 0.84 0.34 0.19 0.27 063127 T 0.04 0.05 0.04 C 0.96 0.95 0.96 0.08 0.09 0.08 063181 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 063191 C 0.15 0.00 0.07 T 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 063274 A 0.50 0.39 0.45 G 0.50 0.61 0.55 0.50 0.48 0.49 063459 + 0.05 0.00 0.02 - 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 063606 A 0.04 0.11 0.08 G 0.96 0.89 0.92 0.08 0.19 0.14 063682 C 0.24 0.11 0.17 T 0.76 0.89 0.83 0.36 0.19 0.29 063756 G 0.16 0.11 0.14 C 0.84 0.89 0.86 0.27 0.20 0.24 063938 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 063966 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 064448 T 0.25 0.32 0.28 C 0.75 0.68 0.72 0.38 0.43 0.40 064640 A 0.25 0.33 0.28 G 0.75 0.68 0.72 0.38 0.44 0.41 064693 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 064696 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 064771 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 065203 G 0.25 0.28 0.27 T 0.75 0.72 0.73 0.38 0.41 0.39 065335 C 0.23 0.33 0.27 T 0.77 0.67 0.73 0.35 0.44 0.40 065446 G 0.26 0.07 0.17 C 0.74 0.93 0.83 0.39 0.14 0.29 065565 C 0.50 0.40 0.46 T 0.50 0.60 0.54 0.50 0.48 0.50 065730 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 065777 C 0.21 0.10 0.16 G 0.79 0.90 0.84 0.33 0.17 0.26 065900 T 0.00 0.13 0.06 C 1.00 0.87 0.94 0.00 0.23 0.12 066062 T 0.15 0.00 0.08 G 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 066144 A 0.52 0.39 0.46 G 0.48 0.61 0.54 0.50 0.48 0.50 066151 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 066167 C 0.52 0.39 0.46 G 0.48 0.61 0.54 0.50 0.48 0.50 066740 T 0.17 0.17 0.17 A 0.83 0.83 0.83 0.28 0.29 0.28 066745 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 066947 A 0.50 0.41 0.46 G 0.50 0.59 0.54 0.50 0.48 0.50 067072 A 0.21 0.11 0.16 G 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 067163 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 067466 G 0.50 0.39 0.45 T 0.50 0.61 0.55 0.50 0.48 0.49 067517 C 0.21 0.11 0.16 T 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 067600 A 0.25 0.28 0.27 G 0.75 0.72 0.73 0.38 0.41 0.39 067690 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 067798 C 0.04 0.04 0.04 T 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 068222 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 068261 G 0.06 0.05 0.05 A 0.94 0.95 0.95 0.12 0.09 0.10 068315 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 068321 G 0.50 0.43 0.47 A 0.50 0.57 0.53 0.50 0.49 0.50 068456 C 0.21 0.12 0.17 T 0.79 0.88 0.83 0.33 0.22 0.28 068492 A 0.29 0.27 0.28 G 0.71 0.73 0.72 0.41 0.40 0.41 068516 T 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 068825 A 0.52 0.39 0.46 G 0.48 0.61 0.54 0.50 0.48 0.50 068955 G 0.21 0.11 0.16 A 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 069069 + 0.02 0.00 0.01 - 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 069455 T 0.45 0.38 0.42 G 0.55 0.62 0.58 0.50 0.47 0.49 069457 T 0.27 0.26 0.27 A 0.73 0.74 0.73 0.40 0.39 0.39 069766 C 0.18 0.12 0.15 G 0.82 0.88 0.85 0.30 0.21 0.26 069767 C 0.18 0.12 0.15 T 0.82 0.88 0.85 0.30 0.21 0.26 069912 G 0.50 0.39 0.44 A 0.50 0.61 0.56 0.50 0.48 0.49 070078 G 0.00 0.07 0.04 A 1.00 0.93 0.96 0.00 0.13 0.08 070293 A 0.22 0.11 0.17 G 0.78 0.89 0.83 0.34 0.20 0.28 070692 A 0.44 0.57 0.50 G 0.56 0.43 0.50 0.49 0.49 0.50 070817 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 071038 C 0.19 0.10 0.15 T 0.81 0.90 0.85 0.30 0.18 0.25 071182 A 0.17 0.14 0.16 T 0.83 0.86 0.84 0.28 0.24 0.26 071393 G 