Site Genotype1 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype2 AD-pop ED-pop Total-pop Genotype3 AD-pop ED-pop Total-pop AD-chi2 ED-chi2 Total-chi2 000272 -- 0 6 6 +- 10 10 20 ++ 11 6 17 2.051 0.182 0.001 000853 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 22 41 0.324 0.000 0.152 001844 CC 6 6 12 CT 12 10 22 TT 4 5 9 0.220 0.043 0.034 001924 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 21 21 42 0.012 0.000 0.006 002155 CC 19 21 40 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.118 0.000 0.056 002263 AA 10 6 16 AG 12 10 22 GG 0 5 5 3.094 0.043 0.387 002480 CC 22 23 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 002590 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 20 39 0.324 0.000 0.160 002825 -- 0 7 7 +- 8 9 17 ++ 9 6 15 1.609 0.714 0.315 004192 CC 22 21 43 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 004323 AA 0 0 0 AT 1 0 1 TT 22 21 43 0.011 0.000 0.006 004383 GG 21 21 42 GT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.024 005705 -- 0 6 6 +- 11 10 21 ++ 12 6 18 2.272 0.182 0.001 006124 AA 0 0 0 AT 0 1 1 TT 24 21 45 0.000 0.012 0.006 006205 AA 1 0 1 AG 7 2 9 GG 16 21 37 0.044 0.048 0.253 006264 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 006355 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 24 21 45 0.000 0.048 0.022 006362 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 006385 AA 6 7 13 AG 12 11 23 GG 6 5 11 0.000 0.030 0.018 006549 CC 21 22 43 CT 2 0 2 TT 0 0 0 0.048 0.000 0.023 006791 AA 21 23 44 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.012 0.000 0.006 006798 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 21 23 44 0.012 0.000 0.006 007039 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 007389 CC 19 23 42 CT 4 0 4 TT 0 0 0 0.209 0.000 0.095 007542 AA 0 0 0 AG 2 0 2 GG 22 23 45 0.045 0.000 0.022 007816 CC 15 21 36 CT 5 2 7 TT 0 0 0 0.408 0.048 0.338 007874 -- 0 0 0 +- 3 0 3 ++ 20 23 43 0.112 0.000 0.052 008077 GG 0 0 0 GT 0 1 1 TT 18 18 36 0.000 0.014 0.007 008515 CC 22 23 45 CG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 008654 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.048 0.000 0.023 008843 CC 11 6 17 CT 6 8 14 TT 0 3 3 0.781 0.014 0.002 009316 CC 23 20 43 CT 0 3 3 TT 0 0 0 0.000 0.112 0.052 009858 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 20 19 39 0.000 0.013 0.006 010518 AA 2 3 5 AG 11 11 22 GG 11 8 19 0.107 0.065 0.135 011456 AA 21 23 44 AG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 011543 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 011555 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 011573 CC 2 8 10 CT 12 10 22 TT 10 5 15 0.375 0.306 0.133 011783 CC 0 0 0 CT 1 10 11 TT 23 13 36 0.011 1.775 0.826 011828 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 011997 CC 15 6 21 CT 9 11 20 TT 0 6 6 1.278 0.043 0.129 012208 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 012225 CC 24 22 46 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.005 012229 AA 2 3 5 AG 11 11 22 GG 11 7 18 0.107 0.159 0.201 012752 AA 0 0 0 AG 3 0 3 GG 21 23 44 0.107 0.000 0.051 012822 AA 0 0 0 AC 1 0 1 CC 23 23 46 0.011 0.000 0.005 012849 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 013016 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 013300 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 013463 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 013483 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 013605 AA 23 22 45 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.006 