Site Allele1 AD-pop ED-pop Total-pop Allele2 AD-pop ED-pop Total-pop AD-hz ED-hz Total-hz 000272 - 0.24 0.50 0.37 + 0.76 0.50 0.63 0.36 0.50 0.47 000853 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 001844 T 0.45 0.48 0.47 C 0.55 0.52 0.53 0.50 0.50 0.50 001924 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002155 T 0.07 0.00 0.03 C 0.93 1.00 0.97 0.13 0.00 0.07 002263 G 0.27 0.48 0.37 A 0.73 0.52 0.63 0.40 0.50 0.47 002480 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 002590 A 0.10 0.00 0.06 G 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 002825 - 0.24 0.52 0.40 + 0.76 0.48 0.60 0.36 0.50 0.48 004192 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004323 A 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 004383 T 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 005705 - 0.24 0.50 0.37 + 0.76 0.50 0.63 0.36 0.50 0.46 006124 A 0.00 0.02 0.01 T 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 006205 A 0.19 0.04 0.12 G 0.81 0.96 0.88 0.30 0.08 0.21 006264 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 006355 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 006362 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006385 G 0.50 0.46 0.48 A 0.50 0.54 0.52 0.50 0.50 0.50 006549 T 0.04 0.00 0.02 C 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 006791 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 006798 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007039 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 007389 T 0.09 0.00 0.04 C 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 007542 A 0.04 0.00 0.02 G 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 007816 T 0.12 0.04 0.08 C 0.88 0.96 0.92 0.22 0.08 0.15 007874 - 0.07 0.00 0.03 + 0.93 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 008077 G 0.00 0.03 0.01 T 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.03 008515 G 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 008654 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 008843 T 0.18 0.41 0.29 C 0.82 0.59 0.71 0.29 0.48 0.42 009316 T 0.00 0.07 0.03 C 1.00 0.93 0.97 0.00 0.12 0.06 009858 A 0.00 0.03 0.01 G 1.00 0.97 0.99 0.00 0.05 0.02 010518 A 0.31 0.39 0.35 G 0.69 0.61 0.65 0.43 0.47 0.45 011456 G 0.06 0.00 0.03 A 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 011543 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 011555 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 011573 C 0.33 0.57 0.45 T 0.67 0.43 0.55 0.44 0.49 0.49 011783 C 0.02 0.22 0.12 T 0.98 0.78 0.88 0.04 0.34 0.21 011828 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 011997 T 0.19 0.50 0.34 C 0.81 0.50 0.66 0.30 0.50 0.45 012208 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012225 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 012229 A 0.31 0.40 0.36 G 0.69 0.60 0.64 0.43 0.48 0.46 012752 A 0.06 0.00 0.03 G 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 012822 A 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 012849 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013016 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013300 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013463 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 013483 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 013605 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 013639 T 0.19 0.52 0.35 C 0.81 0.48 0.65 0.30 0.50 0.45 013777 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 014085 G 0.02 0.00 0.01 A 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 014109 A 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 014211 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 014620 C 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 014623 A 0.48 0.43 0.46 G 0.52 0.57 0.54 0.50 0.49 0.50 014633 G 0.11 0.00 0.05 T 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 015899 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 016272 C 0.33 0.41 0.37 G 0.67 0.59 0.63 0.44 0.48 0.46 016473 G 0.50 0.43 0.47 A 0.50 0.57 0.53 0.50 0.49 0.50 016961 A 0.21 0.52 0.36 G 0.79 0.48 0.64 0.33 0.50 0.46 016964 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 017016 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 017017 A 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 017508 T 0.10 0.00 0.05 C 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 017713 G 0.10 0.00 0.05 A 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 017825 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018243 G 0.10 0.00 0.06 A 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.11 018323 T 0.33 0.53 0.42 C 0.67 0.47 0.58 0.44 0.50 0.49 018749 A 0.10 0.00 0.06 C 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 018823 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 018834 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.05 0.02 018870 T 0.10 0.00 0.06 C 0.90 1.00 0.94 0.19 0.00 0.10 019015 T 0.33 0.52 0.43 G 0.67 0.48 0.57 0.44 0.50 0.49 019147 G 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 019162 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 019263 T 0.25 0.52 0.38 C 0.75 0.48 0.62 0.38 0.50 0.47 019634 C 0.10 0.00 0.05 G 0.90 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 019655 A 0.17 0.52 0.34 G 0.83 0.48 0.66 0.28 0.50 0.45 019676 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 019716 T 0.06 0.00 0.03 C 0.94 1.00 0.97 0.12 0.00 0.06 020363 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 020605 T 0.50 0.43 0.47 A 0.50 0.57 0.53 0.50 0.49 0.50 020724 A 0.50 0.43 0.47 C 0.50 0.57 0.53 0.50 0.49 0.50 020826 T 0.11 0.00 0.05 G 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 021043 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 021098 A 0.00 0.04 0.02 G 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 021409 C 0.40 0.57 0.49 T 0.60 0.43 0.51 0.48 0.49 0.50 021600 A 0.09 0.00 0.04 G 0.91 1.00 0.96 0.16 0.00 0.08 021662 C 0.04 0.00 0.02 T 0.96 1.00 0.98 0.08 0.00 0.04 021675 A 0.00 0.02 0.01 G 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 022278 G 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023322 G 0.11 0.00 0.05 A 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 023342 T 0.11 0.00 0.05 C 0.89 1.00 0.95 0.19 0.00 0.10 023812 T 0.00 0.02 0.01 C 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 023862 A 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.05 0.00 0.02 024436 G 0.00 0.02 0.01 A 1.00 0.98 0.99 0.00 0.04 0.02 024505 C 0.02 0.00 0.01 T 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 024597 A 0.31 0.39 0.35 G 0.69 0.61 0.65 0.43 0.48 0.46 024894 T 0.02 0.00 0.01 G 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025138 T 0.00 0.04 0.02 C 1.00 0.96 0.98 0.00 0.08 0.04 025252 T 0.02 0.00 0.01 C 0.98 1.00 0.99 0.04 0.00 0.02 025308 T 0.15 0.00 0.08 C 0.85 1.00 0.92 0.25 0.00 0.14 Note: AD: African_Descent ED: European_Descent Total: All_population pop : population Diallelic insertion/deletion polymorphisms are represented as: + : insertion allele - : deletion allele The + (inserted) allele for each site is listed below: 000272: GAT 002825: GTTT 005705: A 007874: T