0.12 0.42 0.27 T 0.88 0.58 0.73 0.22 0.49 0.39 071503 C 0.03 0.03 0.03 G 0.97 0.97 0.97 0.05 0.05 0.05 071553 G 0.05 0.00 0.03 T 0.95 1.00 0.97 0.09 0.00 0.05 071689 G 0.52 0.35 0.44 A 0.48 0.65 0.56 0.50 0.45 0.49 072007 G 0.05 0.05 0.05 A 0.95 0.95 0.95 0.09 0.09 0.09 072271 C 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 072595 A 0.00 0.07 0.03 G 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.07 072645 G 0.22 0.11 0.17 A 0.78 0.89 0.83 0.34 0.19 0.28 072933 C 0.25 0.32 0.28 T 0.75 0.68 0.72 0.38 0.43 0.41 073085 T 0.13 0.19 0.16 C 0.87 0.81 0.84 0.23 0.31 0.27 073771 C 0.04 0.05 0.04 T 0.96 0.95 0.96 0.08 0.09 0.08 073780 G 0.21 0.10 0.16 T 0.79 0.90 0.84 0.33 0.18 0.27 074245 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 074554 T 0.06 0.04 0.05 C 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 074721 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 074995 G 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 075341 G 0.21 0.11 0.16 A 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 075966 T 0.15 0.11 0.13 A 0.85 0.89 0.87 0.25 0.19 0.22 076116 A 0.23 0.11 0.17 G 0.77 0.89 0.83 0.35 0.19 0.28 076182 T 0.22 0.09 0.16 G 0.78 0.91 0.84 0.34 0.17 0.26 076313 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 076377 - 0.00 0.02 0.01 + 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 076386 G 0.22 0.09 0.16 A 0.78 0.91 0.84 0.34 0.17 0.26 076441 - 0.16 0.11 0.14 + 0.84 0.89 0.86 0.27 0.20 0.24 076596 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 076599 + 0.00 0.07 0.03 - 1.00 0.93 0.97 0.00 0.13 0.06 076894 G 0.16 0.00 0.09 A 0.84 1.00 0.91 0.27 0.00 0.17 077014 G 0.43 0.34 0.39 A 0.57 0.66 0.61 0.49 0.45 0.48 077307 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 077516 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 077740 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 078143 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 078299 A 0.12 0.20 0.16 G 0.88 0.80 0.84 0.22 0.31 0.27 078745 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 079845 T 0.18 0.22 0.20 A 0.82 0.78 0.80 0.29 0.35 0.31 080157 A 0.03 0.00 0.02 C 0.97 1.00 0.98 0.06 0.00 0.03 080557 G 0.21 0.13 0.17 A 0.79 0.87 0.83 0.33 0.23 0.28 080559 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 080579 C 0.21 0.39 0.30 T 0.79 0.61 0.70 0.33 0.48 0.42 080580 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 080706 T 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 080839 G 0.02 0.03 0.02 A 0.98 0.97 0.98 0.04 0.05 0.05 081041 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 081241 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 081383 A 0.14 0.00 0.07 G 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.13 081397 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 082326 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 082451 G 0.22 0.11 0.16 A 0.78 0.89 0.84 0.34 0.19 0.27 082721 - 0.14 0.00 0.07 + 0.86 1.00 0.93 0.24 0.00 0.12 083004 - 0.23 0.11 0.17 + 0.77 0.89 0.83 0.35 0.19 0.28 083218 G 0.19 0.39 0.29 A 0.81 0.61 0.71 0.30 0.48 0.41 083253 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 083364 A 0.22 0.09 0.16 G 0.78 0.91 0.84 0.34 0.17 0.26 083416 C 0.21 0.09 0.15 T 0.79 0.91 0.85 0.33 0.17 0.26 083461 G 0.22 0.09 0.16 A 0.78 0.91 0.84 0.34 0.17 0.26 083475 C 0.15 0.09 0.12 G 0.85 0.91 0.88 0.26 0.17 0.21 083714 A 0.15 0.00 0.07 G 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 083801 + 0.15 0.11 0.13 - 0.85 0.89 0.87 0.25 0.20 0.23 