013639 CC 15 5 20 CT 9 11 20 TT 0 6 6 1.278 0.000 0.080 013777 CC 19 22 41 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.152 014085 AA 23 23 46 AG 1 0 1 GG 0 0 0 0.011 0.000 0.005 014109 AA 0 0 0 AC 3 0 3 CC 21 23 44 0.107 0.000 0.051 014211 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 014620 CC 0 0 0 CG 5 0 5 GG 18 23 41 0.342 0.000 0.152 014623 AA 5 5 10 AG 12 10 22 GG 6 8 14 0.048 0.306 0.060 014633 GG 0 0 0 GT 5 0 5 TT 18 23 41 0.342 0.000 0.152 015899 AA 22 21 43 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.012 0.006 016272 CC 2 3 5 CG 11 12 23 GG 10 7 17 0.179 0.362 0.454 016473 AA 6 8 14 AG 12 10 22 GG 6 5 11 0.000 0.306 0.169 016961 AA 0 7 7 AG 10 10 20 GG 14 6 20 1.662 0.381 0.289 016964 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 017016 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 017017 AA 0 0 0 AG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 017508 CC 19 23 42 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.148 017713 AA 19 23 42 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.148 017825 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 018243 AA 19 20 39 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.324 0.000 0.160 018323 CC 10 5 15 CT 12 9 21 TT 2 6 8 0.375 0.191 0.019 018749 AA 0 0 0 AC 5 0 5 CC 19 21 40 0.324 0.000 0.156 018823 CC 23 21 44 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 018834 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 24 20 44 0.000 0.012 0.006 018870 CC 19 21 40 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.324 0.000 0.156 019015 GG 10 6 16 GT 12 10 22 TT 2 7 9 0.375 0.381 0.085 019147 CC 21 23 44 CG 3 0 3 GG 0 0 0 0.107 0.000 0.051 019162 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 019263 CC 12 6 18 CT 12 10 22 TT 0 7 7 2.667 0.381 0.004 019634 CC 0 0 0 CG 5 0 5 GG 19 23 42 0.324 0.000 0.148 019655 AA 0 7 7 AG 8 10 18 GG 16 6 22 0.960 0.381 1.018 019676 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 23 23 46 0.011 0.000 0.005 019716 CC 21 23 44 CT 3 0 3 TT 0 0 0 0.107 0.000 0.051 020363 CC 23 23 46 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 020605 AA 6 8 14 AT 12 10 22 TT 6 5 11 0.000 0.306 0.169 020724 AA 6 5 11 AC 12 10 22 CC 6 8 14 0.000 0.306 0.169 020826 GG 18 23 41 GT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.152 021043 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 23 43 0.012 0.000 0.006 021098 AA 0 0 0 AG 0 2 2 GG 23 21 44 0.000 0.048 0.023 021409 CC 2 8 10 CT 12 10 22 TT 6 5 11 1.250 0.306 0.024 021600 AA 1 0 1 AG 2 0 2 GG 20 23 43 4.707 0.000 10.478 021662 CC 0 0 0 CT 2 0 2 TT 21 23 44 0.048 0.000 0.023 021675 AA 0 0 0 AG 0 1 1 GG 23 22 45 0.000 0.011 0.006 022278 CC 23 22 45 CG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.006 023322 AA 18 23 41 AG 5 0 5 GG 0 0 0 0.342 0.000 0.152 023342 CC 18 23 41 CT 5 0 5 TT 0 0 0 0.342 0.000 0.152 023812 CC 21 22 43 CT 0 1 1 TT 0 0 0 0.000 0.011 0.006 023862 AA 0 0 0 AG 1 0 1 GG 20 22 42 0.012 0.000 0.006 024436 AA 24 22 46 AG 0 1 1 GG 0 0 0 0.000 0.011 0.005 024505 CC 0 0 0 CT 1 0 1 TT 23 23 46 0.011 0.000 0.005 024597 AA 2 3 5 AG 11 12 23 GG 11 8 19 0.107 0.209 0.258 024894 GG 23 23 46 GT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.005 025138 CC 24 21 45 CT 0 2 2 TT 0 0 0 0.000 0.048 0.022 025252 CC 23 22 45 CT 1 0 1 TT 0 0 0 0.011 0.000 0.006 025308 CC 17 22 39 CT 7 0 7 TT 0 0 0 0.700 0.000 0.312 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000272: GAT 002825: GTTT 005705: A 007874: T