083839 G 0.21 0.11 0.16 A 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 083860 A 0.10 0.17 0.14 G 0.90 0.83 0.86 0.19 0.29 0.24 083977 C 0.15 0.00 0.08 T 0.85 1.00 0.92 0.26 0.00 0.14 083986 G 0.02 0.20 0.11 A 0.98 0.80 0.89 0.04 0.31 0.19 084171 + 0.04 0.00 0.02 - 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 084227 T 0.07 0.02 0.05 C 0.93 0.98 0.95 0.12 0.05 0.09 084259 T 0.22 0.12 0.17 C 0.78 0.88 0.83 0.34 0.21 0.28 084524 G 0.00 0.03 0.01 A 1.00 0.97 0.99 0.00 0.06 0.03 084630 C 0.23 0.11 0.17 T 0.78 0.89 0.83 0.35 0.20 0.28 084747 A 0.12 0.24 0.17 T 0.88 0.76 0.82 0.21 0.36 0.29 084787 C 0.48 0.39 0.44 T 0.52 0.61 0.56 0.50 0.48 0.49 084796 C 0.21 0.11 0.16 T 0.79 0.89 0.84 0.34 0.19 0.27 085037 T 0.16 0.00 0.08 G 0.84 1.00 0.92 0.27 0.00 0.14 085447 C 0.22 0.14 0.18 A 0.78 0.86 0.82 0.34 0.24 0.30 085553 T 0.26 0.14 0.21 C 0.74 0.86 0.79 0.39 0.24 0.33 085627 C 0.22 0.14 0.18 T 0.78 0.86 0.82 0.34 0.24 0.30 085646 T 0.15 0.14 0.15 A 0.85 0.86 0.85 0.26 0.24 0.25 085675 T 0.22 0.12 0.17 C 0.78 0.88 0.83 0.34 0.22 0.29 085998 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 086003 A 0.24 0.30 0.27 T 0.76 0.70 0.73 0.36 0.42 0.39 086083 A 0.20 0.09 0.14 G 0.80 0.91 0.86 0.31 0.17 0.25 086576 T 0.15 0.11 0.13 C 0.85 0.89 0.87 0.25 0.19 0.22 086701 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 086745 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 086948 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 087158 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 087255 A 0.44 0.39 0.41 G 0.56 0.61 0.59 0.49 0.48 0.49 087513 C 0.19 0.12 0.16 G 0.81 0.88 0.84 0.30 0.21 0.26 087602 C 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 087713 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 087813 T 0.19 0.14 0.16 G 0.81 0.86 0.84 0.30 0.24 0.27 088025 A 0.07 0.00 0.03 G 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.07 088790 + 0.21 0.10 0.16 - 0.79 0.90 0.84 0.33 0.17 0.26 088889 C 0.11 0.00 0.06 T 0.89 1.00 0.94 0.20 0.00 0.11 089969 - 0.24 0.11 0.17 + 0.76 0.89 0.83 0.36 0.20 0.29 090029 - 0.02 0.00 0.01 + 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 090294 + 0.05 0.07 0.06 - 0.95 0.93 0.94 0.09 0.13 0.11 090319 A 0.27 0.27 0.27 G 0.73 0.73 0.73 0.39 0.40 0.40 090510 C 0.27 0.28 0.28 T 0.73 0.72 0.72 0.39 0.41 0.40 090777 T 0.04 0.04 0.04 C 0.96 0.96 0.96 0.08 0.08 0.08 090891 T 0.12 0.22 0.17 C 0.88 0.78 0.83 0.22 0.34 0.28 091169 C 0.41 0.26 0.34 T 0.59 0.74 0.66 0.48 0.39 0.45 091308 C 0.17 0.26 0.21 A 0.83 0.74 0.79 0.28 0.39 0.33 091533 G 0.02 0.02 0.02 T 0.98 0.98 0.98 0.04 0.04 0.04 091609 - 0.06 0.07 0.07 + 0.94 0.93 0.93 0.12 0.13 0.12 092280 A 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 092440 A 0.20 0.11 0.15 G 0.80 0.89 0.85 0.31 0.19 0.26 092463 G 0.20 0.11 0.15 A 0.80 0.89 0.85 0.31 0.19 0.26 092617 * 092638 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 092664 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 092679 A 0.11 0.14 0.12 C 0.89 0.86 0.88 0.19 0.24 0.21 093008 T 0.21 0.11 0.16 C 0.79 0.89 0.84 0.33 0.20 0.27 093200 A 0.19 0.11 0.15 G 0.81 0.89 0.85 0.30 0.19 0.25 093605 A 0.05 0.00 0.02 G 0.95 1.00 0.98 0.09 0.00 0.04 093901 A 0.21 0.11 0.16 G 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 093997 G 0.17 0.11 0.14 T 0.82 0.89 0.86 0.29 0.20 0.25 094262 A 0.05 0.14 0.09 T 0.95 0.86 0.91 0.10 0.24 0.17 094729 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 095376 A 0.29 0.26 0.28 G 0.71 0.74 0.72 0.41 0.39 0.40 095502 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 095517 T 0.10 0.17 0.14 C 0.90 0.83 0.86 0.19 0.29 0.24 095753 A 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 095754 T 0.06 0.04 0.05 C 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 095816 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 095933 - 0.29 0.28 0.29 + 0.71 0.72 0.71 0.41 0.40 0.41 096038 A 0.10 0.24 0.17 G 0.90 0.76 0.83 0.19 0.36 0.28 096101 A 0.50 0.37 0.44 G 0.50 0.63 0.56 0.50 0.47 0.49 096359 T 0.29 0.26 0.28 C 0.71 0.74 0.72 0.41 0.39 0.40 097707 - 0.15 0.12 0.14 + 0.85 0.88 0.86 0.26 0.22 0.24 097793 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 098006 T 0.10 0.15 0.13 A 0.90 0.85 0.87 0.19 0.26 0.22 098184 C 0.21 0.11 0.16 T 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 098204 C 0.21 0.11 0.16 G 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 098245 C 0.21 0.11 0.16 A 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 098247 G 0.15 0.00 0.07 C 0.85 1.00 0.93 0.25 0.00 0.14 098299 C 0.06 0.04 0.05 T 0.94 0.96 0.95 0.12 0.08 0.10 099016 C 0.20 0.09 0.14 T 0.80 0.91 0.86 0.32 0.17 0.23 099689 T 0.00 0.03 0.01 C 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 099738 C 0.19 0.11 0.15 T 0.81 0.89 0.85 0.30 0.19 0.26 099786 C 0.00 0.07 0.03 T 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 099831 T 0.21 0.11 0.16 A 0.79 0.89 0.84 0.33 0.19 0.27 099987 G 0.13 0.00 0.07 A 0.87 1.00 0.93 0.23 0.00 0.12 100008 T 0.22 0.11 0.16 C 0.78 0.89 0.84 0.34 0.19 0.27 100045 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 100148 T 0.12 0.00 0.06 C 0.88 1.00 0.94 0.22 0.00 0.11 100721 T 0.08 0.04 0.06 C 0.92 0.96 0.94 0.15 0.08 0.12 100801 G 0.42 0.37 0.39 C 0.58 0.63 0.61 0.49 0.47 0.48 100915 C 0.48 0.37 0.42 T 0.52 0.63 0.58 0.50 0.47 0.49 101070 A 0.07 0.05 0.06 G 0.93 0.95 0.94 0.13 0.10 0.11 101088 T 0.07 0.00 0.04 A 0.93 1.00 0.96 0.13 0.00 0.07 101325 G 0.18 0.12 0.15 A 0.82 0.88 0.85 0.30 0.22 0.26 101746 G 0.17 0.38 0.28 C 0.82 0.62 0.72 0.29 0.47 0.40 101843 G 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 102395 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 102889 C 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 103138 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 103314 T 0.22 0.11 0.16 C 0.78 0.89 0.84 0.34 0.19 0.27 103744 - 0.04 0.00 0.02 + 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 103973 C 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 103985 - 0.31 0.29 0.30 + 0.69 0.71 0.70 0.43 0.41 0.42 104194 G 0.04 0.00 0.02 A 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 104233 A 0.15 0.20 0.17 C 0.85 0.80 0.83 0.25 0.31 0.28 104271 + 0.17 0.11 0.14 - 0.83 0.89 0.86 0.28 0.20 0.24 104410 C 0.15 0.39 0.27 T 0.85 0.61 0.73 0.25 0.48 0.39 105140 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 105280 - 0.04 0.06 0.05 + 0.96 0.94 0.95 0.08 0.10 0.09 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 006790: AA 021540: TC 028379: A 028823: T 031961: AAAT 032047: A 038873: TAAAA 040059: ATAG 043536: AA 054021: A 055756: A 056153: AGTG 057683: C 062144: CCT 062615: C 063459: C 069069: T 076377: A 076441: T 076599: A 082721: T 083004: TT 083801: T 084171: A 088790: T 089969: AT 090029: CATAAT 090294: A 091609: TAAA 095933: T 097707: TG 103744: G 103985: AAC 104271: ATTT 105280: A Tri-allelic sites: Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop Allele3 AD-pop ED-pop Total-pop 092617 A 0.02 0.00 0.01 C 0.04 0.04 0.04 G 0.94 0.96 0.95